Gökkuşağı Alabalığında Karşılaşılan Bazı Bakteriyel Hastalık Etkenlerinin Hızlı Teşhisi

Bu çalışmada, PCR yöntemi ile gökkuşağı alabalığında (Oncorhynchus mykiss) hastalığa neden olan beş farklı patojenin (Aeromonas salmonicida, Aeromonas hydophila, Yersinia ruckeri, Flavobacterium psychrophila ve Renibacterium salmoninarum) hızlı teşhis edilebilmesi için beşyüz elli balık doku (solungaç, böbrek, ağız, deri ve yüzgeç) örneğinden direk olarak saflaştırılan DNA’lar kullanılmıştır. Çalışmamızdaki balık hastalık etkenlerini tespit edebilmek için beş farklı hedef gen bölgesi (gryA, gyrB, ompTS, n-DNA ve YER) kullanılmıştır ve bunların PCR reaksiyonları gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızda sonuç olarak, hastalıklara neden olan etken bakteriler, dokulardan izole edilen DNA’lardaki hedef genlerin PCR methodu kullanılarak tespit edilmesiyle 3-4 saat içerisinde tanımlanmıştır. 
Anahtar Kelimeler:

PCR, Balık hastalığı

Rapid Detection of Some Bacterial Diseases in Rainbow Trout

In this study, we used five hundred fifty different tissue samples (gill, kidney, mouth, skin and finn) to detect five pathogens (A. salmonicida, A. hydophila, Y. ruckeri, F. psychrophila and R. salmoninarum) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) with using direct PCR methods. Five targeted genes (gryA, gyrB, ompTS, n-DNA and YER) have been chosen to detect the causative agents of diseases. As a result, five infection agents of rainbow trout were identified and determinated within 3-4 hours time by using direct PCR from fish tissues, without any microbiological examination methods.
Keywords:

PCR, Fish Diseases,

___

  • Austin, B., Austin, D.A. (2007). Bacterial Fish Pathogens Diseases of Farmed and Wild Fish. Springer, Praxis Publishing Chichester, UK.
  • Balcazar, J.L., Vendrell, D., de Blas, I., Ruiz-Zarzuela, I., Gironés, O., Múzquiz, J.L. (2007). Quantitative detection of A.salmonicida in fish tissue by real-time PCR using self-quenched, fluorogenic primers. J. Med. Mic., 56(3), 323-8.
  • Cerro, A., Marquez, I., Guıjarro, J.A. (2002). Cerro, A., Marquez, I., Guıjarro, J.A. (2002). Simultaneous detection of A.salmonicida. Appl. Envir. Mic., 68(10), 5177-5180.
  • Chu, W.H., Lu, C.P. (2005). Multiplex PCR assay for the detection of pathogenic A.hydrophila. J. Fish Dis. 28(7), 437-441.
  • Diler, Ö. Altun, S., Çalıkuşu, F., Diler, A. (2000). Gökkuşağı alabalığı (O. mykiss)’nin yaşadığı ortam ile ilişkili kalitatif ve kantitatif bakteriyel florası üzerine bir araştırma, Turkish J. Vet. Anim. Sci., 24, 251-259.
  • Gibello, A., Blanco, M.M., Moreno, M.A., Cutuli, M.T., Domenech, A., Domínguez, L., Fernández-Garayzábal, J.F. (1999). Development of a PCR assay for detection of Y. ruckeri in tissues of inoculated and naturally infected trout. Appl. Envir. Mic., 65(1), 346-350.
  • Gustafson, C.E., Thomas, C.J., Trust, T.J. (1992). Detection of A.salmonicida from fish by using PCR amplification of the virulence surface array protein gene. App. Envir.Mic., 58(12), 3816-25.
  • Hidalgo, R., Magi, G.E., Balboa, S., Barja, J.L., Romalde, J.L. (2008).Development of a PCR protocol for the detection of A.salmonicida in fishby ampli. of the fstA gene. Vet. Mic., 128(3), 386-394.
  • Khushiramani, R., Girisha, S.K., Karunasagar, I., Karunasagar, I.,(2007). Cloning and expression of an outer membrane protein ompTS ofA.hydrophila and study of immunogenicity in fish. Pro. Exp. Pur.51(2):303-7.
  • Kingombe, C.I.B., D'Aoust, J.Y., Huys, G., Hofmann, L., Rao, M., Kwan, J. (2010). Multiplex PCR method for detection of three A. enterotoxin genes. Appl. Envir. Mic., 76, 425-433.
  • Miriam, A., Griffiths, S.G., Lovely, J.E., Lynch, W.H. (1997). PCR and probe-PCR assays to monitor broodstock Atlantic salmon ovarian fluid and kidney for presence of DNA of the fish pathogen R.salmoninarum. J. Clin. Mic., 35(6), 1322-1326.
  • Murcia, M.A.J., Soler, L., Saavedra, M.J., Chacón, M.R., Guarro, J., Stackebrandt, E. (2005). Phenotypic, genotypic, and phylogenetic discrepancies to differentiate A.salmonicida from A. bestiarum. In. Mic., 8(4), 259-269.
  • Onuk, E.E., Ciftci, A., Findik, A., Durmaz, Y. (2010). Development and evaluation of a multiplex PCR assay for simultaneous detection of F.psychrophilum, Y.ruckeri and A.salmonicida in culture fisheries. J. Vet. Sci., 11(3), 235-241.
  • Powell, M., Overturf, K., Hogge, C., Johnson, K. (2005). Detection of R.salmoninarum in chinook salmon, O. tshawytscha, using q-PCR. J. Fish Dis., 28(10), 615-622.
  • Rhodes, L.D., Coady, A.M., .Deinhard, R.K. (2004). Identification of a msa gene in R.salmoninarum and the associated virulence phenotype. Appl.Envir.Mic., 70(11), 6488-94.
  • Roozbahani, M.R., Bandehpour, M., Haghighi-Khiabanian-Asl, A.Abdollahi, H., Kazemi, B., (2009). PCR-Based detection of Y. ruckeriInfection in Rainbow Trout Fish. Asian J. Ani. Vet. Adv. 4(5):258-62.
  • TUİK, 2017. Türkiye İstatistik Kurumu http://www.tuik.gov.tr. Alıntı tarihi: 2018
  • Uma, A., Rebecca, G., Meena, S., Saravanabava, K. (2010). PCR Detection of putative aerolysin and hemolysin genes in an A.hydrophila isolate fromi Koi carp (Cyprinus carpio). Tamilnadu J. Vet. Anim. Sci., 6(1), 31-33.
  • Yeh, H. Y., Shoemaker, C.A., Klesius P.H. (2006). Sensitive and rapid detection of F.columnare in channel catfish Ictalurus punctatus by a loop‐mediated isothermal amplification method. J. Appl. Mic., 100, 919-925.
  • Yugueros, J., Temprano, A., Luengo, J.M., Naharro, G. (2001). Molecular cloning of Y.ruckeri aroA gene: a useful taxonomic tool. J. Fish Dis., 24(7), 383-90.
Journal of advances in vetbio science and techniques-Cover
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 2016
  • Yayıncı: İlker ÇAMKERTEN
Sayıdaki Diğer Makaleler

Gökkuşağı Alabalığında Karşılaşılan Bazı Bakteriyel Hastalık Etkenlerinin Hızlı Teşhisi

İfakat Tulay ÇAĞATAY, Erkan GÜMÜŞ

Hayvan beslemede nanoteknoloji

Duygu BUDAK

Determination of Host Fish Suitability for Unio terminalis delicatus (Bivalvia:Unionidae) From Gölbaşı Lake in Turkey

Hülya ŞEREFLİŞAN

Alopesili erkek köpeklerde düşük testesteron seviyelerinin incelenmesi

Lora KOENHEMSİ, Banu DOKUZEYLÜL, Remzi GÖNÜL, M. Erman OR

Türkiye tatlısu balık yetiştiriciliğinde alternatif bir tür olarak labeo rohita

Suat DİKEL, İbrahim DEMİRKALE, Esra GÖÇMEN

Konya Karapınar İlçesi Orta Anadolu Merinoslarında Sezon İçinde Koç Etkisinin Farklı Uygulamasının Döl Verimine, Aşım ve Doğum Süresine Etkisinin Araştırılması (II)

Şükrü DURSUN, Hasan GÜRBÜZ, Gaye BULUT, Mehmet KÖSE, Sıddık KESKİN, Caner ÖZTÜRK

Sera Koşullarında Melez Tilapiaların Sarımsak (Allium sativum) destekli yemlerle beslenmesinin büyüme performansına ve vücut besin bileşenleri üzerine etkileri

Alp ÖZGÜVEN, Suat DİKEL

Some properties of ayran fortified with black carrot powder

Dilek SAY, İbrahim Başar SAYDAM, Nuray GÜZELER

Boylamanın ve Büyük Bireylerin Yüzer Ağ kafeslerde Asya Kedi Balıklarının (Pangasianodon hypophthalmus) büyümeleri üzerine etkisi

Suat DİKEL, Esra GÖÇMEN

Sistemik Aspergillosis ve Kandidiyazisin Tedavisinde Ekinokandin Grubu Antimikotiklerin Etkinliği ve Veteriner Hekimliğindeki Yeri

Belgi NASİBOĞLU, Banu DOKUZEYLÜL, Fatma ALKAN, Ümit BARUTÇU, Mehmet OR