MUSTAFA YORGANCILAR, EMİNE ATALAY, Hakan BAYRAK, Erdoğan Eşref HAKKI, MUSTAFA ÖNDER, Mehmet BABAOĞLU

ISSR markörleri kullanarak Konya bölgesinden toplanan nohut (Cicer arietinum L.) popülasyonları arasında genetik çeşitliliğin belirlenmesi

Bu çalışma, nohut yetiştiriciliğinde büyük bir paya sahip olan Konya’daki farklı lokalitelerden toplanan nohut popülasyonlarının sahip olduğu genetik çeşitliliğin tespit edilmesi için yapılmıştır. Ülkemiz açısından ekonomik değeri olan, bölgeye uygun nohut çeşitleri geliştirmeye yönelik ıslah programlarına katkıda bulunmak hedeflenmiştir. Çalışmada, Konya Bölgesi’nden toplanmış olan 23 nohut popülasyonu ve 2 nohut çeşidi (Gökçe, Er 99) kullanılmış ve basit dizi tekrarlar arası (ISSR) moleküler markör tekniği ile popülasyonların aralarındaki genetik uzaklıklar belirlenmiştir. Farklı yerlerden temin edilen tohumların ekimi saksılarda kontrollü sera şartlarında gerçekleştirilmiş, yetiştirilen fidelerden alınan genç yaprak örneklerinden 2x CTAB metoduna göre DNA’ları izole edilmiş ve seçilmiş ISSR primerleri ile yapılan PCR işlemleri sonucunda oluşan bantlardan popülasyonların ortalama polimorfizm oranı %88.23 olarak belirlenmiştir. Elde edilen veriler NTSYS-pc 2.1 programı ile analiz edilmiş ve genetik ilişki dendogramı oluşturulmuştur. Çalışma sonucunda Konya Bölgesine ait nohut gen kaynaklarının sahip olduğu genetik çeşitlilik moleküler markörler ile ortaya konmuştur.

Anahtar Kelimeler:

polimeraz zincir reaksiyonu, Cicer arietinum, nohut, genetik çeşitlilik

Determination of genetic diversity among chickpea (Cicer arietinum L.) populations collected from the Konya region using ıssr markers

This study was conducted to determine the genetic diversity of the chickpea populations collected from different localities in Konya, an important region in chickpea production of Turkey. Support of breeding programs that target the development of chickpea varieties with economic value that are also appropriate to the region were also aimed. In the present study, 23 chickpea populations collected from the Konya region were used together with two commercial varieties (Gökçe, Er 99) and genetic distance of the populations were determined via inter simple sequence repeats (ISSR) molecular markers system. Seeds that were collected from different localities were planted in a controlled glasshouse within pots, DNAs were isolated from young leaf samples of the seedlings using 2 x CTAB procedure and genotyping was conducted by selected ISSR primers. Data were analyzed with NTSYS-pc 2.1 package program and polymorphisms of the populations were determined as 88.23%. In the study, genetic diversity of the chickpea gene resources belonging to Konya region was determined.

Keywords:

polymerase chain reaction, Cicer arietinum, chickpeas, genetic variation,

PDF

___

Anonim, 2006. FAO Statistics, Internet; http://www.fao.org.
Barcaccia,G., Lucchin, M., Parrini, P. 2003. Characterization of a flint maize (Zea mays var. indurata) Italian landrace, II. Genetic diversity and relatedness assessed by SSR and Inter-SSR molecular markers. Genetic Resources and Crop Evolution 50: 253–271.
Banerjee, H., Pai R. A., Moss, J. P., Sharma, R. P. 2001. Use of random amplified polymorfic DNA markers for mapping the chickpea genome. Biologia Plantarum 44(2): 195-202.
Chowdhury, M.A., Vandenberg, B., Warkentin, T. 2002. Cultivar identification and genetic relationship among selected breeding lines and cultivars in chickpea (Cicer arietinum L.) Euphytica 127: 317-325.
Domenyuk, V. P., Verbitskaya, T. G., Belousov A. A., Sivolap, Y. M. 2002. Marker Analysis of Quantitative Traits in Maize by ISSR–PCR. Russian Journal of Genetics, Vol. 38, No. 10, pp. 1161–1168. Translated from Genetika, Vol. 38, No. 10, 2002, pp. 1370–1378.
Galvan, M.Z., Bornet, B., Balatti, P.A. & Branchard, M., 2003. Inter simple sequence repeat (ISSR) markers as a tool for the assessment of both genetic diversity and gene pool origin in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Euphytica 132: 297–301.
Iruela, M., Rubio, J., Cubero, J. I., Gil, J., Millán, T. 2002. Phylogenetic analysis in the genus Cicer and cultivated chickpea using RAPD and ISSR markers. Theor Appl Genet. 104:643-651
Nguyen, T.T., Taylor, P.W.J., Redden, R.J., Ford, R. 2004. Genetic diversity estimates in Cicer using AFLP analysis. Plant Breeding 123 (2): 173-179.
Osipova, E. S., Koveza, O. V., Troitskij, A. V., Dolgikh, Yu. I., Shamina, Z. B., Gostimskij, S. A. 2003. Analysis of Specific RAPD and ISSR Fragments in Maize (Zea mays L.) Somaclones and Development of SCAR Markers on Their Basis. Russian Journal of Genetics, Vol. 39, No. 12, , pp. 1412–1419. Translated from Genetika, Vol. 39, No. 12, 2003, pp. 1664–1672.
Önder, M., Bayrak, H. 2005. Konya Ekolojisinde Tarımı Yapılan Yerel Nohut Popülasyonları ve Çeşitlerinin Tarımsal, Teknolojik ve Besinsel Karakterlerinin Belirlenmesi Üzerine Bir Araştırma, S.Ü. BAP 061201032 nolu projesi (Devam ediyor).
Reddy, M.P., Sarla, N. & Siddiq, A., 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding Euphytica 128: 9-17.
Saraçoğlu, D. 2007. Yabani ve Kültür Nohutlarının Moleküler Genetik Yöntemlerle Karakterizasyonu, S.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü Yüksek Lisans Tezi, Konya.
Sudupak, M.A. 2004. Inter and intra-species Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) variations in the genus Cicer. Euphytica 135: 229–238.