2012-2014 YILLARINDA ALT SOLUNUM YOLU ÖRNEKLERİNDEN İZOLE EDİLEN STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE VE HAEMOPHILUS INFLUENZAE SUŞLARINDA ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIĞIN YILLARA VE YAŞ GRUPLARINA GÖRE DEĞERLENDİRİLMESİ
Streptococcus pneumoniae ve Haemophilus influenzae bakteriyel alt solunum yolu infeksiyonu etkenleri arasında önde gelmeleri ve tedavileri için kullanılan antibiyotiklere karşı geliştirdikleri direnç nedeniyle klinik önemlerini korumaktadırlar. Ampirik tedavi seçeneklerinin belirlenmesi için direnç epidemiyolojisinin izlenmesi gerekmektedir. Çalışmamızda 2012-2014 yıllarında alt solunum yolu örneklerinden izole edilmiş S.pneumoniae (n = 223) ve H.influenzae (n = 363) suşunun antimikrobiyal duyarlılıklarının değerlendirilmesi amaçlanmıştır. İncelenen S.pneumoniae suşlarının % 92.4'ü penisiline, % 45.7'si eritromisine, % 56.5'i klindamisine, % 48.4'ü trimetoprim-sülfametoksazole, % 49.8'i tetrasikline duyarlı bulunmuştur. H.influenzae suşlarının % 63.4'ü ampisiline, % 90.1'i ampisilin-sulbaktama, % 89.3'ü sefuroksime, % 61.7'si trimetoprim-sülfametoksazole duyarlı bulunmuştur. Beş yaş ve altı hasta grubunda S.pneumoniae suşlarının eritromisin, klindamisin, trimetoprim-sülfametoksazol ve tetrasiklin duyarlılığının diğer yaş gruplarına göre belirgin farklılık gösterdiği saptanmıştır (sırasıyla p< 0.001, p< 0.001, p< 0.001, p< 0.006). H.influenzae suşlarının antibiyotik duyarlılıklarında ise trimetoprim-sülfametoksazol duyarlılığının diğer yaş gruplarına göre belirgin farklılık gösterdiği saptanmıştır (p< 0.018). İncelenen üç yıllık dönemde S.pneumoniae ve H.influenzae suşlarında değerlendirilen antibiyotiklerin hiçbirinde antimikrobiyal duyarlılık oranlarında anlamlı bir değişiklik izlenmemiştir (p> 0.5). Çalışma sonuçlarımız ile solunum yolu infeksiyonu etkeni S.pneumoniae ve H.influenzae suşları için farklı yaş gruplarında ampirik tedavide kullanılan antibiyotiklerin etkinliklerinin değerlendirilmesine olanak sağlayan kümülatif antimikrobiyal duyarlılık verisi oluşturulmuştur
Evaluation of Antimicrobial Susceptibility in Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae Strains Isolated from Lower Respiratory Tract Samples Between 2012 and 2014 According to Years and Age Groups
Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae are still considered to be clinically important pathogens as they are among the leading causes of bacterial infections in lower respiratory tract and have the ability to develop resistance to antimicrobials used for the treatment. In order to determine the empirical treatment options, resistance epidemiology should be monitored. In this study we aimed to evaluate the antimicrobial susceptibility of S.pneumoniae (n = 223) and H.influenzae (n = 363) strains isolated from lower respiratory tract samples between 2012-2014. The susceptibility rates were determined as 92.4 % for penicillin, 45.7 % for erythromycin, 56.5 % for clindamycin, 48.4 % for trimethoprim-sulfamethoxazole and 49.8 % for tetracycline among the S.pneumoniae isolates. The susceptibility rates were determined as 63.4 % for ampicillin, 90.1 % for ampicillin-sulbactam, 89.3 % for cefuroxime and 61.7 % for trimethoprim-sulfamethoxazole among the H.influenzae isolates. The susceptibility rates for erythromycin, clindamycin, trimethoprim-sulfamethoxazole, and tetracycline susceptibility rates in S.pneumoniae isolates were found significantly different in patients ≤ 5 years of age compared to patients in other age groups (p< 0.001, p< 0.001, p< 0.001, p< 0.006, respectively). In the three-year study period no significant difference in antimicrobial susceptibility according to years was detected in S.pneumoniae and H.influenzae isolates for all evaluated antibiotics (p> 0.05). Our findings enabled us to generate a cumulative antimicrobial susceptibility test data for S.pneumoniae and H.influenzae strains isolated from respiratory tract infections which may be useful in the evaluation of the efficacy of antimicrobials used in the empirical treatment in different age groups
___
- 1. Almeida ST, Nunes S, Santos Paulo AC et al. Low prevalence of pneumococcal carriage and high serotype and genotype diversity among adults over 60 years of age living in Portugal, PLoS ONE 2014;9(3):e90974. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0090974
- 2. Bayer M, Aslan G, Emekdaş G, Kuyucu N, Kanık A. Sağlıklı çocuklarda Streptococcus pneumoniae’nin nazofarengeal taşıyıcılığı ve çoklu antibiyotik direnci, Mikrobiyol Bul 2008;42(2):223-30.
- 3. Budak F, Gür D. Klinik örneklerden izole edilen Haemophilus influenzae suşlarının çeşitli antimikrobik ilaçlara in-vitro duyarlılığı, Mikrobiyol Bul 2003;37(1):19-25.
- 4. Cattoir V, Dowzicky MJ. A longitudinal assessment of antimicrobial susceptibility among important pathogens collected as part of the Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (T.E.S.T.) in France between 2004 and 2012, Antimicrob Resist Infect Control 2014;3(1):36. http://dx.doi.org/10.1186/2047-2994-3-36
- 5. Cerquetti M, Degli Atti MLC, Cardines R et al. Invasive type e Haemophilus influenzae disease in Italy, Emerg Infect Dis 2003;9(2):258-61. http://dx.doi.org/10.3201/eid0902.020142
- 6. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Testing: Twenty-Second Information Suplement. CLSI document M100- S23. Clinical and Laboratory Standards Institute, Pennsylvania USA (2013).
- 7. European Centre for Disease Prevention and Control. Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2013. Annual Report of the European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net). Stockholm: ECDC (2014).
- 8. Felmingham D. Comparative antimicrobial susceptibility of respiratory tract pathogens, Chemotherapy 2003;50(Suppl 1):S3-10. http://dx.doi.org/10.1159/000079816
- 9. Gelmez GA, Soysal A, Kuzdan C et al. Kronik akciğer hastalığı olan, akut alevlenme ve pnömoni tanısı ile başvuran çocuklarda Streptococcus pneumoniae serotip dağılımı ve duyarlılıkları, Mikrobiyol Bul 2013;47(4):684-92.
- 10. Gür D, Özalp M, Sümerkan B et al. Prevalence of antimicrobial resistance in Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis and Streptococcus pyogenes: results of a multicentre study in Turkey, Int J Antimicrob Agents 2002;19(3):207-11. http://dx.doi.org/10.1016/S0924-8579(02)00003-1
- 11. Houck PM, Bratzler DW, Nsa W, Ma A, Bartlett, JG. Timing of antibiotic administration and outcomes for medicare patients hospitalized with community-acquired pneumonia, Arch Intern Med 2004;164(6):637-44. http://dx.doi.org/10.1001/archinte.164.6.637
- 12. İlki A, Sağıroğlu P, Elgörmüş N, Söyletir G. Trends in antibiotic susceptibility patterns of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae isolates: four years follow up, Mikrobiyol Bul 2010;44(2):169-75.
- 13. Jones RN, Sader HS, Mendes RE, Flamm RK. Update on antimicrobial susceptibility trends among Streptococcus pneumoniae in the United States: report of ceftaroline activity from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1998-2011), Diagn Microbiol Infect Dis 2013;75(1): 107-9. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2012.08.024
- 14. Kempf M, Varon E, Lepoutre A et al. Decline in antibiotic resistance and changes in the serotype distribution of Streptococcus pneumoniae isolates from children with acute otitis media; a 2001–2011 survey by the French Pneumococcal Network, Clin Microbiol Infect 2015;21(1):35-42. http://dx.doi.org/10.1016/j.cmi.2014.08.009
- 15. Klugman KP. Clinical impact of antibiotic resistance in respiratory tract infections, Int J Antimicrob Agents 2007;29(Suppl 1):S6-10. http://dx.doi.org/10.1016/S0924-8579(07)70004-3
- 16. Özkul H, Özbek ÖA, Çoban H, Gülay Z. Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’nde 2003-2006 yıllarında üretilen Haemophilus influenzae suşlarının antibiyotik duyarlılıkları, ANKEM Derg 2007;21(2): 86-90.
- 17. Pfaller MA, Farrell DJ, Sader HS, Jones RN. AWARE Ceftaroline Surveillance Program (2008- 2010): trends in resistance patterns among Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Moraxella catarrhalis in the United States, Clin Infect Dis 2012;55(Suppl 3):187-93. http://dx.doi.org/10.1093/cid/cis561
- 18. Richard B, Thomson JR (çeviri Zeynep Ş). Bakteriyolojik örneklerin toplanması, taşınması ve işleme alınması, ‘’Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA (edt). Klinik Mikrobiyoloji, 9.baskı (çeviri editörü Başustaoğlu A)’’ kitabında s.319-20, ASM Press, Washington (2009).
- 19. Şener B, Köseoğlu O, Fişenk İ, Hasçelik G, Günalp A. Streptococcus pneumoniae suşlarında makrolid, linkozamid, streptogramin, okzazolidinon ve ketolid direnci, Mikrobiyol Bul 2002;36(2):125-31.
- 20. Şenol G, Nur EF. Akciğer enfeksiyonlarında Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis ve Streptococcus pneumoniae suşlarının izolasyon oranları ve antibiyotiklere direnci, Toraks Derg 2000;1(1):46-49.
- 21. Tomic V, Dowzicky MJ. Regional and global antimicrobial susceptibility among isolates of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae collected as part of the Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (T.E.S.T.) from 2009 to 2012 and comparison with previous years of T.E.S.T. (2004-2008), Ann Clin Microbiol Antimicrob 2014;13:52. http://dx.doi.org/10.1186/s12941-014-0052-2
- 22. Torres A, Blasi F, Peetermans WE, Viegi G, Welte T. The aetiology and antibiotic management of community-acquired pneumonia in adults in Europe: a literature review, Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2014;33(7):1065-79. http://dx.doi.org/10.1007/s10096-014-2067-1
- 23. Tuncer İ, Arslan U, Fındık D, Ural O. Klinik örneklerden izole edilen Streptococcus pneumoniae suşlarında artan penisilin direnci ve bazı antibiyotiklere karşı direnç durumu, ANKEM Derg 2005;19(1):35-8.
- 24. Uncu H, Çolakoğlu Ş, Turunç T, Demiroğlu YZ, Arslan H. Streptococcus pneumoniae ve Haemophilus influenzae klinik izolatlarının tedavide kullanılan antibiyotiklere karşı in vitro direnç oranları, Mikrobiyol Bul 2007;41(3):441-6.
- 25. Volturo GA, Low DE, Aghababian R. Managing acute lower respiratory tract infections in an era of antibacterial resistance, Am J Emerg Med 2006; 24(3):329-42. http://dx.doi.org/10.1016/j.ajem.2005.10.001
- 26. Woodhead M, Blasi F, Ewig S et al. Guidelines for the management of adult lower respiratory tract infections-full version, Clin Microbiol Infect 2011;17(Suppl 6):S1-59. http://dx.doi.org/10.1111/j.1469-0691.2011.03602.x
- 27. Yenişehirli G, Şener B. Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi hastanelerinde izole edilen Streptococcus pneumoniae suşlarında antibiyotik direnci ve serotip dağılımı, Mikrobiyol Bul 2003;37(1):1-11.
- 28. Xiao Y, Wei Z, Shen P et al. Bacterial-resistance among outpatients of county hospitals in China: significant geographic distinctions and minor differences between central cities, Microb Infect 2015;17(6):417-25. http://dx.doi.org/10.1016/j.micinf.2015.02.001