Yakup GÜRKAN, Feyza ÇETİN, İpek MUMCUOĞLU, Altan AKSOY, Neriman AKSU

Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları

Amaç: Sepsise bağlı mortalite ve morbiditenin yüksek olması nedeniyle, etken mikroorganizmaların hızlı ve doğru tanısı hastanın tedavisi açısından çok önemlidir. Tanı için uygulanması gereken ilk ve en değerli test kan kültürüdür. Kan kültürlerinden etken mikroorganizmanın erken saptanması ve tiplendirilmesi, antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, hastaya uygun tedavi verilmesi açısından önemlidir. Bu çalışmada kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları retrospektif olarak araştırılmış ve hastanemiz antibiyotik kullanım politikalarına katkıda bulunulması amaçlanmıştır.?? Yöntem: Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına 01.07.2012 - 01.07.2013 tarihleri arasında gönderilen kan kültürleri BACT/ALERT 3D (bioMerieux, Fransa) otomatize sisteminde takip edilmiştir. Pozitif örnekler gram boyama yöntemi ile incelendikten sonra kanlı agar, çikolata agar ve eozin metilen blue (EMB) agar besiyerlerine ekimleri yapılmıştır. Tüm plaklar 35±2°C'de 16-20 saat enkübe edilmiş ve VITEK 2 (bioMerieux, Fransa) otomatize sisteminde bakteri tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri çalışılmıştır. Bulgular: Kan kültürlerinden izole edilen toplam 2279 mikroorganizmanın 1533'ü (%67,3) gram-pozitif bakteri, 670'i (%29,4) gram-negatif bakteri, 76'sı (%3,3) mayalardan oluşmaktaydı. En etkili antibiyotikler stafilokoklar için vankomisin (%100), tigesiklin (%100) ve linezolid (%96); E. faecium ve E. faecalis için sırasıyla tigesiklin (%100, %100), linezolid (%96,6, %90,9) ve vankomisin (%75,9, %96,1), Enterobacteriacea için meropenem (%91,7), tigesiklin (%91,3) ve amikasin (%84,6); Acinetobacter spp. için kolistin (%98,9), tigesiklin (%81,5) ve netilmisin (%67,4), Pseudomonas spp. için kolistin (%95,1), amikasin (%54,1) ve gentamisin (%50,6) olarak saptandı. Kültürlerden izole edilen kandida suşlarında vorikonazol, flusitozin ve kaspofungine karşı herhangi bir direnç gözlenmezken bazı non-albicans kandidalarda düşük oranda amfoterisin B ve flukonazol direnci izlenmiştir. Sonuç: Kan kültürleri enfeksiyon hastalıklarının teşhisinde kullanılan en önemli testlerden biridir. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmaların dağılımının her merkezde düzenli aralıklarla izlenmesi ve antimikrobiyal duyarlılığının belirlenmesi ampirik tedaviye başlama sırasında klinisyene yol gösterecektir.

Microorganisms isolated from blood cultures and their antimicrobial susceptibilities

Objective: Because of high sepsis-related mortality and morbidity, fast and correct diagnosis of causative agents is very important for the treatment of patients. The first and most valuable test must be applied is a blood culture. Early detection, identification and determination of antimicrobial susceptibility of pathogen microorganism are important for the decision of appropriate treatment. In this study, the microorganisms which were isolated from blood cultures and their antibiotic susceptibility were investigated retrospectively and it was aimed to contribute to antimicrobial usage policies in our hospital. Method: Blood cultures which were sent to Ankara Numune Training and Research Hospital Microbiology Department during the period 01.07.2012 through to 01.07.2013 were monitorized with BacT / Alert 3D (bioMerieux, France) automated system. Positive cultures were inoculated onto blood agar, chocolate agar and eosin methylene blue agar after examined by Gram stain preparation. All plates were incubated on at 35±2°C for 16-20 hours and bacterial identification and antibiotic susceptibility tests were performed by with the VITEK 2 (bioMerieux, France) system Results: Total of 2279 microorganisms were isolated from blood cultures consisting of 1533 (67.3%) of grampositive bacteria, 670 (29.4%) of gram-negative bacteria and 76 (3.3%) yeast. The most effective antibiotics were vancomycin (100%), tigecycline (100%) and linezolid (96%) for Staphylococcus spp.; tigecycline (100%, 100%) linezolid (96.6%, 90.9%) and vancomycin (75.9%, 96.1%) for E. faecium and E. faecalis respectively; meropenem (91.7%), tigecycline (91.3%) and amikacin (84.6%) for Enterobacteriaceae; colistin (98.9%), tigecycline (81.5%) and netilmicin (67.4%) for Acinetobacter spp.; colistin (95.1%), amikacin (54.1%) and gentamicin (50.6%) for Pseudomonas spp. There was no resistance found against voriconazole, flucytosine and caspofungin in for Candida spp. while there was only few level low percentage resistance found against amphotericin B and fluconazole in some non-albicans candida. Conclusion: Blood cultures are one of the most important tests in diagnosis of infectious diseases. Monitoring the distribution of isolated microorganisms from blood cultures and determination of their antimicrobial susceptibility at regular intervals in each center would be a guide to the clinician in the decision of empirical treatment.

PDF

___

1. Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA. Klinik Mikrobiyoloji. 9.baskı. Ankara: Atlas Kitapçılık, 2009.
2. Forbes BA, Sahm DF, Weissfeld AS. Bailey&Scolt’s Diagnostic Microbiology. 12th ed. Texas: Elsevier Inc, 2007.
3. Yurtsever SG, Baran N, Afşar İ, Yalçın MA, Kurultay N, Türker M. İzmir Eğitim Araştırma Hastanesinde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere karşı duyarlılıkları. Klimik Derg, 2006; 19: 56-9.
4. Pirson M, Dramaix M, Struelens M, Riley TV, Leclercq P. Costs associated with hospital-acquired bacteraemia in a Belgian hospital. J Hosp Infect, 2005; 59 (1): 33-40.
5. Doğanay M. Sepsis. In: Wilke Topçu A, Söyletir G, Doğanaya M eds. İnfeksiyon hastalıkları, İstanbul: Nobel tıp kitabevleri, 1996: 473.
6. Mehli M, Gayyurhan E, Zer Y, Akgün S. Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. İnfeksiyon Derg, 2007; 21(3): 141-5.
7. Yüce P, Demirdağ K, Kalkan A, Özden M, Denk A, Kılıç SS. Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Ankem Derg, 2005; 19 (1): 17-21.
8. Duman Y, Kuzucu Ç, Çuğlan S. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Tıp Derg, 2011; 33 (3): 189-96.
9. Çalışkan E, Dede A, Güven G. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. ANKEM Derg, 2013; 27 (1): 25-30.
10. Hall KK, Lyman JA. Updated review of blood culture contamination. Clin Microbiol Rev, 2006; 19(4): 788-802.
11. Jones RN, Low DE, Pfaller MA. Epidemiologic trends in nosocomial and community-acquired infections due to antibiotic-resistant grampositive bacteria: the role of streptogramins and other newer compounds. Diagn Microbiol Infect Dis, 1999; 33(2): 101-12.
12. Bar K, Wisplinghoff H, Wenzel PR, Bearman GM, Edmond MB. Systemic inflammatory response syndrome in adult patients with nosocomial bloodstream infections due to enterococci. BMC Infect Dis, 2006; 6: 145.
13. Çetinkol Y, Çakır F, Enginyurt Ö. Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında metisiline direncin yıllara göre değişimi. ANKEM Derg, 2013; 27(1): 38-42.
14. Kaya S, Arıdoğan CB, Çetin H, Demirci M. Çocuk hastalardan alınan kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmalar ve antibiyotik dirençleri. Fırat Tıp Derg, 2007; 12 (1): 34-6.
15. Çöplü N, Aktaş D, Şimşek H, Esen B. Ulusal antimikrobiyal direnç surveyans sistemi (UAMDSS) için seçilmiş olan gram pozitif bakterilerde 2011 yılı verilerine göre antimikrobiyal ajanlara karşı direnç yüzdeleri. XXXV. Türk Mikrobiyoloji Kongresi. Kasım, 3-7, Aydın-Türkiye. 2012.
16. Ahmed SH, Daef EA, Badary MS, Mahmoud MA, AbdElsayed A. Nosocomial blood stream infection in intensive care units at Assiut University Hospitals (Upper Egypt) with special reference to extended spectrum b-lactamase producing organisms. BMC Research Notes, 2009; 2: 76.
17. Zarakolu P, Metan G, Hasçelik G, Akova M. Hastane enfeksiyonu etkeni olarak kan kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz prevalansı. Mikrobiyol Bul, 2007; 41(4): 579-84.
18. Şimşek H, Aktaş D, Çöplü N, Esen B. Ulusal antimikrobiyal direnç surveyans sistemi (UAMDSS) için seçilmiş olan gram negatif bakterilerde 2011 yılı verilerine göre antimikrobiyal ajanlara karşı direnç yüzdeleri. XXXV. Türk Mikrobiyoloji Kongresi. Kasım, 3-7, Aydın-Türkiye. 2012.
19. Peterson DL. Serious infections in the intensive care unit: Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii. Clin Infect Dis, 2006; 4: 41-2.
20. Uzun B, Güngör S, Yurtsever S, Afşar İ, Demirci M. Yoğun bakım hastalarının kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumları. ANKEM Derg, 2012; 26(2): 55-60.
21. Çetin ES, Kaya S, Pakbaş İ, Demirci M. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalardan izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. İnönü Üniv Tıp Fak Derg, 2007; 14(2): 69-73.