Yara kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları

Çalışmamızda, yara yeri örneklerinden izole edilen patojen mikroorganizmaların retrospektif olarak değerlendirilmesi ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Laboratuvarlarımıza farklı kliniklerden gönderilen yara yeri örneklerinin kültürü yapılmış, kültürde üreme tespit edilen mikroorganizmalar konvansiyonel yöntemlerle identifiye edilmiş ve Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerilerine göre antibiyotik duyarlılıkları belirlenmiştir. Stafilokok suşlarında metisilin direnci sefoksitin ve oksasilin diskleriyle, Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarında GSBL varlığı çift disk sinerji yöntemiyle araştırılmıştır. Toplam 153 yara yeri örneğinin 71inde (% 46.4) üreme saptanmıştır. Bu etkenlerin 48i (% 67.6) Gram pozitif, 23ü (% 32.4) Gram negatif bakteri olarak tespit edilmiştir. En sık izole edilen bakteriler sırasıyla Staphylococcus aureus 23 (% 32.4), koagülaz negatif stafilokoklar 18 (% 25.3), E. coli 8 (% 11.3), Klebsiella spp. 7 (% 9.9), Streptococcus spp. 7 (% 9.9) Pseudomonas aeruginosa 5 (% 7) ve Acinetobacter spp. 3 (% 4.2) olarak belirlenmiştir. İzole edilen streptokokların 3ü Streptococcus pyogenes, 4ü ise diğer Streptococcus spp. olarak saptanmıştır. Stafilokok ve streptokoklarda glikopeptit direnci saptanmazken, S.aureusların % 21.8i ve koagülaz negatif stafilokokların % 33.3ü metisiline dirençlidir. E.coli suşlarının 4ünde (% 50) ve Klebsiella spp. suşlarının 2sinde (% 28.6) GSBL pozitifliğine rastlanmıştır. İzole edilen Gram negatif bakteriler için karbapenemler, aminoglikozidler ve sefoperazon-sulbaktamın en etkili antibiyotikler olduğu saptanmıştır. Hastanelerde belirli zaman aralıklarında yara infeksiyonu etkeni olan mikroorganizmalar ve bunların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi ampirik tedaviye ışık tutması açısından önemlidir.

Microorganisms isolated from wound cultures and their antibiotic susceptibilities

In this retrospective study it was aimed to evaluate the distribution and antibiotic susceptibilities of pathogen microorganisms isolated from wound specimens. Wound specimens sent from different clinics were evaluated by routine culture methods, microorganisms growth in culture were identified by conventional methods and antibiotic susceptibilities were determined by Kirby-Bauer disk diffusion method according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) recommendations. Methicillin resistance in staphylococci was investigated with sefoxitin and oxacillin disks, the precence of ESBL in Escherichia coli and Klebsiella spp. strains was investigated by double disk sinergy method. From a total of 153 wound specimens, pathogenic microorganisms were detected in 71 (46.4 %) samples. 48 (67.6 %) of the positive cultures were Gram positive bacteria and 23 (32.4 %) were Gram negative bacteria. The most commonly isolated microorganisms were Staphylococcus aureus 23 (32.4 %), coagulase negative staphylococci 18 (25.3 %), E.coli 8 (11.3 %), Klebsiella spp. 7 (9.9 %), Streptococcus spp. 7 (% 9.9), Pseudomonas aeruginosa 5 (7 %) and Acinetobacter spp. 3 (4.2 %). It is detected that 3 of isolated Streptococcus were Streptococcus pyogenes and 4 of them were other Streptococcus spp. There was no glycopeptide resistance in Gram positive bacteria; 21.8 % of S.aureus and 33.3 % of coagulase negative staphylococci were found to be methicillin resistant. ESBL positivity is detected in 4 (50 %) of E.coli strains and 2 (28.6 %) of Klebsiella spp. strains. Carbapenems, aminoglycosides and cefoperazon-sulbactam were detected as the most effective antibiotics for gram negative bacteria. Determination of microorganisms that cause wound infections and their antibiotic suspectibilities periodically at hospitals is important to guide empirical antibiotic treatment.

PDF

___

1.Ağalar C, Göçmen JS, Kılıç D, Kaygusuz S, Karabıçak Ç. Antibacterial susceptibility patterns of methicillin resistant Staphylococcus spp. from a tertiary reference hospital, J Clin Exp Invest 2012;3(1):71-4.
2.Ağca H. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretimleri ve antibiyotik duyarlılık oranları, Dokuz Eylül Üniv Tıp Fak Derg 2011;25(3):169-73.
3.Akinjogunla OJ, Adegoke AA, Mboto CI, Chuk- wudebel IC, Udokang IP. Bacteriology of automobile accident wounds infection, Int J Med Sci 2009;1(2):23-7.
4.Albayrak N, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu betalaktamaz üretimleri ve antibiyotik direnç oranları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009;39(1-2):16-21.
5.Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; Twentieth informational supplement, M100-S20, CLSI, Wayne PA (2010).
6.Çetin ES, Kaya S, Arıkan MS, Güneş H. Solid organ maligniteli hastalarda infeksiyon etkenleri ve antibiyotik duyarlılık durumları, Kocatepe Tıp Derg 2006;7(1):37-40.
7.Çetin ES, Kaya S, Taş T, Arıdoğan BC, Demirci M. Cerrahi alan infeksiyonlarında mikroorganizma profili ve antibiyotik duyarlılık durumu, ANKEM Derg 2006;20(2):89-93.
8.Çiftci A, Aksaray S, Cesur S. Yanık ünitesinde yatan hastaların yara ve kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları, İnfeksiyon Derg 2003;17(3):293-6.
9.Demir H, Erandaç M. Cerrahi alan infeksiyonlarından izole edilen mikroorganizmalar, Cumhuriyet Üniv Tıp Fak Derg 2001;23(2):89-91.
10.Derbentli Ş. Cerrahi infeksiyonlarda dirençli Gram pozitif bakteri sorunu, ANKEM Derg 2004;18(Ek 2):215-21.
11.Doğan SŞ, Paköz NİE, Aral M. Laboratuvarımıza gönderilen yara yeri örneklerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere direnç durumları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2010;40(4): 243-9.
12.Eryılmaz M, Bozkurt ME, Yıldız MM, Akın A. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta- laktamaz sıklığının araştırılması, Marmara Eczacılık Derg 2010;14(1):10-2.
13.Fışgın NT, Tanyel E, Topgül K, Sarıkaya H, Doğancı L, Tülek T. Kolon cerrahisi uygulanan hastalarda gelişen cerrahi alan infeksiyonları ve risk faktörleri, İnfeksiyon Derg 2008;22(3):141-5.
14.İris NE, Arat ME, Yıldırmak T, Sayıner HS, Varol B, Erkmen T. Klinik örneklerden izole edilen metisiline dirençli stafilokok suşlarının çeşitli antibiyotiklere duyarlılıkları, XIII. Türk Klinik Mikrobi- yoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi kitabı P011, Antalya (2007).
15.Jepsen OB. Contamination of the wound during operation and postoperative wound infection, Ann Surg 1973;111(2):178-80. http://dx.doi.org/10.1097/00000658-197302000- 00009 PMid:4572782 PMCid:1355560
16.Özcan N, Durmaz ÇB, Oktar M. Yara örneklerinden izole edilen stafilokok suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranlarının araştırılması, XI. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi kitabı P-13/30, İstanbul (2003).
17.Özmen E, Geyik MF, Uluğ M, Çelen MK, Hoşoğlu S, Ayaz C. Yatan hastalardan izole edilen gram negatif bakteriler ve antibiyotik dirençlerinin değerlendirilmesi, Düzce Tıp Fak Derg 2010;12(3): 32-9.
18.Polat Y, Karabulut A, Balcı YI, Çilengir M, Övet G, Cebelli S. Yanık olgularında kültür ve antibiyogram sonuçlarının incelenmesi, Pamukkale Tıp Derg 2010;3(3):131-5.
19.Yurtsever SG, Kurultay N, Çeken N ve ark. Yara yeri örneklerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi, ANKEM Derg 2009;23(1):34-8.
20.Zafar A, Anwar N, Ejaz H. Bacteriology of infected wounds - A study conducted at Children Hospital Lahore, Biomedica 2007;23:8(A):1-4.