RT-PCR ile pozitif saptanan COVID-19 vakalarının değerlendirilmesi

Amaç: Bu çalışmada Antalya Halk Sağlığı Laboratuvarı (AHSL)’na COVID-19 şüphesi ile gönderilen örneklerin RT-PCR ile incelenmesi ve vakaların epidemiyolojik ve klinik özelliklerinin araştırılması amaçlanmıştır. Yöntem: Bu çalışma, 18 Mart 2020 ile 18 Mayıs 2020 tarihleri arasında AHSL’na COVID-19 şüphesi ile gelen 6404 solunum yolu örneği üzerinde yapıldı. Solunum yolu örneklerinde Real Time PCR testi ile SARS CoV-2 spesifik N ve Orf1ab gen bölgeleri analiz edildi. Test yapılan kişilerin tıbbi, epidemiyolojik ve demografik bilgilerine retrospektif olarak ulaşıldı. Gruplar arası oransal farklılıkları karşılaştırmak için ki-kare testi kullanıldı. Bulgular: 6.404 solunum yolu örneğinin %6,2’si (n=398) pozitif saptandı. Testin yapıldığı ay ile PCR pozitiflik oranı arasında anlamlı farklılık görüldü (p

Evaluation of COVID-19 cases detected positive by RT-PCR

Objective: In this study, it was aimed to examine samples sent to Antalya Public Health Laboratory (AHSL) with the suspicion of COVID-19 by RT-PCR and to investigate the epidemiological and clinical characteristics of the cases. Methods: This study, conducted between 18 March 2020 and 18 May 2020, retrospectively analyzed on 6404 respiratory tract samples that came to AHSL with suspected COVID-19. SARS CoV-2 specific N and Orf1ab gene regions were analyzed with Real Time PCR test in respiratory tract samples. Medical, epidemiological and demographic information of the people who were tested were obtained retrospectively. Chi-square test was used to compare the proportional differences between groups. Results: In this study 6.2% (n = 398) of 6,404 respiratory tract samples were found to be positive. There was a significant difference between the month of the test and the PCR positivity rate (p

___

  • 1. Sijia T, Nan H, Jing L, Kun C, Xuqin K, Zhenjun X et al. Characteristics of COVID-19 infection in Beijing. J Infect, 2020; 80(4): 401–406.
  • 2. Nanshan C, Min Z, Xuan D, Jieming Q, Fengyun G, Yang H, et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet, 2020; 395(10223): 507–513.
  • 3. Huilan T, Sheng T, Shiqi G, Anwen S, Jifang S. The epidemiological and clinical features of COVID-19 and lessons from this global infectious public health event. J Infect, 2020; 81(1): 1-9.
  • 4. Chih-Cheng L, Tzu-Ping S, Wen-Chien K, Hung-Jen T, Po-Ren H. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and coronavirus disease-2019 (COVID-19): The epidemic and the challenges. Int J Antimicrob Agents, 2020; 55(3): 105924.
  • 5. Rui L, Huan H, Fang L, Zhihua L, Kailang W, Yingle L, et al. Positive rate of RT-PCR detection of SARS-CoV-2 infection in 4880 cases from one hospital in Wuhan, China, from Jan to Feb 2020. Clin Chim Acta, 2020; 505: 172-175.
  • 6. Qun L, Xuhua G, Peng W, Xiaoye W, Lei Z, Yeqing T et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia. N Engl J Med, 2020; 382(13): 1199–1207.
  • 7. Jingchun F, Xiaodong L, Guojun S, Junpin Q, Yi L, Weimin P, et al. The epidemiology of reverse transmission of COVID-19 in Gansu Province, China. Travel Med Infect Dis, 2020; 37: 101741.
  • 8. Chen W, Peter WH, Frederick GH, George FG. A novel coronavirus outbreak of global health concern. Lancet, 2020; 395(10223): 470–473.
  • 9. Haneen A, Ghina’a I Abu D, Alaa A A A, Kamal D, Murtaza M T. COVID-19 pandemic: an overview of epidemiology, parthenogenesis, diagnostics and potential vaccines and therapeutics. Ther Deliv, 2020; 11(4): 245-268.
  • 10. MOH, TurkeyScientific Advisory Board. COVID-19 (SARS-CoV-2 Infection) General Information, Epidemiology and Diagnosis. Turkey: Ministry of Health, General Directorate of Public Health; 27 November 2020.
  • 11. Nolan T, Hands RE, Bustin SA. Quantification of mRNA using real-time RT-PCR. Nat Protoc, 2006; 1(3): 1559–1582.
  • 12. Görgülü Ö , Duyan M. rRT-PCR Results of a Covid-19 Diagnosed Geriatric Patient. SN Compr Clin Med, 2020; 2(11): 2423-2426.
  • 13. Kampf G, Todt D, Pfaender S, Steinmann E. Persistence of coronaviruses on inanimate surfaces and their inactivation with biocidal agents. J Hosp Infect, 2020; 104(3): 246–251.
  • 14. Zhoukun L, Xi X, Qingxin G, Lieguang Z, Liangping L, Xiaoping T, et al. Asymptomatic SARS-CoV-2 infected patients with persistent negative CT findings. Eur J Radiol, 2020; 126:108956.
  • 15. Ma Y, Xu QN, Wang FL, Ma XM, Wang XY, Zhang XG. Characteristics of asymptomatic patients with SARS-CoV-2 infection in Jinan, China. Microb Infect, 2020; 22: 212–217.
  • 16. Görgülü Ö, Duyan M. Effects of comorbid factors on prognosis of three different geriatric groups with COVID-19 diagnosis. SN Compr Clin Med, 2020; 2(12): 2583-2594.
  • 17. Karageçili H, Yıldırım Z. Epidemiological and clinical aspects of the COVID-19 pandemic and world common experiences in treatment: Turkey experience. Turk Hij Den Biyol Derg, 2020; 77(3): 355-366.
  • 18. Michael L, Andrea M, Vincent M. Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses. Nat Microbiol, 2020; 5(4): 562-569.
  • 19. Rinkoo D, Stefan RB, Ali El-A, Roman NR, Alexander M, Ben W, et al. The ACE-2 in COVID-19: Foe or Friend? Horm Metab Res, 2020; 52(5): 257-263.
  • 20. Giuseppe P, Alessandro S, Chiara P, Federica B, Romualdo Del B, Fabio C, et al. COVID 19 diagnosis and management: a comprehensive review. J Intern Med, 2020; 288(2): 192-206.
  • 21. Chadia H, Sandrella Bou M, Hala S, Pascale S. Smoking and COVID-19: A Scoping Review. Tob Use Insights, 2021; 14: 1179173X21994612.
  • 22. Usman MS, Siddiqi TJ, Khan MS, Patel UK, Shahid I, Ahmed J, et al. Is there a smoker’s paradox in COVID-19? BMJ Evid Based Med, 2020;26(6):279-84.
  • 23. Chaolin H, Yeming W, Xingwang L, Lili R, Jianping Z, Yi H, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet, 2020; 395(10223): 497-506.
  • 24. Di W, Tiantian W, Qun L, Zhicong Y. The SARS-CoV-2 outbreak: What we know. Int J Infect Dis, 2020; 94: 44-48.
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi-Cover
  • ISSN: 0377-9777
  • Yayın Aralığı: 4
  • Başlangıç: 1938
  • Yayıncı: Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
Sayıdaki Diğer Makaleler

Yatan hasta yakınlarının su/sıvı tüketimi ve etkileyen faktörlerin değerlendirilmesi

Gamze ÇAN, Nazım Ercüment BEYHUN, Sevil TURHAN, İrem DİLAVER, Büşra PARLAK SOMUNCU, Kübra ŞAHİN, Medine Gözde ÜSTÜNDAĞ, Murat TOPBAŞ

Üriner kateter bakım demeti uyumunun kateter ilişkili idrar yolu enfeksiyonları üzerine etkisi

Tuğba YANIK YALÇIN, Çiğdem EROL, Fatma İrem YEŞİLER, Burcu GÖNÜLAL, Saliha AYDIN

Sığırlarda koyun ilişkili Ovine gammaherpesvirus-2’nin moleküler karakterizasyonu ve risk faktörlerinin belirlenmesi

Mehmet Özkan TİMURKAN, Nergis ULAŞ, Hakan AYDIN, Şükrü DEĞİRMENÇAY

Türkiye’de yeni üretilen ve geliştirilmekte olan nikotin ve tütün ürünleri ile ilgili yasal düzenlemeler

Benay Can EKE, Yunus YÜCE

RT-PCR ile pozitif saptanan COVID-19 vakalarının değerlendirilmesi

Vildan GÖRGÜLÜ, Fazila ATAKAN ERKAL, Şenay TUĞLU ATAMAN, Esra ÇİFTÇİ, Önder SER, Elçin YENİDÜNYA KONUK, Fırat KÖSE

Ebeveynlerin HPV aşılaması hakkındaki bilgileri ve tutumları: Tanımlayıcı çalışma

Serkan TURSUN, Hüsniye YÜCEL, Esma ALTINEL AÇOĞLU

Türkiye Sağlık Bakanlığı koordinasyonunda olan sertifikalı sağlık eğitim programlarının katılımcılar tarafından değerlendirilmesi

Emine ÇETİN ASLAN, Gülsen TOPAKTAŞ, Hüseyin ASLAN

Keratit olgularında mikrobiyal etkenlerle birlikte mikobakteri varlığının araştırılması

Ali ÜÇKAYABAŞI, Tülay KANDEMİR, Toğrul NAĞIYEV

Hastanemize başvuran hastalarda HBsAg, Anti-HBs, Anti-HCV ve Anti-HIV seroprevalansı: 5 yıllık retrospektif veri

Havva AVCIKÜÇÜK, Dilek DÜLGER, Feray AYDIN, Ümmü Sena SARI

Yatırılarak tedavi edilen COVID-19 hastalarinda göz bulguları

Yasemin Fatma ÇETİNKAYA, Ceren KARAÇAYLI