YEŞİM ALPAY, Canan AĞALAR, Nilgün KARABIÇAK, Dilek KILIÇ, SEDAT KAYGUSUZ, ERGİN AYAŞLIOĞLU AÇIKGÖZ, Berrin ESEN

Klinik Örneklerden Elde Edilen Albicans ve Non-albicans Candida Türlerinde Biyofilm Oluşumunun Araştırılması ve Türlere Göre Dağılımı

GİRİŞ ve AMAÇ: Candida türleri, dünya çapında hastane kaynaklı enfeksiyonların önemli nedenleri arasında kabul edilmektedir. Başlıca virülans faktörleri; biyofilm oluşumu, fosfolipaz ve asit proteaz üretimidir. Biyofilm üretimi türleri Candida'lar için önem taşımaktadır ve antifungal direnç ile ilişkilidir. Çalışmada; nonalbicans Candida'lar ve C. albicans türlerinde biofilm oluşumu araştırılmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM: Çalışmaya, klinik örneklerden izole edilen 53 Candida suşu alındı. 37°C'de 48-72 saat inkübasyon sonrası sabouraud dekstroz agarda (SDA) saf olarak üretilen kolonilerin tiplendirilmesinde; mikroskopik değerlendirme, germ tüp testi, ve API ID 32C (bio Mérieux, Fransa) kullanıldı. Tüm şuslarda biyofilm üretimi araştırıldı. Biyofilm varlığı tespiti için glukozlu triptik soy broth (modifiye tüp adherens yöntemi) kullanıldı. BULGULAR: Elli üç Candida suşunun 34'ü (%64,1) C. albicans, 11'i (%20,7) C. parapsilosis, 4'ü (%7,5) C. kefyr, 3'ü (%5,6) C. tropicalis ve 1'i (%1,8) C. glabrata olarak saptandı. Tüm suşlar değerlendirildiğinde; biyofilm oluşumu % 47,2 olarak saptandı. Albicans türü Candida'larda %38,2 oranında, non-albicans Candida'larda ise %63,1 oranında biyofilm oluşumu gözlendi. C albicans suşlarının %38,2'inde (13), C parapsilosis suşlarınn %63,6'sinde (7), C. kefyr suşlarının %50'sinde (2), C. tropicalis suşlarının %66,6'sinde (2) ve bir C glabrata (1) suşunda biyofilm üretimi tespit edildi. Biyofilm pozitifliği gösteren suşların; %96'sının, servis ve yoğun bakımlarda yatmakta olan ve uzun süreli antibiyotik tedavisi alan hastalardan izole edildiği gözlendi. TARTIŞMA ve SONUÇ: Doğada mikrobiyal büyümede ve klinik enfeksiyonların gelişmesinde biyofilm oluşumu büyük önem taşımakta olup, mikroorganizmayı konak savunmasından ve antimikrobiyallerden korumaktadır. İlişkili mikroorganizmalarda antimikrobiyal direnç yüksektir. Son yıllarda invazif uygulamaların artışı ile fungal patojenler için risk artışı da söz konusudur. Nonalbicans kandidemilerin artışı ve biyofilm oluşumu artan antifungal dirence neden olmaktadır. Etken profili ve antimikrobiyal duyarlılıkta epidemiyolojik değişimler göz önüne alındığında Candida suşları da dikkatli şekilde değerlendirilmelidir. Etken dağılımı, biyofilm oluşumu, antifungal duyarlılık durumlarının bilinmesi, uygun tedavinin belirlenmesi, lokal verilerin ışığında ampirik tedavi seçimlerinin doğru yapılması ve sonuçlar açısından yararlı olacaktır.

Investigation of Biofilm Formation in Albicans and Non-Albicans Candida Species Obtained from Clinical Specimens and Distribution by Species

INTRODUCTION:Candida species are one of the important causes of hospital-acquired infections worldwide. Major virulence factors are; biofilm formation, phospholipase and acid protease production. Biofilm production are important for Candida species and associated with antifungal resistance. In the study; Biofilm formation in nonalbicans Candida and C. Albicans species was investigated. MATERIAL and METHOD: Fiftythree Candida species isolated from clinical specimens. Typing of purely produced colonies on sabouraud dextrose agar (SDA) after 48-72 hours incubation at 37° C; microscopic evaluation, germ tube test, and API ID 32C (bio Mérieux, France) were used. In all cases, biofilm production was investigated. Glucose tryptic soy broth (modified tube adherens method) was used to detect biofilm presence. RESULTS: Biofilm formation was observed in 38.2% of albicans Candida species and 63.1% in non-albicans Candida species. Of the thirty three candida species, 34 (64.1%) were C. albicans, 11 (20.7%) were C. parapsilosis, 4 (7.5%) were C. kefyr, 5,6) C. Tropicalis and 1 (1.8%) C. Glabrata were detected. When all species are evaluated; biofilm formation was found to be 47.2%. Biofilm production in C. Albicans 38.2% (13), in C. parapsilosis 63.6% (7), in C. kefyr 50% (2), in C. glabrata (1) was detected. Species showing biofilm positivity; 96% were isolated from patients receiving long-term antibiotic therapy in the service and intensive care unit. DISCUSSION and CONCLUSION: Biofilm formation is very important factor in microbial growth and in the development of clinical infections. It protects the microorganism from host defense and antimicrobials. Antimicrobial resistance is high in bacteria producing biofilms. In recent years, the risk for fungal pathogens has increased within invasive procedures. Non-albicans candidiasis and biofilm formation associated antifungal resistance. Considering the epidemiological changes in the efficacy profile and antimicrobial susceptibility, Candida species should also be evaluated carefully. Distribution of microorganism, biofilm formation, knowledge of antifungal susceptibility, local datas will be useful choices of empirical appropriate treatment.

PDF

___

1.Calderone RA, Clancy CJ. Candida and Candidiasis: ASM Press,Washington, DC, 2012:1-5
2. Mujica MT, Finquelievich JL, Jewtuchowicz V et al. Prevalence of Candida albicans and Candida non-albicans in clinical samples during 1999-2001. Revista Argentina de microbiologia. 2004;36:107-12.
3.Mohandas V, Ballal M. Distribution of Candida species in different clinical samples and their virulence: biofilm formation, proteinase and phospholipase production: a study on hospitalized patients in southern India. Journal of global infectious diseases. 2011;3:4-8.
4.Mukherjee PK, Zhou G, Munyon R et al. Candida biofilm: a well-designed protected environment. Medical mycology. 2005;43:191-208.
5.Crump JA, Collignon PJ. Intravascular catheter associated infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2000;1:1-8.
6.Mukherjee PK, Chandra J. Candida biofilm resistance. Drug resistance updates: reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy. 2004;7:301-9.
7. Ramesh N, Priyadharsini M, Sumathi CS et al. Virulence Factors and Anti Fungal Sensitivity Pattern of Candida Sp. Isolated from HIV and TB Patients. Indian journal of microbiology. 2011;51:273-8.
8. Karabıçak N, Kurtoğlu E, Sovuksu K ve ark. Hastanede Yatan Bir Grup Hastanın Ağız Florasından İzole Edilen Mayaların Tiplendirilmesi ve 'Slime' Üretimlerinin Gösterilmesi. Flora. 2004;1:61-5.
9. Ozkan S, Kaynak F, Kalkanci A ve ark. Slime production and proteinase activity of Candida species isolated from blood samples and the comparison of these activities with minimum inhibitory concentration values of antifungal agents. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. 2005;100:319-23.
10. Matsumoto FE, Gandra RF, Ruiz LS et al. Yeasts isolated from blood and catheter in children from a public hospital of Sao Paulo, Brazil. Mycopathologia. 2002;154:63-9.
11. Tumbarello M, Posteraro B, Trecarichi EM et al. Biofilm production by Candida species and inadequate antifungal therapy as predictors of mortality for patients with candidemia. Journal of clinical microbiology. 2007;45:1843-50.
12. Arslan U, Fındık D. In vitro investigation of virulence factors (proteinase, slime and phospholipase) in clinical isolates of Candida albicans. Turkish Journal of Infection. 2003;17:471- 81.
13. Yakupoğulları Y, Toraman ZA. Çeşitli Klinik Örneklerden Soyutlanan Candida Kökenlerinde Slime Faktörü Üretiminin Araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2004;34:78-181.
14. Kaskatepe B, Yıldız S. Investigation of Association between Slime Production by Candida Spp and Susceptibility to Fluconazole and Voriconazole. Tropical Journal of Pharmaceutical Research. 2013;12:821-5.
15. Branchini ML, Pfaller MA, Rhine-Chalberg J et al. Genotypic variation and slime production among blood and catheter isolates of Candida parapsilosis. Journal of clinical microbiology. 1994;32:452-6.
16. Pfaller MA, Messer SA, Hollis RJ. Variations in DNA subtype, antifungal susceptibility, and slime production among clinical isolates of Candida parapsilosis. Diagn Microbiol Infect Dis 1995;21:9- 14.
17. Agwan V, Butola R, Madan M. Comparison of biofilm formation in clinical isolates of Candida species in a tertiary care center, North India. . Indian Journal of Pathology and Microbiology. 2015;58:475-8.
18. Rishpana MS, Kabbin JS. Candiduria in Catheter Associated Urinary Tract Infection with Special Reference to Biofilm Production. Journal of Clinical and Diagnostic Research 2015;9:11-3.
19. Gulati M, Nobile CJ. Candida albicans biofilms: development, regulation, and molecular mechanisms. Microbes and Infection. 2016;18:310- 321.
20. Senet JM. Candida adherence phenomena, from commensalism to pathogenicity. International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology. 1998;1:117-22.
21. Ozkan S, Kaynak F, Kalkanci A et al. Slime production and proteinase activity of Candida species isolated from blood samples and comparison of these activities with minimum inhibitory concentration values of antifungal agents. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. 2005;100:319-24. .
22. Pfaller MA, Jones RN, Messer SA et al. National surveillance of nosocomial blood stream infection due to species of Candida other than Candida albicans: frequency of occurrence and antifungal susceptibility in the SCOPE Program. SCOPE Participant Group. Surveillance and Control of Pathogens of Epidemiologic. Diagnostic microbiology and infectious disease. 1998;30:121- 9.