Analysis of genetic polymorphism with microsatellite method in Turkey Local Sheep Breeds

Bu çalışmada, Türkiye’nin Bafra, İvesi, Karayaka, Morkaraman, Sakız ve Türk Merinosu olarak adlandırılan 6 yerli koyun ırkında ırk içi ve ırklar arasındaki genetik ilişki mikrosatellit analizi ile belirlendi. Tüm ırklar OarCP34, MAF65, MAF209 and DYMS1 lokusları için ABI PRISM 310 sekans cihazı kullanılarak tarandı. Elde edilen bütün veriler “Genetix 4.05” ve “Populations 1.0” istatistik programları kullanılarak değerlendirildi. Türk Merinosu ırkının en yüksek heterozigotluğa sahip olduğu belirlendi. En kısa genetik mesafe Sakız ve Morkaraman ırkları arasında gözlendi ve en uzak genetik mesafe ise Türk Merinosu ve İvesi ırkları arasında gözlendi. Sonuç olarak, bu çalışmada Bafra, Sakız, Karayaka, İvesi ve Türk Merinosu isimli Türkiye yerli koyun ırklarında mikrosatellit belirleyicileri kullanılarak genetik karakterizasyon yapıldı.

Türkiye yerli koyun ırklarında genetik polimorfizmin mikrosatelit yöntemi ile analizi

In this study, genetic relationships within and between the sheep breeds of Turkey called Bafra, İvesi, Karayaka, Morkaraman, Sakız and Turkish Merino was determined by microsatellite method. All breeds were screened for OarCP34, MAF65, MAF209 and DYMS1 loci by using ABI PRISM 310 sequencer. The obtained data were evaluated by using “Genetix 4.05” and “ Populations 1.0” statistics programs. It was determined that the Turkish Merino breed had the highest heterozygosity. The shortest genetic distance was found between Sakız and Morkaraman breeds and the longest genetic distance was observed between Turkish Merinos and İvesi sheep breeds. As a result, in this study, genetic characterization in Turkey Local Sheep Breeds called Bafra, Sakız, Karayaka, İvesi and Turkish Merino breeds were made by using microsatellite markers.

___

  • 1. Diez-Tasco’n C, Littlejohn RP, Almeida PAR, Crawford AM: Genetic variation within the Merino sheep breed: Analysis of closely related populations using microsatellite. Animal Genetics, 31, 243-251, 2000.
  • 2. Devrim AK, Kaya N: Genetik polimorfizm ve mikrosatellitler. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 10 (2): 215-220, 2004.
  • 3. Forbes SH, Hogg JT, Buchanan FC, Crawford AM, Allendor FW: Microsatellite evolution in congeneric Mammals: Domestic and bighorn sheep. Mol Bio. Evol, 12 (6): 1106-1113, 1995.
  • 4. Baumung R, Simianer H, Hoffmann I: Genetic diversity studies in farm animals-a survey. J Anim Breed Genet, 121, 361-373, 2004.
  • 5. Secondary Guidelines for Development of National Farm Animal Genetic Resources Management Plans. Measurement of domestic animal diversity (MoDAD): Recommended microsatellite markers. Rome. FAO. 2001. http://dad.fao.org/cgi-bin/getblob.cgi?sid=88ed1a36db578882ebc221aa8ce4f164,50006220, Accessed: 23.09.2011
  • 6. Belkhir K, Borsa P, Chikhi L, Goudet J, Bonhomme F: Genetix 4.00 Windows software population genetics, Laboratoire Genome, Populations, Interactions, University of Montpellier, France, 1996-2000.
  • 7. Soysal MI, Koban E, Özkan E, Altunok V, Bulut Z, Nizamlıoğlu M, Togan I: Evolutionary relation sheep among three native and two crossbreed sheep breeds of Turkey: Preliminary results. Revue Mèd Vèt, 5, 289-293, 2005.
  • 8. Gutierrez-Gil B, Uzun M, Arranz JJ, Primitivo FS, Yıldız S, Çenesiz M, Bayón Y: Genetic diversity in Turkish sheep. Acta Agriculturae Scand Section A, 56, 1-7, 2006.
  • 9. Uzun M, Gutierrez-Gil B, Arranz JJ, Primitivo FS, Saatçi M, Kaya M, Bayón Y: Genetic relationships among Turkish sheep. Genet Sel Evol, 38, 513-524, 2006.
  • 10. Koban E: Genetic diversity native and crossbreed sheep breeds in Anotolia. PhD Thesis, Institute of Science, ODTU, Turkey, 2004.
  • 11. Arranz JJ, Bayo’n Y, San Primitivo F: Genetic variation at micro-satellite loci in Spanish sheep. Small Ruminant Research, 39, 3-10, 2001.
  • 12. Dalvit C, Sacca E, Cassandro M, Gervaso M, Pastore E, Piasentier E: Genetic characterization of Alpine sheep breeds. Acta agriculturae Slovenica, 2, 79-84, 2008.
  • 13. Gutiérrez-Espeleta GA, Kalinowski ST, Boyce WM, Hedrick PW: Genetic variation and population structure in desert bighorn sheep: Implications for conservation. Conservation Genetics, 1, 3-15, 2000.
  • 14. Arora R, Bhatia S: Genetic structure of Muzzafarnagri sheep based on microsatellite analysis. Small Rum Res, 54, 227-230, 2004.
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6045
  • Yayın Aralığı: 6
  • Başlangıç: 1995
  • Yayıncı: Kafkas Üniv. Veteriner Fak.
Sayıdaki Diğer Makaleler

Humik asitlerin koyunlarda rumen ve kan parametreleri ile protozoon sayısı üzerine etkisi

MUHAMMET ALİ TUNÇ, MEHMET AKİF YÖRÜK

Normal ultrasonographic anatomy of the prostate in Kars Shepherd Dogs

SADIK YAYLA, SAVAŞ ÖZTÜRK, ÖZGÜR AKSOY, ENGİN KILIÇ, SAVAŞ YILDIZ

The effects of ginseng and echinacea on some plasma cytokine levels in rats

DENİZ ULUIŞIK, ERCAN KESKİN

The effects of additional glycerol in different feed form on dairy cows

BEHİÇ COŞKUN, FATMA İNAL, EMEL GÜRBÜZ, ESAD SAMİ POLAT, MUSTAFA SELÇUK ALATAŞ

Interaction of mannan oligosaccharide with immune system “transport of MOS in to the lamina propria”

HAYDAR ÖZPINAR, İsmail Hakkı AYDIN, Kirk C. KLASING, İSMAİL HAKKI TEKİNER

Sıcaklık stresi altındaki erken yumurtlama döneminde olan tavukların rasyonlarına E vitamini ve lizin katkısının performans ve yumurta kabuk özellikleri üzerine etkisi

G. Ahmet ÖNOL, Mehmet DAŞKIRAN, ÖZCAN CENGİZ, AHMET NAZLIGÜL, Mustafa SARI

Broyler rasyonlarına humat ile bitki ekstraktı karışımı ilavesinin büyüme performansı, bazı bağışıklık ve serum biyokimya değerlerine etkileri

BEKİR HAKAN KÖKSAL, MEHMET KEMAL KÜÇÜKERSAN

Effects of zinc sulphate on transcaucasian barb, (Capoeta capoeta [guldenstaedt, 1773]) plasma nitric oxide, malondialdehyde and total sialic acid levels

Muhittin YILMAZ, MAHMUT KARAPEHLİVAN, İNAN KAYA

Siyah Alaca ineklerde vücut kondüsyon skorunun embriyo kalitesine etkisi

TUGAY AYAŞAN, Ali ASARKAYA, Hatice HIZLI, Kurtuluş GÖK, Aysun TEKGÜL, Emel KARAKOZAK, Uğur KARA, M. Seymen SEĞMENOĞLU, Serdal ÇOBAN, Hasan MUTLU, NUMAN KILIÇALP

Determination of insulin in rabbit plasma using high-performance liquid chromatography

BİLAL YILMAZ, YÜCEL KADIOĞLU