ÖZLEM DOĞAN, DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ, SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI

5547

FUNGEMİ OLGULARINDA HIZLI BİR ÖN TANIMLAMA TESTİ:POZİTİF KAN KÜLTÜRÜ ŞİŞESİNDEN YAPILAN DOĞRUDANGERM TÜP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Kandidemi, çoğu merkezde sıklığı gittikçe artan ve mortalitesi yüksek bir klinik tablodur. Kandidemilerde en sık etken genellikle Candida albicans olmakla birlikte, diğer Candida türlerinin sıklığında da merkeze göre değişen artışlar bildirilmektedir. Kandidemi tanısı için altın standart kan kültürüdür ve etkenin kesin tanımlaması kan kültürünün pozitif sinyal vermesinden sonra katı besiyerine pasaj yapılarak üreyen mikroorganizmaların konvansiyonel yöntemlerle tanımlanmasını gerektirmektedir. Öte yandan, maya pozitif kan kültürü şişelerinden doğrudan germ tüp testi (GTT) uygulandığında C.albicans ve Candida dubliniensis bir gün önce tanımlanabilmektedir. Bu durumda uygun antifungal tedavinin daha erken başlanması ve mortalitenin azaltılabilmesi için bir fırsat elde edilebilmektedir. Bu çalışmanın amacı, merkezimizde maya pozitif kan kültürü şişelerinden doğrudan GTT değerlendirilmesinin konvansiyonel yöntemlerle uyumunun araştırılmasıdır. Mikoloji Laboratuvarı'na Ekim 2014-Temmuz 2016 arasında gelen maya pozitif kan kültürü şişeleri çalışmaya alınmıştır. Bu şişelerden doğrudan GTT yapılmış, ayrıca Sabouraud dekstroz agar ve kromojenik agara pasaj yapılarak üreyen koloniler konvansiyonel yöntemlerle tanımlanmıştır. Çalışma süresinde 169 hastaya ait 172 kan kültürü örneği değerlendirilmiş, bunlardan 151'inde (% 87.8) doğrudan GTT testi ile konvansiyonel maya tanımlaması sonuçları tam uyumlu bulunmuştur. Doğrudan GTT pozitif olan 80 örneğin tümünde C.albicans/C.dubliniensis üremesi saptanmış, yanlış pozitiflik gözlenmemiştir. Doğrudan GTT negatif olan 92 örneğin ise 11'inde (% 12) C.albicans/C.dubliniensis bulunmuştur. Dikkati çeken bir nokta, örneklerin % 5.8'inde birden fazla maya türünün saptanmış olmasıdır. Bu örneklerden birinde, doğrudan GTT'nin pozitif bulunmasını takiben, C.albicans ile birlikte flukonazole doza bağlı duyarlı veya dirençli olabilen bir tür olan Candida glabrata üremiştir. Sonuç olarak, maya pozitif kan kültürü şişelerinden doğrudan GTT uygulamasının, konvansiyonel tanımlama yöntemleri ile uyumunun yüksek olduğu görülmüştür. Deneyimli personel varlığında kolay uygulanabilen ve maliyeti düşük bir test olan GTT'nin bu şekilde direkt kullanımı, daha erken dönemde uygun antifungal tedavi seçimine olanak tanıyabilmektedir. Ancak, yanlış negatiflikler gözlenebilmesi ve kan kültüründe birden fazla maya türü üremesi durumunda tedavinin yanlış yönlendirilmesi riskinin bulunması nedeniyle, sonucun ön tanımlama sonucu olarak bildirilmesi ve kesin tanımlama sonucunun konvansiyonel testlerden sonra rapor edilmesinin uygun olduğu görüşüne varılmıştır

A Fast Preliminary Identification Test in Fungemia: Evaluation of Germ Tube Test Directly from Positive Blood Culture Bottles

The incidence of candidemia tends to increase in high risk patient populations in most centers and it presents with high mortality. The causative agent is generally Candida albicans; however, frequency of other Candida species is rising with variations among centers. Blood culture is the gold standard to diagnose candidemia and definitive identification of the causative agent requires positive signal in automated blood culture system, subculture on solid media and examination of growth via conventional methods. When germ tube test (GTT) is perfor-med directly from yeast positive blood culture bottles ("direct GTT"), on the other hand, C.albicans and Candida dubliniensis may be identi-fied one day earlier as compared to the conventional methods, providing an opportunity for an earlier appropriate antifungal therapy and decrease in mortality. The aim of this study was to investigate the correlation of the results obtained by direct GTT with those by conventional identification methods. Yeast positive blood culture bottles that were referred to the Mycology Laboratory within the time period of October 2014 and July 2016 were included the study. GTT was performed directly from the bottles and colonies obtained from subcultures on Sabouraud dextrose agar and chromogenic agar were identified by conventional methods. A total of 172 blood culture specimens from 169 patients were evaluated during the study period. Of these, 151 (87.8 %) were in accordance with conventional identification results. C.albicans/C.dubliniensis grew in all 80 direct GTT positive specimens, (leading to no false positives) and 11 of the 92 (12 %) GTT negative specimens. A remarkable point was the detection of multiple yeast species in 5.8 % of the samples. Importantly, one sample for which direct GTT was found to be positive yielded C.albicans together with Candida glabrata, a species known to be less susceptible or putatively resistant to fluconazole. In conclusion, the results obtained by direct GTT from yeast positive blood culture bottles proved to be well correlated with those of conventional identification methods. This particular utility of GTT, which is an easily implemented and low-cost test, might allow earlier guidance for appropriate antifungal therapy. However reporting direct GTT result as a finding of presumptive early identification and confirmation by conventional identification tests remain of particular significance due to the possibility of false negatives and existence of multiple yeast species that may lead to problems in selection of appropriate antifungal therapy.
PDF

___

  • Alp Ş, Arıkan-Akdağlı S, Gülmez D, Aşçıoğlu S, Uzun Ö, Akova M. Epidemiology of candidaemia in a tertiary care university hospital: 10-year expe- rience with 381 candidaemia episodes between 2001 and 2010, Mycoses 2015;58(8):498-505. http://dx.doi.org/10.1111/myc.12349.
  • Barchiesi F, Orsetti E, Gesuita R, Skrami E, Manso E, and Candidemia Study G. Epidemiology, clini- cal characteristics, and outcome of candidemia in a tertiary referral center in Italy from 2010 to 2014, Infection 2016;44(2):205-13. http://dx.doi.org/10.1007/s15010-015-0845-z.
  • Castanheira M, Messer SA, Rhomberg PR, Pfaller MA. Antifungal susceptibility patterns of a global collection of fungal isolates: results of the SENTRY Antifungal Surveillance Program (2013), Diagn Microbiol Infect Dis 2016;85(2):200-4. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2016.02.009.
  • Chen S, Slavin M, Nguyen Q et al. Active surveil- lance for candidemia, Australia, Emerg Infect Dis 2006;12(10):1508-16. http://dx.doi.org/10.3201/eid1210.060389.
  • Clancy CJ, and Nguyen MH. Finding the "missing 50%" of invasive candidiasis: how nonculture diagnostics will improve understanding of disea- se spectrum and transform patient care, Clin Infect Dis 2013;56(9):1284-92. http://dx.doi.org/10.1093/cid/cit006.
  • Cornely OA, Bassetti M, Calandra T et al. ESCMID* guideline for the diagnosis and management of Candida diseases 2012: non-neutropenic adult patients, Clin Microbiol Infect 2012;18(Suppl):719- 37. http://dx.doi.org/10.1111/1469-0691.12039.
  • Çiçek B, Yılmaz H, Mutlu Yılmaz E, Esen S, Birinci A. Candida epidemiyolojisindeki değişikliklerin araştırılması, Mikrobiyol Bul 2015;49(3):423-31.
  • Dark P, Blackwood B, Gates S et al. Accuracy of LightCycler((R)) SeptiFast for the detection and identification of pathogens in the blood of pati- ents with suspected sepsis: a systematic review and meta-analysis, Intensive Care Med 2015;41(1):21- 33. http://dx.doi.org/10.1007/s00134-014-3553-8.
  • Diekema D, Arbefeville S, Boyken L, Kroeger J, Pfaller M. The changing epidemiology of healthcare-associated candidemia over three deca- des, Diagn Microbiol Infect Dis 2012;73(1):45-8. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2012.02.001.
  • Doğan Ayçık Ö, Gülmez D, Arıkan-Akdağlı S. Kandidemili olgularda eş zamanlı iki Candida türü saptanma insidansı: Hacettepe Üniversitesi Mikoloji Laboratuvarı, 1999-2013 verileri, 8. Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi Kitabı, PP-096, Ankara (2014).
  • Gorton RL, Ramnarain P, Barker K et al. Comparative analysis of Gram's stain, PNA-FISH and Sepsityper with MALDI-TOF MS for the iden- tification of yeast direct from positive blood cultu- res, Mycoses 2014;57(10):592-601. http://dx.doi.org/10.1111/myc.12205.
  • Gülmez D, Doğan Ayçık Ö, Arıkan-Akdağlı S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşların- da önceki ile karşılaştırmalı olarak yeni CLSI direnç sınır değerlerinin triazol duyarlılık katego- rilerinin belirlenmesine etkisi, 1. Ulusal Tıbbi Mikoloji Kongresi Kitabı, P23, Ankara (2014).
  • Hoppe JE, Frey P. Evaluation of six commercial tests and the germ-tube test for presumptive iden- tification of Candida albicans, Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1999;18(3):188-91.
  • Jensen J, Munoz P, Guinea J, Rodriguez-Creixems M, Pelaez T, Bouza E. Mixed fungemia: incidence, risk factors, and mortality in a general hospital, Clin Infect Dis 2007;44(12):e109-14. http://dx.doi.org/10.1086/518175.
  • Karabıçak N, Alem N. Candida türlerinin triazol antifungal duyarlılık profilleri: Antifungal diren- cin belirlenmesinde yeni CLSI türe özgü klinik direnç sınır değerleri ve epidemiyolojik eşik değerlerinin uygulanması, Mikrobiyol Bul 2016;50(1):122-32.
  • Kollef M, Micek S, Hampton N, Doherty JA, Kumar A. Septic shock attributed to Candida infection: importance of empiric therapy and source control, Clin Infect Dis 2012;54(12):1739-46. http://dx.doi.org/10.1093/cid/cis305.
  • Larone DH. Medically Important Fungi: A Guide to Identification, 5. baskı. ASM Press, Washington DC. (2011).
  • Liguori G, Di Onofrio V, Galle F et al. Candida albicans identification: comparison among nine phenotypic systems and a multiplex PCR, J Prev Med Hyg 2010;51(3):121-4.
  • Nguyen MH, Wissel MC, Shields RK et al. Performance of Candida real-time polymerase chain reaction, beta-D-glucan assay, and blood cultures in the diagnosis of invasive candidiasis, Clin Infect Dis 2012;54(9):1240-8. http://dx.doi.org/10.1093/cid/cis200.
  • Orasch C, Marchetti O, Garbino J et al. Candida species distribution and antifungal susceptibility testing according to European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing and new vs. old Clinical and Laboratory Standards Institute clinical breakpoints: a 6-year prospective candida- emia survey from the fungal infection network of Switzerland, Clin Microbiol Infect 2014;20(7):698- 705. http://dx.doi.org/10.1111/1469-0691.12440.
  • Park BR, Kim TH, Kim HR, Lee MK. Comparative analysis of simulated candidemia using two diffe- rent blood culture systems and the rapid identifi- cation of Candida albicans, Ann Clin Lab Sci 2011;41(3):251-6.
  • Pfaller M, Neofytos D, Diekema D et al. Epidemiology and outcomes of candidemia in 3648 patients: data from the Prospective Antifungal Therapy (PATH Alliance(R)) registry, 2004-2008, Diagn Microbiol Infect Dis 2012;74(4):323-31. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2012.10.003.
  • Segal E, Elad D. Candidiasis, "Merz WG,Hay RJ (ed.), Topley and Wilson's Microbiology and Microbial Infections Medical Mycology, baskı" kitabında. p.579-623, Hodder Arnold&ASM Press, London (2005).
  • Sheppard DC, Locas MC, Restieri C, Laverdiere M. Utility of the germ tube test for direct identifi- cation of Candida albicans from positive blood culture bottles, J Clin Microbiol 2008;46(10):3508-9. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01113-08.
  • Terlecka JA, du Cros PA, Orla Morrissey C, Spelman D. Rapid differentiation of Candida albi- cans from non-albicans species by germ tube test directly from BacTAlert blood culture bottles, Mycoses 2007; 50(1):48-51. http://dx.doi.org/10.1111/j.1439-0507.2006.01307.x.
ANKEM Dergisi-Cover
  • ISSN: 1301-3114
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 1986
  • Yayıncı: Antibiyotik ve Kemoterapi Derneği
Arşiv
Sayıdaki Diğer Makaleler

PSEUDOMONAS AERUGINOSA DİRENÇ MEKANİZMALARI: AKTİF POMPA SİSTEMLERİ

Hüseyin Agah TERZİ

SAĞLIK ÇALIŞANLARINDA HEPATİT A, HEPATİT B, HEPATİT C VE HIV İNFEKSİYONU SEROPREVALANSI

Muhammed BEKÇİBAŞI, Ali ÜZEL

FUNGEMİ OLGULARINDA HIZLI BİR ÖN TANIMLAMA TESTİ:POZİTİF KAN KÜLTÜRÜ ŞİŞESİNDEN YAPILAN DOĞRUDANGERM TÜP TESTİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

ÖZLEM DOĞAN, DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ, SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI

YENİ BİR KÜRESEL TEHDİT: ZİKA VİRÜS İNFEKSİYONLARI

SALİH ATAKAN NEMLİ, Tuna DEMİRDAL

ERİŞKİN YAŞ GRUBUNDA KIZAMIK VAKALARININ İRDELENMESİ

AYŞE SAĞMAK TARTAR, Şafak ÖZER BALİN, Yasemin KİRİK, Ayhan AKBULUT, Kutbeddin DEMİRDAĞ