Bu çalışmada, Van Gölü Havzası’nda yetiştiriciliği yapılan buğday, arpa, fasülye, mısır, kavun, nohut ve pırasa bitkilerinin tohumlarında bulunan fungusların izolasyonu, tanılanması ve patojenitelerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Yapılan izolasyonlar sonucunda genel olarak tohum örneklerinin Penicillium spp., Fusarium spp. ve Alternaria spp. ile kontamine oldukları belirlenmiştir. Özellikle Fusarium graminearum yoğun olarak buğday ve arpadan, Fusarium oxysporum kavun, pırasa ve mısırdan, Macrophomina phaseolina fasulye ve bakladan izole edilmişlerdir. Patojenite testleri iklim odası koşullarında yürütülmüş, hastalık şiddeti, kök uzunlukları, yaş ve kuru ağırlıklar ekimden 8 ile 10 hafta sonra belirlenmiştir. Deneme 2 kere 4 tekerrürlü olarak yürütülmüştür. Patojenite sonuçlarında F.  graminearum, F. oxysporum ve M. phaseolina izolatlarının hastalık şiddeti sırasıyla buğday ve arpada % 68,6 ve % 72, kavun, pırasa ve mısırda % 83, % 43 ve % 65,3, fasulye ve baklada % 75,2 ve % 68,4 olmuştur. Diğer funguslar daha az patojeniteye sebep olmuşlardır.