Mona GAZEL, Bahar TUNÇ, Kadriye ÇAĞLAYAN

Hatay Ve Tekirdağ İlleri Bağ Alanlarında Odun Dokusunda Deformasyona (Rugose Wood) Neden Olan Virüslerin Serolojik Ve Moleküler Yöntemlerle Saptanması Ve Karakterizasyonu

Bağ yetiştiriciliğinin oldukça önemli olduğu Hatay ve Tekirdağ illerinde yetiştirilen farklı bağ çeşitlerinde odun deformasyonuna neden olan etmenleri araştırmak amacıyla 2015-2016 yıllarında bu çalışma yürütülmüştür. Yerli ve yabancı bağ çeşitlerinden olmak üzere Hatay’dan toplam 100, Tekirdağ’dan 133 örnek alınmıştır. Odun deformasyonuna neden olan etmenlerden Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD) ve Grapevine rupestris stem pitting associated virus (GRSPaV)’leri DAS-ELISA ve/veya RT-PCR yöntemleri ile araştırılmıştır. DAS-ELISA sonuçlarına göre Hatay’da farklı bağ çeşitlerinde GVA %4,77 enfeksiyon oranında bulunurken, Tekirdağ ilinden alınan örneklerin hiçbirisinde GVA saptanamamıştır. Hatay ve Tekirdağ illerinden alınan bağ örneklerinin RT-PCR yöntemiyle testlenmesi sonucu sırası ile en çok GVA (%69 ve %17), ve GRSPaV (RSP48-49 primeri ile %39 ve %40,6; RSP13-14 primeri ile %41 ve %12,96) bulunmuştur. GVD sadece Hatay ilinde %4 enfeksiyon oranıyla saptanırken GVB testlenen örneklerde bulunamamıştır. En çok rastlanan çoklu enfeksiyonlar ise GVA+GRSPaV (Hatay’da %37, Tekirdağ’da %12) olarak belirlenmiştir. Yapılan RT-PCR analizleri sonucunda GVA (429 bp), GVD (852 bp), GRSPaV (RSP48-49 primeri ile 330 bp ve RSPaV13-14 339 bp) için beklenen düzeyde DNA amplifikasyonları gözlenmiştir. GRSPaV’ünün seçilen 4 izolatının DNA dizilemesi yapılmış ve Gen Bankasında kayıtlı referans izolatlarla % 98-99 oranında benzerlik gösterdiği saptanmıştır.

Anahtar Kelimeler:

Bağ, GVA, GVB, GVD, GRSPaV

PDF

___

Anonim 2014. http://tuikapp.tuik.gov.tr/ bitkiselapp/bitkisel.zul
Clark MF, Adams AN, 1977. Characteristics of the microplate method of enzyme-linked. immunosorbentassay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology. 34: 475–83.
Fajardo TVM, Eiras M, Nickel O, Dubiela CR, Souto ER, 2012. Detection and partial molecular characterization of Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 and -6 infecting grapevines in Brazil. Ciência Rural, Santa Maria. 42 (12): 2127-2130.
Garau R, Prota VA, Piredda R, Boscia D, Prota U, 1997. On the possible relationship between Kober stem grooving and Grapevine virus A. Vitis, 33: 161-163.
MacKenzie DJ, Mclean, MA, Mukerjı S, Green M, 1997. Improved RNA extraction for woody plants for the detection of viral pathogens by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction. Plant Disease, 81: 222-226.
Martelli GP, 2014. Directory of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine and Their Agents. Journal of Plant Pathology, 96: 1-136.
Martelli GP, Boudon-Padieu E, 2006. Directory of infectious diseases of grapevines. Options Mediterraneennes, Series B55: 11-201.
Martelli GP, Adams MJ, Kreuze JF, Dolja VV, 2007. Family Flexiviridae: a case study in virion and genome plasticity. Annual Review of Phytopatohology, 45: 73-100.
Meng B, Pange SZ, Forsline PL, Mcferson JR, Gonsalves D, 1998. Nucleotide sequence and genome structure of grapevine rupestris stem pitting associated virus-1 reveal similarities to apple stem pitting. Journal of General Virology, 79: 2059-69.
Meng B, Zhu HY, Gonsaalves D, 1999. Rupetris stem pitting associated virus-1 consists of a family of sequence variants. Archives of Virology, 144: 2071-2085.
Minafra A, Saldarelli P, Grieco F, Martelli GP, 1994. Nucleotide sequence of the 3' terminal region of the RNA of two filamentous grapevine viruses. Archives of Virology, 137: 249-261.
Oraman MN, 1965. Arkeolojik Buluntuların Işığı altında Türkiye Bağcılığının Tarihçesi Üzerinde Araştırmalar. Ankara Ün. Ziraat Fak. Yıllığı. 15(2): 96-108.
Walter B, Martelli GP, 1997. Clonal and sanitary selection of the grapevine. In : Walter B (ed.) Sanitary Selection of the Grapevine. Protocols for the Detection of viruses and virus-like Diseases. Les Colloques, Paris, France: INRA Editions, 86: 43-95.
Zhang Y, Uyemoto JK, Golino D, Rowhani A, 1998. Nucleotide sequence and genome structure of Grapevine rupestris stem pitting associated virus-1 reveal similarities to Apple stem pitting virus. Journal of General Virology, 79: 2059-2069.