Aynur EREN TOPKAYA, Mine AYDIN KURÇ, Özge TOMBAK, Dumrul GÜLEN

KAN KÜLTÜRLERİNDE ÜREYEN ENTEROBACTERİCEAE İZOLATLARINDA GENİŞLEMİŞ SPEKTRUMLU BETA-LAKTAMAZ SIKLIĞI VE KARBAPENEMAZ VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI

Amaç: Enterobactericeae ailesinin üyeleri kan kültürlerinde ürediklerinde daima etken olarak kabul edilmektedirler. Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (GSBL) üreten çoklu ilaca dirençli Enterobactericeae izolatlarına bağlı enfeksiyonların tedavisinde karbapenemler kullanılmaktadır. Karbapenemlerin, özellikle GSBL üreten bakteriler ile oluşan ciddi enfeksiyonların tedavisinde yaygın olarak kullanılması, karbapenemaz üreten suşların ortaya çıkmasına neden olmuştur. Bu çalışmada; kan kültürlerinde üreyen Enterobacteriaceae (E. coli ve K. pneumoniae) izolatlarında GSBL sıklığı ve karbapenemaz varlığı fenotipik yöntem ve moleküler yöntem ile araştırılmıştır. Materyal ve Metot: Namık Kemal Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na 01.01.2013-30.04.2016 tarihleri arasında gönderilen kan örneklerinden izole edilen 56 E.coli ve 11 K.pneumoniae izolatı çalışmaya alınmıştır. İzolatların GSBL varlığı Clinical and Laboratory Standards (CLSI) önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon ve kombine disk yöntemi ile çalışılmıştır. Karbapenemaz aktivitesi ise; karbapenemlerden herhangi biri için inhibisyon zonu

Investigation of Extended-Spectrum Beta-Lactamase Production Frequency and Carbapenemase Activity of Enterobactericeae Strains Isolated from Blood Cultures

Aim: The members of Enterobactericeae family are always accepted as pathogenic when they are isolated from blood cultures. The carbapenems are preferred for the treatment of serious infections caused by ESBL producing multidrugresistant Enterobactericeae isolates. Carbapenems are used extensively for treatment of serious infections caused by ESBL producing bacteria, this situation leads to emerging of carbapenemase producing strains. The main purposes of this study were to investigate ESBL positivity and the presence of carbapenemase by phenotypic method and molecular method from Enterobactericeae (E.coli and K.pneumoniae) strains isolated from blood cultures. Material and Method: 56 E. coli and 11 K.pneumoniae isolates isolated from the blood samples sent to the Namık Kemal University Health Practice and Research Center Microbiology Laboratory between 01.01.2013 and 30.04.2016 were taken to the study. ESBL positivity were determined by Kirby-Bauer disc diffusion method based on suggestion of Clinical and Laboratory Standards (CLSI). The zone diameter of carbapenem; measured as

PDF

___

Swaminathan M, Sharma S, Poliansky Blash S, Patel G, Banach DB, Phillips M, et al. Prevalence and risk factors for acquisition of carbapenem resistant Enterobacteriaceae in the setting of endemicity. Infect Control Hosp Epidemiol 2013;34(8):809-8.
Çakar A, Akyön Y, Gür D Karatuna O, Öğünç D, Özhak Baysan B, ve ark. Türkiye’de 2014 yılı İçinde izole edilen karbapeneme dirençli Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenemaz varlığının araştırılması. Mikrobiyol Bul 2016;50(1):21- 33.
Canton R, Akova M, Carmeli Y, Giske CG, Glupczynski Y, Gniadkowski M, et al. Rapid evolution and spread of carbapenemases among Enterobacteriaceae in Europe. Clin Microbiol Infect 2012;18(5): 413-31.
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance Standarts for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-fifth Informational Supplement. M100- S25.Wayne PA: CLSI 2015.
The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. EUCAST guidelines for detection of resistance mechanisms and specific resistances of clinical and/or epidemiological importance Version 2.0 2017. (http://www.eucast.org).
Centers for Disease Control and Prevention. Multiplex real-time PCR detection of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) and New Delhi metallo-βlactamase (NDM-1). 2011 [https:/ /www.cdc.gov/hai/pdfs/labsettings/kpc – ndm –protocol - 2011.pdf]. (Erişim tarihi: 25.07.2017)
Hindiyeh M, Smollen G, Grossman Z, Ram D, Davidson Y, Mileguir F, et al. Rapid Detection of blaKPC carbapenemase genes by real-time PCR. J Clin Microbiol 2008(Sept);2879-83.
Weldhagen GF, Prinsloo A. Molecular detection of GES-2 extended spectrum Betalactamase producing Pseudomonas aeruginosa in Pretoria, South Africa. Int J Antimicrob Agents. 2004; 24:35-8.
Avlami A, Bekris S, Ganteris G, Kraniotaki E, Malamou-Lada E, Orfanidou M, et al. Detection of metallo-β-lactamase genes in clinical specimens by a commercial multiplex PCR system. J Microbiol Methods 2010;83(2):185-7.
Saenz Y, Brinas L, Domínguez E, Ruiz J, Zarazaga M, Vila J, et al. Mechanisms of resistance in multipleantibiotic-resistant Escherichia coli strains of human, animal, and food origins. Antimicrob Agents Chemother 2004;48 (10):3996-1.
Hofko M, Mischnik A, Kaase M, Zimmermann S, Dalpke AH. Detection of carbapenemases by real-time PCR and melt curve analysis on the BD Max System. J Clin Microbiol. 2014;52(5):1701-4.
Turton JF, Woodford N, Glover J, Yarde S, Kaufmann ME, Pitt TL. Identification of Acinetobacter baumannii by detection of the blaOXA-51-like carbapenemase gene intrinsic to this species. J Clin Microbiol 2006;44(8):2974-6.
Poirela L, Walshb TR, Cuvilliera V, Nordmanna P. Multiplex PCR for detection of acquired carbapenemase genes. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2011; 70:119-23.
Hong SS, Kim K, Huh JH, Jung B, Kang MS, Hong SG. Multiplex PCR for rapid detection of genes encoding class a carbapenemases. Ann Lab Med. 2012; 32:359-61.
Gür D, Gülay Z, Akan OA, Aktaş Z, Bal Kayacan Ç, Çakıcı Ö. ve ark. Türkiye'de hastane izolatı gramnegatif bakterilerde yeni beta-laktam antibiyotiklere direnç ve GSBL tipleri: Çok merkezli Hitit sürveyansının sonuçları. Mikrobiyol Bul 2008; 42(4):537-44.
Gür D, Haşçelik G, Aydın N, Telli M, Gültekin M, Ogülnç D, et al. Antimicrobial resistance in gramnegative hospital isolates: results of theTurkish HITIT2 surveillance study of 2007. J Chemother 2009;21(4):383-9.
Pfaller MA, Jones RN. MYSTIC (Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection) results from the Americas: resistance implications in the treatment of serious infections. MYSTIC Study Group (Americas). J Antimicrob Chemother 2000; 46(Suppl T2):25-37.
Poirel L, Heritier C, Tolun V, Nordmann P. Emergence of oxacillinase-mediated resistance to imipenem in Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother 2004;48(1):15-22.
1Potron A, Poirel L, Rondinaud E, Nordmann P. Intercontinental spread of OXA-48 beta-lactamaseproducing Enterobacteriaceae over a 11-year period, 2001 to 2011. Euro Surveill. 2013;18(31). pii: 20549.
Güzel Tunçcan Ö, Tozlu Keten D, Dizbay M, Hızel K. Hastane kaynaklı Escherichia coli ve Klebsiella suşlarının ertapenem ve diğer antibiyotiklere duyarlılığı. ANKEM Derg 2008;22(4):188-92.
Görgeç S, Kuzucu Ç, Yetkin F, Ersoy Y. Kan kültürlerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten gram negatif bakterilerde tigesiklin ve diğer antimikrobiyallerin in vitro etkinliği ve karbapenemaz aktivitesinin araştırılması. İnönü Ünv Tıp Fak Derg 2011;18(2):106-10.
Doyle D, Peirano G, Lascols C, Lloyd T, Church DL, Pitout JD. Laboratory detection of Enterobacteriaceae that produce carbapenemases. J Clin Microbiol 2012; 50:3877-80.
Bush K. Alarming beta-lactamase-mediated resistance in multidrug-resistant Enterobacteriaceae. Curr Opin Microbiol. 2010; 13(5): 558-64.
Poirel L, Özdamar M, Ocampo-Sosa AA, Türkoğlu S, Ozer UG, Nordmann P. NDM-1-Producing Klebsiella pneumoniae now in Turkey. Antimicrob Agents Chemother 2012;56(5): 2784-5.
Kilic A, Baysallar M. The first Klebsiella pneumoniae isolate co-producing OXA-48 and NDM-1 in Turkey. Ann Lab Med. 2015;35(3):382-3.
Tekintaş Y, Çilli F, Eraç B, Yaşar M, Aydemir SS, Hoşgör Limoncu M. Klinik Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenemaz üretiminin saptanmasında polimeraz zincir reaksiyonu ve fenotipik yöntemlerin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul 2017; 51(3):269-76.
Lomaestro BM, Tobin EH, Shang W, Gootz T. The spread of Klebsiella pneumoniae carbapenemase– producing K. pneumoniae to upstate New York. Clin Infect Dis 2006;43(3):268.