İnterlökin 1 gen varyantları ve sendromik olmayan mikrotia riski

GİRİŞ ve AMAÇ: Mikrotia küçük ve şekil bozukluğu olan kulak kepçesi ile görülen kongenital bir anomalidir. İnterlökin (IL) 1 enflamasyon ve kıkırdak harabiyeti için önemli bir düzenleyicidir. Bu çalışma Türk mikrotia hastalarında IL-1A (-889) ve IL-1B (-511) varyantlarının ilişkisini değerlendirmeyi amaçlamıştır. YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışmaya mikrotia tanılı 19 hasta ve 40 sağlıklı kontrol dahil edilmiştir. IL-1A (-889) ve IL-1B (-511) varyantları polimeraz zincir reaksiyonu (PZR)- sınırlayıcı parça uzunluk polimorfizm (RFLP) yöntemi ile incelenmiştir. İstatistik analiz için, SPSS 22.0 versiyonu kullanılmıştır. BULGULAR: IL-1A (-889) varyant genotip dağılımı hastalar ve kontrol grubu arasında istatistiksel olarak farklıydı. IL-1A -889 TT genotipi mikrotia hastalarında daha yaygınken, CC genotipi mikrotia hastalarında daha azdı, sırasıyla (p=0.008, p=0.008). Hasta ve kontrol grupları IL-1 (-889) CT+TT durumuna göre karşılaştırıldığında büyük fark saptandı (p=0.003). IL-1A (-889) C alleli mikrotia hastalarında azdı ve T alleli hastalarda çoktu (p=0.005). IL-1B (-511) CT varyant genotip ve allel dağılımı hastalar ve kontrol arasında herhangi istatistiksel fark göstermedi (p>0.05). TARTIŞMA ve SONUÇ: Bildiğimiz kadarıyla literatürde ilk olarak, IL-1A (-889) fonksiyonel varyantın Türk topluluğunda mikrotia ile önemli ilişkisi olduğunu gösterdik.Türkçe Kısa Başlık: Mikrotiada IL-1 gen varyantları

Interleukin-1 gene variants and the risk of non-syndromic microtia

INTRODUCTION: Microtia is a congenital anomaly, manifested by a small and disfigured auricle. Interleukin (IL) 1 is an important mediator of inflammation and cartilage destruction, This study is aimed at investigating association of IL-1A (-889) and IL-1B (-511) variants in a Turkish patient population with microtia. METHODS: Nineteen patients diagnosed with microtia and 40 healthy controls were enrolled to the study. The IL-1A (-889) and IL-1B (-511) variants were evaluated using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. For statistical analysis, SPSS version 22.0 was used. RESULTS: The genotype distribution of the IL-1A (-889) variant was statistically different between the cases and the control group. IL-1A -889 CC genotype was lower in microtia cases while TT genotype was more prevalent in microtia cases, respectively (p=0.008, p=0.008). High difference was also observed when the patient group and the control group were compared according to IL-1 (-889) CT+TT (p=0.003). IL-1A (-889) C allele was lower in microtia patients and T allele was higher in patients (p=0.005). The allele frequency and genotype distribution of IL-1B (-511) CT variant did not show any statistically difference between patients and controls (p>0.05). DISCUSSION AND CONCLUSION: To our knowledge, for the first time in the literature we have demonstrated a significant association of the IL-1A (-889) functional variant with microtia in a Turkish cohort. İngilizce Kısa Başlık: IL-1 gene variants in microtia

___

  • 1. Luquetti DV, Heike CL, Hing AV, Cunningham ML, Cox TC. Microtia: Epidemiology and genetics. Am J Med Genet A 2012;158A:124-39.
  • 2. Cremers CW. Meatal atresia and hearing loss. Autosomal dominant and autosomal recessive inheritance. Int J Pediatr Otorhinolaryngol 1985;8:211-213.
  • 3. Vishnoi M, Pandey SN, Choudhuri G, Mittal B. IL-1 gene polymorphisms and genetic susceptibility of gallbladder cancer in a north Indian population. Cancer Genet Cytogenet 2008;186:63-68.
  • 4. Kruessel JS, Huang HY, Wen Y, Kloodt AR, Bielfeld P, Polan ML. Different pattern of interleukin-1 beta-(IL-1 beta), interleukin-1 receptor antagonist- (IL-1ra) and interleukin-1 receptor type I- (IL-1R tI) mRNA-expression in single preimplantation mouse embryos at various developmental stages. J Reprod Immunol 1997;34(2):103-120.
  • 5. Cortial D, Gouttenoire J, Rousseau CF, et al. Activation by IL-1 of bovine articular chondrocytes in culture within a 3D collagen-based scaffold. An in vitro model to address the effect of compounds with therapeutic potential in osteoarthritis. Osteoarthritis Cartilage 2006;14:631-640.
  • 6. Haroon J, Hussain S, Javed Q. Heritability of IL-1A Gene Promoter Polymorphism in Patients With Coronary Artery Disease: A Trio-Family Study. Lab Med 2015;46:20-25.
  • 7. di Giovine FS, Takhsh E, Blakemore AI, Duff GW. Single base polymorphism at -511 in the human interleukin-1 beta gene (IL1 beta). Hum Mol Genet 1992;1:450.
  • 8. Achyut BR, Srivastava A, Bhattacharya S, Mittal B. Genetic association of interleukin-1beta (-511C/T) and interleukin-1 receptor antagonist (86 bp repeat) polymorphisms with Type 2 diabetes mellitus in North Indians. Clin Chim Acta 2007;377:163-169.
  • 9. Miller SA, Dykes DD, Polesky HF. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Res 1988;16:1215.
  • 10. Maria de Freitas, N Imbronito AV, Neves AC, Nunes FD, Pustiglioni FE, Lotufo RF. Analysis of IL-1A(-889) and TNFA(-308) gene polymorphism in Brazilian patients with generalized aggressive periodontitis. Eur Cytokine Netw 2007;18:142-147.
  • 11. Bioque G, Crusius JB, Koutroubakis I, et al. Allelic polymorphism in IL-1 beta and IL-1 receptor antagonist (IL-1Ra) genes in inflammatory bowel disease. Clin Exp Immunol 1995;102:379-383.
  • 12. http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl.(Accessed July 29,2017)
  • 13. Forrester MB, Merz RD. Descriptive epidemiology of anotia and microtia, Hawaii, 1986-2002. Congenit Anom (Kyoto) 2005;45:119-124.
  • 14. Alasti F, Van Camp G. Genetics of microtia and associated syndromes. J Med Genet 2009;46:361-369.
  • 15. Singh M, Chaudhry P, Asselin E. Bridging endometrial receptivity and implantation: network of hormones, cytokines, and growth factors. J Endocrinol 2011;210:5-14.
  • 16. Kauma S, Matt D, Strom S, Eierman D, Turner T. Interleukin-lp (IL-lb),human leukocyte antigen HLA-DRn, and transforming growth factor-b (TGF-b) expression in endometrium, placenta and placental membranes. Am J Obstet Gynecol 1990;163:1430-1437.
  • 17. Orsi NM. Cytokine networks in the establishment and maintenance of pregnancy. Hum Fertil (Camb) 2008;11:222-230.
  • 18. Goldring MB, Birkhead JR, Sandell LJ, Kimura T, Krane SM. Interleukin 1 suppresses expression of cartilage-specific types II and IX collagens and increases types I and III collagens in human chondrocytes. J Clin Invest 1988;82:2026-2037.
  • 19. Richardson DW, Dodge GR. Effects of interleukin-1β and tumor necrosis factor-α on expression of matrix-related genes by cultured equine articular chondrocytes. Am J Vet Res 2000;61:624-630.
  • 20. Henrotin YE, DeGroove DD, Labasse AH, et al. Effects of exogenous IL-1, TNF-α, IL-6, IL-8 and LIF on cytokine production by human articular chondrocytes. Osteoarthritis Cartilage 1996;4:163-173.
  • 21. Arner EC, Pratta MA. Modulation of interleukin-1-induced alterations in cartilage proteoglycan metabolism by activation of protein kinase C. Arthritis Rheum 1991;34:1006-1013.
  • 22. Ghasemi M, Kashani E, Fayyaz A, Attar M, Shahbazi M. Interleukin-1 alpha variation is associated with the risk of developing preeclampsia. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2015;193:75-78.
  • 23. Sun X, Cai H, Li Z, et al. Association between IL-1β polymorphisms and gastritis risk: A meta-analysis. Medicine (Baltimore) 2017;96:e6001.
Pamukkale Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1309-9833
  • Yayın Aralığı: 4
  • Başlangıç: 2008
  • Yayıncı: Prof.Dr.Eylem Değirmenci
Sayıdaki Diğer Makaleler

Adolesan yaş grubunda adneksiyel kitle nedeniyle opere edilen hastaların analizi: 104 hastalık tek merkez deneyimi

Meryem KURU PEKCAN, AYTEKİN TOKMAK, Özgür AĞLAMIŞ, Kübra AKKAYA, Yasemin TAŞCI

Huntington hastalığında lisan fonksiyonlarının değerlendirilmesi

MURAT GÜLTEKİN, Ruslan BAYRAMOV

İnstabil intertrokanterik femur kırıklarında proksimal femur çivisi ile hemiartroplasti sonuçlarının karşılaştırılması

Mehmet Birol ILGIN, AHMET NADİR AYDEMİR, MURAT SONGÜR, SELÇUK KESER, AHMET BAYAR

Gallstone ileus: Computed tomography findings

FURKAN UFUK, PINAR ÇAKMAK

Çanakkale ili 112 acil sağlık hizmetleri istasyonlarında çalışan personelin afet tıbbı konusundaki bilgi düzeyleri.

Özgür SEVİNÇ, Yusuf GÜNER, Ayşen TİL

Düşük kemik mineral yoğunluğu olan kadınlarda kuramlar üstü modelin egzersiz yapma alışkanlığı kazandırma üzerine etkisinin incelenmesi

NERİMAN TEMEL AKSU, KEMAL ALPARSLAN ERMAN

İnstabil intertrokanterik femur kırıklarında proksimal femur çivisi ile hemiartroplasti sonuçlarının karşılaştırılması.

Ahmet Nadir Aydemir

Klomifen sitrat ile ovulasyon indüksiyonu ve doğal ilişki sonrası ender görülen heterotopik gebelik

İlyas TURAN, ÜMİT ÇABUŞ, Veysel FENKCİ

Tip 1 diyabetli çocukların hastalığa uyumunda eğitimin ve sosyal desteğin etkisi

SEBAHAT ALTUNDAĞ

Erişkin yaş hipospadias onarımında tubularized-incised plate urethroplasty yönteminin etkinliği

Cem BAŞATAÇ