IL7R GEN MUTASYON VE POLİMORFİZMLARİNİN AĞIR KOMBİNE İMMUN YETMEZLİKLİ HASTALARDAKİ SIKLIĞI
Öz Ağır kombine immün yetmezlik immün sistem hücrelerinin defektleri ile ilgili olan nadir görülen genetik bir hastalıktır. Bu hastalık T lenfosit, B lenfosit ve Doğal Öldürücü (NK) lenfosit gruplarının birinde veya birkaçında görülebilir. Çalışmamızda Türkiye’nin güneyinde yer alan ağır kombine immün yetmezlikli hastalarda IL7R gen polimorfizmlerinin tanımlanması ve hastaların immünfenotip sonuçları ile birlikte değerlendirilmesi amaçlandı. Çalışmamızda ağır kombine immün yetmezlik tanısı alan 30 hastanın sanger DNA dizi analizi yöntemi ile analizi yapıldı. Hastalardan taze kan örnekleri alınarak akım sitometri yöntemi ile hastalardaki IL7R gen polimorfizmlerinin fenotiplendirilmesi yapıldı. Çalışmanın sonunda ağır kombine immün yetmezlikli hastalardan birinde (%3,3; 1/30) heterozigot p.R140Q (c.419G>A) mutasyonu tespit edilirken, hastaların 26’sında (%86,7; 26/30) de heterozigot ve/veya homozigot IL7R polimorfizmleri (T166I, I138V, T244I ve I356V) saptandı. Ağır immün yetmezlikli hastalarda IL7R gen polimorfizmlerinin sık görülmesi, bu polimorfizm ile hastalık arasında ilişki olduğu görüşünü güçlendirmiştir. Abstract Severe combined immunodeficiencies are a group of rare inherited disorders with profound defects in immune cells. This genetic disorder might have effect on T lymphocytes, B lymphocytes and/or Natural Killer cells (NK). This study aimed at the identifying the polymorphisms in IL7R gene present in severe combined immunodeficies patients who located in southern part of Turkey. A total of 30 patients with severe combined immunodeficiencies were investigated for IL7R polymorphisms using Sanger sequencing and immune phenotyping by flow cytometric analysis. One heterozygote p.R140Q (c.419G>A) mutation was identified in 1 patient (n=1, %3,3) and 86.7% (n=26) of all patients had IL7R polymorphisms (T166I, I138V, T244I and I356V) whether heterozygote and/or homozygote. The frequent occurence of IL7R gene polymorphisms in patients with severe immunodeficiency has strengthened the view that there is a relationship between this polymorphism and disease.
___
- Butte, M.J., Haines, C., Bonilla, F.A., Puck, J., (2007) IL-7 reseptor deficient SCID with
a unique intronic mutation and post-transplant autoimmunity due to chronic GVHD. Clin Immunol, 125(2), 159-164.
- Chou, J., Ohsumi, T.K., & Geha, R.S., (2012) Use of whole exome and genome
sequencing in the identification of genetic causes of primary immunodeficiencies. Curr Opin Allergy Clin Immunol, 12(6), 623-628.
- Derelli, E., Bozdoğan, G., & İkincioğulları, A., (2004) Ağır kombine immün yetmezlik.
Sted, 13(9):349-350.
- Dincer, D., Erdem, C., (2015) Primer İmmün Yetmezlik Sendromları ve Kutanöz
Bulguları. Dermatoz, 15062d1.
- Felgentreff, K., Perez-Becker, R., Speckmann, C., (2011) Clinical and immunological manifestations of patients with atypical severe combined immunodeficiency. Clin
Immunol, 141(1), 73-82.
- Hanımeli, Ö.A., Yılmaz, Ö., & Yüksel, H. (2010) Primer immün yetmezlikli çocuğa
Yaklaşım. Dicle Tıp Dergisi, 37(3), 307-313.
- Kalman, L., Lindegren, M.L., Kobrynski, L., Vogt, R., Hannon, H., & Howard, J.T.,
(2004) Mutations in genes required for T-cell development: IL7R, CD45, IL2RG, JAK3, RAG1, ARTEMIS and ADA and severe combined immunodeficiency: HuGE review. Genet Med 2004; 6:16-26.
- Özkan A., (2014) Primer immün yetmezlik hastalıkları ve hematopoetik kök hücre nakli.
Arşiv Kaynak Tarama Dergisi, 23(1), 108-117.
- Safaei, S., Pourpak, Z., Moin, M., & Houshmand, M., (2011) IL7R and RAG1/2 genes
mutations/polymorphisms in patients SCID. Iran J Allergy Asthma Immunol, 10(2), 129-132.
- Lee, P.P., Chan, T.X., & Jiang, L.P., (2011) Molecular diagnosis of severe combined
immunodeficiency identification of IL2RG, JAK3, DCLRE1C, RAG1 and RGA2 mutations in a cohort of Chinese and Southeast sian children. J Clin Immunol, 31(2), 281-296.
- Metzker, M.L., (2010) Sequencing Technologies-the next generation. Nature Reviews
Genetics, 11(1): 31-46.
- Rivers, L., Gaspar, B., (2014) Severe combined immunodeficiency: recent developments
and guidance on clinical management. Archdischild, 6.
- Tan, W., Yu, S., & Lei, J., (2015) A novel common gamma chain mutation in a Chinese
family with X-linked severe combined immunodeficiency X-SCID; T(-) NK(-)
B(+). Immunogenetics, 67(11-12), 629-639.
- Uygun, Kocacık, D.F., & Hafızoglu, D., (2015) Primer immün yetmezlik hastalarımızın
retrospektif değerlendirilmesi; Erzurum deneyimi. Asthma Allergy Immunol, 13,
90-93.
- Wang, X.S., Wen, P.F., & Zhang, M., (2014) Interleukin-7 receptor single nucleotide
polymorphism rs6897932 (C/T) and the susceptibility to systemic lupus
erythematosus. Inflammation, 37(2), 615-620.
- Yu, G.P., Nadeau, K.C., Berk, D.R., (2011) Genotype, phenotype and outcomes of nine
patients with T-B+NK+SCID. Pediatr Transplant, 15(7), 733-741.
- Yorulmaz, A., Artaç, H., Kara, R., Keleş, S., & Reiskli, İ. (2008) Primer immün
yetmezlikli 1054 olgunun retrospektif değerlendirilmesi. Astım Allerji İmmünoloji,
6(3), 127-134.