Fuat Sezgin 24 Ekim 1924 tarihinde Bitlis’te doğdu. Babası âlimdi. İlkokulu Doğubayazıt’ta, ortaokul ve liseyi Erzurum’da okudu. Üniversite eğitimi için 1943 yılında İstanbul’a gitti. Sezgin, İstanbul’a ilk gittiğinde matematik okuyup mühendis olmak istediğini, fakat bir yakının yönlendirmesiyle Alman şarkiyatçı Hellmut Ritter’le tanışıp ondan çok etkilenerek ilgisini şarkiyata yönlendirdiğini ifade etmiştir. Bu itibarla İstanbul Üniversitesi Şarkiyat Araştırmaları Enstitüsü’nde Ritter’in öğrencisi oldu. Aynı yıl Nazi Almanyası’nın Bulgaristan’a kadar ilerlemesi sonucu teyakkuza geçen Türkiye’de üniversitelerin güvenlik sebebiyle kapatılması, onun için bir fırsata dönüştü. Hocasının tavsiyesi üzerine Arapça öğrenmeye yoğunlaşan Sezgin, altı ay boyunca olağanüstü bir özveri göstererek Arapça’ya aşinalık kazandı. Bireysel teşebbüsle sürdürdüğü Arapça öğrenimini, Muhammed et-Taberî’nin (ö. 310/923) tefsirini, Türkçe meallerle karşılaştırmalı okuyarak gerçekleştirdiğini bizzat söylemiştir.