Deniz BORCAK, Ünal ÇAĞIR, Altan YALÇINER

Nevşehir ilinde hepatit C virüs genotip dağılımı ile serum alanin aminotransferaz ve kantitatif serum HCV rna düzeyleri ilişkisi

Hepatit C virüsü (HCV) Flaviviridae ailesinin bir üyesidir ve RNA yapısındaki genom yüksek genetik heterojeniteye sahiptir. HCV infeksiyonunun tedavi süresi ve tedaviye verilen yanıt ile genotipleri yakından ilişkilidir. Bu çalışmada Nevşehir ilindeki kronik Hepatit C hastalarında genotip dağılımları ve serum alanin aminotransferaz (ALT), HCV RNA kantitatif düzeyleri ile ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada kronik hepatit C nedeni ile takip edilen 170 hastanın serum örnekleri incelenmiştir. Viral yük Cobas AmpliPrep/Cobas Taqman 48 (Roche, ABD) sistemi, HCV genotipleri ise Real Time HCV Genotype II (Abbott Molecular, ABD) sistemi ile çalışılmıştır. Hastaların 78i (% 45.1) genotip 1, 64ü (% 37) genotip 1b, 25i (% 14.5) genotip 2, ikisi (% 1.2) genotip 3 ve bir hasta (% 0.6) genotip 4 olarak belirlenmiştir. Sonuç olarak, genotip dağılımları ile ALT ve HCV RNA PCR düzeyleriyle arasında istatistiksel anlamlı bir ilişki saptanmamıştır (p>0.05). Nevşehirde HCV genotip 2 prevalansının ülkemiz genelinden daha yüksek oranda bulunması, bu bölgede daha kapsamlı çalışmalara gereksinim olduğunu göstermektedir.

Distribution of Hepatitis C virus genotypes and their association with serum alanine aminotransferases and quantitative serum HCV RNA levels

Hepatitis C virus (HCV) is a member of Flaviviridae family and its RNA genome has high genetic heterogenity. In HCV infections, duration of treatment and the response to therapy are strongly related to HCV genotypes. In this study we aimed to identify the distribution of hepatitis C virus genotypes in patients with chronic hepatitis C infection and its associa - tion with serum alanine aminotransferases (ALT) and quantitative serum HCV RNA levels in Nevşehir city. Serum samples of 170 patients with chronic HCV infection were analyzed. Viral quantative RNA was determined by Cobas AmpliPrep/Cobas Taqman 48 (Roche, USA) system and viral genotypes were determined by Real Time HCV Genotype II (Abbott Molecular, USA) system. Genotype 1 was identified in 78 (45.1 %), genotype 1b in 64 (37 %), genotype 2 in 25 (14.5 %), genotype 3 in two (1.2 %) and genotype 4 in one (0.6 %) of the patients. As a result there was no statistically significant relationship bet- ween genotype distribution, HCV RNA load (p>0.005) and ALT levels. The prevalence of HCV genotype 2 was found to be higher in Nevşehir than the average in Turkey. The results of this study indicated that further comprehensive studies are needed in this region.

PDF

___

1. Abacıoğlu YH, Davidson F, Tuncer S et al. The distribution of hepatitis C virus genotype in Turkish patients, J Viral Hepat 1995;2(6):297-301. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2893.1995.tb00045.x PMid:8732176
2. Aktaş O, Özbek A, Aydın H et al. Distribution of HCV genotypes in patients of with chronic hepa titis C in the eastern anatolia region, Viral Hepatitis Journal 2014;20(3):91-4. PMid:21063977
3. Altuğlu İ, Söyler İ, Özacar T, Erensoy S. Distribution of hepatitis C virus genotypes in patients with chronic hepatitis C infection in western Turkey, Int J Infect Dis 2008;12(3):239-44. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijid.2007.07.003 PMid:17942359
4. Çelik C, Bakıcı MZ, Kaygusuz R, Ertürk R. Sivas yöresindeki HCV genotip dağılımlarının araştırıl ması, Viral Hepatit Derg 2010;16(3):106-10.
5. Çiftçi İH, Er H, Aşık G ve ark. The distribution of genotype of the hepatitis C virus (HCV) RNA positive patients, Med J Kocatepe 2009;10(1,2,3): 21-4.
6. Çil T, Özekinci T, Göral V, Altıntaş A. Güneydoğu Anadolu Bölgesinde HCV virüsü genotipleri, Türkiye Klinikleri J Med Sci 2007;27(4):496-500.
7. Ersöz Galip. Hepatit C infeksiyonu tedavisinde konakla ilgili faktörler, IL28B polimorfizmi, ANKEM Derg 2012;26(Ek 2):144-9.
8. Gökahmetoğlu S, Atalay MA, Kılınç A. Hepatit C virüs genotiplerinin pirosekanslama yöntemi ile belirlenmesi, Erciyes Tıp Derg 2011;33(2):99-102.
9. Kalaycı R, Altındiş M, Gülamber C ve ark. Kronik hepatit B ve hepatit Cli hastalarda genotip dağılımı ve hepatit B olgularında direnç paterninin araştırılması, Mikrobiyol Bul 2010;44:237-43. PMid:20549958
10. Karslıgil T, Savaş E, Savaş MC. Genotype distribu- tion and 5 UTR nucleotide changes in hepatitis C virus, Balkan Med J 2011;28(3):232-6.
11. Kayman T, Karakukcu Ç, Karaman A ve ark. Kayseri bölgesinde Hepatit C virüs enfeksiyonunun genotip dağılımı, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012;42(1):21-6.
12. Kirişçi Ö, Çalışkan A, Koçtürk S ve ark. Kahraman- maraş ili Hepatit C virüs ile enfekte bireylerde genotip dağılımı ve genotipin HCV-RNA yükü ve ALT-AST ilişkisi, Viral Hepatit Derg 2013;19(2):67-70. http://dx.doi.org/10.4274/Vhd.57966
13. Küçüköztaş MF, Özgüneş N, Yazıcı S. Kronik hepatit Cli hastalarda hepatit C virüsü (HCV) genotipleri ile alanin aminotransferaz ve HCV- RNA düzeyleri arasındaki ilişkinin araştırılması, Mikrobiyol Bul 2010;44(1):111-15. PMID: 20455406
14. Lee YS, Yoon SK, Chung ES et al. The relationship of histologic activity to serum ALT, HCV genoty- pe and HCV RNA titers in chronic hepatitis C, J Korean Med Sci 2001;16(5):585-91. http://dx.doi.org/10.3346/jkms.2001.16.5.585
15. Muir AJ, Bornstein JD, Killenberg PG, Atlantic Coast Hepatitis Treatment Group. Peginterferon alfa-2b and ribavirin for the treatment of chronic hepatitis C in blacks and non-Hispanic whites, N Engl J Med 2004;350(22):2265-71. http://dx.doi.org/10.1056/NEJMoa032502
16. Özacar T, Altuğlu İ, Zeytinoğlu A ve ark. Kronik C hepatitinde HCV genotiplerinin dağılımı, Mikrobiyoloji Bul 2001;35(3):451-8.
17. Özbek E, Ozekinci T, Mese S, Atmaca S. Hepatitis C virus genotypes are changing in the Southeast of Turkey, Biotechnol Biotechnol Eq 2009;23(4): 1521-3. http://dx.doi.org/10.2478/V10133-009-0021-7
18. Öztürk AB, Doğan ÜB, Akçaer Öztürk N et al. Hepatitis C virus genotypes in Adana and Antakya regions of Turkey, Turk J Med Sci 2014;44(4):661-5. http://dx.doi.org/10.3906/sag-1308-35
19. Şanlıdağ T, Akçalı S, Özbakkaloğlu B ve ark. Manisa bölgesinde hepatit C virüs genotiplerinin dağılımı, Mikrobiyol Bul 2009;43(4):613-18. PMid:20084914
20. Thomas DL, Lemon SM. Hepatitis C,Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds). Principles and Practice of Infectious Diseases, 6.baskı kitabında s.1950-81, Philadelphia: Churchill Livingstone (2005).
21. Ural O, Arslan U, Fındık D. Konya bölgesinde hepatit C virüsü genotip dağılımı, İnfeksiyon Derg 2007;21(4):175-81.
22. Yarkın F, Hafta A. Kronik hepatit C infeksiyonu olan hastalarda hepatit C virüs genotiplerinin dağılımı, Viral Hepatit Derg 2000;6(3):164-7.