Avrupa ve Türkiye’den Toplanan Venturia inaequalis İzolatlarının Genetik Farklılığının Moleküler Markırlar ile Değerlendirilmesi

Elma kara lekesi hastalığı Venturia inaequalis Cke Wint dünyada olduğu gibi ülkemizde de elmanın ana hastalığıdır. Hastalık, yurdumuzda elma yetiştirilen tüm bahçelerde önemli ürün kaybına neden olabilmektedir. Bu çalışmada moleküler markırlar ile Türkiye’den ve Avrupa’dan toplanan Elma kara lekesi izolatlarının genetik farklılıkları ve akrabalık ilişkileri araştırılmıştır. Moleküler çalışmalarda RAPD, ISSR, SSR ve SRAP markırları kullanılmıştır. Markırsistemlerinden elde edilen sonuçlara göre, izolatların tamamı birbirinden ayrılmış ve bunlar arasında bir varyasyon olduğu görülmüştür. Genetik benzerlikler birbirine yakın bulunmuş, gruplar arasında konukçu seçimi ve coğrafik konum yönünden farklılıklar oluşmamıştır. SSR ve SRAP markırlarında gruplar daha toplu oluşmuş ve uygulamanın kolaylığı, tekrarlanabilirliği ve spesifikliği bakımından daha bilgi verici bulunmuştur.

The Assessment of Genetic Diversity of Venturia inaequalis Isolates Obtained from Turkey and Europe by Molecular Markers

Apple scab Venturia inaequalis Cke Wint is the main disease of apple trees not only in the world but also in Turkey. The disease can cause severe yield losses in all Turkish apple orchards. Genetic diversity and relatedness of apple scab Venturia inaequalis Cke Wint isolates collected from Turkey and Europe were investigated in this study through molecular markers. RAPD, ISSR, SSR and SRAP markers were used in the molecular studies. Results obtained by marker system revealed that isolates were quite separated from each other and it is appeared to exist a variation between them. Genetic relatedness between the isolates are very close to each other, and difference among the groups is not significant due to host specificity and geographical location. The groups are consisted of more number of isolates when SSR and SRAP markers are used compared with ISSR and RAPD markers. Using SSR and SRAP markers are preferable to provide more informative outcomes because of ease of use, repeatability and specificity

___

  • Barbara D J, Roberts A & Xu X-M (2008). Virulence characteristics of apple scab (Venturia inaequalis) isolates from monoculture and mixed orchards. Plant Pathology 57(3): 552-561
  • Baysal Ö, Siragusa M, İkten H, Polat İ, Gümrükçü E, Yiğit F, Carimi F & Teixeira da Silva J A (2009). Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. Physiological and Molecular Plant Pathology 74(1): 68-75
  • Boehm E W A, Freeman S, Shabi E & Michailides T J (2003). Microsatellite primers indicate the presence of asexual populations of Venturia inaequalis in Coastal Israeli apple orchards. Phytoparasitica 31(3): 236-251
  • Dice L R (1945). Measures of the amount of ecologic association between species. Ecology 26(3): 297-302
  • Gladieux P, Zhang X-G, Afoufa-Bastien D, Valdebenito Sanhueza R-M, Sbaghi M & Le Cam B (2008). On the origin and spread of the scab disease of apple: Out of Central Asia. PLoS ONE 3(1): e1455. doi:10.1371/ journal.pone.0001455
  • Guérin F & Le Cam B (2004). Breakdown of the scab resistance gene Vf in apple leads to a founder effect in populations of the fungal pathogen Venturia inaequalis. Phytopathology 94(4): 364-369
  • Guérin F, Franck P, Loiseau A, Devaux M & Cam B L (2004). Isolation of 21 new polymorphic microsatellite loci in the phytopathogenic fungus Venturia inaequalis. Molecular Ecology Notes 4(2): 268-270
  • Kaymak S, Boyraz N, İşci M, Dolunay E M & Özongun Ş (2008). MM 106 anaçlı bazı elma çeşitlerinin elma karalekesi hastalığı (Venturia inaequalis (Cke) Wint.)’na karşı dayanıklılık reaksiyonlarının belirlenmesi üzerine araştırmalar. Selçuk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 22(46): 55-61
  • Li G & Quiros C F (2001). Sequence related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: Its application to mapping and gene tagging in Brassica. Theoretical and Applied Genetics 103(2-3): 455-461
  • MacHardy W (1996). Inheritance of resistance to Venturia inaequalis. In: Apple Scab, Biology, Epidemiology and Management. APS, St. Paul, pp. 61-103
  • MacHardy W, Gadoury D M & Gessler C (2001). Parasitic and biological fitness of Venturia inaequalis: relationship to disease management strategies. Plant Disease 85(10): 1036-1051
  • Melounova M, Vejl P, Sedlák P, Reznerová A, Tesařová M, Blažek J & Zoufalá J (2004). The variability of Venturia inaequalis CKE. Races in the Czech Republic and the accumulation of resistance genes in apple germplasm. Plant Soil and Environment 50(9): 416-423
  • Padder B A, Shah M D, Mushtaq Ahmad T A S, Ahanger F A & Hamid A (2011). Genetic differentiation among populations of Venturia inaequalis in Kashmir: A North-Western State of India. Asian Journal of Plant Pathology 5(2): 75-83
  • Rohlf F J (1993). NTSYS-PC, numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 1.8. Exeter Software. Setauket, NY
  • Sierotzki H & Gessler C (1998). Genetic analysis of a cross of two Venturia inaequalis strains that differ in virulence. Journal of Phytopathology 146(10): 515-519
  • Sierotzki H, Eggenschwiler M, Boillat O, McDermott J M & Gessler C (1994). Detection of variation in virulence toward apple cultivars in natural populations of Venturia inaequalis. Phytopathology 84(10): 1005-1009
  • Soriano J M, Joshi S G, Van Kaauwen M, Noordijk Y, Groenwold R, Henken B, Van de Weg W E & Schouten H J (2009). Identification and mapping of the novel apple scab resistance gene Vd3. Tree Genetics & Genomes 5(3): 475-482
  • Taylor J W, Geiser D M, Burt A & Koufopanou V (1999a). The evolutionary biology and population genetics underlying fungal strain typing. Clinical Microbiology Reviews 12(1): 126-146
  • Taylor J W, Jacobson D J & Fisher M C (1999b). The evolution of asexual fungi: reproduction, speciation and classification. Annual Review of Phytopathology 37(1): 197-246
  • Taylor J W, Jacobson D J, Kroken S, Kasuga T, Geiser D M, Hibbett D S & Fisher M C (2000). Phylogenetic species recognition and species concepts in fungi. Fungal Genetics and Biology 31(1): 21-32
  • Tenzer I & Gessler C (1997). Subdivision and genetic structure of four populations of Venturia inaequalis in Switzerland. European Journal of Plant Pathology 103(6): 565-571
  • Tenzer I & Gessler C (1999). Genetic diversity of Venturia inaequalis across Europe. European Journal of Plant Pathology 105(6): 545-552
  • Tenzer I, Ivanissevich S D, Morgante M & Gessler C (1999). Identification of microsatellite markers and their application to population genetics of Venturia inaequalis. The American Phytopathological Society 89(9): 748-753
  • Xu X, Yang J, Thakur V, Roberts A & Barbara D J (2008). Population variation of apple scab (Venturia inaequalis) isolates from Asia and Europe. Plant Disease 92(2): 247-252
  • Xu X, Roberts T, Barbara D, Harvey N G, Gao L & Sargent D J (2009). A genetic linkage map of Venturia inaequalis, the causal agent of apple scab. BMC Research Notes 2(163): 1-6
  • Yalım D (2005). Türkiye’de yetişen arpa çeşitlerinde genetik çeşitliliğin ISSR (basit dizilim tekrarları) moleküler markır tekniği ile saptanması. Yüksek lisans tezi, Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü (Basılmamış), Adana
Tarım Bilimleri Dergisi-Cover
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Yayıncı: Halit APAYDIN
Sayıdaki Diğer Makaleler

Doğu Akdeniz Bölgesi Zeytin Bahçelerinde Palpita unionalis ile İki Önemli Parazitoiti Apanteles brunnistigma ve Trichogramma evanescens Arasındaki İlişki

Gülay KAÇAR, Mehmet Rifat ULUSOY

İnek ve Keçi Sütü Karışımlarından Üretilen Kış Yoğurtlarının Fizikokimyasal ve Duyusal Karakteristikleri

Harun KESENKAŞ, Cem KARAGÖZLÜ, Oktay YERLİKAYA, Elif ÖZER, Aslı AKPINAR, Necati AKBULUT

Evaluation of Some Physical, Chemical and Sensory Properties of Kasar Cheese and Its Processed and Analogue Types

Musa YALMAN, Onur GÜNEŞER, Yonca KARAGÜL YÜCEER

Physicochemical and Sensory Characteristics of Winter Yoghurt Produced from Mixtures of Cow's and Goat's Milk

Aslı AKPINAR, Harun KESENKAŞ, Cem KARAGÖZLÜ, Elif ÖZER, Oktay YERLİKAYA, Necati AKBULUT

Avrupa ve Türkiye’den Toplanan Venturia inaequalis İzolatlarının Genetik Farklılığının Moleküler Markırlar ile Değerlendirilmesi

Suat KAYMAK, Nuh BOYRAZ, Hasan PINAR

The Assessment of Genetic Diversity of Venturia inaequalis Isolates Obtained from Turkey and Europe by Molecular Markers

Nuh BOYRAZ, Suat KAYMAK, Hasan PINAR

Kışlık Ekmeklik Buğday Çeşitlerinin Azot Etkinliklerinin Belirlenmesi

Bekir ATAR, Burhan KARA, Zeliha KÜÇÜKYUMUK

Bahçe Traktörlerinde Kullanılan Muharrik Lastiklerin Bazı Özelliklerinin Çeki Performansına Etkileri

Şerafettin EKİNCİ, Kazım ÇARMAN

Mercimek ve Yabani Yulaf Tohumlarının Kimi Fiziksel Özellikleri ve Gravite Masa Selektörü ile Yabani Yulaf Tohumlarının Mercimek Tohumlarından Ayrılmasını Etkileyen Özellikler Üzerine Bir Araştırma

Mansour RASEKH, Hadi BAGHERI, Mohammad Hossien KIANMEHR, Shahriar KOURAVAND

Yüksek Çözünürlüklü Uydu Görüntülerinde Farklı Görüntü İşleme Yöntemleri ile Yağ Gülü Parsellerinin Belirlenmesi

Rabia ERSAN, Levent BAŞAYİĞİT