Türkiye’de Mardin İli Zeytin Alanlarında Bazı Virüslerin Serolojik ve Moleküler Tekniklerle Araştırılması

Güneydoğu Anadolu bölgesinde yer alan Mardin il ve ilçelerindeki zeytin ağaçlarındaki bazı virüs hastalıklarının durumunu araştırmak amacıyla 2010 yılında surveyler yapılmıştır. Virüs simptomu gösteren ağaçlardan ve virüslerin latent olarak taşındıkları göz önüne alınarak simptomsuz ağaçlardan da tesadüfi olarak toplam 170 sürgün örneği toplanmıştır. Alınan örnekler Olive latent-1 virus (OLV-1, Zeytin latent-1 virüs), Olive latent-2 virus (OLV-2, Zeytin latent-2 virüsü), Cherry leaf roll virus (CLRV, Kiraz yaprak kıvrılma virüsü), Arabis mosaic virus (ArMV, Arabis mozaik virüs), Strawberry latent ringspot virus (SLRSV, Çilek latent halkalı leke virüsü), Olive latent ringspot virus (OLRSV, Zeytin latent halkalı leke virüsü) ve Cucumber mosaic virus (CMV, Hıyar mozaik virüsü), Olive latent-3 virus (OLV-3, Zeytin latent-3 virüs)’üne karşı testlere tabi tutulmuştur. Toplanan zeytin örneklerine  mevcut poliklonal antiserumlar kullanılarak (DAS-ELISA) serolojik testler (CLRV, ArMV, SLRSV veCMV) ve moleküler metodlar (dsRNA, RT-PCR) uygulanarak virüsler test edilmiştir. DAS-ELISA ve PCR analizlerinde tüm örnekler negatif olarak tespit edilirken, dsRNA anlizlerinde 41 örnekte, dsRNA profilleri tespit edilmiştir. Test edilen zeytin örnekleri araştırılan virüsler açısından temiz bulunurken, bu örneklerin zeytin ağaçlarını enfekte ettiği bilinen diğer virüsler açısından da test edilmesi gerektiği sonucuna ulaşılmıştır.

Research on the Presence of Some Viruses in Olive Orchards Using Serological and Molecular Techniques in Mardin Province of Turkey

Surveys were performed in 2010 in order to investigate the presence of several virus diseases in olive trees grown in Mardin province and counties located in the Southeastern Anatolia. Totally 170 shoot samples were collected from trees showing virus symptoms and also collected randomly symptomless trees considering the possibility of virus presence latently. Olive plant samples were tested against Olive latent-1 virus (OLV-1), Olive latent-2 virus (OLV-2), Cherry leaf roll virus (CLRV), Arabis mosaic virus (ArMV), Strawberry latent ringspot virus (SLRSV), Olive latent ringspot virus (OLRSV), Cucumber mosaic virus (CMV) and Olive latent-3 virus (OLV-3). To identify viral agents, the serological (DAS-ELISA) tests using available polyclonal antisera (SLRSV, ArMV, CLRV and CMV) and molecular methods (dsRNA, RT-PCR) were applied to collected olive samples. According to results of DAS-ELISA and PCR analysis, all samples were found negative whereas dsRNA profiles were observed in 41 samples. All tested samples were found free of tested viruses but it was concluded that they have to be tested against other known viruses of olives.

___

  • Al Abdullah A., Elbeaino T., Minafra A., Digiaro m., Martelli G.P., 2009.,Detection And Variability Of Olive Latent Virüs 3 Gn The Mediterrenean Region., Journal Of Plant Pathology , 91(3),521-525
  • Al Abdullah, A., T. El Beaino, M. Saponari, H. Hallak and M. Digiaro 2005. Preliminaryevaluation of the status of olive-infecting viruses in Syria. EPPO Bulletin 35 (2), 249-252.
  • Al Rwahnih M., Guo Y., Daubert S., Golino D. and Rowhanni A., 2011, Characterization Of Latent Viral Gnfection Of Olive Trees Gn The National Germplazm Repository Gn California, Journual Of Plant Pathology, Vol 93 No 1
  • Anonim, 2011. Tarımsal yapı üretim, fiyat, değer. T.C. Başbakanlık Türkiye İstatistik Kurumu.
  • Anonim, 2012. Mardin İl Müdürlüğü Proje İstatistik şubesi Verileri, 10S
  • Bertolini, E., Fadda, Z., Garcia, F., Celada, B., Olmos, A., Gorris, M.T., Del Rio, C., Caballero, J., Duran-Vila, N. and Cambra, M. 1998. Virosis del olivo detectadas en Espana, Nuevos metodos de diagnostico. Phytoma, 102: 191-193.
  • Bertolini, E., Olmos, A., Martinez, M.C., Gorris, M.T. and Cambra M. 2001. Single-step multiplex RT-PCR for simultaneous and colourimetric detection of six RNA viruses in olive trees. Journal of Virological Methods, 96: 33-41.
  • Bjelis. M., Loconsole, G., and Saponari, M., 2007. Presence of virruses in Croatian olive groves. Pomologia Croatica 13:16S-172.
  • Clark, M.F. and Adams, A.N., (1977). Characteristics of microplate method of enzymelinked immunosorbent assay for detection of plant viruses. J.Gen.Virol. 34: 475-483.
  • Çağlayan, K., U. Fidan, G. Tarla, and M. Gazel, 2004. First report of olive viruses in Turkey. Journal of Plant Pathology, 86 (1): 89-90.
  • El Aır M., Mahfoudi N., Digiaro M., Najjar A. and Elbeaino T., 2011 Detection of Oliveinfecting Viruses in Tunisia. J Phytopathol 159:283-286
  • Erilmez S ve Erkan S.,2014. Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi. bitki koruma bülteni 2014, 54(1):45-67 ıssn 0406-3597. 45-67
  • Fadel, C., Digiaro, M., Choueiri, E., El Beaino, T., Saponari, M., Savino, V. and Martelli, G.P. 2005. On the presence and distribution of olive viruses in Lebanon. OEPP/EPPO Bulletin, 35: 33-36.
  • Faggioli F., Ferreti, L., Albanese, G., Sciarroni, R., Pasquini, G., Lumia, V. and Barba, M., 2005. Distirubition of olive tree viruses in Italy as revealed by one-step RT-PCR. Journal of Plant Pathology, 87:45-51.
  • Faggioli, F., Ferretti, L., Pasquini, G. and Barba, M. 2002. Detection of Stravberry latent ring spot virus in leaves of olive trees in Italy using a one-step RT-PCR. Journal of Phytopathology, 150: 636-639.
  • Fidan ve Ertem,.1995. Ege yöresindeki zeytin ağaçlarında virus hastalıklarının ELISA yöntemi ile belirlenmesi üzerinde araştırmalar. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, 26-29 Eylül 1995: 378-380, Adana.
  • Gallitelli, D. and Savino,. V. 1985. Olive latent virus 1. A single-RNA spherical virus isolated from in Apulia (Southern Italy). Annals of Applied Biology, 106: 295-303.
  • Grieco F, Parrella G, Vovlas C, 2002. An isolate of Olive latent virus 2 infecting castor bean in Greece. Journal of Plant Pathology 84, 129-31.
  • Grieco, F., Alkowni, R., Saponari, M., Savino, V. and Martelli, G.P. 2000. Molecular detection of olive viruses. OEPP/EPPO Bulletin, 30: 469-473.
  • Hasiów-Jaroszewska B, Borodynko N, Pospieszny H. 2011. Molecular characterisation of the full-length genome of olive latent virus 1 isolated from tomato. . Journal of Applied Genetics. 52(2):245-247.
  • Henriques, N.I.C., Rei, F.T., Alit, F.A., Serena, J.F. and Poet, M.F,. 1992. Virus diseases in Olea europaea cultivars: Immunodiagnosis of Strawberry latent ringspot nepovirus. Phytopatologia Mediterranae, 31 127-132.
  • Kanematsu, S., Taga, Y. and Morikawa, T. 2001. Isolation of Olive latent virus 1 from Tulip in Toyoma Prefecture. Journal of General Plant Pathology, 67: 333-334.
  • Loconsole G., Saponari M., Faggioli F., Albanese G., Bouyahia H., Elbeaino T., Materazzi
  • A., Nuzzaci M., Prota V., Romanazzi G., Trisciuzzi N. and Savino V., (2010), InterLaboratory Validation Of PCR-Based Protocol For Detection Of Olive Viruses., The Authors. Journal compilation a 2010 OEPP/EPPO, Bulletin OEPP/EPPO Bulletin 40, 423-428
  • Luigi, M., Godena, S., Dermic, E., Barba, M. and Faggioli, F., 2011, Detection of viruses in olive trees in Croatian Istria.,Phytopathol. Mediterr. 50: 150-153.
  • Martelli, G.P. 1999. Infectious diseases and certification of olive: an overview.OEPP/EPPO Bulletin, 29: 127-133.
  • Martelli, G.P., Sabanadzovic, S., Savino, V., Abu-Zurayk, A.R. and Masannat, M. 1995,.Virus-like diseases and viruses of olive in Jordan. Phytopathologia Mediterranee, 34: 133-136.
  • Martelli, G.P., Yılmaz, M.A., Savino, V., Baloğlu, S., Grieco, F., Güldür, M.E., Greco, N. and Lafortezza, R. 1996 Properties of citrus isolate of Olive latent virus 1, a new Necrovirus. European Journal of Plant Pathology, 102(6): 527-536.
  • Poggi Pollini, C., Bissani, R., Giunchedi, L. And Vindimian, F. 1996. First report of a phytoplasma infection in olive trees. Journal of Phytopathology, 144, 109-111.
  • Poggi Pollini, C., Bissani, R., Ragozzino, A., Pasquini, F., Barba, M., Marzachi, C. and Boccardo, G. 2002. Detection and characterization of phytoplasmas in olive trees from Italy. Proc. 4th International Symposium on Olive Growing. Acta Horticulturae 586, ISHS 2002, (2), 781-783.
  • Rei, F.T., Henriques, M.I.C., Leitao, F.A., Serrano, J.F. and Potes, M.F. 1993. Immunodiagnosis of Cucumber mosaic cucumovirus in different olive cultivars. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 23: 501-504.
  • Rott M.A. and Jelkmann W. 2001,. Characterizasyon and detection of sevral filamentous viruses of cherry: adaptation of an alternative cloning metod (DOP-PCR), and modificasyon of an RNA extraction protocol. Europan journal of plant pathology 107:411-420
  • Sabanadzovic, S., Abou-Ghanem, N., La Notte, P., Savino, V,. Scarito, G. and Martelli, G.P. 1999. Partial molecular characterization and RT-PCR detection of a putative closterovirus associated with olive leaf yellowing. Journal of Plant Pathology, 81(1): 37-45.
  • Savino V., Galitelli, D. and Barba, M. 1983. Olive latent ringspot virus, a newly recognized virus infecting olive in Italy. Annals of Applied Biology, 133(2): 243-249.
  • Savino, V., Piazzola, T., Di Franco, A. and Martelli, G.P. 1984. Olive latent virus 2, a newly recognized virus with a differently shaped particle. In: Proceeding of the 6th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, pp. 24-26. Cairo (Egypt).
  • Ulubaş Serce, Ç. U., Yalçın S,. Gazel M, Cağlayan K. and Faggioli F., 2007. First Report of Olive Latent Virus 1 from Olive Trees in Turkey. Journal of Plant Pathology 89(3):73.
  • Tarla, G., ve. Çağlayan K, 1998. Hatay Yöresinde Yetilen Zeytin Ağaçlarında Görülen Bazı Virüs Hastalıklarının Serolojik Olarak Saptanması. (Serologicaly detection of some virus diseases in olive grown in Hatay province) VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, Ankara, pp.239-243.
  • Walia, J. J., Salem, N. M., and Falk, B. W. 2009. Partial sequence and survey analysis identify a multipartite, negative-sense RNA virus associated with fig mosaic. Plant Dis. 93:4-10.
  • Yalçın, S., 2008. Doğu Akdeniz Bölgesi"ndeki zeytin bahçelerindeki virüslerin yaygınlığının RT-PCR ile belirlenmesi v karakterizasyonu. M.K.Ü., Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, 50 s.
  • Youssef S.A., Moawed S.M., el-sayed M. and Shalaby A.A.2010., Detection Of Olive Tree Viruses Gn Egypt By One-Step Rt-Pcr, 21st Gnternational Conference On Virüs And Other Greft Trasmissible Disease Of Fruit Crops., Julius-kühn-archiv, 427.
Bitki Koruma Bülteni-Cover
  • ISSN: 0406-3597
  • Yayın Aralığı: Yılda 4 Sayı
  • Başlangıç: 1952
  • Yayıncı: Zirai Mücadele Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü
Sayıdaki Diğer Makaleler

Gymnodamaeus Kulczynski, 1902 (Acari, Oribatida, Gymnodamaeidae) türleri üzerine bir çalıĢma

Ayşe TOLUK, Nusret AYYILDIZ

Erzurum İlinde Çilek Bitkilerinden İzole Edilen Fusarium Türlerinin Patojeniteleri

Emre DEMİRER DURAK, Erkol DEMİRCİ

Güney Marmara Bölgesi’nde Domates güvesi [Tuta absoluta (Meyrick, 1917) (Lepidoptera: Gelechiidae)]’nin doğa koşullarında bazı biyolojik özelliklerinin belirlenmesi

Gürsel ÇETİN, Cemil HANTAŞ, İbrahim SÖNMEZ

Çanakkale ilinde Archips rosana (Linnaeus, 1758) ve Pandemis cerasana (Hübner, 1786) (Lepidoptera: Tortricidae)’nın meyve alanlarında yayılışı ve şeftali bahçelerinde popülasyon gelişmesi

Şeyda ERCAN, Ali ÖZPINAR

Güney Marmara Bölgesi’nde Domates güvesi [Tuta absoluta (Meyrick, 1917) (Lepidoptera: Gelechiidae)]’nin doğa koĢullarında bazı biyolojik özelliklerinin belirlenmesi

Gürsel ÇETİN, Cemil HANTAŞ, İbrahim SÖNMEZ

Depolanmış çeltikte zararlı Tribolium castaneum (Herbst)’un mücadelesinde diyatom toprağının kullanım olanakları

Sait ERTÜRK, Mevlüt EMEKCİ

Kahramanmaraş Başkonuş Ormanlık Alanlarından İzole Edilen Entomopatojen Funguslar

Ümit İZGİ, Özlem GÜVEN

Türkiye’de Mardin İli Zeytin Alanlarında Bazı Virüslerin Serolojik ve Moleküler Tekniklerle Araştırılması

Osman ÇİFÇİ, Çiğdem ULUBAŞ SERÇE

Marmara Bölgesi Ayva Bahçelerinde Zararlı Böcek ve Akar Türleri ile Doğal Düşmanlarının Saptanması ve Önemli Zararlı Türlerin Popülasyon Değişimi

Cemil HANTAŞ, Gürsel ÇETİN, M. Emin AKÇAY

Orta Anadolu bölgesinde Domateslerde zararlı olan Domates güvesi [Tuta absoluta Meyrick (Lepidoptera: Gelechiidae)]’nin sürveyi ile popülasyon takibi

Pervin ERDOĞAN, Aydemir BARIŞ, Yasin Nazım ALPKENT