Reverse transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyon (RT-PCR) yöntemi kullanılaak hıyar mozayik virüsü enfeksiyonunun belirlenmesi

Son yıllarda moleküler yöntemlerin kullanılması ile bitki virolojisi alanında çok önemli gelişmeler elde edilmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi, bitki virüslerinin teşhisinde, viral genlerin enfeksiyon sırasındaki rollerinin araştırılmasında en fazla kullanılan moleküler yöntemlerden birisidir. Bu çalışmada, Samsun ilinde hıyar üretim alanlarından toplanan örneklerden izole edilen Hıyar mozayik virüsü (CMV)' nün kapsid protein genini içeren bölge, reverse trasnskriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.

Determination of Cucumber mosaic virus infection by using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) method

In recent years, significant developments have been obtained by using molecular methods in plant virology. Polymerase chain reaction (PCR) has become one of the most common used molecular techniques in virus detection and determination of viral genes and their functions. In this study, the sequences involving capsid-protein gene of Cucumber mosaic virus (CMV) was amplified by using reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR).

___

  • Abdalla, O.A.. P.R. Desjardins, and J.A. JDodds. 1991. Identification, disease incidence arid distribution of viruses infecting peppers in California. Plant Disease 75: 10I9-İ023.
  • Choi, S.K., J.K. Choi, W.M Park, and K.I1. Ryu, 1999. RT-PCR detection and identification of three species of cucumoviruses with a genus-specific single pair of primers. Journal of Virological Methods, 83: 67-73.
  • Çağlar. B. K. ve M, A. Yılmaz, 2002. Detection of Squash mosaic comovinis (SqMV) of Cucurbits by biological, serological and advanced techniques methods in Çukurova region in Turkey. J. Turk. Phytopath. 31 (2):79-87.
  • Çıtır. A., N.D. Kutluk, N. Sağlam, ve H. İlbağı, 1998. Amasya, Çorum. Samsun ve Tokat illerinde hıyar ve , kabak kültürlerinde görülen virüs hastalıklarının simptomatolojik ve biyolojik yöntemlerle tanıları. Türkiye VIII. Fitopatoloji Kongresi. Ankara s: 331-335.
  • Desbiez, C, H. Lecoq. S. Aboulama, and M. PeterschmitL 2000. First Report of Cucurbit Yellow Stunting Disorder Virus in Morocco. Plant Disease 84: 596.
  • Fidan, I.J., 1995. Virus Diseases of Vegetables in Greenhouses in İzmir and Muğla. J. Turkish Phytopathology, 24: 7-14.
  • Gibbs A..I., and B.D. Harrison. 1970. Cucumber Mosaic Virus. Descriptions of Plant Viruses. No: 1. CM.!./ A.A.B. Kew. Surrey. England.
  • Hamilton, R.İ., 1985. Virus Transmission. In ihe Planl. Viruses Volume I. Polyhedral Virions with Tripartite Genomes. Plenum Press. New York, p: 309
  • Henson, J.M. and R. French. 1993. The polymerase chain reaction and plant disease diagnosis. Annual Rev. Phytopathlogy, 31: 81-109.
  • Havelda, Z., and A..I. Maule. 2000. Complex Spatial Responses to Cucumber Mosaic Virus Infection in Susceptible Citcurhita pepo Cotyledons. Planl Cell. 12(10): 1975-1986
  • Isakeit, T., N.I.-. Robertson. J.K. Brown, and R.I.. Gilbertsoni. 1994. First Report of Squash Leaf Curl) Virus on Watermelon in Texas. Plant Disease. 78:1010.
  • Kaper. J.M.. I I.E. VVaterworth. 1981. Citcitmovintses. in: Kurstak. E.. ed. Handbook of Planl Virus Infections and, Comparative Diagnosis. The Netherlands: Elsevier/Noifh Holland Biomedical Press. 257-263.
  • Kon, T., L.M. Dolores, N. B. Bajet, S. Hase, H. Takahashi, and M. Ikegami, 2003. Molecular Characterization of a Strain of Squash Leaf Curl China Virus from the Philippines, J. Phytopathology 151: 535-539.
  • Kurçman, S., 1977. Determination of Virus Diseases on Cultural Plants in Turkey. J. Turkish Phytopathology, 6: 25-46,
  • Lakshman, D.K., and D. Gonsalves, 1985. Genetic Analyses of Two Large-Lesion Isolates of Cucumber Mosaic Virus. Phytopathology 75: 758-762.
  • Lisa, V., G. Boccardo, G. D'Agostino, G. Dellavalle, and M. d'Aquilio, 1981. Characterization of a potyvirus that causes Zucchini yellow mosaic. Phytopathology. 71: 667-672.
  • Lovisolo, O., 1981. Virus and Viroid Diseases of Cucurbits. Acta Horticulture. 88: 33-82.
  • Moreno, I.M., J.M. Malpica, J.A. Diaz-Pendo'n, E. Moriones, A. Fraile, and F. Garcia-Arenal, 2004. Variability and genetic structure of the population of watermelon mosaic virus infecting melon in Spain. Virology 318: 451-460
  • Nogay, A., and Ü., Yorgancı, 1984. Investigations on the Identification, Transmission and Host Range of Viruses Infecting the Culture Plant Cucurbitaceae in Marmara Region. 1- The Identification of Viruses Cucurbits in Marmara Region. J. Turkish Phytopathology, 13: 9-28.
  • Pico, B., C. Villar, and F. Nuez, 2003. Screening Cucumis sativus landraces for resistance to cucumber vein yellowing virus. Plant Breeding 122,426-430.
  • Sevik, M.A and M. Arli-Sokmen., 2003. Viruses Infecting Cucurbits in Samsun, Turkey. Plant Disease, 87(4): 341-344.
  • Taliansky, M.E., and F. Garcia- Arenai, 1995. Role of Cueumovirüs capsid protein in long- distance movement within the infected plant. American Society for Microbiology. Vol 69: 1-20.
  • Thomson, K.G., R.G. Dietzgen, A.J. Gibbs, Y.C. Tang, W. Liesack, D.S. Teakle, and E. Stackebrandt 1995. Identification of Zucchini yellow mosaic potyvirus by RT-PCR and analysis of sequence variability. Journal of Virological Methods, 55 (1): 83-96.
  • Varveri, C, and K. Boutsika, 1999. Characterization of cucumber mosaic cucumovirus isolates in Greece. Plant Pathology, 48: 95-100.
  • Verwored, T.C., B.M.M. Dekker, and A. Hoekema, 1989. A Small Scale Procedure for the Rapid isolation of plant RNAs. Nucleic Acid Research 17, 2362.
  • Yang,Y., K.S. Kim, and E.J. Anderson, 1997. Seed Transmission of Cucumber Mosaic Virus in Spinach. Phytopathology, 87: 924-931.
  • Yardımcı, N., ve S. Korkmaz, 2002. İsparta yöresinde üretilen kabaklarda enfeksiyon oluşturan viral etmenin dsRNA analiz yöntemi ile tanılanması üzerinde araştırmalar. S.D.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 6 (2): 49-55.
  • Yılmaz, M.A., S. Baloğlu, M. Özaslan, ve M.E. Güldür, 1995. GAP Bölgesi kültür bitkilerinde belirlenen virüsler. GAP Bölgesi Bitki Koruma Sorunları ve Çözüm Önerileri Sempozyumu s: 241-250 Şanlıurfa/Türkiye.
  • Zhao, M.F., J. Chen, H.Y. Zheng, M. J. Adams and J.P. Chen, 2003. Molecular Analysis of Zucchini yellow mosaic virus Isolates from Hangzhou, China, J. Phytopathology 151, 307-311.
Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-2988
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 2018
Sayıdaki Diğer Makaleler

Bursa' da ahududu alanlarında saptanan Coleoptera türleri

Mehmet KAYA, Bahattin KOVANCI

Reverse transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyon (RT-PCR) yöntemi kullanılaak hıyar mozayik virüsü enfeksiyonunun belirlenmesi

Arlı Miray SÖKMEN, MEHMET ALİ ŞEVİK

Sera şartlarında harç ortamında yetiştirilen marul çeşitlerinin ürün miktarları, $NO_3, NO_2$ ve mineral madde kapsamları

Ahmet KOKMAZ, AYHAN HORUZ, Buğra ÇOLAK

Zararlılarla mücadelede entomopatojenik nematod, Steinernema ve Heterorhabditis (Nematoda: Rhabditoidae) türlerinin kullanımı

FARUK AKYAZI, Ayhan GÖKÇE, Osman ECEVİT, Kenan KARA

Bafra Ovasında Burley tütünü ile sebzelerin girdi kullanımı ve karlılık yönünden karşılaştırılması

Osman KILIÇ, Hüseyin Avni CİNEMRE, Kudret KEVSEROĞLU, ALİ KEMAL AYAN, Ömer ÇALIŞKAN

Düzenleyici uygulamalarının bazı toprak özellikleri ve mısırda N kapsamına etkileri

NUTULLAH ÖZDEMİR, AYHAN HORUZ, Semra ÖZKAPTAN

Su ürünlerinde Listeria monocytogenes

Mehtap YILMAZ, E. Mahmut KOCAMAN, MUHAMMED ATAMANALP

Börülce (Vigna unguiculata (L.) Walp.)' de bitki sıklığı ve azotlu gübrelemenin verim ve verim öğelerine etkisi

Yeliz ÖZTURAN, Ali GÜLÜMSER

Nohut (Cicer arietinum L.) çeşitlerinin tane verimi ve bazı özellikleri arasındaki ilişkiler ve kalıtım derecelerinin belirlenmesi

Hüseyin ÖZÇELIK, HATİCE BOZOĞLU

Azot fikse eden bazı mikroorganizmaların sürdürülebilir tarımdaki yeri ve baklagil olmayan bitkilerde kullanımı

YUSUF ŞAVŞATLI, Ali GÜLÜMSER