Selahattin KİRAZ, Seyrani KONCAGÜL, Mehmet Sait EKİNCİ

537

Keçilerde yapılan moleküler filogenetik çalışmalar

Evcil keçiler (Capra hircus ), yaklaşık 10.000 yıl önce Neolitik devirde Yakın Doğudaki FertileCrescent bölgesinde evcilleştirilmiş ve bugün Dünyanın bütün kıtalarına yayılmıştır. Keçiler,etinden, sütünden, lifinden ve derisinden yararlanılan önemli çiftlik hayvanlarıdır. Çiftlikhayvanları üzerinde yapılan filogenetik çalışmalarda mitokondriyal DNA moleküler belirteç olarakkullanılmaktadır. Son zamanlarda, keçilerde yapılan moleküler filogenetik çalışmalarda A, B1, B2,C, D, F ve G olmak üzere 6 mitokondriyal haplogrup tanımlanmıştır. Soy A, en çeşitli olanıdır vetüm kıtalara yayılmıştır. Bu derlemede, keçilerde yapılan moleküler filogenetik çalışmalarhakkında bilgi verilmiştir.

Molecular phylogenetic studies in goats

Domestic goats ( Capra hircus ) were domesticated in the Fertile Crescent in the Near East in theNeolithic period about 10.000 years ago, and has spread to all continents in the world today. Goatsare an important livestock used for meat, milk, wool and leather. Mitochondrial DNA is used asmolecular markers in phylogenetic studies in livestock. Recently, in molecular phylogeneticstudies, six divergent mitochondrial haplogroups were identified as A, B1, B2, C, D, F and G ingoats. The haplogroup A is predominant and widely distributed across all continents. In thisreview, the information presented about the molecular phylogenetic studies in goats.
PDF

___

  • Amills, M., Ramírez, O., Tomàs, A., Badaoui, B., Marmi, J., Acosta, J., Sànchez, A., Capote, J., 2009. Mitochondrial DNA diversity and origins of South and Central American goats. Animal Genetics , 40(3):315 -322.
  • Azor, P.J., Monteagudo, L.V., Luque, M., Tejedor, M.T., Rodero, E., Sierra, I, Herrera, M,. Rodero, A., Arruga, M.V. 2005. Phylogenetic relationships among Spanish goats breeds. Anim al Genetics , 36(5):423 -425
  • C hen, S. Y. , Su, Y .H ., Wu, S.F., Sha , T., Zhang, Y .P. 2005. Mitochondrial Diversity and Phylogeographic Structure of Chinese Domestic Goats. Mol. Phylogenet. Evol. , 37(3):804-814.
  • C hen, S., Fan, B., Liu, B., Yu, M., Zhao, S., Zhu, M., Xiong, T., Li, K. 2006. Genetic variations of 13 indigenous Chinese goat breeds based on cytochrome b gene sequences. Biochem. Genet. , 44(3 – 4):89-99.
  • Fan, B. , Chen, S.L., K ijas, J.H., Liu, B ., Yu, M., Zhao, S.H., Zhu, M.J., Xiong, T.A., Li, K. 2007. Phylogenetic relationships among Chinese indigenous goat breeds inferred from mitochondrial control region sequence. Small Ruminant Research, 73: 262- 266
  • FAOSTAT, 2011. FaoStat: Statistics Database, www.fao.org
  • Hao, R.C., Zan, L.S., Liu, C.S., Wang, Z.G., Zhang, G.X., H an, X ., H ao, H.Z., W ang, J., D u, X.Y. 2008. [Genetic diversity and origin of mitochondrial DNA D - loop region for some domestic goat breeds of China]. Yi Chuan, 30(9):1187 - 94. Chinese.
  • Joshi, M.B., Rout, P.K., Mandal, A.K., Tyler - Smith, C., Singh, L., Thangaraj , K. 2004. Phylogeography and Origin of Indian Domestic Goats. Mol. Biol. Evol. , 21(3):454- 462.
  • Kiraz, S. 2009. Şanlıurfa Yöresindeki Küçükbaş Hayvanların Filogenetik Yapılarının Moleküler Tekniklerle B elirlenmesi Çalışmaları. Harran Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Şanlıurfa. ( Doktora Tezi).
  • Kul, B. Ç. 2010. Türkiye Yerli Keçi Irklarının Mitokondrial DNA Çeşitliliği ve Filocoğrafyası. Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Ankara. (Doktora Tezi).
  • Lin B.Z., Odahara S., Ishida M., Kato T., Sas azaki S., Nozawa K. and Mannen H., 2013. Molecular phylogeography and genetic diversity of East As ian goats. Animal Genetics , 44: 79–85.
  • Liu, R.Y., Lei, C.Z., Liu, S. H., Yang, G.S. 2007. Genetic Diversity and Origin of Chinese Domestic Goats Revealed by Complete mtDNA D -loop Sequence Variation. Asian- Aust. J. Anim. Sci. 20:178 – 183.
  • Liu, Y.P., C ao, S.X., C hen, S.Y., Yao, Y.G., Liu, T.Z. 2009. Genetic diversity of Chinese domestic goat based on the mitochondrial DNA sequence variation. J. Anim . Breed. Genet. , 126(1):80-89.
  • Luikart, G., Gielly, L., Excoffier, L., Vigne, J.D., Bouvet, J., Taberlet, P. 2001.
  • Multiple Maternal Origins and Weak Phylogeographic Structure in Domestic Goats. Proc. Natl. Acad. Sci. , 98(10):5927 -5932.
  • Naderi, S., Rezaei, H.R., Taberle t, P., Zundel, S., Rafat, S.A., Naghash, H.R ., El- Barody, M.A ., Ertugrul, O., Pompanon, F., 2007. Econogene Consortium. Large -scale mitochondrial DNAanalysis of the domestic goat reveals six haplogroups with high diversity. PLoS ONE, 2(10):e1012.
  • Naderi, S ., Rezaei, H.R., Pompanon, F., Blum, M.G.B., Negrini, R., Naghash, H.R., Balkiz, O., Mashkour, M., Gaggiotti, O. E., Ajmone -Marsan, P., Kence, A., Vigne, J.D., Taberlet, P. 2008. The goat domestication process inferred from large -scale mitochondrial DNA analysis of wild and domestic individuals. PNAS 105 (46): 17659–17664.
  • Odahara S., Chung H.J., Yu S.L., Sasazaki S., Ma nnen H., Park C. S. & Lee J.H. 2006. Mitochondrial DNA diversity of Korean native goats. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences . 19: 482– 48 5.
  • Parma, P., Feligini, M., Greeppi, G., Enne, G. 2003. The Complete Nucleotide Sequence of Goat ( Capra Hircus ) Mitochondrial Genome. Goat Mitochondrial Genome. DNA Seq. , 14(3):199-203.
  • Pereira, F., Pereira, L., Van Asch, B., Bradley, D.G., Amorim, A. 2005. The mtDNA Catalogue of All Portuguese Autochthonous Goat (Capra Hircus ) Breeds:High Diversity of Female Lineages at The Western Fringe of European Distribution. Molecular Ecology., 14(8):2313 -2318.
  • Sardina, M.T., Ballester, M., Marmi, J., Finocchiaro, R., Van Kaam, J.B., Portolano, B., Folch, J.M. 2006.
  • Phylogenetic analysis of Sicilian goats reveals a new mtDNA lineage. Anim al Genetics , 37(4):376-378.
  • Sultana, S., Mannen, H., Tsuji, S. 2003. Mitochondrial DNA Diversity of Pakistani Goats. Animal Genetics , 34(6):417 -421.
  • Sultana S. & Mannen H. 2004. Polymorphism and evolutionary profile of mitochondrial DNA control region inferred from the sequences of Pakistani goats. Animal Science Journal, 75 : 303 – 309.
  • Wang, J., Chen, Y., Wang, X., Yang, Z. 2008. The genetic diversity of seven indigenous Chinese goat breeds. Small Ruminant Research, 74:231 -237.
  • Wu, Y.P., Guan, W.J., Zhao, Q.J., H e , X.H., Pu, Y.B., Huo, JH., X ie , J.F., H an, J.L., R ao, S.Q., Ma, Y.H. 2009. A fine map for maternal lineage analysis by mitochondrial hypervariable region in 12 Chinese goat breeds. Animal Science Journal, 80(4):372-380.
  • Zeder, M.A., Hesse, B. 2000 . The initial Domestication of Goats (Capra hircus ) in The Zagros Mountains 10,000 Years Ago. Science , 287(5461):2254-2257.
  • Zhao Y.J., Zhang J.H., Zhao E.H., Zhang X.G., Liu X.Y. and Zhang N.Y., 2011.
  • Mitochondrial DNA diversity and origins of domestic goats in Southwest China (excluding Tibet). Small Ruminant Research, 95, 40–47.
  • Zhong, T., Zhao, Q.J., Niu, L.L., Wang, J., J in, P.F., Zhao, W., Wang, L.J., Li, L., Zhang, H.P., Ma, Y.H. 2013 . Genetic phylogeography and maternal lineages of 18 Chinese black goat breeds . Trop Anim. Health Prod. 45:1833 –1837.
Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6819
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Yayıncı: İbrahim TOBİ
Arşiv
Sayıdaki Diğer Makaleler

Şanlıurfa'da çok amaçlı toplum merkezlerine (çatom) katılımlar ve beklentilerin gerçekleşmesi üzerinde bir araştırma

Zeynep Müjde SAKAR, Bülent GÜLÇUBUK, Bekir Erol AK

Çukurova koşullarında bazı atdişi mısır ( zea mays l. i ndentata) genotiplerinin verim ve morfolojik özelliklerinin belirlenmesi

Abdullah ÖKTEM, Abdurrahman TOPRAK

In vıtro koşullarında nacl stresinin domates çeşitlerinin çimlenmesi üzerine fizyolojik ve biyoki myasal etkileri

Mehmet Ali ÇULLU, Sema KARAKAŞ, Murat DİKİLİTAŞ

Yem katkısı selülaz enzimlerini üreten termofilik bacillus suşlarının izolasyonu ve enzimlerin kısmi karakterizasyonu

Bahri Devrim ÖZCAN, Harun Reşit KILIÇER

Keçilerde yapılan moleküler filogenetik çalışmalar

Selahattin KİRAZ, Seyrani KONCAGÜL, Mehmet Sait EKİNCİ