Aydın İlinde Pamukta Rhizoctonia solani İzolatlarında Mikoviral Çift Sarmallı (ds) RNA'nın Araştırılması

Rhizoctonia solani’nin patojenik izolatlarının, farklı familyalardan birçok bitki türünde hastalığa neden olduğu bilinmektedir. Bu patojen, pamukta çökertene ve kök çürüklüğüne neden olan fungal patojenlerin en önemlilerinden biridir. Günümüzde hastalığa karşı kullanılan mücadele yöntemleri hastalık nedeniyle oluşan verim kayıplarının önlenmesinde yeterli olmamaktadır. Geçmişte, farklı ülkelerden R. solani izolatları üzerinde yapılan çalışmalarda mycoviral dsRNA’lerin varlığı belirlenmiştir. Bu çalışmanın amacı; Aydın ilinde pamuklardan toplanan R. solani izolatlarının mikoviral dsRNA içeriklerinin araştırılmasıdır. Çalışma kapsamında, zayıf çökerten belirtileri gösteren pamuk fidelerinden elde edilmiş toplam 64 adet R. solani izolatı dsRNA analizine tabi tutulmuştur. Altı R. solani izolatında 12-18 kb büyüklüğünde dsRNA elektroforetik profiller saptanmıştır. dsRNA pozitif 6 izolatın virülensliği dsRNA-negatif bir izolat ile elma testinde karşılaştırılmıştır. İki dsRNA pozitif R. solani izolat elma üzerinde inokulasyon noktasında küçük lezyonlar oluşturmuştur ve bu durumun hipovirülenslik ile bir ilişkisi olabileceği düşünülmüştür.

Investigation of Mycoviral double-stranded (ds) RNA in Rhizoctonia solani Isolates from Cotton in Aydin Province/Turkey

Pathogenic forms of Rhizoctonia solani are known to attack many species of higher plants from different families. It is one of the causal agent of the damping-off and root rot of cotton. The current damping-off management practices are not satisfactory for preventing yield losses in cotton production. Hypovirulence, caused by particular mycoviruse species, is used in the management of certain plant diseases. The existence of mycoviral dsRNAs in the isolates of R. solani has been previously determined in various countries. This study aimed to investigate dsRNA content in the cotton isolates of R. solani collected from Aydin Province. In total, 64 R. solani isolates collected from cotton seedlings exhibiting light damping-off symptoms were subjected to dsRNA analysis. The dsRNA electrophoretic pattern with the size of 12-18 kb were detected in six R. solani isolates. The virulence of these six isolates were compared with a dsRNA-free isolate in apple assay. Two R. solani isolates having dsRNA content caused smaller lesions in the inoculation point on apple fruit, which may be the indication of hypovirulence.

___

  • Abdoulaye AH, Foda MF, Kotta-Loizou I (2019) Viruses infecting the plant pathogenic fungus Rhizoctonia solani. Viruses, 11:12, 1113.
  • Agrios GN (1997) Plant Pathology. 4th Ed, Academic Press, New York, USA. p. 606.
  • Balijja A, Kvarnheden A, Turchetti T (2008) A non-phenol– chloroform extraction of double-stranded RNA from plant and fungal tissues. Journal of Virological Methods. 152: 32– 37.
  • Basal H, Karademir E, Goren HK, Sezener V, Dogan MN, Gencsoylu I, Erdogan O (2019) Cotton Production in Turkey and Europe. In: Cotton Production. John Wiley and Sons, New York, USA. pp.297-321.
  • Bharathan N, Saso H, Gudipati L, Bharathan S, Whited K (2005) Double-stranded RNA: distribution and analysis among isolates of Rhizoctonia solani AG-2 to -13. Plant Pathol. 54: 196–203.
  • Erincik O, Döken MT, Açikgöz S, Ertan E (2008) Characterization of Cryphonectria parasitica Isolates Collected from Aydın Province in Turkey, Phytoparasitica.36(3): 249-259.
  • Finkler A, Koltin Y, Barash I, Sneh B, Pozniak D (1985) Isolation of a virus from virulent strains of Rhizoctonia solani. Journal of General Virology, 66(6): 1221-1232.
  • Milgroom MG, Cortesi P (2004) Biological control of chestnut blight with hypovirulence: a critical analysis. Annual Review of Phytopathology, 42: 311-338.
  • Papavizas GC, Adams PB, Lumsden RD, Lewis JA, Dow RL, Ayers WA, Kantzes JG (1975) Ecology and epidemiology of Rhizoctonia solani in field soil. Phytopathology, 65: 871- 877.
  • Sneh B, Jabaji-Hare S, Neate S, Dijst G (1996) Rhizoctonia species: Taxonomy, Molecular Biology, Ecology, Pathology, and Control. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands. p. 578.
  • Supyani S, Hardjono SG (2014) Hypovirvlent isolates of Rhizoctonia solani collected from Rice karanganyar ergency, Central Java, Indonesia, ARPN Journal of Agricultural and Biological Science. VOL. 9, NO. 1.
  • Ghabrial SA (2001) Fungal viruses. In O. Maloy and T. Murray, eds. Encyclopedia of Plant Pathology. John Wiley and Sons, New York. 1: 478-483.
  • Zanzinger DH, Bandy BP, Tavantzis SM (1984) High frequency of finding double-stranded RNA in naturally occurring isolates of Rhizoctonia solani. Journal of General Virology, 65(9): 1601-1605.
Adnan Menderes Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1304-7787
  • Yayın Aralığı: Yılda 2 Sayı
  • Başlangıç: 2004
  • Yayıncı: Adnan Üniv. Ziraat Fak.
Sayıdaki Diğer Makaleler

Aydın İlinde Pamukta Rhizoctonia solani İzolatlarında Mikoviral Çift Sarmallı (ds) RNA'nın Araştırılması

Serap AÇIKGÖZ, Sahra HOSSEINALIZADEH, Ömer ERİNCİK

Kısıntılı ve Tam Sulama Koşullarında Verim ve Lif Kalitesi Bakımından Üstün İleri Pamuk (Gossypium hirsutum L.) Hatlarının Seleksiyonu

Hüseyin BAŞAL, Hatice Kübra GÖREN

Farklı Kullanım Alanlarındaki Bitkisel Kompozisyonların Bitkisel Tasarım İlkelerine Göre Değerlendirilmesi

Selma KÖSA, Şükran AKSÖĞÜT

Akdeniz Meyve Sineği (Ceratitis capitata Wied.) (Diptera: Tephritidae)' nin Hünnap Bahçesindeki Popülasyon Dalgalanmaları ve Zararı

Sergen GÜLCÜOĞLU, Hüseyin BAŞPINAR

Mardin İlinde Satışa Sunulan Endüstriyel ve Geleneksel Yöntemle Üretilen Yoğurtların Kalite Kriterlerinin Araştırılması

Büşra PALABIÇAK, Musa Serdar AKIN, Semra GÜRBÜZ, Musa Serdar AKIN, Mutlu Buket AKIN

Bitkilerde Hareket, Davranış ve Zekâ

Zeynel DALKILIÇ

Aydın Ekolojisinde Yetiştirilen Bazı Erik Çeşitlerinde Çiçek Tozu Kalite ve Kantitesinin Belirlenmesi

Selçuk BİNİCİ, Gonca GÜNVER DALKILIÇ

Akdeniz Meyve Sineği (Ceratitis capitata Wiedemann) (Diptera: Tephritidae)' nin Hünnap Bahçesindeki Popülasyon Dalgalanmaları ve Zararı

Hüseyin BAŞPINAR, Sergen GÜLCÜOĞLU

Yerel Kuru Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Tane Verimi, Verim Unsurları ve Bazı Kalite Özelliklerinin Belirlenmesi

Abdulveli SİRAT

Süt Sığırcılığı İşletmelerinde Yem Tedarikçi ve Süt Alıcı Tercihlerinin Belirlenmesi: İzmir ve Manisa Örneği

Gamze SANER, Duran GÜLER