Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının OLR1 gen polimorfizminin araştırılması

Amaç: Sunulan çalışmada farklı sığır ırkları arasındaki OLR1 gen polimorfizmi araştırılmıştır. Gereç ve Yöntem: Türkiye'nin değişik bölgelerinden rastgele seçilmiş Boz Irk (BI), Yerli Kara (YK) ve Güney Anadolu Kırmızısı (GAK) ırklarından alınan 147 kan örneği kullanıldı. Kan örneklerinden standart fenol/kloroform yöntemiyle DNA izolasyonu yapıldı. Elde edilen DNA'ların OLR1 gen bölgesinin 270 baz çift (bç) lik fragmenti PZR yöntemi ile yükseltendi. PZR işleminden sonra örneklere PstI restriksiyon enzimi ilave edildi ve kesim işleminden sonra jelde bant uzunlukları görüntülendi. Bulgular: Genotiplemesi yapılan verilerin allel ve genotip frekansları ki-kare ($x^{2}) testi ile değerlendirildi. Anlamlılık seviyesi 0.05 alındı. HardyWeinberg dengesine göre, BI sığır populasyonunun HW dengesinden saptığı gözlendi. GAK ve YK sığır ırklarının ise HW dengesinde olduğu ve ırkların birbirine benzerlik gösterdiği tespit edildi. Öneri: Süt yağı verimi ve süt yağı oranı üzerine etkisi olan OLR1 genindeki polimorfik bölgenin; diğer sığır ırkları da kullanılarak ve sütün benzer özelliklerine etki ettiği düşünülen farklı polimorfik bölgelerle birlikte çalışılarak daha yarar sağlayabileceği düşünülmektedir.

Investigation of OLR1 gene polymorphism of various cattle breeds in Turkey

Aim: The objective of this study was investigation of OLR1 gen polymorphism among different cattle breeds in Turkey. Materials and Methods: A total of 147 blood samples were collected from Anatolian Grey (AG), Anatolian Black (AB) and South Anatolian Red (SAR) cattle breeds and DNAs were isolated. PCR-RFLP method was used to determine allele types. Genotype and allele frequencies were calculated after genotyping. Results: Results are evaluated by square test ($x^{2}$). The significance level was taken as 0.05. While AG cattle breed deviated from HW equilibrium, SAR and AB cattle breeds were on the HW equilibrium and they are similar to each other. Conclusion: It is thought that the effect of polymorphic region in OLR1 gene on milk fat and the ratio of milk fat will be more efficient by studying with various polymorphic areas, and by using other cattle races that they have effects on similar characteristics of milk.

PDF

___

Akman N, Özkütük K, Kumlu S, Yener SM, 2011. Türkiye’de sığır yetiştiriciliği ve sığır yetiştiriciliğinin geleceği. Erişim tarihi: 12.05.2011. Brown TA, 2002. Genomes 2. Garland Sci, Wiley-Liss, USA.
Don RH, Cox PT, Wainwright BJ, Baker K, Mattick JS, 1991. Touchdown PCR to circumvent spurious priming during gene amplification. Nucleic Acids Res, 19, 4008.
Elmacı C, Öner Y 2007. Et sığırcılığında moleküler genetik yaklaşımlar. Hayvansal Üretim, 48, 45-48.
Georges M, Nielsen D, Mackinnon M, Mishra A, Okimoto R, Pasquino AT, Sargeant LS, Sorensen A, Steele MR, Zhao X, Womack JE, Hoeschele I, 1995. Mapping quantitative trait loci controlling milk production in dairy cattle by exploiting progeny testing. Genetics, 139, 907-920.
Haldene JBS, 1954. An exact test for randomness of mating. Department of Biometry. University College, London, UK.
Khatib H, Leonard D, Schutzkus V, Luo W, Chang YM, 2006. Association of the OLR1 gene with milk composition in Holstein Dairy Cattle. J Dairy Sci, 89, 1753-1760.
Khatib H, Rosa GJM, Weigel K, Schiavini F, Santus E, Bagnato A,2007. Additional support for an association between OLR1 and milk fat traits in cattle. Anim Genet, 38, 308-310.
Kiraz S, Ekinci MS, Özköse E, Akyol İ, 2007. Genetik polimorfizmin belirlenmesinde kullanılan moleküler teknikler. 5. Ulusal Zootekni Bilim Kongresi. Yüzüncü Yıl Üni. 5-8 Eylül 2007, Van, Türkiye.
Komisarek J, Dorynek Z, 2009. Effect of ABCG2, PPARGC1A, OLR1 and SCD1 gene polymorphism on estimated breeding values for functional and production traits in Polish Holstein-Friesian bulls. J Appl Genet, 50, 125-132.
Miller MP, 1997. Tools for population genetic analyses. TFPGA, 1, 3.
Primrose SB, Twyman RM, 2006. Principles of gene manipulation and genomics, 7th edition, Malden, Blackwell, USA.
Schennink A, Bovenhuis H, Leon-Kloosterziel K.M, Arendonk M, Visker W 2009. Effect of polymorphisms in the FASN, OLR1, PPARGC1A, PRL and STAT5A genes on bovine milk-fat composition. Anim Genet, 40, 909-916.
Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T, 1989. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Erişim tarihi: 25.08.2011.
Ünal RN, Besler H, 2006. Beslenmede sütün önemi, Sinem Matbası, Türkiye, pp:1-46.
Weller JI, 2009. Quantitative trait loci analysis in animals, Modular Texts, Cambridge, USA.