İnsan Patojeni Escherichia coli İzolatlarının Fenotipik Özellikleri, Plazmit ve Protin Profillerine Göre Karakterizasyonu

Bu çalışmada, 13 adet E. coli suşu fenotipik özellikleri, plazmit ve protein profillerine göre karakterize edildi. Agaroz jel elektroforez analiz sonuçlarına göre bütün suşların en az bir adet plazmit bulundurduğu belirlendi. Toplam hücre protein profil sonuçları esas alınarak yapılan nümerik analiz, benzerlik düzeyi % 71'in üzerinde 2 ayrı büyük grup ortaya koydu. Ayrıca, hücre dışı protein profil sonuçları esas alınarak yapılan nümerik analiz ise benzerlik düzeyi % 60'ın üzerinde 3 ayrı büyük grup ortaya koydu. Bu araştırma, SDS-PAGE yöntemiyle elde edilen toplam hücre ve hücre dışı protein profillerinin test edilen E. coli suşlarının taksonomik ilişkilerinin incelenmesinde etkili bir yaklaşım sağlamadığını gösterdi. Bununla birlikte, hücre dışı protein profillerinin toplam hücre protein profillerine göre daha iyi ayırım sağladığı da belirlendi.

Characterization of Human Pathogenic Escherichia coli lsolates According to Phenotypic Properties, Plasmid and Protein Profiles

In the present study, 13 E. coli strains were characterized using phenotypic properties, plasmid and protein profiles. According to agarose gel electrophoresis analysis it was confirmed that all strains consisted of at least one plasmid. A numerical analysis based on whole-cell protein patterns revealed 2 distinct major groups with a similarity level of above 71 %. Afterwards, a numerical analysis based on extracellular protein patterns revealed 3 difference major groups with a similarity level of above 60 %. The research indicated that whole-cell and extracellular protein profiles obtained by SDS-PAGE did not provide an effective approach to the investigation of taxonomic relationship among the tested E. coli strains. However, it determined that extracellular protein patterns were more difference than whole-cell protein profiles.

___

  • Kaynakça verildi.
Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-5413
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 1995
  • Yayıncı: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü
Sayıdaki Diğer Makaleler

Van İlinde Kırsal Kalkınma Amacıyla Kurulan Gökkuşağı Alabalığı, Oncorhynchus mykiss, İşletmelerinin Genel Durumları, Sorunları ve Çözüm Önerileri

Kenan GÜLLÜ, Şenol GÜZEL

Perovskit Yapıdaki Kristallerde İzotop Yerleştirmenin Etkisi

Bahattin ERDİNC

Kanatlı Hayvan Beslemede Fitin Fosforu ve Fitaz Enziminin Önemi

Tülay ÇİMRİN, Murat DEMİREL

M-Plus'ta Latent Class Analizlerin Uygulamasına İlişkin Bir Örnek Çalışma

Murat KAYRİ

Nematik Sıvı Kristal Bir Filmin Elektro-Optik Özelliklerinin İncelenmesi

Ridvan KARAPINAR, Nilay ÖZÇANKAYA

İnsan Patojeni Escherichia coli İzolatlarının Fenotipik Özellikleri, Plazmit ve Protin Profillerine Göre Karakterizasyonu

İsmet BERBER, Akın ÖTER

Patlıcanda Verticillium Solgunluğuna Dayanıklılık ile Kallus Kültüründe Solavetivon Birikimi Arasındaki İlişkinin İncelenmesi

Sevinç USLUKIRAN, Şeküre Şebnem ELLİALTIOĞLU, Sara DOLAR, Harun BAYRAKTAR, Ayşen Sülün ÜSTÜN, Ülkü MEHMETOĞLU

Karpuz (Citrullus lanatus ) Genotiplerinde, Tuz Stresinden Kaynaklanan Oksidatif Zararlanmanın Zamana Göre Değişimi ve Skala ile İlişkisinin Belirlenmesi

Fikret YAŞAR, Taylan ÖZPAY, Özlem UZAL, Şeküre Şebnem ELLİALTIOĞLU

Fasulye Genotiplerinin ( Phaseolous vulgaris L.) Artan Tuz Konsantrasyonu ve Farklı Zamanlardaki Gelişim Performansları

Fikret YAŞAR, Özlem UZAL, Şeküre Şebnem ELLİALTIOĞLU, Özlem KILIÇ

Enzimlerin Silaj Katkı Maddesi Olarak Kullanımı

Mehtap GÜNEY, Murat DEMİREL