Neslihan EKİNCİ, Mehmet Ali GÜNDOĞDU, Murat ŞEKER, Engin GÜR

Trabzon Hurması (Diospyros kaki L.) ve Artvin Hurması (Diospyros lotus L.) Çöğür Populasyonlarının Genom Hacmi Farklılıklarının Hücre Akış Sitometrisi ile Karşılaştırılması

Hücre Akış Sitometrisi (Flow Cytometry) hücre döngüsünün izlenmesi, ploidi seviyesinin belirlenmesi, genom hacminin ortaya çıkarılması ve ıslah çalışmalarında erken seleksiyon yapılmasına imkân tanıyan gelişmiş bir tekniktir. Trabzon hurması çeşitlerinin çoğaltılmasında genel olarak Diospyros lotus (Artvin hurması) türünden elde edilen çöğür anaçları kullanılmaktadır. Ayrıca, Diospyros kaki türüne ait bazı çeşitlerin de tohumları değişik fidanlıklarda kullanılmaktadır. Bu çalışmada, D. kaki ve D. lotus türlerine ait çöğür populasyonlarında bulunan bitkilerin taze yaprak dokularından elde edilen hücre çekirdekleri propidyum iyodür (DAPI) ile boyanmış ve hücre akış sitometrisi tekniği ile floresant yoğunlukları ölçülmüştür. D. lotus türü D. kaki bitkilerinden daha küçük genom hacmine sahip olmuş ayrıca tür içi varyasyon D. lotus bitkilerinde daha düşük seviyede gerçekleşmiştir. D. kaki bitkilerinde yüksek seviyede varyasyon izlenmiştir. Özellikle buruk olmayan çeşitler (PCNA ve PVNA grubu çeşitler) için anaç olarak kullanılması gereken D. kaki türünde birörnek çöğür oluşturan genotiplere ihtiyaç bulunduğu vurgulanmıştır.

Comparison of Genome Sizes of Persimmon (Diospyros kaki L.) and Caucasian Persimmon (Diospyros lotus L.) Seedling Populations by Using Flow Cytometry

Flow cytometry is an improved technique for following cell cycle, determination of ploidy levels, calculationof genome sizes and early selection of candidates in plant breeding studies. Persimmon is generally propagated by usingDiospyros lotus seedlings in Turkey. Moreover some persimmon varieties can be used for propagation as rootstock seedsources. In this study, fresh leaf tissues of Diospyros kaki and Diospyros lotus seedlings were used for obtaining of cellnuclei then stained by propidium iodide and were used for estimation of floresence intensities. According to the obtainedresults caucasian persimmon seedlings were had smaller genome sizes compare to the persimmon genomes and had lessvariation than persimmons. The relative ploidy level of caucasian persimmon seedlings were diploid where as hexploidsin persimmon seedlings. By this experiment it was emphasized that new genotypes which have uniform rootstockcharateristics for PCNA (Pollination Constant Non Astringent) and PVNA (Pollination Variant Non Astringent)persimmon varieties are needed for better performance in persimmon growing.

PDF

___

Arumuganathan K and Earle ED (1991). Estimation of nuclear DNA content of plants by flow cytometry. Plant Molecular Biology Reporter, 9 (3): 229-233.
Choi Y, Tao R, Yonemori K and Sugiura A (2003). Genomic distribution of three repetitive DNAs in cultivated hexaploid Diospyros spp. (D. kaki and D. virginiana) and their wild relatives. Genes Genetic Systems, 78(4):301-8.
Dolezel J, Dolezelova M and Novak FJ (1994). Flow cytometric estimation of nuclear DNA amount in diploid bananas (Musa acuminata and M. balbisiana). Biologia Plantarum, 36: 351- 357.
Giordani E (2002). Varietal assortment of persimmon in the countries of the Mediterranean area and genetic improvement. First Mediterranean Symposium on Persimmon, University of Florence, 23-24 November 2001, p. 23-37. Faenza – Italy.
Seker M (2001a). Determination of ploidy level and genome size by flow cytometry in cytological studies. Proceedings of the 1st Eurasian Congress on Molecular Biotechnology, s. 257–260. Trabzon, Turkey.
Seker M (2001b). Estimation and comparison of nuclear DNA content of the seedling populations of important citrus rootstocks by flow cytometry. Proceedings of the 1st Eurasian Congress on Molecular Biotechnology, s. 261–264. Trabzon, Turkey.
Seker M, Tuzcu O and Ollitrault P (2003). Comparison of nuclear DNA content of citrus rootstock populations by flow cytometry. Plant Breeding, 122(2): 169-172.
Şeker M (2009). Investigation of isozyme polymorphism and nuclear DNA content variation of free–pollinated peach (Prunus persica L.) seedlings. Acta Horticulturae, 962: 177-183.

Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover

ISSN: 1300-2910
Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
Başlangıç: 1985
Yayıncı: Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi Yayın Ofisi