2021

Gram negatif bakterilerde antibakteriyal direncin fenotipik yöntemler ile tayin ve bildirimi

İn-vitro olarak antibiyotik duyarlılık testleri, bakteriyel patojenin bir antibiyotiğin tedavisi sırasında ulaşılan in-vivo düzeylerine duyarlı olup olmadığının değerlendirilmesi amacıyla uygulanmaktadır. Rutin duyarlılık testlerinde bazı direnç mekanizmaları gözden kaçabilmekte; bu gibi durumlarda bazı ek testler gerekebilmektedir. Uygulanan ek testler sayesinde antibiyotiğe karşı oluşmuş direnç mekanizması tahmin edilebilir. Bu testler ayrıca direnç mekanizmasından etkilenen diğer antibiyotiklerin duyarlılıklarını saptamada yol gösterir. Duyarlılık testlerinin standart bir yöntemle uygulanması, sonuçlarının yorumlanması ve uygun raporlanması ile tedavi başarısızlıkları en aza indirilebilmektedir. Bu derlemede Gram negatif bakterilerde genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz tarama ve tanı testleri ile bildirimleri, AmpC beta-laktamaz tanı testleri ve karbapenemazların tarama, tanı testleri ve bildirimi üzerine güncel bilgiler sunulmuştur

Detection and reporting of antibacterial resistance using phenotypic methods in Gram negative bacteria

In vitro antibiotic susceptibility testing is applied in order to determine whether the bacterial pathogens are sensitive to the in vivo levels that were achieved during treatment. In routine susceptibility tests, some resistance mechanisms may not be noticed; some additional tests may be needed in such cases. The resistance mechanisms can be estimated through additional tests. These tests indicate how to determine the sensitivity of the other antibiotic that are affected by the resistance mechanisms. Treatment failures can be reduced by a standard method implementation of the susceptibility tests, interpretation and appropriate reporting of the results. The interpretation and reporting of the antibiotic susceptibility results is the task of the clinical microbiology specialist who made the tests. In this review, current information about the screening, detection and reporting of extended-spectrum beta-lactamases, AmpC beta-lactamases and capbapenemases in Gram negative bacteria are presented.

PDF

___

1.Akçam FZ, Gönen İ, Kaya O, Yaylı G. Hastane infeksiyonu etkeni çeşitli Gram negatif bakteriler - de geniş spektrumlu beta-laktamaz yapımının iki yöntemle karşılaştırılması, Klimik Derg 2004; 17(1):47-9.
2.Akyar I, Kocagöz S, Kocagöz T ve ark. Beş yılda izole edilen 15434 Escherichia coli ve 3178 Klebsiella spp. suşunda genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretiminin yıllara, kliniklere ve örnek türlerine dağılımı, ANKEM Derg 2010; 24(1):34-41.
3.Albayrak GT. Hastane infeksiyonu etkeni olan Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde çift disk sinerji testi ve kombine çift disk sinerji ile metallo- beta-laktamaz varlığının araştırılması, Uzmanlık Tezi, Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul (2008).
4.Balıkçı A. Escherichia coli ve Klebsiella cinsi bakterilerde plazmidik AmpC tipi beta-laktamaz direnci, Uzmanlık Tezi, İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul (2007).
5.Bradford PA. Extended-spectrum beta-lactamase in the 21st century: Characterization, epidemiology and detection of this important resistance threat, Clin Microbiol Rev 2001;14(4):933-51. http://dx.doi.org/10.1128/CMR.14.4.933-951.2001 PMid:11585791 PMCid:89009
6.Bush K, Jacoby GA, Medeiros AA. A functional classification scheme for beta-lactamases and its correlation with molecular structure, Antimicrob Agents Chemother 1995;39(6):1211-33. http://dx.doi.org/10.1128/AAC.39.6.1211 PMid:7574506 PMCid:162717
7.Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial suscepti - bility testing, Twenty-first Informational Supplement, CLSI Document M100-S20, CLSI, Wayne PA (2011).
8.Çelebi S, Yüce N, Çakır D, Hacımustafaoğlu M, Özkaya G. Çocuklarda genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten E.coli infeksiyonlarında risk faktörleri ve klinik sonuçları; beş yıllık çalışma, Çocuk Enf Derg 2009;3(1):5-10.
9.Decre D, Burghoffer B, Gautier V, Petit JC, Arlet G. Outbreak of multi-resistant Klebsiella oxytoca involving strains with extended-spectrum beta- lactamases and strains with extended-spectrum activity of the chromosomal beta-lactamase, J Antimicrob Chemother 2004;54(5):881-8. http://dx.doi.org/10.1093/jac/dkh440 PMid:15472005
10.Dizbay M, Karakuş R, Arman D. Hastane infeksiyonu etkeni Gram negatif bakterilerde genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz varlığının saptanması (Özet), ANKEM Derg 2000;14(2):136.
11.Dumlupınar B. Antibiyotiklere dirençte yeni eğilimler, Klimik Derg 2001;(2):47-56.
12.Falagas ME, Karageorgopoulos DE. Extendedspectrum beta-lactamase-producing organisms, J Hosp Infect 2009;73(4):345-54. http://dx.doi.org/10.1016/j.jhin.2009.02.021 PMid:19596491
13.Fritsche TR, Sader HS, Toleman MA, Walsh TR, Jones RN. Emerging metallo-beta-lactamasemediated resistances: A summary report from the Worldwide SENTRY Antimicrobial Surveillance Program, Clin Infect Dis 2005;41(Suppl 4):S276-8. http://dx.doi.org/10.1086/430790 PMid:16032565
14.Güdücüoğlu H, Baykal S, İzci H, Berktaş M. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotiklere direnci, ANKEM Derg 2007;21(3):155-60.
15.Gülay Z. Antibiyotik duyarlılık testlerinin yorumu, Türk Toraks Derg 2002;3(1):75-88.
16.Gülay Z. ESBLlerin tanı yöntemleri, Köksal İ (ed): Yeni ve Yeniden Gündeme Gelen İnfeksiyonlar. Genişlemiş Spektrumlu Betalaktamazlar kitabından s.13-26, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara (2004).
17.Gür D. Bakterilerde antibiyotiklere karşı direnç, Topçu AW, Söyletir G, Doğanay M (eds). İnfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi, Cilt 1 kitabında s.243-57, Nobel Tıp Kitabevleri, İstanbul (2008).
18.Gür D. Hastane infeksiyonlarında önem kazanan gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç mekanizmaları, Hastane İnfeksiyon Derg 1997; (1): 38-45.
19.Harada S, Ishii Y, Yamaguchi K. Extended- spectrum beta-lactamases: Implications for the clinical laboratory and therapy, Korean J Lab Med 2008;28(6):401-12. http://dx.doi.org/10.3343/kjlm.2008.28.6.401 PMid:19127103
20.Jacoby G, Bush K. Beta-lactam resistance in 21st century, White DG, Alekshun MN, Mc Dermott PF (eds). Frontiers in Antimicrobial Resistance kitabında s:53-65, ASM Press, Washington (2005).
21.Kaçmaz B, Ece G. Genişlemiş spektrumlu beta- laktamaz saptanmasında ikinci, üçüncü ve dördüncü kuşak sefalosporinlerin çift disk sinerji testinde kullanılması ve sefoksitin duyarlılığı, ANKEM Derg 2010;24(2):61-4.
22.Lee K, Chong Y, Shin HB et al. Modified Hodge test and EDTA synergy tests to screen metallo- beta-lactamase-producing strains of Pseudomonas and Acinetobacter species, Clin Microbiol Infect 2001;(7):88-91. http://dx.doi.org/10.1046/j.1469-0691.2001.00204.x PMid:11298149
23.Lee K, Lim YS, Yong D, Yum JH, Chong Y. Evaluation of the Hodge test and the imipenem- EDTA double disk synergy test for differentiating metallo-beta-lactamase producing isolates of Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp., J Clin Microbiol 2003;41(10):4623-9. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.41.10.4623-4629.2003 PMid:14532193 PMCid:254300
24.Livermore DM. Beta-lactamases in laboratory and clinical resistance, Clin Microbiol Rev 1995;8(4):557-84. PMid:8665470 PMCid:172876
25.Mehli M, Zer Y, Gayyurhan E. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Enterobacteriaceae suşlarında GSBL oluşturmanın ÇDST ve VITEK 2 yöntemleri ile araştırılması, ANKEM Derg 2007;21(2):71-5.
26.Nasim K, Elsayed S, Pitout JDD, Conly J, Church DL, Gregson DB. New method for laboratory detection of AmpCs-lactamases in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, J Clin Microbiol 2004;(42):4799-802. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.42.10.4799-4802.2004 PMid:15472344 PMCid:522373
27.Nordmann P, Cuzon G, Naas T. The real threat of Klebsiella pneumoniae carbapenemase-producing bacteria, Lancet Infect Dis 2009;9(4):228-36. http://dx.doi.org/10.1016/S1473-3099(09)70054-4
28.Nordmann P, Poirel L, Carrër A, Toleman MA, Walsh TR. How to detect NDM-1 producers, J Clin Microbiol 2011;49(2):718-21. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01773-10 PMid:21123531 PMCid:3043507
29.Pitout JD. Infections with extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae: changing epidemiology and drug treatment choices, Drugs 2010;70(3):313-33. http://dx.doi.org/10.2165/11533040-000000000- 00000 PMid:20166768
30.Pitout JD, Nordmann P, Laupland KB et al. Emergence of Enterobacteriaceae producing extended-spectrum-beta-lactamases (ESBLs) in the community, J Antimicrob Chemother 2005; 56(1):52-9. http://dx.doi.org/10.1093/jac/dki166 PMid:15917288
31.Sarı H. Karbapenemlere dirençli Gram negatif basil izolatlarında imipenem-EDTA/ meropenem- EDTA disk yöntemi ve modifiye Hodge test ile metallo-beta-laktamaz varlığının araştırılması, Uzmanlık Tezi, Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Servisi, İstanbul (2005).
32.Taşova Y. Gram negatif enterik bakteri infeksiyonlarının yönetimi, ANKEM Derg 2011;25(2):33-44.
33.Yan JJ, Wu JJ, Tsai SH, Chuang CL. Comparison of the double-disk, combined disk, and E- test methods for detecting metallo-ß-Iactamases in Gram negative bacili, Diagn Microbiol Infect Dis 2004; 49(1):5-11. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicro -bio.2004.01.002 PMid:15135493