PİNOT NOİR ÜZÜM ÇEŞİDİNDE SPONTAN MUTASYON OLUŞUMUNUN MORFOLOJİK VE MOLEKÜLER OLARAK İNCELENMESİ
Islah çalışmalarında mutajen kullanılarak uyarılmış mutasyon uygulamaları yürütüldüğü gibi, doğada daender olarak spontan mutasyonlar görülebilmektedir. İster uyarılmış ister spontan mutasyon sürecindetüm hücre tabakaları, gen bölgeleri aynı değişime uğramayarak aynı doku üzerinde morfolojik olarakmutant ve mutant olmayan farklı dokuların görüldüğü kimeralar oluşabilmektedir. Her iki durumu içinealabilecek benzer bir durum, arazi çalışmaları esnasında Tekirdağ’ın Şarköy İlçesindeki Pinot noir üzümçeşidi ile tesis edilmiş üretici bağında tespit edilmiştir. Aynı omca üzerinde farklı tane rengine sahipsalkımların olduğu bu durum morfolojik ve moleküler olarak incelenmiş, tane kabuk renginin değiştiğimutant genotip ile orijinal Pinot noir çeşidi kıyaslanmıştır. Morfolojik farklılıkları ortaya koymak adınaOIV tanımlayıcı skalası kullanılarak 24 ampelografik karakter üzerinde değerlendirmeler yapılmış,değerlendirme sonucunda başta tane kabuk rengi olmak üzere bazı karakterlerde farklılıklar tespitedilmiştir. OIV tanımlayıcı skalasında bulunan 6 SSR (Simple Sequnce Loci) lokusu ile yapılanmoleküler tanı analizinde ise iki örnek arasında mutasyon polimorfizm tespit edilememiştir. Ayrıca ikiörnek, asmada renk karakterini kontrol eden Myb ilişkili gen grubu açısından da değerlendirilmiştir.Analizler ve mevcut literatürler ışığında, oluşan mutasyonun Myb ilişkili gen grubu kaynaklı olmadığısaptanmıştır.
MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR INVESTIGATION OF SPONTANEOUS MUTATION FORMATION IN PINOT NOIR GRAPE
Mutagenic mutations have been carried out in breeding studies, as well as spontaneous mutations rarely seen in nature. Both in the stimulated mutation and in the spontaneous mutation process, all cell layers and gene regions can not undergo the same variation. The presence of mutant and non–mutant parts on the same tissue is called chimera. A similar situation that could include both cases was determined in a vineyard established with Pinot noir grape variety in Şarköy district of Tekirdağ during the field studies. This situation that the bunches with different colored berries on the same vine are examined morphologically and molecularly. The original Pinot noir variety was compared with the mutant Pinot noir. In order to demonstrate the morphological differences, 24 ampelographic characters were evaluated using the OIV descriptive scale. As a result of the morphological evaluation, differences were found in some other characters as well as berry color. In the molecular diagnostic analysis performed with 6 SSR (Simple Sequnce Loci) loci on the OIV descriptor scale, mutation polymorphism could not be detected between two samples. In addition, two samples were evaluated for the gene group associated with Myb, which controls color characteristics in grape. According to the analyzes and available literature, it was determined that the mutation formed was not caused by the Myb related gene group.
___
- Azuma, A., Kobayashi, S., Yakushui, H.,
Yamada, M., Mitani, N., Sato, A. 2007.
VvmybA1 Genotype Determines Grape
Skin Color. Vitis Geilweilerhof 46(3):154.
- Azuma, A., S. Kobayashi, N. Goto
Yamamoto, M. Shiraishi, N. Mitani, H.
Yakushiji, 2009. Color Recovery in
Berries of Grape (Vitis vinifera L) Benitaka a Bud Sport of Italia, is Caused
by a Novel Allele at the VvmybA1 Locus.
Plant Sci 176:470–478.
- Barritt, B.H. and J. Einset, 1969. The
Inheritance of Three Major Fruit Colors in
Grapes. J. Am. Soc. Hort. Sci. 94:87–89.
- Carrasco, D., G. De Lorenzis, D.
Maghradze, E. Revilla, A. Bellido, O.
Failla and R. Arroyo García, 2015. Allelic
Variation in the VvMYBA1 and
VvMYBA2 Domestication Genes in
Natural Grapevine Populations (Vitis
vinifera subsp. sylvestris). Plant Syste
matics and Evolution 301(6):1613-1624.
- Carrier, G., L. Le Cunff, A. Dereeper, D.
Legrand and F. Sabot, 2012. Transposable
Elements Are a Major Cause of Somatic
Polymorphism in Vitis vinifera L. Plos One
7(3):e32973.doi:10.1371/journal.pone.
0032973
- Değirmenci, D., 2006. Sultani Çekirdeksiz
ve Kalecik Karası Üzüm Çeşitlerinde
Uyarılmış Mutasyon Etkilerinin
Sitogenetik Tanımlanması (Doktora Tezi).
Ankara Üniversitesi Fen Bil. Enst. 116s.
- Doligez, A., A. Bouquet, Y. Danglot, F.
Lahogue, S. Riaz, C.P. Meredith and K.J.
Edwards, 2002. Genetic Mapping of
Grapevine (Vitis vinifera L.) Applied to the
Detection of Qtls for Seedlessness and
Berry Weight. Theor. Appl. Genet. 105:
780–795.
- Fischer, B.M., I. Salakhutdinov, M.
Akkurt, R. Eibach, K.J. Edwards, R.
Töpfer and E.M. Zyprian, 2004.
Quantitative trait Locus Analysis of Fungal
disease Resistance Factors on a Molecular
Map of Grapevine. Theor. Appl. Genet.
108:501–515.
- Kobayashi, S., M. Ishimaru, K. Hiraoka
and C. Honda, 2002. Myb–Related Genes
of the Kyoho Grape (Vitis labruscana)
Regulate Anthocyanins Biosynthesis.
Planta 215:924–933.
- Kunter, B. ve D. Değirmenci Karataş,
2011. Asmalarda Mutasyonlar ve Mutant
Vitis vinifera L. Çeşitleri. YYÜ Tar. Bil.
Derg. 21(2):146–151.
- Lefort, François and C. Gerard Douglas,
1999. An Efficient Micro Method of DNA
Isolation from Mature Leaves of Four
Hardwood Tree Species Acer, Fraxinus,
Prunus and Quercus. Annals of Forest
Science 56(3):259–263.
- Pelsy, F., 2010. Molecular and Cellular
Mechanisms of Diversity within Grapevine
Varieties. Heredity 104:331–340.
- Regner, F., R. Hock and J.L. Santiago,
2006. Highly Variable Vitis Microsatellite
Loci Fort the Identification of Pinot Noir
Clones. Vitis 45(2):85–91.
- This, P., A. Jung, P. Boccacci, J. Borrego,
R. Botta, L. Costantini, M. Crespan, G.S.
Dangl, C. Eisenheld, F. Ferreira Monteiro,
M.S. Grando, J. Ibanez, T. Lacombe, V.
Laucou, N. Magalhaes, C.P. Meredith, N.
Milani, E. Peterlunger, F. Regner, L. Zulini
and E. Maul, 2004. Development of a
Standard Set of Microsatellite Reference
Alleles for Identification of Grape
Cultivars. Theoretical and Applied
Genetics, 109:1448–1458.
- Van Harten, A.M., 1998. Mutation
Breeding: Theory and Practical
Applications. Cambridge Univ. Press.
Cambridge. 353p.
- Velasco, R., A. Zharkikh, M. Troggio, D.
A. Cartwright, A. Cestaro, D. Pruss and G.
Malacarne, 2007. A High Quality Draft
Consensus Sequence of the Genome of a
Heterozygous Grapevine Variety. Plos
One, 2(12):e1326.
- Yakushiji, H., S. Kobayashi, N. Goto
Yamamoto, S. Tae Jeong, T. Sueta and N.
Mitani, 2006. A Skin Color Mutation of
Grapevine, from Black Skinned Pinot Noir
to White Skinned Pinot Blanc, is caused by
Deletion of the Functional VvmybA1
Allele. Biosci Biotechnol Biochem
70:1506–1508.
- Yanshuai, X., J. Nan, Z. Yaguang, W. Min,
R. Junpeng and T. Jianmin, 2017. A SNP
in the Promoter Region of the VvmybA1
Gene is Responbible for Differences in
Grape Berry Color Between two Related
Bud Sports of Grape. Plant Growth Regul.
82:457–465.