Türkiye'de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması

Amaç: Antimikrobial direnç sorununun artmaktaolması nedeniyle ülkemizde Ulusal AntimikrobiyalDirenç Sürveyans Sistemi (UAMDSS) kurulma çalışmalarıbaşlatılmıştır. UAMDDS'ye dahil olacak laboratuvarlarınsisteme güvenilir veri sağlayabilmesi önemlidir. Buamaçla ülkedeki mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültürve antibiyotik duyarlılık testleri (ADT) yapabilmekapasitelerini değerlendiren bir anket uygulamasıyapılmıştır.Yöntem: Bu çalışma 2009-2010 yılları arasındayapılmış olup mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültürve ADT yapabilme kapasitelerine odaklanan 90 soruiçermektedir. Anket formları T.C. Sağlık Bakanlığıtarafından mikrobiyoloji uzmanı bulunduğu bilgisineulaşılan kamuya bağlı 354 hastanenin tıbbi mikrobiyolojilaboratuvarına gönderilmiştir. Sonuçlar SPSS 18,0istatistik programı kullanılarak değerlendirilmiştir.Bulgular: Ankete %70,5'i devlet hastanesi, %16,5'ieğitim ve araştırma hastanesi ve %13'ü üniversitehastanesi olmak üzere 322 laboratuvar cevap vermiştir.Birinci basamak sisteme dahil olma kriterleri olan;mikrobiyoloji uzmanı bulunması (%99,1), bakteriyolojibölümü olması (%97,5) ve kan kültürü çalışılması(%83,6) sorularının her üçüne de evet cevabı veren 259 (%80,4) laboratuvar ileri değerlendirmeye alınmıştır.İkinci aşama olan skor çalışmasında kullanılan sorularve bu sorulara verilen cevap yüzdeleri şöyledir:i) Escherichia coli (ortalama: 74,7), Klebsiella spp.(ortalama: 22,9), Staphylococcus aureus (ortalama:19,6), Pseudomonas aeruginosa (ortalama: 19,5),Enterococcus spp. (ortalama: 16,1) ve Streptococcuspneumoniae (ortalama: 3,7), için uygulanan aylıkADT sayısının ortalama değerlerinin üzerinde olması,ii) klinik olarak anlamlı kabul edilen mikroorganizmalaraveya izole edilen hastada klinik olarak önemli kabuledilen mikroorganizmalara kan izolatları için sırasıyla%49,2 ve %30,2; BOS izolatları için sırasıyla %88,7 ve%75,5 ADT uygulaması, iii) ADT için standart uygulamaprosedürünün olması (%81,6), iv) iç kalite kontrolsonuçlarının gözden geçiriliyor olması (%82,2),v) ADT için standart yöntemlerden herhangi birininkullanılıyor olması (%95,8), vi) ADT sonuçlarınınyorumu için standart rehber kullanılması (%94,2)vii) sonuçların tutarlılığının değerlendirilmesi(%96,9) şeklindedir. 259 laboratuvardan 173'ü skorbelirleme sorularının tümüne cevap vermiş olup, bulaboratuvarların skor değerleri 4-7; 8-11 ve 12-15olacak şekilde gruplandırılmıştır. Laboratuvarlardan43/173 (%24,8)'ünün 12-15 skor grubuna dahil olduğugörülmüştür. Üniversite hastaneleri ve eğitim vearaştırma hastanelerinin büyük bir kısmı 12-15 arasıskor puanı alırken (sırasıyla %64,9 ve %53,3'ü), devlethastanelerinin büyük bir bölümünün 4-7 (%50) ve 8-11(%47,2) arası skor puanı aldığı belirlenmiştir.Sonuç: UAMDSS için katılımcı laboratuvarbelirlerken; skor değerinin yüksek olması, Türkiyeİstatistikî Bölge Birimleri Sınıflandırması'na görebelirlenen 12 bölgeye olabildiğince eşit dağılması veüniversite, eğitim araştırma ve devlet hastaneleriniiçerecek şekilde olması dikkate alınmıştır. Buna göreUAMDSS'ye güvenilir veri sağlayabilecek katılımcı 78laboratuvar seçilmiştir.

Performance evaluation of the microbiology laboratories in Turkey for culture and antibiotic susceptibility tests and the selection of laboratories to provide data for National Antimicrobial Resistance Surveillance System: Questionnary application

Objective: Due to the increase in of the antimicrobial resistance problem, in our country, the studies to establish National Antimicrobial Resistance Surveillance System (NAMRSS) was started. It is important to provide reliable data for the laboratories those will be included in NAMRSS. For this purpose, a questionnaire was applied to evaluate the culture and antimicrobial susceptibility tests performance capacities (AST) of the laboratories in the country. Method: This study was done between 2009 and 2010 years, and included 90 queries which were focused on the capacities of microbiology laboratories to perform culture and AST. The questionnaires were sent to medical microbiology laboratories of 354 public hospitals, where the presence of a specialist knowledge is achieved by TR Ministry of Health. Results were analysed by using SPSS 18.0 statistical program. Results: Three hundred twenty two laboratories replied the questionnaire among which were 70.5% state hospital, 16.5% training and research hospital and 13% university hospital laboratories. The number of laboratories which have positive reply to all three questions which are the first stage of the selecton criteria; presence of microbiolog specialist (99.1%) presence of bacteriology laboratory (97.5%) andperformance of blood culture (83.6%), were 259(80.4%) and they were included in further evaluation.The queries and percentage of the replies usedfor the second stage were: i) The number of ASTperformed to be more than the average monthlynumber for Escherichia coli (mean: 74.7), Klebsiellaspp. (mean: 22.9), Staphylococcus aureus (mean:19.6), Pseudomonas aeruginosa (mean: 19.5),Enterococcus spp. (mean: 16.1) and Streptococcuspneumoniae (mean: 3.7), ii) performance of ASTwhen a microorganism that is generally accepted asclinically significant or significant for the patient fromwhom the microorganism was isolated; 49.2% and30.2% for blood culture, and 88.7% and 75.5% for CSF,respectively, iii) the presence of standard operatingprocedures for AST (81.6%), iv) revising the internalquality control results (82.2%), v) usage of any of thestandard methods for AST (95.8%), vi) using standardguidelines for the interpretation of results (94.2%),and vii) the evaluation of the consistency of the results(96.9%). Among 259 laboratories 173 of them replied allthe queries for score determination, and theselaboratories were grouped as 4-7; 8-11 and 12-15according to their scores. Among 173 laboratories, 43of them were found to be involved in the group 12-15 score. While most of the teaching and researchhospitals and university hospitals received score 12-15points (64.9% and 53.3% respectively), most of the statehospitals received 4-7 (50%) and 8-11 (47.2%) scorepoints.Conclusion: For the determination of participantlaboratories; having a high score, equally distributionin 12 regions determined by Turkey StatisticalClassification of Territorial Units include university,training and reserach and state hospitals were takeninto consideration. Accordingly 78 laboratorieswhich can provide reliable data for NAMRSS werechosen as participant.

___

  • 1. EARSS Annual Report 2008 On-going surveillance of S. pneumoniae, S. aureus, E. coli, E. faecium, E. faecalis, K. pneumoniae, P. aeruginosa (http://www.ecdc.europa.eu/en/activities/ surveillance/EARS-Net/Documents/2008_EARSS_ Annual_Report.pdf) (Erişim Tarihi: 15.01.2015).
  • 2. Van de Sande-Bruinsma N, Grundmann H, Verloo D, Tiemersma E, Monen J, Goossens H, et al. European Antimicrobial Resistance Surveillance System Group; European Surveillance of Antimicrobial Consumption Project Group. Antimicrobial drug use and resistance in Europe. Emerg Infect Dis, 2008; 14(11): 1722-30.
  • 3. Cantón R. Role of the microbiology laboratory in infectious disease surveillance, alert and response. Clin Microbiol Infect, 2005; 11(1): 3-8.
  • 4. Bulaşıcı Hastalıklar Sürveyans Ve Kontr ol Esasları Yönetmeliği, Resmi Gazete: 30.5.2007 - 26537. http://www.saglik.gov.tr/TR/belge/1-4958/ bulasici-hastaliklar-surveyans-ve-kontrol-esaslariyone-.html
  • 5. Ulusal Antimikrobiyal Direnç Surveyans Sistemi 2011 Yıllık Raporu, Türkiye Halk Sağlığı Kurumu, Ankara, 2013. (http://uamdss.thsk.gov.tr/ index.php?option=com_phocadownload&view =category&id=6:raporlar&Itemid=13)(Erişim Tarihi:15.01.2015).
  • 6. Akbaş E, Buyurgan V. Bildirimi zorunlu bulaşıcı hastalıklar için klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarının tanı kapasitelerinin değerlendirilmesi: Bir anket çalışması. XXXI. Türk Mikrobiyoloji Kongresi; S8, s375, 12-16 Eylül 2006, Antalya.
  • 7. WHO/CDS/CSR/RMD/2003.10Antimicrobial Resistance Surveillance Questionnaire for Assessment of National Networks Department Of Communicable Disease Surveillance And Response World Health Organization 2003.
  • 8. Sader HS, Farrell DJ, Flamm RK, Jones RN. Antimicrobial susceptibility of Gram-negative organisms isolated from patients hospitalised with pneumonia in US and European hospitals: results from the SENTRY Antimicrobial SurveillanceProgram, 2009-2012. Int J Antimicrob Agents, 2014; 43(4): 328-34.
  • 9. de Kraker ME, Jarlier V, Monen JC, Heuer OE, van de Sande N, Grundmann H. The changing epidemiology of bacteraemias in Europe: trends from the European Antimicrobial Resistance Surveillance System. Clin Microbiol Infect, 2013; 19(9): 860-8.
  • 10. Mister P, Lehman DC. Bacteremia and Sepsis. Chapter 36 p.868-883. In: Mahan CR, Manuselis G (eds) Textbook of Diagnostic Microbiology 5th ed. Elsevier 2015 Saunders, Missouri. Printed in China.
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi-Cover
  • ISSN: 0377-9777
  • Başlangıç: 1938
  • Yayıncı: Türkiye Halk Sağlığı Kurumu
Sayıdaki Diğer Makaleler

Mardin Devlet Hastanesi'nde 2011-2013 yılları arasında metisiline dirençli stafilokoklarda direnç profilleri

Filiz ORAK

Determination of microbiological characteristics of several kinds of ready-to-eat meals presented for consumption

Yıldırım CESARETLİ, Umut BERBEROĞLU, Havva SARI, Şule ERGÜL ŞENSES, Sevinç ERTAŞ, Hasan IRMAK

Anjioimmünoblastik T-hücreli lenfoması olan bir hastada çoklu ilaç dirençli Corynebacterium mucifaciens'in neden olduğu ölümcül bir sepsis olgusu

Nevriye GÖNÜLLÜ, Fatma ÇAKIRLAR KÖKSAL, Nuri KİRAZ, Kübra CAN, Seval ÜRKMEZ, Mert KUŞKUCU, Kenan MİDİLLİ

Hastanede yatan ishalli hastaların dışkı örneklerinde Clostridium difficile toksin araştırılması ve risk faktörlerinin incelenmesi

Elif ŞAHİN-HORASAN, Nuran DELİALİOĞLU, Hande KOSTUL, Candan ÖZTÜRK, Gürol EMEKDAŞ, Necdet KUYUCU

Türkiye'de mikrobiyoloji laboratuvarlarının kültür ve antibiyotik duyarlılık testi performans değerlendirmesi ve Ulusal Antimikrobiyal Direnç Sürveyans Sistemine veri sağlayacak laboratuvarların seçimi: Anket uygulaması

Dilber AKTAŞ, Gül Bahar ERDEM, İpek MUMCUOĞLU, Nilay ÇÖPLÜ, Ayşegül GÖZALAN, Hüsniye ŞİMŞEK

Mikolojik klinik tanıda moleküler teknikler

Nuri KİRAZ

Manisa'da aynı yemek şirketinden yemek alan farklı işletmelerde meydana gelen stafilokok kaynaklı besin zehirlenmesi

Fehminaz TEMEL, Ali BOZ, Selmur TOPAL, Mustafa Bahadır SUCAKLI, Ali Hasan ZUBAROĞLU, Metin KIZILELMA, Gonca ATASOYLU, Belkıs LEVENT

İpek atıksularından geri kazanılan serisin proteininin karakterizasyonu

Gökşen ÇAPAR, Seylan Saniye AYGÜN

Bitkilerde RNA interferans

Semra SOYDAM-AYDIN, Aslı FAZLIOĞLU, Demet CANSARAN-DUMAN, İlker BÜYÜK, Sümer ARAS, Kürşat DERİCİ

Tarım çalışanlarının bitki koruma ürünleri konusunda bilgi ve davranışları

Ersin USKUN