Transition from CLSI to EUCAST: How our antibiotic susceptibility tests will be affected

Objective: Two standard guidelines are commonly used worldwide. In our country CLSI guidelines have been used up to recent years, but currently, a transition to EUCAST standards has begun in many centers. In this study the effect of transition from CLSI guideline to EUCAST guideline on antibiotic susceptibility test (AST) reports in a high prevalence region for antibiotic resistance was investigated. Methods: Non-duplicated 5003 isolates (1902 Enterobacteriaceae, 1261 Acinetobacter baumannii, 697 Pseudomonas aeruginosa, 424 Staphylococcus aureus, 336 Enterococcus faecalis, 257 Enterococcus faecium, and 126 Stenotrophomonas maltophilia) isolated from the samples sent from intensive care units (ICUs) were included in the study. The identifications of the microorganisms were performed with Bruker Microflex MS (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) system, and their AST were evaluated with Phoenix automated system (BD, Sparks, MD, USA). The MIC values were interpreted according to the breakpoints indicated in CLSI and EUCAST guidelines. Results: The highest resistance increase among Enterobacteriacea was seen to beta lactam/ betalactamase inhibitor combinations, followed by cephalosporins, quinolones and aminoglycosides. ESBL positive Enterobacteriaceae isolates were found more resistant to cephalosporins. The resistance rates of A. baumannii and P. aeruginosa seemed increased for quinolones, aminoglycosides and cephalosporins, however colistin resistance remained unchanged. All Gram-negative bacilli included in the study had decreased resistance rates for imipenem and meropenem. Similarly, S. maltophilia isolates had a decreased resistance rate for trimethoprim-sulfamethoxazole. While methicillin resistance rate did not change for S. aureus, minor changes were encountered for other antibiotic groups. There is no categorical changes observed at the susceptibility of enterococci to ampicillin, vancomycin, teicoplanin and linezolid. Conclusion: Transition to EUCAST guideline in our hospital did not affect AST results of Gram- positive bacteria isolated from the patients in ICU. However, higher resistance rates were observed for all antibiotic groups except carbapenems in Gram- negative bacteria. As a result, following the current epidemiological data according to the standard used is of great importance in terms of determining the appropriate treatment.

CLSI’den EUCAST’a geçiş: Antibiyotik duyarlılık testlerimiz nasıl etkilenecek

Amaç: Antibiyotik duyarlılık testlerinde iki standart kılavuz tüm dünyada yaygın olarak kullanılmaktadır. Ülkemizde son yıllara kadar CLSI kılavuzu kullanılmakta iken, günümüzde birçok merkezde EUCAST kılavuzuna geçildi. Bu çalışmada, antibiyotik direnci açısından yüksek prevalanslı bir merkezde CLSI kılavuzundan EUCAST kılavuzuna geçişin antibiyotik duyarlılık test (AST) raporlarına etkisi araştırıldı. Yöntem: Yoğun bakım ünitesinden gönderilen örneklerden izole edilen tekrar içermeyen 5.003 izolat (1.902 Enterobacteriaceae, 1.261 Acinetobacter baumannii, 697 Pseudomonas aeruginosa, 424 Staphylococcus aureus, 336 Enterococcus faecalis, 257 Enterococcus faecium ve 126 Stenotrophomonas maltophilia) çalışmaya dahil edildi. Suşların tanımlanmasında Bruker Microflex MS (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) sistemi kullanıldı. Antibiyotik duyarlılık sonuçları için Phoenix otomatize sistemi (BD, Sparks, MD, USA) ile elde edilen MİK değerleri, CLSI ve EUCAST kılavuzlarında belirtilen direnç sınır değerlerine göre yorumlandı. Bulgular: Enterobacteriacea’da en yüksek direnç artışının beta laktam / beta-laktamaz inhibitör kombinasyonlarında, ardından sefalosporinler, kinolonlar ve aminoglikozitlerde olduğu görüldü. ESBL pozitif Enterobacteriaceae izolatlarının sefalosporinlere karşı daha dirençli olduğu bulundu. A. baumannii ve P. aeruginosa’nın direnç oranları kinolonlar, aminoglikozidler ve sefalosporinler için artmış görünse de kolistin için direnç değişmedi. Çalışmaya dahil edilen tüm gram-negatif basillerde, imipenem ve meropenem için direnç oranları azaldı. Benzer şekilde, S. maltophilia izolatları trimetoprimsülfametoksazol için düşük direnç oranına sahipti. Metisilin direnç oranı S. aureus için değişmezken, diğer antibiyotik gruplarında minör değişikliklerle karşılaşıldı. Enterokokların ampisilin, vankomisin, teikoplanin ve linezolide duyarlılığında kategorik bir değişiklik gözlenmedi. Sonuç: Hastanemizde YBÜ hastalarından izole edilen gram pozitif bakterilerin ADT sonuçlarını EUCAST kılavuzuna geçiş etkilemedi. Ancak, gram-negatif bakterilerdeki karbapenemler hariç tüm antibiyotik grupları için daha yüksek direnç oranları gözlendi. Sonuç olarak, kullanılan standarda göre güncel epidemiyolojik verilerin takip edilmesi, uygun tedavinin belirlenmesi açısından büyük önem arz etmektedir.

___

1. MacKenzie FM, Gould IM, Bruce J, Mollison J, Monnet DL, Krcmery V. et al. The role of microbiology and pharmacy departments in the stewardship of antibiotic prescribing in European hospitals. J Hosp Infect, 2007; 65 (2): 73-81.

2. Hombach M, Bloemberg GV, Böttger ECJ. Effects of clinical breakpoint changes in CLSI guidelines 2010/2011 and EUCAST guidelines 2011 on antibiotic susceptibility test reporting of Gramnegative bacilli. Antimicrob Chemother. 2012; 67 (3): 622-32.

3. Hombach M, Wolfensberger A, Kuster SP, Böttger EC. Influence of clinical breakpoint changes from CLSI 2009 to EUCAST 2011 antimicrobial susceptibility testing guidelines on multidrug resistance rates of Gram-negative rods. J Clin Microbiol 2013; 51 (7): 2385-87.

4. Wolfensberger A, Sax H, Weber R, Zbinden R, Kuster SP, Hombach M. Change of antibiotic susceptibility testing guidelines from CLSI to EUCAST: influence on cumulative hospital antibiograms. PLoS One. 2013; 8 (11) :e79130.

5. Van der Bij AK, Van Dijk K, Muilwijk J, Thijsen SF, Notermans DW, de Greeff S, et al. Clinical breakpoint changes and their impact on surveillance of antimicrobial resistance in Escherichia coli causing bacteraemia. Clin Microbiol Infect. 2012; 18 (11): 466-72.

6. Hawser SP, Badal RE, Bouchillon SK, Hoban DJ, Hsueh PR. Comparison of CLSI 2009, CLSI 2010 and EUCAST cephalosporin clinical breakpoints in recent clinical isolates of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca from the SMART Global Surveillance Study. Int J Antimicrob Agents. 2010; 36 (3): 293-94.

7. Gür D, Gülay Z, Akan OA, Aktaş Z, Kayacan CB, Cakici O, et al. Resistance to newer betalactams and related ESBL types in gram-negative nosocomial isolates in Turkish hospitals: results of the multicentre HITIT study. Mikrobiyol Bul 2008; 42 (4): 537-44.

8. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2017. M100 Performance standards for antimicrobial susceptibility testing: 27rd informational supplement. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA.

9. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 7.1, 2017. http://www.eucast.org.

10. Giani T, Morosini MI, D’Andrea MM, GarcíaCastillo M, Rossolini GM, Cantón R. Assessment of the Phoenix™ automated system and EUCAST breakpoints for antimicrobial susceptibility testing against isolates expressing clinically relevant resistance mechanisms. Clin Microbiol Infect. 2012; 18: (11): 452-58.

11. Marchese A, Esposito S, Barbieri R, Bassetti M, Debbia E. Does the adoption of EUCAST susceptibility breakpoints affect the selection of antimicrobials to treat acute community-acquired respiratory tract infections? BMC Infect Dis. 2012; 12 (16): 181.

12. Rodríguez-Martínez JM, Briales A, Velasco C, Díaz de Alba P, Martínez-Martínez L, Pascual A. Discrepancies in fluoroquinolone clinical categories etween the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) and CLSI for Escherichia coli harbouring qnr genes and mutations in gyrA and parC. J Antimicrob Chemother. 2011; 66 (6): 1405-07.

13. Masterton RG. The new treatment paradigm and the role of carbapenems. Int J Antimicrob Agents. 2009; 33 (2): 105-10.

14. Rodríguez-Baño J, Picón E, Navarro MD, LópezCerero L, Pascual A, ESBL-REIPI Group. Impact of changes in CLSI and EUCAST breakpoints for susceptibility in bloodstream infections due to extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli. Clin Microbiol Infect. 2012; 18 (9): 894-900.

15. Wang P, Hu F, Xiong Z, Ye X, Zhu D, Wang YF et al. Susceptibility of extended- spectrum- betalactamase- producing Enterobacteriaceae according to the new CLSI breakpoints. J Clin Microbiol. 2011; 49 (9): 3127-131.

16. Polsfuss S, Bloemberg GV, Giger J, Meyer V, Hombach M. Comparison of European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) and CLSI screening parameters for the detection of extended-spectrum β-lactamase production in clinical Enterobacteriaceae isolates. J Antimicrob Chemother. 2012; 67 (1): 159-66.

17. Kaki R, Elligsen M, Walker S, Simor A, Palmay L, Daneman N. Impact of antimicrobial stewardship in critical care: a systematic review. J Antimicrob Chemother. 2011; 66 (6): 1223-230.

18. Kassim A, Omuse G, Premji Z, Revathi G. Comparison of Clinical Laboratory Standards Institute and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing guidelines for the interpretation of antibiotic susceptibility at a University teaching hospital in Nairobi, Kenya: a cross-sectional study. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2016; (11): 15-21.
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi-Cover
  • ISSN: 0377-9777
  • Başlangıç: 1938
  • Yayıncı: Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
Sayıdaki Diğer Makaleler

Ensefalitli ve anemili koyunda Chaphamaparvovirüs’ün ilk keşfi

Eda ALTAN, Eric DELWAR, Gilberto SABINO-SANTOS JR, Patricia PESAVENTO

Kandan izole edilen Enterococcus türlerinde biyofilm oluşumunun fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

Yeliz Tanriverdi Çaycı, Asuman BIRINCI, Kemal BILGIN, Zeynep ÖZKÖK

Brucella Coombs jel testi: Brusellozun serolojik tanısında hızlı bir test olarak diğer serolojik yöntemlerin yerini alabilir mi?

Begüm Nalça ERDIN, Mehmet PARLAK, Ayşe GÜVEN AYDINLI, Feyza DEMIR

Association between T3, T4, and TSH hormones proportion and Toxoplasma gondii anti-IgG seroprevalence in patients suffering from clinical and drug-controlled thyroid dysfunctions in southeastern Iran

Vahid RAISSI, Gita ALİZADEH, Fatemeh BAYAT, Elham AKHLAGHİ, Muhammad GETSO, Omid RAIESI, Ali ABDOLLAH, Asma İBRAHİM, Sakineh AKBARİ, Zahra NAVİ, Soudabeh ETEMADI

COVID-19 küresel salgınının toplumsal etkileri

Kemal ATAMAN, Erol GÖKA, Veysel BOZKURT, Mustafa Necmi İLHAN, Nuran YILDIRIM, Berkay VURAN

CLSI’den EUCAST’a geçiş: Antibiyotik duyarlılık testlerimiz nasıl etkilenecek

Gülşen HAZIROLAN

Transition from CLSI to EUCAST: How our antibiotic susceptibility tests will be affected

GÜLŞEN HAZIROLAN

COVID-19 pandemisinde SARS-CoV-2 ve İnfluenza koinfeksiyonu

Mehmet Sami İSLAMOĞLU, Betül BORKU UYSAL

Birinci Dünya Savaşı’nda Kafkas Cephesi’nde sağlık hizmetleri ve Erzurum’da ilk tifüs aşısı uygulamaları

Figen KAYSERILI ORHAN

Türkiye’de paketli glutensiz ürünlerin besin ögesi ve fiyat analizleri üzerine bir çalışma

Alev KESER, Esra TUNÇER, Mahmut BODUR