Halk Elinde Yetiştirilen Simental, İsviçre Esmeri, Güney Anadolu Kırmızısı ve Boz Irk Sığırlarında Beta- Laktoglobulin Gen Polimorfizminin PCR- RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi

Bu çalışmada Türkiyede yetiştirilen sığır ırklarından Simental, İsviçre Esmeri, Güney Anadolu Kırmızısı ve Boz Irk sığırlarında beta- laktoglobulin geninin allel yapılarının restriksiyon fragment uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemi ile belirlenmesiamaçlanmıştır. Çalışmanınmateryalini, halkelindeyetiştirilen 75 başSimental, 75 başİsviçreEsmeri, 40 baş Güney Anadolu Kırmızısı ve 40 baş Boz Irk sığırı oluşturmuştur. Çalışmada kullanılan DNAlar kandan fenol- kloroform yöntemi ile elde edilmiştir. Beta- laktoglobulin allellerinin belirlenmesinde uygulanan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) işleminitakibeneldeedilenPCRürünleriHaeIII endonükleazenzimiilekesilmiştir.Eldeedilenkesimürünleri%4lükagaroz jel eletroforez yöntemi ile belirlenmiştir. Beta- laktoglubulin geni için en yüksek AA genotip frekansı Simental ırkında, en yüksekBBgenotip frekansıGüneyAnadoluKırmızısı (GAK)ırkındaveenyüksekABgenotip frekansıİsviçreEsmeriırkında görülmüştür. GAK ırkında B allelinin frekansı, Simental ırkında ise A allelinin frekansı en yüksek bulunmuştur. Çalışma sonundaincelenenırklardabeta- laktogrobulinlokusuyönündenHardy- Weinbergdengesinden(HWE)sapmagörülmüştür

Detection of Beta- Lactoglobulin Gene Polymorphism by PCR- RFLP in Simmental, Brown Swiss, South Anatolian Red and Turkish Grey Cattle Breeds Reared Privately

The purpose of this work was to examine the allele structures of beta- lactoglobulin gene with restriction fragmentlength polymorphism (RFLP) method in Simmental, Brown Swiss, South Anatolian Red and Turkish Grey cattle breeds beingraised in Turkey. The material of the study consisted of 75 heads of Simmental, 75 heads of Brown Swiss, 40 heads SouthAnatolian Red and 40 heads Turkish Grey cattle. DNA materials were isolated from blood samples using phenol- chloroformextraction method. In order to determine the beta- lactoglobulin alleles in polymerase chain reaction (PCR) products, thePCR products were digested with HaeIII endonuclease enzyme. The digest products obtained were determined byelectrophoresis using 4% agarose gel. The AA genotypic frequency was found the highest in Simmental breed; the BBgenotypic frequency was found the highest in the South Anatolian Red (SAR) breed and the AB genotypic frequency wasfound the highest in Brown Swiss breed in beta- lactoglobulin gene. In this study, the B allele frequency was found higherthan the A allele in SAR cattle breeds. But, the A allele frequency was found higher than the B allele in the Simmental breed.At the end of this study, a deviation in Hardy- Weinberg equilibrium (HWE) was observed in terms of beta- lactoglobulinlocus in the breeds examined.

___

  • Bonfatti V., Di Martino G., Cecchinato A., Degano L., Carnier P., 2010. Effects of beta- kappa- casein (CSN2- CSN3) haplotypes, beta- lactoglobulin (BLG) genotypes, and detailed protein composition on coagulation properties of individual milk of Simmental cows. J. Dairy. Sci., 93, 3809- 3817. Caroli A., Chessa S., Bolla P., Budelli E., Gandini GC., 2004. Genetic structure of milk protein polymorphisms and effects on milk production traits in a local dairy cattle. J. Anim. Breed. Genet., 121, 119- 127. Caroli AM., Chessa S., Erhardt GJ., 2009. Invited review: Milk protein polymorphisms in cattle: effect on animal breeding and human nutrition. J. Dairy. Sci., 92, 5335- 5352. Celik S., 2003. β- Lactoglobulin genetic variants in Brown Swiss breed and its association with compositional properties and rennet clotting time of milk. Int. Dairy J., 13, 727- 731. Dinc H., Kepenek ES., Koban E., Ozkan E., Togan I., 2007. Determination of genotypes for four milk protein related genes in native cattle breeds of Turkey. 3rd Joint Meeting of the Network of Universities and Research Institutions of Animal Science of the South Eastern European Countries, 10- 12, February, Thessaloniki. Elmacı C., Öner Y., Koyuncu M., 2008. Saanen keçilerinde β- laktoglobulin genotiplerinin PCR- RFLP yöntemi ile belirlenmesi. Hayvansal Üretim, 49, 1- 4. Freeman AR., Bradley DG., Nagda S., Gibson JP., Hanotte O., 2006. Combination of multiple microsattelite data sets to investigate genetic diversity and admixture of domestic cattle. Anim. Genet., 37, 1- 9. Jaan OC., Ibeagha- Awemu EM., Ozbeyaz C., Zaragoza P., Williams JL., Ajmole- Marsan P., Lenstra JA., Moazami- Goudarzi K., Erhardt G., 2004. Geographic distribution of haplotype diversity at the bovine casein locus. Genet. Sel. Evol., 36, 243- 257. Jeichitra V., Kandasamy N., Panneerselvam S., 2003. Milk protein polymorphism in Kangayam cattle. Trop. Anim. Health Prod., 35, 147- 153. Kemenes PA., Regitano LCA., Rosa AJM., Packer IU., Razook AG., de Figueiredo LA., Silva NA., Etchegaray MAL., Coutinho LL., 1999. κ- casein, β - lactoglobulin and growth hormone allele frequencies and genetic distances in Nelore, Gyr, Guzerá, Caracu, Charolais, Canchim and Santa Gertrudis cattle. Genet. Mol. Biol., 22, 539- 541. Klug WS., Cummings MR., 2003. Genetik kavramlar. altıncı baskıdan çeviri, 586- 592, Palme yayıncılık, Ankara. Kovács K., Völgyi- Csík J., Zsolnai A., Györkös I., Fésüs L., 2006. Associations between the AluI polymorphism of growth hormone gene and production and reproduction traits in a Hungarian Holstein- Friesian bull dam population. Arch. Tierz. Dummerstorf, 49, 236- 249. Loftus RT., Ertugrul O., Harba AH., El- Barody MAA., MacHugh DE., Park SDE., Bradley DG., 1999. A microsatellite survey of cattle from a centre of origin: the Near East. Mol. Ecol., 8, 2015- 2022. Martin P., Szymanowska M., Zwierzchowski L., Leroux C., 2002. The impact of genetic polymorphisms on the protein composition of ruminant milks. Reprod. Nutr. Dev., 42, 433- 459. Matějíček A., Matějíčková J., Němcová E., Jandurová OM., Štípková M., Bouška J., Frelich J., 2007. Joint effects of CSN3 and LGB genotypes and their relation to breeding values of milk production parameters in Czech Fleckvieh. Czech J. Anim. Sci., 52, 83- 87. Oner Y., Elmaci C., 2006. Milk protein polymorphisms in Holstein cattle. Int. J. Dairy Technol., 59, 180- 182. Patel RK., Chauhan JB., Singh KM., Soni KJ., 2007. Allelic frequency of kappa- casein and beta- lactoglobulin in Indian crossbred (Bos taurus × Bos indicus) dairy bulls. Turk J. Vet. Anim. Sci., 31, 399- 402. Rachagani S., Gupta ID., Gupta N., Gupta SC., 2006. Genotyping of β- lactoglobulin gene by PCR- RFLP in Sahiwal and Tharparkar cattle breeds. BMC Genet., 7, 31. Sambrook J., Fritsch EF., Maniatis T., 1989. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2nd ed., chapter 6, 22, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold- Spring Harbor, New York. Tambasco DD., Paz CCP., Tambasco- Studart MD., Pereira AP., Alencar MM., Freitas AR., Coutinho LL., Packer IU., Regitano LCA., 2003. Candidate genes for growth traits in beef cattle crosses Bos taurus x Bos indicus. J. Anim. Breed. Genet., 120, 51- 56. Tsiaras AM., Bargouli GG., Banos G., Boscos CM., 2005. Effect of kappa- casein and beta- lactoglobulin loci on milk production traits and reproductive performance of Holstein cows. J. Dairy Sci., 88, 327- 334.
Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi-Cover
  • ISSN: 1306-6137
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Yayıncı: Atatürk Üniversitesi Veteriner Fakültesi
Sayıdaki Diğer Makaleler

Erzurum İlinde Kesimi Yapılan Sığırlarda Karaciğer Lezyonları Üzerinde Patolojik İncelemeler

Yavuz Selim SAĞLAM, Serdar ALTUN

Erzurum İlinde Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca İneklerin Bazı Reprodüktif Performansları ve Ayıklama Nedenleri Üzerine Bir Araştırma

Ömer ÇOBAN, Murat GENÇ, Ahmet YILDIZ, Ekrem LAÇİN, Nilüfer SABUNCUOĞLU

Sıçanda Pankreas'ın Makroanatomisi ve İmmun Boyama Yöntemi ile İnnervasyonunun İncelenmesi

Emine KARAKURUM, Ayşe HALIGÜR

Halk Elinde Yetiştirilen Simental, İsviçre Esmeri, Güney Anadolu Kırmızısı ve Boz Irk Sığırlarında Beta- Laktoglobulin Gen Polimorfizminin PCR- RFLP Yöntemi ile Belirlenmesi

Niyazi DEMİRCİ, Bilal AYÜZ

Bazı Viral Enfeksiyonlarda Melatoninin Etkileri

Yavuz Selim MEMİŞ, Semra GÜMÜŞOVA OKUR

Ruminant Beslemede NDF ve ADF'nin Önemi

Mehmet GÜL, Emre TEKCE

Isolation and Identification of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli F rom Various Animal Source Foods by Conventional Methods and PCR

Ekrem KİREÇCİ, Serap ALTUN KILIC, Omer Faruk KUCUKKALEM, Senay SEYITOĞLU

Alterations in Serum Copper and Zinc Levels in Dogs Naturally Infested with Sarcoptes canis

Nilgün PAKSOY, Ekin Emre ERKILIÇ, Gencay Taşkın TAŞÇI, Ali Haydar KIRMIZIGÜL, Mehtap ÖZÇELİK

Atlarda Ön v e Arka Bacağın Denge Mekanizması

Yasin DEMİRASLAN, Sami ÖZCAN

Sprague Dawley Ratlarda Kısa Fotoperyotun Bazı Kan Parametrelerine Etkisi: I- Enzim Seviyeleri

Pelin Ayça DEMİR, Nilüfer SABUNCUOĞLU