MEHMET PARLAK, Yasemin BAYRAM, AYTEKİN ÇIKMAN, Mustafa BERKTAŞ

Kan ve dışkı örneklerinden izole edilen Salmonella ve Shigella suşları ve antibiyotiklere direnç oranları

Diğer Gram negatif bakteri türlerinde olduğu gibi Salmonella ve Shigella izolatlarının antibiyotik direnç oranlarında artışa da dikkat çekilmektedir. Çalışmada kan ve dışkı örneklerinden soyutlanan Salmonella ve Shigella cinsi bakterilerin serovarlarının ve türlerinin dağılımı ve çeşitli antibiyotiklere direnç durumunun belirlenmesi amaçlanmıştır. 2006-2011 yılları arasında kan ve dışkı örneklerinden elde edilen 46 Salmonella ve 21 Shigella cinsi bakteriye ait identifikasyon ve antibiyogram sonuçları geriye dönük olarak incelenmiştir. Kan kültür örnekleri BacT/Alert (bioMérieux, France) otomatize sistemde inkübe edilmiştir. Dışkı örnekleri selenit-F besiyerinde sekiz saat inkübasyondan sonra EMB agara ve SS agara ekilmiş ve 37°Cde 18-24 saat kültürü yapılmıştır. Suşlarının tür düzeyinde identifikasyonu ile antibiyotik duyarlılık testlerinde BD Phoenix (Becton Dickinson, USA) otomatize mikrobiyoloji sisteminden yararlanılmıştır. Çalışmaya dahil edilen Salmonella suşlarının 21i S.Typhi, 20si Salmonella spp., 4ü S.Paratyphi A, biri S.Choleraesuis olarak tanımlanmıştır. Shigella suşlarının 12si S.flexneri, 6sı S.boydii, 2si S.sonnei ve biri S.dysenteriae olarak belirlenmiştir. Salmonella ve Shigella suşlarına en etkili antibiyotikler sırasıyla siprofloksasin, seftazidim ve sefotaksim olarak bulunmuştur. Çalışmamızda Salmonella ve Shigella infeksiyonlarının tedavisinde önerilen birinci basamak ilaçlar olan kinolonlara ve diğer antibiyotiklere karşı direnç oranları düşük olarak bulunmuştur. Ampirik antibiyotik tedavisine yön vermesi ve dirençli suşların neden olduğu infeksiyonların önüne geçebilmek için antimikrobiyal direncin izlendiği buna benzer çalışmaların periyodik olarak bildirilmesi önem taşımaktadır.

Salmonella and Shigella strains isolated from blood and stool samples and their antibiotic resistance rates

Increased antibiotic resistance rates of Salmonella and Shigella isolates draw attention like with other Gram negative species. In this study we aimed to determine the serotype distribution and resistance rates to various antibiotics of Salmonella and Shigella strains isolated from blood and stool samples. Identification and antibiogram results of 46 Salmonella and 21 Shigella strains isolated between 2006 and 2011 were retrospectively examined. Blood culture samples were incubated in the BacT/Alert (bioMérieux, France) automated system. After incubation on selenit-F medium, stool samples were cultured onto EMB and SS agar at 37°C for 18-24 h. For species identification and antibiotic susceptibility tests, BD Phoenix (Becton Dickinson, USA) Automated Microbiology System was utilized. Of the 46 Salmonella isolates 21 were identified as S.Typhi, 20 were Salmonella spp., 4 were S.Paratyphi A, 1 was S.Choleraesuis. The 21 Shigella strains were identified as 12 S.flexneri, 6 S.boydii, 2 S.sonnei and 1 S.dysenteriae. Ciprofloxacin, ceftazidim and cefotaxim were found to be the most effective antibiotics against Sallmonela and Shigella strains. Salmonella and Shigella isolates resistance rates to quinolones recommended first-line drugs and to other antibiotics were found low. It is important that studies similar to this one should be undertaken periodically in order to guide empiric antibiotic therapy and prevent infections caused by resistant strains.

PDF

___

1.Alıcı Ö, Açıkgöz ZC, Gamberzade Ş, Göçer S, Karahocagil MK. Dışkı kültürlerinden 1999-2003 yılları arasında izole edilen Shigella türleri ve antibiyotiklere direnç oranları, Mikrobiyol Bul 2006;40(1):9-14. PMid:16775951
2.Bakıcı Z, Çakmaktepe S, Güney A. Bölgemizden soyutlanan Salmonella ve Shigella bakterileri ve antibiyotik duyarlılıkları, Cumhuriyet Üniv Tıp Fak Derg 2001;23(3):141-4.
3.Balcı İ, Alkan GN, Bayram A. Kan kültürlerinde Salmonella sıklığı ve antibiyotik duyarlılıkları, Van Tıp Derg 1999;6(4):25-7.
4.Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; Twenty-first informational supplement; CLSI document M 100-S20, CLSI, Wayne, Pennsylvania (2011).
5.Crump JA, Mintz ED. Global trends in typhoid and paratyphoid fever, Clin Infect Dis 2010;50(2): 241-6. http://dx.doi.org/10.1086/649541 PMid:20014951 PMCid:2798017
6.Çiçek A, Kuzucu Ç, Durmaz R. Bir yıl içerisinde kan kültürlerinden infeksiyon etkeni olarak izole edilen bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları, ANKEM Derg 2006;20(1):13-7.
7.Çiftci İH, Aktepe OC, Altındiş M, Çetinkaya Z, Aşık G, Çalışkan K. Shigella türlerinde antimikrobiyal direnç değişimi: Sekiz yıllık izlem, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2010;40(2):125-30.
8.Demirtürk N. Akut ishalli olguların değerlendirilmesi: 2 yıllık izlem, ANKEM Derg 2004;18(1):24-7.
9.Gülay Z. Gram negatif çomaklarda antibiyotik direnci: 2003-2004 Türkiye haritası, ANKEM Derg 2005;19(Ek 2):66-77.
10.Gündüz T, Tünger Ö, Sürücüoğlu S, Özbakkaloğlu B. Manisa bölgesinde soyutlanan Salmonella ve Shigella suşlarının antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002;32(3-4):216-9.
11.Harish BN, Menezes GA. Antimicrobial resistance in typhoidal salmonellae, Indian J Med Microbiol 2011;29(3):223-9. http://dx.doi.org/10.4103/0255-0857.83904 PMid:21860101
12.Koneman E, Winn W, Alen S et al. Enterobacteria- ceae, Konemans Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology, 6th Edition s.211-302, Lippincott Willams & Wilkins, Philadelphia, PA (2006).
13.Niyogi SK. Shigellosis, J Microbiol 2005;43(2):133- 43. PMid:15880088
14.Pullukçu H, Aydemir Ş, Sipahi OR, Yamazhan T, Tünger A. 1999-2006 yılları arasında dışkı kültürlerinden izole edilen 439 Shigella kökeninin tür dağılımı ve antibakteriyel direnç durumları, ANKEM Derg 2007;21(3):137-41.
15.Ryan KJ, Ray CG (Eds). Enterobacteriaceae. In: Sherris Medical Microbiology. Fifth edition, p:579- 608, McGraw-Hill Companies, International Edition (2010).
16.Sürücüoğlu S, Tünger Ö, Özbakkaloğlu Ö, Gazi H, Değerli K, Aydemir Ş. Salmonella suşlarında antimikrobiyal direncin ve geniş spektrumlu beta- laktamaz üretimin araştırılması, ANKEM Derg 2001;15(1):40-5.
17.Yazıcı V, Gültekin B, Aydın N, Aral YZ, Aydoğdu A, Karaoğlu AÖ. Akut gastroenteritli olguların dışkı örneklerinde bazı bakteri ve virüslerin araştırılması, ANKEM Derg 2009;23(2):59-65.
18.Yegane Tosun S, Demirel M, Benzergil S. Çocuklardan izole edilen Salmonella suşlarının antibiyotik duyarlılıkları, ANKEM Derg 2003; 17(1):42-5.
19.Zer Y, Karaoğlan İ, Kılıç İH, Karagöz DI, Namıduru M. Kan kültürlerinden izole edilen Salmonella izolatlarında tigesiklinin in-vitro etkinliği ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretimi araştırılması, ANKEM Derg 2008;22(4):198-202.