Buhara ve Semerkand, Buhara Emirliği'nin en önemli iki merkezidir. Bu şehirler coğrafi konumları, iklimleri, verimli toprakları ve demografik yapılarından dolayı emirliğin diğer şehirlerine nazaran ön plana çıkmıştır. Semerkand; güzel iklimi ve çevresini saran verimli toprakları ile adından söz ettirirken, Buhara; medrese ve camileri ile ünlenerek İslam dinin önemli merkezlerinden biri haline gelmiştir. XIX. yüzyılın ikinci yarısından itibaren Rus işgali ile birlikte bu şehirlerde mimari ve demografik yapı başta olmak üzere birçok alanda kayda değer değişimler meydana gelmiştir.

Bukhara and Samarkand was the most important two center of Emirate of Bukhara. This cities took over compared to other cities because of geographical location, climate, fertile soil and demographic structure. While Samarkand was mentioned surrounding fertile soil and good cilmate, Bukhara that famous for the madrassas and mosques became important center of İslam. From the second half of the 19th century with the Russian invasion significant changes was happened especilally architectural and demographic structure of this cities.