Cüneyt TAMER, Emre ÖZAN, Bahadır MÜFTÜOĞLU

SARS CoV-2’nin moleküler ve epidemiyolojik yönleri

İnsanoğlu, tarih boyunca çeşitli mikroorganizmalar tarafından meydana getirilen enfeksiyonlardan muzdarip olmuş ve maalesef olmayadevam etmektedir. Bu enfeksiyonlardan bazıları sınırlı bir bölge dehastalıklar meydana getirirken, bazıları ise ciddi epidemilere hattadünyayı etkisi altına alan pandemilere neden olmuştur. Son olarak Coronaviridae ailesinin üyesi olan ve Severe Acute RespiratorySyndrome coronavirus 2 (SARS CoV-2) olarak adlandırılan viral etkentarafından meydana getirilen pandemi, halk sağlığı açısından önemlisalgınlardan biri olarak tarih sahnesindeki yerini almıştır. Hastalığınilk bildirimi 2019 yılının Aralık ayında Çin’in Wuhan şehrinden yapılmış olmasına rağmen kısa bir süre de birçok ülke de hastalık görülmeye başlanmış ve Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) tarafından pandemiseviyesine ulaştığı bildirilmiştir. Günümüzde, hastalık henüz kontrolaltına alınamamakla birlikte yaklaşık 19 milyon insanın hastalığa yakalandığı bilinmektedir. Ayrıca hastalığın, özellikle ileri yaşlı ve/veyakronik hastalığa sahip farklı yaş gruplarındaki insanlarda ölümlereneden olması, salgının ciddiyetini ortaya koymaktadır. Birçok ülketarafından SARS CoV-2’nin moleküler ve epidemiyolojik özelliklerihakkında bilgi birikimimizin arttırılması, hastalıkla mücadele dekritik öneme sahip olan aşı ve antiviral ajanların geliştirilmesi içinçeşitli araştırmalar yapılmaktadır. Bu araştırmaların bir sonucu olarak özellikle aşı geliştirme çalışmaların da umut verici haberler gelmeye başlamıştır. Ancak SARS CoV-2’nin moleküler yapısının dahaiyi bilinmesi ve meydana gelmesi olası mutasyonların takip edilmesi,özellikle aşılama başarısı için kritik önem taşımaktadır.

Molecular and epidemiological aspects of SARS CoV-2

Mankind has suffered from infections caused by various microorganisms throughout history. While some of these infections have caused diseases in a limited region, some of these have caused serious epidemics and even pandemics that affect the world. The pandemic, which is caused by the viral agent called Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus 2 (SARS CoV-2) in Coronaviridae family, has taken its place in the history scene as one of the important epidemics in terms of public health. Although the first notification of the disease was made in Wuhan, China in December 2019, the disease started to appear in many countries for a short time and it was declared as pandemic by the World Health Organization (WHO). Today, it is known that about 19 million people get the disease, besides the disease has not been controlled yet. Also, the fact that the disease causes deaths, especially in the elderly and/or people with chronic diseases in different age groups, reveals the severity of the outbreak. Various researches are carried out by many countries to increase our knowledge about the molecular and epidemiological properties of SARS CoV-2 and to develop vaccines and antiviral agents, which are critical in fighting the disease. As a result of these researches, promising news started to come especially in vaccine development studies. However, better knowledge of the molecular structure of SARS CoV2 and the monitoring of possible mutations are critical, especially for vaccination success.

PDF

___

Aries-Reyes C, Zubieta-DeUrioste N, Poma-Machicao L, Aliaga-Raduan F, et al., 2020. Does the pathohenesis of SARSCoV-2 virus decrease at high-altitude? Respir Physiol Neurobiol, 277, 103443.
Astuti I, 2020. Sever acute respiratory seyndrome coronavirus 2 (SARS-Cov-2): an overview of viral structure and host response. Diabetes Metab Syndr, 14, 407-412.
Bulut C, Kato Y, 2020. Epidemiology of COVID-19. Turk J Med Sci, 50, 563-570.
Brownlie J, Whittaker G, 2017. Coronaviridae, In: Fenner’s Veterinary Virology, Ed; MacLachlan NJ, Dubovi EJ, Beşinci Baskı, Elsevier Inc, United Kingdom, 435-461.
Cui J, Li F, Shi ZL, 2019. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbiol, 17(3), 181-192.
Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P, 2019. Bat coronaviruses in China. Viruses, 11(3), 210. GISAID, 2020. Genomic epidemiology of hCOV-19. Erişim:[https://www.gisaid.org/epiflu-applications/nexthcov-19-app/]. Erişim Tarihi:14.08.2020
Hasöksüz M, Kılıç S, Saraç F, 2020. Coronaviruses and SARSCoV-2. Turk J Med Sci, 50, 549-556.
Helmy YA, Fawzy M, Elaswad A, Sobieh A, et al., 2020. The COVID-19 pandemic: a comprehensive review of taxonomy, genetics, epidemiology, diagnosis, treatment, and control. J Clin Med, 9, 1225.
ICTV, 2020. International Commitee on Taxonomy of Viruses. Erişim:[ https://talk.ictvonline.org/taxonomy/]. Erişim Tarihi:14.08.2020
Junejo Y, Ozaslan M, Safdar M, Khailany RA, et al., 2020. Novel SARS-CoV-2/COVID-19: Origin, pathogenesis, genes and genetic variations, immune responses and pkylogenetic analysis. Gene Reports, 20, 100752.
Kaul D, 2020. An overview of coronaviruses including the SARS-2 coronavirus – molecular biology, epidemiology and clinical implications. Curr Med Res Pract, 10, 54-64.
Li X, Zai J, Zhao Q, Nie Q et al., 2020. Evolutionary history, potential intermediate animals host, and cross-species analyses of SARS-CoV-2. J Med Virol, 92(6), 602-611.
NCBI, 2020. National center for biotechnology information. Erişim:[ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term= severe+acute+respiratory+seyndrome+coronavirus+2]. Erişim Tarihi:14.08.2020
OIE, 2020. World organisation for animal health. Erişim:[https://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/ Diseaseinformation/WI]. Erişim Tarihi:14.08.2020
Ozan E, Tamer C, 2020. Evcil hayvanların önemli coronavirüs enfeksiyonları. Eurasian JHS, 3(COVID-19 Special Issue), 102-110.
Petrosillo N, Viceconte G, Ergonul O, Ippolito G, et al., 2020. COVID-19, SARS and MERS: are they closely related? Clin Microbiol Infect, 26(6), 729-734.
Riggioni C, Comberiati P, Giovannini M, Agache I, et al., 2020. A compendium answering 150 questions on COVID-19 and SARS-CoV-2. Allergy, In press.
Shi Y, Wang G, Cai XP, Deng JW, et al., 2020. An overview of COVID-19. J Zhejiang Univ Sci, 21(5), 343-360.
Tang X, Wu C, Li X, Song Y, et al., 2020. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2. Natl Sci Rev, 7, 1012-1023.
TÜBİTAK, 2020. Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu, COVID-19 Araştırma Portalı. Erişim:[https:// covid19.tubitak.gov.tr/dunyada-durum]. Erişim Tarihi:03.08.2020.
WHO, 2020. World Health Organization-Coronavirus Disease(COVID-19). Erişim:[https://covid19.who.int/]. Erişim Tarihi:03.08.2020
Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, et al., 2020. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature, 579, 265-269.
Yeşilbağ K, Aytoğu G, 2020. Coronavirus host divergence and novel coronavirus (Sars-CoV-2) outbreak. Clin Exp Ocul Trauma Infect, 2(1), 6-14.
Yin C, 2020. Genotyping coronavirus SARS CoV-2: methods and implications. Genomics, 112, 3588-3596.
Yoshimoto FK, 2020. The proteins of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS CoV-2 or n-COV19), the cause of COVID-19. The Protein Journal, 39, 198-216.
Zaki AM, Van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus ADME, et al., 2012. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N Engl J Med, 367(19), 1814-1820.
Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, et al., 2020. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 579, 270-273.