Figen TÜRK MERT

1510

Örtüaltında yetiştirilen marulda sclerotınıa sclerotıorum populasyonunda genetik çeşitliliğin mikrosatelit markörler ile belirlenmesi

Sclerotinia sclerotiorum sebze yetiştiriciliğinde en yıkıcı patojenlerden biridir.Çanakkalede marul Kasımdan Mart ayına kadar örtü altında yetiştirilmekte, bu dönemlerdışındaki zamanlarda ise hıyar tarımı yapılmaktadır. Her iki bitki türü de hastalık etmenindenetkilenmekte ve yıl boyunca hastalık simptomlarını görmek mümkün olmaktadır. Bu çalışmanınamacı örtüaltında yetiştiriciliği yapılan marul seralarında, S. sclerotiorum un hastalıksimptomlarını gösteren bitkilerden etmeni izole etmek ve izolatlar arasında genetik çeşitliliği PCRyoluyla saptamaktır. Bu çalışmada 18 patojen izolatı, bu izolatlar arasında farklılığı saptamak içinise 8 mikrosatelit primeri kullanılmıştır. (TACA) 10 primeri kullanıldığında tüm izolatlardan aynıbüyüklükte PCR ürünü elde edilmiştir. (GT) 8 primeri kullanıldığında popülasyonda 2 farklıbüyüklükte, (GA)9 , (TATG) 9, ve (GT)10 locuslarında ise 3 farklı büyüklükte allel saptanmıştır.(CATA)25 ve (TTA)9 primerleri kullaınldığında 5er allel saptanırken, (AGAT) 14(AAGC) 4locusunda toplam 6 polimorfik banda rastlanmıştır. Marul populasyonunda yapılan bu çalışmada,izolatlar arasında yüksek oranda polimorfizm olduğu saptanmıştır.

Determination of gen etic variation in the population of sclerotinia sclerotiorum in greenhouse grown lettuce by microsatellite markers

Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops. inÇanakkale, lettuce is cultivated under greenhouses between November until end of March.Afterwards, lettuce is replaced with cucumber. Both are important hosts of the pathogen andinfected plants can be found throughout the year. Here, we tested if polymorphism exists in theis olates collected from the greenhouses. Eighteen isolates were employed in the research. Eightmicrosatellite primer sets were used for this purpose. One of them ((TACA) 10) did not showpolymorphism among the isolates. We found 2 alleles at (GT) 8, 3 alleles at (GA) 9, (TATG)9 , and(GT)10 loci. Five loci were observed at (CATA) 25 and (TTA) 9 alleles. The most obviouspolymorphism existed at (AGAT) 14(AAGC) 4 loci revealing 6 alleles. A high level ofpolymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also withinpopulations from the same greenhouse.
PDF

___

  • Atallah ZK, Larget B, Johnson DA. (2004) High genetic diversity, phenotypic uniformity and evidence of outcrossing in Sclerotinia sclerotiorum in the Columbia basin of Washington State. Phytopathology 94:737 -742.
  • Boland GC, Hall R. (1994) Index of plant hosts of Sclerotinia sclerotiorum . Can J Plant Pathol 2:93 – 108.
  • Carpenter, M. A., Frampton, C. and Stewart, A. 1999. Genetic variation in New Zealand populations of the plant pathogen Sclerotinia sclerotiorum . N.Z. J. Crop Hortic. Sci. 27: 13 -21.
  • Cubeta, M.A. Cody, B. R. Kohli Y. And L. M. Kohn. 1997. Clonality in Sclerotinia sclerotiorum on infected cabbage in Eastern North Carolina.
  • Phtopathology. 87: 1000-1004. Glass, N. L. and Kuldau, G. A. 1992. Mating type and vegetative incompatibility in filamentous ascomycetes. Ann. Rev. Phytopathol. 30: 201 -224.
  • Gaggiotti OE, Lange O, Rassmann K, Gliddon C. (1999) A comparison of two indirect methods for estimating average levels of gene flow using microsatellite data. Mol Ecol 8:1513 - 1520.
  • Kohn LM, Carbone I, Anderson JB. (1990) Mycelial interactions in Sclerotinia sclerotiorum. Exp Mycol 14:255 -267. Kull, L. S. and Pedersen, W. L. 2004. Mycelial compatibility grouping and virulence of Sclerotinia sclerotiorum . Plant Dis. 88: 325 -332.
  • Marciano, P., Dileena, P. and Magro, P. 1983. Oxalic acid, cell wall degrading enzymes and pH in pathogenesis and their significance in the virulence of two Sclerotinia sclerotiorum isolates on sunflower. Physiol. Plant Pathol. 22: 339-345.
  • Malvarez, G., Carbone, I., Grunwald, N. J., Subbarao, K. V., Schafer, M. and Kohn, L. M. 2007. New populations of Sclerotinia sclerotiorum from lettuce in California and peas and lentils in Washington. Phytopathol. 97: 470-483.
  • Mert-Türk, F., Ipek, M., Mermer, D., and Nicholson, P. (2007). Microsatellite and morphological markers reveal genetic variation within a population of Sclerotinia sclerotiorum from oilseed rape in the Çanakkale Province of Turkey. Journal of Phytopathology, 155, 182–187.
  • Mert-Türk, F. ve D. Mermer, “Çanakkale Örtüaltı Marul Yetiştiriciliğinde Sclerotinia sclerotiorum ’un Yaygınlığının ve Miselyal Uyum Gruplarının Saptanması”. MKU Ziraat Fakültesi Dergisi, 9(1 -2), 1 -8, ( 2004).
  • Onaran, A., Yanar, Y. 2007. Tokat ve Amasya Yöresinde Seralarda Hıyarlarda Görülen Beyaz Çürüklük Etmeni Sclerotinia sclerotiorum ’un Yaygınlığı ve Miselyal Uyumluluk Gruplarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri. s.283.
  • Purdy LH. (1979) Sclerotinia sclerotiorum - history, diseases and symptomatology, host range, geographic distribution, and impact. Phytopathology 69:875 - 880.
  • Saitoh K, Togashi K, Arie T, Teraoka T (2006) A simple method for a mini- preparation of fungal DNA. J Gen Plant Pathol 72:348 –350
  • Sexton AC, BJ Howlett. (2004) Microsatellite markers reveal genetic differentiation among populations of Sclerotinia sclerotiorum from Australian canola fields. Curr Genet 46:357 – 365.
  • Sexton AC, Whitten AR, Howlett BJ. (2006) Population structure of Sclerotinia sclerotiorum in an Australian canola field at flowering and stem infection stages of the disease cycle. Genome 49:1408 –1415.
  • Sirjusingh C, Kohn LM. (2001) Characterization of microsatellites in the fungal pathogen, Sclerotinia sclerotiorum. Mol Ecol Notes, 1, 267 – 269.
  • Tok, F.M., Kurt, Ş. 2007. Akdeniz Bölgesi Örtü Altı D omates Bitkilerinden Elde Edilen Sclerotinia sclerotirum İzolatlarının Miselyal Uyum Grubu (MUG) ve Patojenisite Yöntemleriyle Karakterizasyonu. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri s.284.
  • Tozlu, E. Demirci, E. 2008. Erzurum-Pasinler Ovası’nda ayçiçeğinde Sclerotinia sclerotiorum ve S. minor tarafından oluşturulan gövde çürüklüğü hastalığının yaygınlığı, etmenlerin tanılanması ve bazı ayçiçeği çeşitlerinin hastalık etmenlerine reaksiyonu. Bitki Koruma Bülteni, 48(4): 19- 33
Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6819
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Yayıncı: İbrahim TOBİ
Arşiv
Sayıdaki Diğer Makaleler

Meta analiz ile tarımsal verilerin değerlendirilmesi

Zeki DOĞAN, Mehmet ŞELLİ

Saksılı bitkilerin açık alanda kapillar yöntem ile sulanmasında su iletim materyali sayısı ve toprak yapısının su tüketimi üzerine etkileri

Muhammet KARAŞAHİN

Dikenli yılan balığı (mastacembelus mastacembelus, bank&solender 1794)' nın sıcak tütsüleme sonrası aminoasit ve organoleptik kalitesi

İlkan Ali OLGUNOĞLU

Örtüaltında yetiştirilen marulda sclerotınıa sclerotıorum populasyonunda genetik çeşitliliğin mikrosatelit markörler ile belirlenmesi

Figen TÜRK MERT

Çaylarbaşı (Şanlıurfa)'nın çayır vejetasyonu üzerine floristik bir araştırma

Cenap CEVHERİ

Arıcılıkta verim artışı üzerinde etkili olan faktörlerin belirlenmesine yönelik bir araştırma: Tra2 bölgesi örneği

Ayşe SEZGİN, Muhsin KARA