Asya Filinde (Elephas maximus) Biglikanın Tanımlanması, Karakterizasyonu ve Ekspresyon Analizi

Bu çalışmanın amacı Asya filinde biglikan kodlayan sekans ve sonuçlanan amino asit sekansı ile farklı dokulardaki ekspresyonunu araştırmak ve yara iyileşmesindeki durumunu incelemektir. Elde edilen sonuçlar Asya fili biglikan kodlayan sekansın 1110 baz çifti (Ulaşım Numarası: JQ753329) olduğunu ve 369 amino asit kodladığını göstermiştir. Asya ve Afrika filleri arasında kodlama ve amino asit sekansları birbirleriyle sırasıyla %99 ve %98 oranında benzerlik gösterdi. Biglikan proteinde korunmuş domainin varlığı gözlemlendi. Ayrıca biglikan ekspresyonu 15 farklı dokuda tespit edilirken kıkırdak ve dalakta baskın olarak eksprese edildiği belirlendi. Yara iyileşmesindeki ekspresyon analizinde biglikan mRNA seviyesinin yaş, yara tipi ve devresi gibi birçok faktör tarafından etkilendiği tespit edildi.

Identification, Characterization and Expression Analysis of Biglycan in Asian Elephant (Elephas maximus)

The aims of this study were to investigate the coding sequence and the deduced amino acid sequence of Asian elephant's biglycan gene as well as its expression in different tissues and conditions using wound healing as a model. The results showed that Asian elephant biglycan coding sequence was 1,110 base pair (bp) long (accession number: JQ753329), encoding 369 amino acids. The coding and amino acid sequences between Asian and African elephants revealed 99% and 98% similarity, respectively. The conserved domains of biglycan protein were also observed. In addition, its expression was found in 15 tissues with a predominant expression in cartilage and spleen. For expression analysis in the wound healing process, it was found that the level of biglycan mRNA was influenced by many factors, including age, type of wound and stage of wound healing.

___

  • 1. Wildlife Information Network: Elephant: Diseases and treatment. In, Vila-Garcia G, Bourne DC, (Eds): Wildpro. Warwickshire, UK: Wildlife Information Network; 2006.
  • 2. Angkawanish T, Boonprasert K, Homkong P, Sombutputorn P, Mahasawangkul S, Jansittiwate S, Keratimanochaya T, Clausen B: Elephant health status in Thailand: The role of mobile elephant clinic and elephant hospital. Gajah, 31, 15-20, 2009.
  • 3. Nastase MV, Young MF, Schaefer L: Biglycan: A multivalent proteoglycan providing structure and signals. J Histochem Cytochem, 60 (12): 963-975, 2012. DOI: 10.1369/0022155412456380
  • 4. Wadhwa S, Embree MC, Bi Y, Young MF: Regulation, regulatory activities, and function of biglycan. Crit Rev Eukaryot Gene Expr, 14 (4): 301- 315, 2004. DOI: 10.1615/CritRevEukaryotGeneExpr.v14.i4.50
  • 5. Boykiw R, Sciore P, Reno C, Marchuk L, Frank CB, Hart DA: Altered levels of extracellular matrix molecule mRNA in healing rabbit ligaments. Matrix Biol, 17 (5): 371-378, 1998. DOI: 10.1016/S0945-053X(98)90089-0
  • 6. Westermann D, Mersmann J, Melchior A, Freudenberger T, Petrik C, Schaefer L, Lullmann-Rauch R, Lettau O, Jacoby C, Schrader J, BrandHerrmann SM, Young MF, Schultheiss HP, Levkau B, Baba HA, Unger T, Zacharowski K, Tschope C, Fischer JW: Biglycan is required for adaptive remodeling after myocardial infarction. Circulation, 117 (10): 1269-1276, 2008. DOI: 10.1161/circulationaha.107.714147
  • 7. Schaefer L, Babelova A, Kiss E, Hausser H-J, Baliova M, Krzyzankova M, Marsche G, Young MF, Mihalik D, Götte M, Malle E, Schaefer RM, Gröne H-J: The matrix component biglycan is proinflammatory and signals through Toll-like receptors 4 and 2 in macrophages. J Clin Invest, 115 (8): 2223-2233, 2005. DOI: 10.1172/JCI23755
  • 8. McGinnis S, Madden TL: BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools. Nucleic Acids Res, 32 (suppl_2): W20-W25, 2004. DOI: 10.1093/nar/gkh435
  • 9. Larkin MA, Blackshields G, Brown NP, Chenna R, McGettigan PA, McWilliam H, Valentin F, Wallace IM, Wilm A, Lopez R, Thompson JD, Gibson TJ, Higgins DG: Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics, 23 (21): 2947-2948, 2007. DOI: 10.1093/bioinformatics/btm404
  • 10. Schmittgen TD, Livak KJ: Analyzing real-time PCR data by the comparative CT method. Nat Protocols, 3 (6): 1101-1108, 2008. DOI: 10.1038/nprot.2008.73
  • 11. Wegrowski Y, Pillarisetti J, Danielson KG, Suzuki S, Iozzo RV: The murine biglycan: complete cDNA cloning, genomic organization, promoter function, and expression. Genomics, 30 (1): 8-17, 1995. DOI: 10.1006/geno.1995.0002
  • 12. Bianco P, Fisher LW, Young MF, Termine JD, Robey PG: Expression and localization of the two small proteoglycans biglycan and decorin in developing human skeletal and non-skeletal tissues. J Histochem Cytochem, 38 (11): 1549-1563, 1990. DOI: 10.1177/38.11.2212616
  • 13. Yang CH, Culshaw GJ, Liu MM, Lu CC, French AT, Clements DN, Corcoran BM: Canine tissue-specific expression of multiple small leucine rich proteoglycans. Vet J, 193 (2): 374-380, 2012. DOI: 10.1016/j. tvjl.2012.01.018
  • 14. Roughley PJ, Melching LI, Recklies AD: Changes in the expression of decorin and biglycan in human articular cartilage with age and regulation by TGF-beta. Matrix Biol, 14 (1): 51-59, 1994. DOI: 10.1016/0945- 053X(94)90029-9
  • 15. Guo S, DiPietro LA: Factors affecting wound healing. J Dent Res, 89 (3): 219-229, 2010. DOI: 10.1177/0022034509359125
  • 16. Han G, Ceilley R: Chronic wound healing: A review of current management and treatments. Adv Ther, 34 (3): 599-610, 2017. DOI: 10.1007/s12325-017-0478-y
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6045
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 1995
  • Yayıncı: Kafkas Üniv. Veteriner Fak.
Sayıdaki Diğer Makaleler

Türkiye'de Hayvan Refahı Mevzuatına Tarihsel Bir Bakış

ABDULLAH ÖZEN

Negatif Enerji Dengesiyle Oluşturulmuş Koyun Yağlı Karaciğerinin Ultrasonografik Değerlendirmesi

Wei YANG, Chuang XU, Cheng XIA, Yuanyuan CHEN, Jiasan ZHENG, Xinwei LI, Guowen LIU, Xiaobing LI

Kısraklarda Tek ve Çift Taze Sperm İle Tohumlama Sonrası Uterin İmmun Yanıt

MEHMET CAN GÜNDÜZ, GAMZE EVKURAN DAL, İbrahim KURBAN, ÖZGE TURNA, Zeynep UÇMAK, MELİH UÇMAK, Bilge ÖZSAİT SELÇUK, Evrim KÖMÜRCÜ-BAYRAK, FUNDA YILDIRIM, Damla HAKTANIR YILDIRIM, GÜVEN KAŞIKÇI, Heiner BOLLWEIN

Şişe Burunlu Bir Yunusta (Tursiops truncatus) Patolojik ve Parazitolojik İncelemeler

Sümbül Serap BİRİNCİOĞLU, Süleyman AYPAK, Hamdi AVCI, Birol BİRİNCİOĞLU, Emrah İPEK, Ayşe Nur AKKOÇ

Böbrekte İskemi-Reperfüzyon Hasarında Ticagrelor'un Etkisi: Pleiotropik Etki Geçerli Bir Faktör mü?

MURAT BAĞCIOĞLU, RAMAZAN KOCAASLAN, Mehmet USLU, GÜLNAME FINDIK GÜVENDİ

Gine Tavuklarında (Numida meleagris) Diyete L-glutamin İlavesinin Yumurta Kalitesi, Fertilite ve Bazı Kan Biyokimyasal Değerleri Üzerine Etkisi

Vahid GHOLIPOUR, Mohammad CHAMANI, Habib AGHDAM SHAHRYAR, Ali Asghar SADEGHI, Mehdi AMINAFSHAR

At-Destekli Terapi İçin Ponilerde Atalet Belirleme Teknolojisinin Fizibilite Çalışması

Siriporn PEANSUKMANEE, Nuanlaor THAWINCHAI, Prakaykul KHANPROA, Prayanee KHAMINLUANG

Karacabey Merinosu Koyunlarinda Canlı Ağırlık İle Vücut Ölçüleri Arasındaki İlişkilerin Path Analizi Yaklaşımı İle İncelenmesi

KADRİYE PINAR AMBARCIOĞLU, UFUK KAYA, DOĞUKAN ÖZEN, İSMAYİL SAFA GÜRCAN

Yumuşak Doku Yaralanması Sonrası Ozon Tedavisinin Etkileri ve IGF-1 Seviyesiyle Olan İlişkisi: Rat Modelinde Deneysel Bir Çalışma

SEFER ÜSTEBAY, Ömür ÖZTÜRK, ALİ BİLGE, Döndü Ülker ÜSTEBAY, Aysu Hayriye TEZCAN

Türkiye'de Hayvan Refahı Mevzuatına Tarihsel Bir Bakış

Abdullah ÖZEN