Çin Guangdong Bölgesindeki bir üçüncü basamak hastanede izole karbapenem dirençli Enterobacteriaceae kökenlerinin moleküler özellikleri

Amaç: Bu çalışmada Çin'in Guangdong bölgesinde bulunan bir eğitim hastanesinde, Ocak 2008 ile Aralık 2011 tarihleri arasında dönemde izole edilen karbapenem dirençli Enterobacteriaceae (CRE), kökenlerinin moleküler özelliklerini incelemesi amaçlanmıştır.Yöntemler: Çalışma döneminde 3286 suştan toplam 28 (% 0,9) CRE izolatı ayrıştırıldı ve çalışmaya alındı. Antimikrobiyal duyarlılık testleri, Modifiye Hodge (MHT) testi ve genotip incelenmesinde Pulsed-field jel elektroforez kullanıldı. Genişletilmiş spektrumlu ?-laktamaz (GSBL) ve karbapenemaz genlerinin varlığı, gen amplifikasyonu ve dizi analizi kullanılarak tespit edildi. Bakterilerin Dış zar porini (OMP) genleri (OmpK35 / OmpK36 K. pneumoniae, E. cloacae için OMPC / OmpF) incelendi.Bulgular: MHT ile 28 kökenin yedisi (% 25,0) dirençli Enterobacteriaceae olarak tanımlandı. PCR ve dizi analizi gibi moleküler yöntemlerle kökenlerden 15'inin (% 53,6) GSBL pozitif olduğu, altısının AmpC (% 21,4), beşinin IMP-4 (% 17,9) ve dokuzunun en az iki farklı sınıf dirence sahip olduğu görülmüştür. Özel olarak, yedi MHT pozitif kökenin beşinin (% 71,4) karbapenemaz kodlayan genlerinin IMP-4 üretimine bağlı iken PFGE analizinde bir K. pneumoniae dışında hemen hemen tüm CRE kökenlerinin, OMPC ve / veya ompF içinde OmpK35 ve / veya OmpK36 kaybı gen ifade kaybı gözlendi. PFGE analizi genomik değişkenlik gösterdi.Sonuç: Enterobacteriaceae karbapenem direnci bu organizmalarda gözlenen OMP'lerin kayb sonucu oluşan porin'e değişimi ve ?-laktamazların kombine etkisi nedeniyle oluşmaktadır. CRE yayılımı ve enfeksiyonlar hem anlamlı acil halk sağlığı hedefleri haline gelmiştir önlemek için.

Molecular characteristics of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates from a Chinese Tertiary hospital in Guangdong

Objective: The aim of this study was to investigate the molecular characteristics of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) isolates from a teaching hospital in Guangdong, China, during the period between January 2008 and December 2011. Methods: A total of 28 (0.9%) CRE isolates were collected among 3286 isolates. Antimicrobial susceptibility testing, Modified Hodge Test (MHT) and genotyping by pulsed-field gel electrophoresis were performed. Extended-spectrum ?-lactamase (ESBL) and carbapenemase genes were detected using gene amplification and sequencing. Outer membrane porin (OMP) genes (OmpK35/OmpK36 for K. pneumoniae, OmpC/OmpF for E. cloacae were examined.Results: Seven (25.0%) isolates of the 28 carbapenem resistant Enterobacteriaceae had a positive MHT. PCR and sequencing analysis revealed that 19 of the 28 isolates were molecularly confirmed to harbor ESBLs (15 isolates, 53.6%), AmpC (6 isolates, 21.4%), or IMP-4 (five isolates, 17.9%), and nine (32.1%) isolates of the 28 isolates possessed at least two different classes of ?-lactamases. Specially, five (71.4%) of seven MHT-positive CRE isolates is due to the production of the carbapenemase-encoding gene IMP-4. Almost all of the CRE isolates in the present study loss gene expressions of OmpK35 and/or OmpK36 in K. pneumoniae, OmpC and/or OmpF in E. cloacae, except for one K. pneumoniae. PFGE analysis demonstrated genomic variability.Conclusion: Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae is due to the combined effect of ?- lactamases with porin impermeability caused by loss of OMPs observed in these organisms. To prevent both CRE transmission and infections has become significantly urgent public health objectives. J Microbiol Infect Dis 2014; 4(4): 145-151

___

  • 1. Brink AJ, Feldman C, Grolman DC, et al. Appropriate use of the carbapenems. S Afr Med J 2004; 94:857-861.
  • 2. Rhomberg P R, Jones R N. Summary trends for the Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection Program: a 10-year experience in the United States (1999- 2008). Diagn Microbiol Infect Dis 2009; 65:414-426.
  • 3. Hidron AI, Edwards JR, Patel J, et al. NHSN annual update: antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: annual summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2006-2007. Infect Control Hosp Epidemiol 2008; 29:996-1011.
  • 4. Livermore DM, Woodford N. The beta-lactamase threat in Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter. Trends Microbiol 2006; 14:413-420.
  • 5. Nordmann P, Naas T, Poirel L. Global spread of Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. Emerg Infect Dis 2011; 17:1791-1798.
  • 6. Doumith M, Ellington M J, Livermore D M, et al. Molecular mechanisms disrupting porin expression in ertapenem-resistant Klebsiella and Enterobacter spp. clinical isolates from the UK. J Antimicrob Chemother 2009; 63:659-667.
  • 7. Kim S Y, Park Y J, Yu J K, et al. Prevalence and mechanisms of decreased susceptibility to carbapenems in Klebsiella pneumoniae isolates. Diagn Microbiol Infect Dis 2007; 57:85-91.
  • 8. Wang X D, Cai J C, Zhou H W, et al. Reduced susceptibility to carbapenems in Klebsiella pneumoniae clinical isolates associated with plasmid-mediated beta-lactamase production and OmpK36 porin deficiency. J Med Microbiol 2009; 58:1196-1202.
  • 9. Cai J C, Zhou H W, Zhang R, et al. Emergence of Serratia marcescens, Klebsiella pneumoniae, and Escherichia coli Isolates possessing the plasmid-mediated carbapenemhydrolyzing beta-lactamase KPC-2 in intensive care units of a Chinese hospital. Antimicrob Agents Chemother 2008; 52:2014-2018.
  • 10. Yu F, Ying Q, Chen C, et al. Outbreak of pulmonary infection caused by Klebsiella pneumoniae isolates harbouring blaIMP-4 and blaDHA-1 in a neonatal intensive care unit in China. J Med Microbiol 2012; 61:984-989.
  • 11. Wei Z, Yu T, Qi Y, et al. Coexistence of plasmid-mediated KPC-2 and IMP-4 carbapenemases in isolates of Klebsiella pneumoniae from China. J Antimicrob Chemother 2011;66:2670-2671.
  • 12. Yan J J, Ko W C, Wu H M, et al. Complexity of Klebsiella pneumoniae isolates resistant to both cephamycins and extended-spectrum cephalosporins at a teaching hospital in Taiwan. J Clin Microbiol 2004;42:5337-5340.
  • 13. Yigit H, Queenan A M, Anderson G J, et al. Novel carbapenem-hydrolyzing beta-lactamase, KPC-1, from a carbapenem-resistant strain of Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother 2001;45:1151-1161.
  • 14. Queenan A M, Bush K. Carbapenemases: the versatile betalactamases. Clin Microbiol Rev 2007; 20:440-458.
  • 15. Poirel L, Benouda A, Hays C, et al. Emergence of NDM- 1-producing Klebsiella pneumoniae in Morocco. J Antimicrob Chemother 2011;66:2781-2783.
  • 16. Dai W, Sun S, Yang P, et al. Characterization of carbapenemases, extended spectrum beta-lactamases and molecular epidemiology of carbapenem-non-susceptible Enterobacter cloacae in a Chinese hospital in Chongqing]. Infect Genet Evol 2013; 14:1-7.
  • 17. Hidron A I, Edwards J R, Patel J, et al. NHSN annual update: antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: annual summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2006-2007. Infect Control Hosp Epidemiol 2008; 29:996-1011.
  • 18. Patel G, Huprikar S, Factor S H, et al. Outcomes of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae infection and the impact of antimicrobial and adjunctive therapies. Infect Control Hosp Epidemiol 2008;29:1099-1106.
  • 19. Gupta N, Limbago B M, Patel J B, et al. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae: epidemiology and prevention. Clin Infect Dis 2011;53:60-67.
  • 20. Hirsch E B, Tam V H. Detection and treatment options for Klebsiella pneumoniae carbapenemases (KPCs): an emerging cause of multidrug-resistant infection. J Antimicrob Chemother 2010;65:1119-1125.
  • 21. Balm M N, Ngan G, Jureen R, et al. Molecular characterization of newly emerged blaKPC-2-producing Klebsiella pneumoniae in Singapore. J Clin Microbiol 2012;50:475-476.
  • 22. Hu F, Chen S, Xu X, et al. Emergence of carbapenem-resistant clinical Enterobacteriaceae isolates from a teaching hospital in Shanghai, China. J Med Microbiol 2012;61:132-136.
  • 23. Nordmann P, Poirel L, Carrer A, et al. How to detect NDM-1 producers. J Clin Microbiol 2011;49:718-721.
  • 24. Cornaglia G, Giamarellou H, Rossolini G M. Metallo-betalactamases: a last frontier for beta-lactams? Lancet Infect Dis 2011;11:381-393.
  • 25. Yan J J, Ko W C, Chuang C L, et al. Metallo-beta-lactamaseproducing Enterobacteriaceae isolates in a university hospital in Taiwan: prevalence of IMP-8 in Enterobacter cloacae and first identification of VIM-2 in Citrobacter freundii. J Antimicrob Chemother 2002;50:503-511.
  • 26. Kumarasamy K K, Toleman M A, Walsh T R, et al. Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study. Lancet Infect Dis 2010;10:597-602.
  • 27. Rolain J M, Parola P, Cornaglia G. New Delhi metallo-betalactamase (NDM-1): towards a new pandemia? Clin Microbiol Infect 2010;16:1699-1701.
  • 28. Doumith M, Ellington M J, Livermore D M, et al. Molecular mechanisms disrupting porin expression in ertapenem-resistant Klebsiella and Enterobacter spp. clinical isolates from the UK. J Antimicrob Chemother 2009;63:659-667.
Journal of Microbiology and Infectious Diseases-Cover
  • ISSN: 2146-3158
  • Başlangıç: 2011
  • Yayıncı: Sağlık Araştırmaları Derneği
Sayıdaki Diğer Makaleler

İran Kerman'da hastane kökenli Staphylococcus aureus suşlarında antimikrobiyalduyarlılık, virulans faktörleri ve biyofilm yapımı

Mohammad Reza SHAKİBAİE, Gholamabas SALAJEGHEH, Yasser GOLKARİ

Kedi tırmalaması sonrası Pasteurella multocida'ya bağlı abse: Olgu sunumu

Pınar KORKMAZ, Yeşim ALPAY, Nevil AYKIN, Figen ÇEVİK

Uzamış kolestazı olan akut hepatit A enfeksiyonunda steroid kullanımı

Meltem Işıkgöz TAŞBAKAN, Hasip KAHRAMAN, Bilgin Arda ARDA, Sercan ULUSOY, Tansu YAMAZHAN, Hüsnü PULLUKÇU, Oğuz Reşat SİPAHİ

Febril nötropenik kanser hastalarında serum amiloid-A and C-reaktif protein CRP'nin enfeksiyon için öngörü değeri

Ayşe BATIREL, Serdar ÖZER, Taflan SALEPCİ, Serap GENCER

Çin Guangdong Bölgesindeki bir üçüncü basamak hastanede izole karbapenem dirençli Enterobacteriaceae kökenlerinin moleküler özellikleri

Min LİU, Kang LİAO, Penghao GUO, Dongmei CHEN, Yili CHEN, Han HUANG, Yan ZENG

Miyelodisplastik sendromlu bir hastada Campylobacter fetus subsp. fetus'e bağlı bir bakteriyemi: Olgu sunumu

Hatice Türk DAĞI, Mehmet DAĞLI, Ayşe Rüveyda UĞUR, İnci TUNCER

Mycobacterium tuberculosis tanısında mikroskopi ve PCR metotlarının karşılaştırılması

Pooja SAXENA, Ashish K. ASTHANA, Molly MADAN

BOS'tan izole edilen pnömokok suşlarında penisilin direncinin artışı: Bir eğitim hastanesinden 15 yıllık tecrübe

Sevtap GÜRSOY, Gönül ŞENGÖZ, Filiz PEHLİVANOĞLU

İnsan barsağında gastrodüedonal hastalıklara yol açan Heliccobacter pylori'nin kalıcı kolonizasyonu

Animesh SARKER, Tasnim AHMED, Marufa NASREEN, Rafiad ISLAM, Rezual ISLAM, Noor JAHAN

Bu gerçekten bir erizipel mi?

İlker İnanç BALKAN, Muhammed BEKÇİBAŞI, Ayşe SALİHOĞLU, Ali MERT