Başnayayla molibden-bakır cevherleşmesi, Orta Anadolu Kristalin Karmaşığı ve/veya Kırşehir Masifi'nin kuzey kesiminde, Yozgat ilinin yaklaşık 15 km güneybatısındaki Paleosen (?) yaşlı granitik kayaçlarla ilişkilidir. Cevherleşme çevresindeki kayaç birimleri kamışcıdere gabrosu, Başnayayla granitoyiti, Beşiktepe volkano-sedimanter serisi ve alüvyonlardır. Başnayayla granitoyiti biyotit granit, mikroklin granit, iki mikalı granit ve andalüsit-sillimanit granit ile felsik dayklardan oluşmaktadır. Kamışcıdere gabrosu ve Başnayayla granitoyiti mafik ve felsik karakterli dayklar tarafından kesilmektedir. Molibden cevherleşmesi Kamışcıdere gabrosu ve Beşiktepe volkano-sedimanter serisi ile çevrelenen Başnayayla granitoyitinin biyotit granit, andalüsit-sillimanit granit ve iki mikalı granit birimleri ile kordiyerit granit, aplit granit ve kuvars damarlarında gözlenmektedir.Bu kayaçlar içinde cevherleşme kuvars-molibden damar/damarcıkları, çatlak-kırıklarda sıvama ve saçınım şeklindedir. Ana cevher mineralleri; molibdenit, kalkopirit, pirit ve manyetittir. Ayrıca, tali olarak kübanit, pirotin, sfalerit, galenit, ilmenit, bomit ve bizmutinit saptanmıştır. İkincil mineraller limonit, hematit, markazit, kalkozin ve kovellindir. Cevherleşme ile ilişkili olarak üç tip alterasyon tespit edilmiştir. Bu alterasyonlar kuvars+feldispat+biyotit, kuvars+feldispat+biyotit+serisit/muskovit ve kuvars+serisit+pirit, mineral birliklerinden oluşmaktadır. Cevherleşme, genellikle kuvars+serisit+pirit zonu ile kuvars+feldispat+biyotit zonu arasında ve kuvars+feldispat+biyotit zonu içerisinde gözlenmektedir. Cevherleşme cevher tipleri, mineralojisi ve alterasyon özellikleri açısından düşük tenörlü porfiri ve/veya ştokvörk (ağsı) molibden-bakır cevherleşmesi olarak tanımlanabilir. Başnayayla porfiri ve/veya ştokvörk (ağsı) molibden-bakır cevherleşmesinin bağlı olduğu Başnayayla granitoyiti, köken ve jeotektonik ortam açısından, literatürdeki benzer cevherleşmelerin yan kayaçlarından farklılıklar göstermektedir. Başnayayla granitoyiti mineralojik-petrografik ve jeokimyasal veriler dikkate alındığında, hem I hem de S-tipi granitlerin özelliklerine sahip olmasına rağmen, S-tipi özellikler daha baskındır. Jeotektonik ortam açısından ise Başnayayla granitoyiti, çarpışmayla eş zamanlı granitlerin özelliklerini yansıtmaktadır.

Başnayayla molybdenum-copper mineralization is related to granitic rocks ofPaleocene age (?) which are located on the northern edge of the Central Anotalian Crystalline Complex and/or Kırşehir Massif, approximately 15 km southwest of Yozgat district. The rock units around the mineralization are; Kamışcıdere gabbro, Başnayayla granitoid, Beşiktepe volkano-sedimentary series and alluvium. Başnayayla granitoid consists of biotite granite, microcline granite, andalusite-sillimanite granite ve two mica granite together with felsic dikes. Kamışcıdere gabbro and Başnayayla granitoid are cut by felsic and mafic veins. Molybdenum-copper mineralization is hosted by biotit granite, andalusite-sillimanite granite and two mica granite with cordierite granite, apljte granite and quartz veins of the Başnayayla granitoid surrounded by Kamışcıdere gabbro and Beşiktepe volkano-sedimentary series. Molybdenum: mineralizations are occured as molybdenite-bearing quartz veins/veinlets, coatings in joints and cracks and, disseminations in the host rock. Main ore minerals are molybdenite, pyrite, chalcopyrite and magnetite. Cubanite, pyrrhotite, sphalerite,-galena, ilmenite,.bomite and bismuthinite are also encountered in traces. Limonite, hematite, marcasite, chalcocite and covellite are occured as secondary minerals. Three types of alterations related to the mineralization were determined and these are quartz+sericite+pyrite, quartz+feldspar+biotite and quartz+feldspar+biotite+sericite/muskovite associations. Molybdenum mineralization is generally seen between quartz+sericite+pyrite and quartz+feldspar+biotite alteration zones and within quartz+feldspar+biotite alteration zone. The mineralizations my be defined as low-grade porphyry and/or stockwork molybdenum-copper type when the ore types, mineralogy and alteration properties are taken into account. Başnayayla granitoid which in volves Başnayayla porphyry and/or stockwork molybdenum-copper mineralization posseses the different properties than those of the host rocks mentioned in the literature from the points of origin and geotectonic environments. On the basis of mineralogical, petrographical and geochemical data, although it has the properties of I- and S-type granites, the properties of the S-type is dominant in the Başnayayla granitoid. From the geotectonic environments point of view, the Başnayayla granitoid possesses the features of the syn-collisional granites.