Influenza and SARS-CoV-2 coinfection during the COVID-19 pandemic

Objective: Because severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), which produces pandemic pneumonia and has a more fatal course than seasonal flu, has no effective treatment, protection against secondary infections is essential in preventing disease-related mortality. The study’s goal is to prove a link between seasonal Influenza A-B and SARS-CoV-2 coinfections in the winter, when respiratory tract illnesses are widespread. Methods: This study was designed retrospective. After ethic commitee approval; 515 patients with cold symptoms between November 2, 2020 and February 17, 2021 were included in study. Influenza Antigen Card Plus was used for the detection of influenza. In the PCR test for SARS-CoV-2, swab samples taken from both the mouth and nose were studied in the CFX96 Real time PCR device. Patients were divided into groups according to whether the Influenza A-B and COVID-19 PCR tests were positive or negative. The relationship between influenza A-B positivity and SARS-CoV-2 positivity was investigated. Results: The female / male ratio in the 515 patients included in the research was 60.7% / 39.2%. Influenza positivity was found 55.2% in women and 44.5% in men. Influenza-A was revealed to be the most prevalent influenza subtype. Influenza and COVID-19 coinfection was detected in 33.1% of the cases. Influenza-A was positive in 29.9% and Influenza B was positive in %10.1 of the patients with positive COVID-19 RT-PCR test. Conclusion: We have determined that it can be seen as a coinfection with SARS-CoV-2, as well as the occurrence of Influenza alone during the flu season. Although the pandemic appears to be speeding up at times owing to changes in isolation measures, the impact of influenza, other respiratory tract diseases, and coinfection on the disease’s progression is unknown, and further study is needed.

COVID-19 pandemisinde SARS-CoV-2 ve İnfluenza koinfeksiyonu

Amaç: Pandemik pnömoniye neden olarak tüm dünyada hızla yayılan ve mevsimsel gribe göre daha mortal seyreden Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)’nin etkin bir tedavisi olmadığından hastalığa bağlı ölümlerde sekonder enfeksiyonlardan korunma önemlidir. Çalışmanın amacı, solunum yolu enfeksiyonlarının sık görüldüğü kış sezonunda mevsimsel İnfluenza A-B ve SARS-CoV-2’nin birlikte olduğu ko-infeksiyonun gösterilmesidir. Yöntem: Çalışma retrospektif olarak planlandı. Etik kurul onayının alınmasının ardından 2 Kasım 2020 ile 17 Şubat 2021 arasında soğuk algınlığı semptomları ile başvurmuş olan 515 hasta çalışmaya alındı. İnfluenza tespiti için İnfluenza Antijen Card Plus yöntemi kullanıldı. SARS-CoV-2’nin PCR yöntemi ile tespiti için ağız boşluğu ve burundan alınan sürüntü örnekleri CFX96 Real time PCR cihazında çalışıldı. Hastalar İnfluenza A-B ve Reverse transcription polymerase chain reaction COVID-19 RT-PCR pozitif veya negatif olmasına göre gruplara ayrıldı. Hastalarda İnfluenza A-B pozitifliği ile SARS-CoV-2 pozitif vakaların birlikteliğine bakıldı. Bulgular: Çalışmaya alınan 515 hastada kadın / erkek oranı %60.7 / %39.2 saptandı. İnfluenza pozitifliği kadınlarda %55.2, erkeklerde %44.5 saptandı ve COVID-19 ko-infeksiyonu %33,1 vakada saptandı. COVID-19 RT-PCR testi pozitif olan 177 hastanın %29,9 (53)’unda İnfluenza-A, %10.1 (18)’inde İnfluenza-B pozitif saptandı. Sonuç: Grip sezonunda tek başına İnfluenza görülmesinin yanında, SARS-CoV-2 ile koinfeksiyon olarak da görülebildiği ortaya konuldu. İzolasyon önlemlerindeki değişimlere bağlı olarak pandeminin aralıklı olarak hızlandığı görülmekle birlikte influenzanın, diğer solunum yolu infeksiyonlarının ve koinfeksiyonun hastalık seyrine etkisi net olmayıp bu konuda ileri araştırmalara gereksinim vardır

___

1. Maltezou HC, Theodoridou K, Poland G. Influenza immunization and COVID-19. Vaccine. 2020;38(39):6078-9.

2. Cheng Y, Ma J, Wang H, Wang X, Hu Z, Li H,et al. Co-infection of influenza A virus and SARSCoV-2: A retrospective cohort study. J Med Virol. 2021;93(5):2947-954.

3. Konala VM, Adapa S, Gayam V, Naramala S, Daggubati SR, Kammari CB, et al. Co-infection with Influenza A and COVID-19. Eur J Case Rep Intern Med. 2020;7:001656.

4. Cox MJ, Loman N, Bogaert D, O’Grady J. Coinfections: potentially lethal and unexplored in COVID-19. Lancet Microbe. 2020;1.

5. Balla M, Merugu GP, Patel M, Koduri NM, Gayam V, Adapa S, et al. COVID-19, Modern Pandemic: A Systematic Review From Front-Line Health Care Providers’ Perspective. J Clin Med Res. 2020;12(4):215-29.

6. Iuliano AD, Roguski KM, Chang HH, Muscatello DJ, Palekar R, Tempia S. Estimates of global seasonal influenza-associated respiratory mortality: a modeling study. Lancet. 2018;391:1285–300.

7. Centers for Disease Control and Prevention. 2019‐2020 U.S. flu season: preliminary burden estimates. 2020. https://www.cdc.gov/flu/about/ burden/preliminary-in-season-estimates.htm.

8. Distante C, Piscitelli P, Miani A. Covid-19 outbreak progression in Italian regions: approaching the peak by the end of March in Northern Italy and first week of April in Southern Italy. Int J Environ Res Public Health. 2020.

9. Faust JS, del Rio C. Assessment of deaths from COVID-19 and from seasonal influenza. JAMA Intern Med. 2020 .

10. Peeri NC, Shrestha N, Rahman MS, Zaki R, Tan Z, Bibi S,et al. The SARS, MERS and novel coronavirus (COVID-19) epidemics, the newest and biggest global health threats: what lessons have we learned? Int J Epidemiol. 2020 doi: 10.1093/ije/ dyaa033.

11. The Atlantic News Report from February 24, 2020. Accessed on February25,2020. https://www.

theatlantic.com/health/archive/2020/02/covidvaccine/607000/. 12. Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, et al. Early transmission dynamics in Wuhan, China, of novel coronavirus-infected pneumonia. N Engl J Med. 2020;382:1199–207.

13. Chan JF, Yuan S, Kok KH, To KK, Chu H, Yang J, et al. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster. Lancet. 2020;395(10223):514–23.

14. Lai CC, Wang CY, Hsueh PR. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020;53(4):505-12.

15. Zhu X, Ge Y, Wu T, Zhao K, Chen Y, Wu B,et al. Co-infection with respiratory pathogens among COVID-2019 cases. Virus Res. 2020;285.

16. Kim D, Quinn J, Pinsky B, Shah NH, Brown I. Rates of Co-infection Between SARS-CoV-2 and Other Respiratory Pathogens. JAMA. 2020;323(20):2085-6.

17. Marín-Hernández D, Schwartz RE, Nixon DF. Epidemiological evidence for association between higher influenza vaccine uptake in the elderly and lower COVID-19 deaths in Italy. J Med Virol. 2021;93(1):64-5.
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi-Cover
  • ISSN: 0377-9777
  • Başlangıç: 1938
  • Yayıncı: Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
Sayıdaki Diğer Makaleler

Brucella Coombs jel testi: Brusellozun serolojik tanısında hızlı bir test olarak diğer serolojik yöntemlerin yerini alabilir mi?

Begüm Nalça ERDIN, Mehmet PARLAK, Ayşe GÜVEN AYDINLI, Feyza DEMIR

Birinci Dünya Savaşı’nda Kafkas Cephesi’nde sağlık hizmetleri ve Erzurum’da ilk tifüs aşısı uygulamaları

Figen KAYSERILI ORHAN

Ensefalitli ve anemili koyunda Chaphamaparvovirüs’ün ilk keşfi

Eda ALTAN, Eric DELWAR, Gilberto SABINO-SANTOS JR, Patricia PESAVENTO

El yıkama alışkanlıklarının eldeki aerob mikroorganizma yükü ile ilişkisi

Yasemin ÖZ, Nilgün KAŞIFOĞLU, Tuğçe Nur ÖZTÜRK, Betül KARADENIZ, Ahmet İshak ÖZDEMIR, Berk PALAZOĞLU, Fatma Betül KARAL, Mohammed V. SHERIFF

Düşük doz fraksiyone olmayan heparin ve düşük moleküler ağırlıklı heparinin farelerde subaraknoid kanama sonrası erken beyin hasarı üzerindeki etkileri

Orhan ALTAY

COVID-19 küresel salgınının toplumsal etkileri

Kemal ATAMAN, Erol GÖKA, Veysel BOZKURT, Mustafa Necmi İLHAN, Nuran YILDIRIM, Berkay VURAN

COVID-19 pandemisinde SARS-CoV-2 ve İnfluenza koinfeksiyonu

Mehmet Sami İSLAMOĞLU, Betül BORKU UYSAL

Transition from CLSI to EUCAST: How our antibiotic susceptibility tests will be affected

GÜLŞEN HAZIROLAN

Gıda çalışanlarından izole edilen Enterobacterales suşlarında antimikrobiyal direnç ve GSBL/Karbapenemaz varlığının araştırılması

Nesrin ÇAKICI, Yasemin NUMANOĞLU ÇEVİK, Serap SÜZÜK YILDIZ, ALPER AKÇALI, NÜKHET NİLÜFER ZORBA

Investigation of biofilm formation of Enterococcus species isolated from blood by phenotypic and genotypic methods

Zeynep ÖZKÖK, Kemal BİLGİN, Yeliz TANRIVERDİ ÇAYCI, Asuman BİRİNCİ