Mutation Analysis of Beta-Thalassemia Major Patients and Their Parents in Diyarbakir Province, Turkey

Objectives: In this study, beta-Thalassemia Major (BTM) diagnosed patients and their parents were subjected to DNA sequencing in order to confirm their diagnosis, improve their treatment and determine the mutation distributions of both patients and their parents. Methods: A total of 90 people, BTM patients (n=30) and their parents (n=60), were included in the study. For all analyses, two blood samples were taken into EDTA-containing tubes from each of the patients and each of their parents. Complete blood count, hb variant and mutation analysis were studied, respectively. Results: 8 types of mutation were determined: IVS-I-110 (G->A) 46.67%, codon 8 (-AA) 16.67%, IVS-II-1 (G->A) 11.67%, codon 44 (-C) 10.00%, IVS-II-745 (C->G) 5.00%, IVS-I-1 (G->A) 3.33%, IVS-I-5 (G->T) 3.33% and -30 (T- >A) 3.33%. Hb concentrations of 9.2 ± 1.32 g/dL and Hb variant levels of HbA 81.58% ± 11.05, HbF 10.44% ± 11.54 were found in patients with BTM who received transfusion therapy regularly. Typical hemogram count and Hb variants levels were seen in parents. Conclusion: In our study, a similar distribution was identified throughout Turkey in terms of mutation. Mutations were classified in all the studied people. This study increased the detection percentage of undetermined mutations by the use of DNA sequencing. Thus a multi-centric coordinated study with high capacity will improve detecting these mutations and their effects on the disease.

Diyarbakır İlinde Beta-Talasemi Majörlü Hastalar ve Ebeveynlerinde Mutasyon Analizi

Amaç: Bu çalışmada beta-Talasemi Majör (BTM) tanısı almış hastalar ve ebeveynlerinde; DNA dizi analizi yöntemiyle tanısının kesinleştirilmesi, tedavisine katkıda bulunulması ve mutasyon dağılımının tespiti amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışmaya BTM’li hastalar (n=30) ve ebeveynleri (n=60) olmak üzere toplam 90 kişi dâhil edilmiştir. Tüm analizler için hastalar ve ebeveynlerinin her birinden iki adet EDTA ihtiva eden tüplere kan numunesi alınmıştır. Sırasıyla tam kan sayımı, Hb varyant ve mutasyon analizi çalışılmıştır. Bulgular: IVS-I-110 (G->A) %46.67, codon 8 (-AA) %16.67, IVS-II-1 (G->A) %11.67, codon 44 (-C) %10.00, IVS-II745 (C->G) %5.00, IVS-I-1 (G->A) %3.33, IVS-I-5 (G->T) %3.33 ve -30 (T->A) %3.33 olmak üzere 8 çeşit mutasyon tespit edildi. Düzenli olarak transfüzyon tedavisi alan BTM’li hastalarda Hb konsantrasyonu 9.2±1.32 g/dL ve Hb varyant düzeyi HbA %81.58±11.05, HbF %10.44±11.54 olarak tespit edilmiştir. Ebeveynlerde ise tipik hemogram sayımı ve Hb varyant düzeyleri görüldü. Sonuç: Çalışmamızda mutasyon açısından Türkiye geneline benzer bir dağılım tespit edildi. Çalışılan tüm kişilerde mutasyonlar tasnif edildi. Bu çalışma DNA dizi analizi yönteminin kullanımına bağlı olarak saptanamayan mutasyonların belirlenme oranını artırmıştır. Buna bağlı olarak yüksek kapasiteli çok merkezli koordine bir çalışma ile bu mutasyonların ve bunların hastalığa etkisinin belirlenmesini geliştirecektir.

___

1. Thein SL. Genetic modifiers of beta-thalassemia. Haematologica 2005; 90: 649-60.

2. Mettananda S, Higgs DR. Molecular basis and genetic modifiers of thalassemia. Hematol Oncol Clin North Am 2018; 32: 177-91.

3. Origa R. β-Thalassemia. Genet Med 2017; 19: 609- 19.

4. Cao A, Galanello R. Beta-thalassemia. Genet Med 2010; 12: 61-76.

5. Basak AN. The molecular pathology of beta thalassemia in Turkey: The Boğaziçi University experience. Hemoglobin 2007; 31: 233-41.

6. Brancaleoni V, Di Pierro E, Motta I, Cappellini MD. Laboratory diagnosis of thalassemia. Int J Lab Hematol 2016; 38: 32-40.

7. Viprakasit V, Ekwattanakit S. Clinical classification, screening and diagnosis for thalassemia. Hematol Oncol Clin North Am 2018; 32: 193-211.

8. Jain P, Gupta M, Dua S, Marwah N, Gill M, Sen R. Prevalence of Various Hemoglobinopathies-An Experience from Tertiary Care Centre. Dicle Med J 2019; 46: 269-76

9. Giardine B, Borg J, Viennas E, et al. Updates of the HbVar database of human hemoglobin variants and thalassemia mutations. Nucleic Acids Res 2014; 42: 1063-69. http://globin.cse.psu.edu

10. Çürük MA, Yalın E, Aksoy K. Prevention of hemoglobinopathies in Turkey. Thalassemia Rep 2013; 3: 1-4.

11. Mansilla-Soto J, Riviere I, Boulad F, Sadelain M. Cell and gene therapy for the beta-thalassemias: Advances and prospects. Hum Gene Ther 2016; 27: 295-304.

12. Thein SL. Molecular basis of β thalassemia and potential therapeutic targets. Blood Cells Mol Dis 2018; 70: 54-65.

13. Thompson AA, Walters MC, Kwiatkowski J, et al. Gene therapy in patients with transfusion dependent β-thalassemia. N Engl J Med 2018; 378: 1479-93.

14. Danjou F, Anni F, Galanello R. Beta-thalassemia: From genotype to phenotype. Haematologica 2011; 96: 1573-5.

15. Muncie HL Jr, Campbell J. Alpha and beta thalassemia. Am Fam Physician 2009; 80: 339-44.

16. Ulutaş KT, Şahpaz F, Sarıcı İŞ, et al. A screening study on premarital hemoglobinopathy: Is Kadirli a risk-bearing region for beta-thalassemia in Turkey?. Turk J Biochem 2014; 39: 357-61

17. Altay Ç. The frequency and distribution pattern of ß-thalassemia mutations in Turkey. Turk J Haematol 2002; 19: 309-15.

18. Ince HH, Ayyildiz O, Kalkanli S, Batun S, Muftuoglu E. Molecular basis of beta-thalassemia mutations in Diyarbakir in the southeastern region of Turkey. Hemoglobin 2003; 27: 275-8.

19. Yılmaz S. The spectrum of β-thalassemia mutations in Siirt province, southeastern Turkey. Hemoglobin 2019; 43: 174-81.

20. Ayçiçek A, Koç A, Özdemir ZC, Bilinç H, Koçyiğit A, Dilmeç F. Beta-globin gene mutations in children with beta-thalassemia major from Şanlıurfa province, Turkey. Turk J Haematol 2011; 28: 264-8.

21. Genc A, Tastemir Korkmaz D, Buyukleyla M, Celiker M. Prevalence and molecular analysis of β-thalassemia in Adiyaman, Turkey. Hemoglobin 2012; 36: 13-8.

22. Pehlivan S, Okan V, Guler E, et al. Thalassemia mutations in Gaziantep, Turkey. Afr J Biotechnol 2010; 9: 1255-8.

23. Guzelgul F, Seydel GS, Aksoy K. Β-globin gene mutations in pediatric patients with β-thalassemia in the region of Çukurova, Turkey. Hemoglobin 2020; 44: 1-5.

24. Guvenc B, Canataroglu A, Unsal C, et al. β-thalassemia mutations and hemoglobinopathies in Adana, Turkey: Results from a single center study. Arch Med Sci 2012; 8: 411-4.

25. Ozkinay F, Onay H, Karaca E, et al. Molecular basis of β-thalassemia in the population of the Aegean region of Turkey: Identification of a novel deletion mutation. Hemoglobin 2015; 39: 230-4.

26. Kurtoğlu A, Karakuş V, Erkal Ö, Kurtoğlu E. β-thalassemia gene mutations in Antalya, Turkey: results from a single centre study. Hemoglobin 2016; 40: 392-5.

27. Yalçıntepe S. Beta globin mutations in beta thalassemia minor patients in Genetics Diagnosis Center of Trakya University Faculty of Medicine. Ege J Med 2019; 58: 330-5.
Dicle Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-2945
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1963
  • Yayıncı: Cahfer GÜLOĞLU
Sayıdaki Diğer Makaleler

İnsan Bazal Hücreli Karsinom TE 354.T Hücre Hattında Hypericum Perforatum Ekstraktının Apoptotik ve Antiinflamatuvar Etkileri

Ebru ÇELİK, Halil Mahir KAPLAN, Ergin ŞİNGİRİK, Muhammed Salih ÇELİK, Harun ALP

Hyaluronik Asitin Endometrium Dokusunda αVβ3 İntegrin ve Metalloproteinaz Ekspresyonuna Etkisi

Hatice ORUÇ DEMİRBAĞ, Nazlı ÇİL, Gülçin ABBAN METE, Semih TAN

Diyarbakır İlinde Beta-Talasemi Majörlü Hastalar ve Ebeveynlerinde Mutasyon Analizi

Murat SÖKER, Nuriye METE, Cemal POLAT

Geriatrik Populasyonda Baş Boyun Cilt, Ciltaltı Tümöral Lezyonlarının İncelenmesi

Ragıp Onur ÖZTORNACI, Talih ÖZDAŞ, Emin KAPI, Kemal Koray BAL, Sedat ALAGÖZ, Elif Burcu ŞENYURT, Asiye Merve ERDOĞAN

Erişkin Yabancı Cisim Aspirasyon Şüpheli Olguların Yönetimi

Şeyma YILMAZ, İrfan CHOUSEİN, Binnaz Zeynep YILDIRIM, Mehmet Akif ÖZGÜL, Efsun Gonca UĞUR CHOUSEİN, Demet TURAN, Elif TANRIVERDİ, Erdoğan ÇETİNKAYA

Management of Adults With Suspected Foreign Body Aspiration

Efsun UĞUR, Elif TANRIVERDİ, Demet TURAN, Binnaz YILDIRIM, Şeyma YILMAZ, İrfan CHOUSEİN, Mehmet Akif ÖZGÜL, Erdoğan ÇETİNKAYA

COVID-19 ve Diğer Viral Pnömoniler

Nazlı GÖRMELİ KURT, Melih ÇAMCI

Investigation of the 1249G>A Genetic Variation of ABCC2 Drug Transporter Gene in the Turkish Population

Zuhal UCKUN SAHİNOGULLARİ

Akut Koroner Sendrom Hastalarında Syntax Skoru İle Epikardiyal Yağ Doku Arasındaki İlişki

Adem ATICI, Fatih ÖZTÜRK, Yunus Emre OKUDAN, Ali Yaşar KILINÇ, Mehmet YAMAN, Hakkı ŞİMŞEK, Koray DEMİR, Serkan AKDAĞ

Pediatrik Pyoderma Gangrenozum

Rana KAPUKAYA, Ahmet KAPUKAYA, İsmail AKÇAY