Şebnem TİRENG KARUT, Sümer HORUZ, Yeşim AYSAN

Domates Bakteriyel Kanser ve Solgunluk Hastalığı Etmeni Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis’ in Tohumda Aranması ve Farklı Tohum Uygulamalarının Hastalık Gelişimi Üzerine Olan Etkisinin Belirlenmesi

Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), domateste tohum kökenli bakteriyel kanser ve solgunluk hastalığına neden olur. Bu hastalık tüm dünyada seralarda ve tarlada yetiştirilen domateslerde ciddi kayıplar oluşturmaktadır. Hastalığa karşı etkin bir mücadele yöntemi bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amaçlarından biri ülkemizde kullanılan 41 adet ticari domates tohumlarında patojen Cmm varlığının fidede belirti izleme, tohum çalkalama suyundan King B ve SCM besi yerlerine ekim ile bakteri izolasyonu yapılarak türe spesifik ELISA ve BIO-PCR yöntemleriyle tespit etmektir. Diğer amacı ise, tohum kökenli inokulumu yok edebilecek veya azaltabilecek farklı tohum uygulamalarının etkisini belirlemektir. Bu amaçla, yapay olarak patojenle bulaşık domates tohumlarına $K_2C\\$ kodlu bölgesel bir antagonist bakteri, Serenade, ISR 2000, sodyum hipoklorit, üzüm sirkesi, elma sirkesi, sıcak su ve laktik asit uygulanmıştır. Tohum çalkalama suyundan yapılan ELISA testlerinde bir adet tohum partisinde (tohum partisi 13) ve SCM besi yerinde gelişen bakterilerin toplanmasıyla yapılan ELISA testlerinde iki farklı tohum partisinde (tohum partisi 6 ve 13) Cmm bulaşıklığı saptanmıştır. Yapılan çeşitli tohum uygulamaları, tohumdaki bakteri yoğunluğunu %77-100, bulaşık tohum sayısını % 31-100 oranında azaltmıştır. Sodyum hipoklorit, üzüm sirkesi, elma sirkesi, sıcak su ve laktik asit uygulamaları başarılı tohum uygulamaları olarak saptanmıştır. Çalışma ile, konvansiyonel ve organik tarım yetiştiriciliğinde patojene karşı üzüm ve/veyaelma sirkesi tohum uygulamalarının kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.

Detection of Tomato Bacterial Canker and Wilt Disease Agent Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis on/in Tomato Seeds and Efficacy of Different Seed Treatments on Pathogen Development

Seed-borne pathogenic bacterium, Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm), causes bacterial canker and wilt disease on tomato plants. Disease raises severe economic losses both on greenhouse or field grown tomatoes worldwide. No effective management strategy is available to avoid the disease. The aims of this study were (1) to detect Cmm on/in seeds of 41 individual seedlots using the methods seedling grow-out assay, pathogen isolation from seed washing water dilutions onto King’s Medium B and SCM with the aid of Cmm specific ELISA and BIO-PCR, (2) to determine the efficacy of seed treatments like regional antagonistic bacterium coded $K_2C\\$ , Serenade, ISR 2000, sodium hypochloride, grape and apple vinegars, hot water and lactic acid to reduce/eliminate pathogen inoculum from tomato seeds. Cmm specific ELISA could detected one contaminated seed lot (seed lot 13) from seed washing water and two contaminated seedlots (seedlot 6 and 13) from seed dilutions onto semi selective medium SCM. Seed treatments successfully reduced pathogen inoculum on/in seeds and contaminated seeds from 77 to 100% and from 31 to 100%, respectively. In this study, the seed treatments sodium hypochlorite, grape and apple vinegars, hot water and lactic acid proved to be most efficient. As a result, the study concluded that grape and apple vinegars can be used as seed treatments in conventional and organic farming systems to avoid Cmm contamination.

PDF

___

Anonim, 2018. Domatesin Türkiye ve dünyadaki durumu, BATEM. http://www. batem.gov.tr/urunler/sebzelerimiz/domates/domates.htm, erişim tarihi 2.12.2018.
Aysan, Y., Sahin, F., Çetinkaya-Yıldız, R., Mirik, M. and Yucel, Y., 2004. Occurence and primer inoculum sources of bacterial stem rot caused by Erwinia species on tomato in the Eastern Mediterranean region of Turkey. Journal of Plant Diseases and Protection, 112:42-51.
Aysan, Y., ve Çetinkaya-Yıldız, R., 2006. Domates bakteriyel solgunluk hastalığına karşı bitki büyüme düzenleyici rizobakterilerle dayanıklılığın teşviki, TOVAG–105 O 465 no’lu Proje Sonuç Raporu, 34 sayfa.
Chang, R. J., Ries, S. M., and Pataky, J. K., 1992. Local sources of Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis in the development of Bacterial Canker on Tomatoes. Phytopathology, 82:553-560.
Chetelat R.T. 2014. Tomato diseases, pests and disorders. In: Jones, J.B, Zitter, T.A., Momol, T.M. and Miller, S. (Eds.) Compendium of tomato diseases and pests. 2nd edition. APS Press. St. Paul, Minnesota, 55121, USA, 1-5.
Çetinkaya-Yıldız, R., 2007. Domates Bakteriyel solgunluk hastalığı etmeni [Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Smith) Davis Et. Al.]’nin tanılanması ve bitki büyüme düzenleyici rizobakteriler ile biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Doktora Tezi, Adana, 173s.
Dreier J., Bermpohl A., Eichenlaub R., 1995. Southern hybridization and PCR for specific detection of phytopathogenic Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis. Phytopathology 85: 462-468.
FAO, 2016. FAOSTAT Agriculture. http://faostat.fao.org/site/567/-DesktopDefault. aspx?PageID=567#ancor, Erişim tarihi 02.12.2018.
Fatmi, M. Schaad, N. W. 1988. Semiselective agar medium for isolation of Clavibacter michiganense subsp. michiganense from tomato seed. Phytopathology, 78:121-126.
Fatmi, M., Schaad, N. W., and Bolkan, H. A., 1991. Seed treatments for eradicating Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis from naturally infected tomato seeds. Plant Disease, 75:383-385.
Gleason, M.L. Gitaitis R.D. Miller, S.A. 2014. Bacterial canker. In: Jones, J.B, Zitter, T.A., Momol, T.M. and Miller, S. (Eds.) Compendium of tomato diseases and pests. 2nd edition. APS Press. St. Paul, Minnesota, 55121, USA, 50-53.
Horuz S. Sari A. and Aysan Y. 2018. Efficacy of hot water and chemical seed treatments on bacterial speck of tomato in Turkey. Fresenius Enviromental Bulletin, 27(5): 3185-3190.
King, E.O. M.K. Ward, and D.E. Raney, 1954. Two simple media for the demonstration of pyocianin and floresin. J.Lab. Clin. Med. 44:301-307.
Lang, M.M., Ingham, B.H. and Ingham, S.C. 2000. Efficacy of novel organic acid and hypochlorite treatments for eliminating Escherichia coli O157:H7 from alfalfa seeds prior to sprouting. International Journal of Food Microbiology 58 : 73–82.
Mengulluoglu, M., and Soylu, S. 2012. Antibacterial activities of essential oils from several medicinal plants against the seed-borne bacterial disease agent Acidovorax avenae subsp. citrulli. Research on Crops, 13: 641-646.
Nei, D., Bari, M.L. and Enomoto, K. 2013. Validation of hot water and chlorine treatments to inactivate pathogens inoculated on mung bean seeds: Influence of the seed production area. Food Control 32: 186-189.
Nejat, N. K. Sijam, S.N.A. Abdullah, G. Vadamalai, and M. Dickinson, 2009. Molecular characterization of a phytoplasma associated with Coconut Yellow Decline (CYD) in Malaysia. American Journal of Applied Sciences, 6 (7):1331-1340.
Özaktan, H, 1991. Domates bakteriyel solgunluğu (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) ile savaşım olanakları üzerine araştırmalar. Ege Üniversitesi Doktora Tezi, Bornova-İzmir, 98s.
Soylu, S., Baysal, Ö. and Soylu, E.M. 2003. Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-s-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) in tomato seedlings. Plant Science 165: 1069-1075.
Sivritepe, H.Ö. 1999. Sebze tohumlarında kalite ve performansın arttırılması üzerine ozmotik koşullandırmanın etkileri. Türkiye 3. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 14-17 Eylül 1999, Ankara, s. 525-529.
Tokgönül, S., 1998. Ticari domates tohumlarında bakteriyel solgunluk etmeni (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis)’nin saptanması ve etmene karşı mücadele olanakları üzerine araştırmalar. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Doktora Tezi, Adana, 93s