Düzeltme: İzole 13q Delesyonu Saptanan KLL Olgularında Notch1 ve Sf3b1 Genlerinde Mutasyon Analizi

Kronik lenfositik lösemi (KLL) klonal matür B lenfositten kaynaklanan ve genetik heterojenite gösteren bir lösemi tipi olarak bilinmektedir. KLL’nin genomunun aydınlatılması için birçok çalışma yapıldığı görülmektedir. Bu çalışmalarda, kromozomal aberasyonlardan en sık del(13q)’nun meydana geldiği bildirilmektedir. Bu anomali izole olduğu durumda iyi prognoz ile ilişkilendirilmesine rağmen, hastalar klinik heterojenite göstermektedir. Bunun yanında kötü prognoz ile ilişkilendirilen TP53, NOTCH1 ve SF3B1 gen mutasyonlarının da bulunduğu bir çok gende mutasyonlar tanımlanmış ve prognostik önemleri ortaya koyulmaya başlanmıştır. Biz de, bu veriler doğrultusunda FISH yöntemiyle izole del(13q) saptadığımız 43 olguda NOTCH1 ve SF3B1 genlerinin mutasyon oranını belirlemeyi ve prognoza (hastalık evreleri, TTFT ve OS) olan etkisini araştırmayı hedefledik. KLL’de en sık gözlenen NOTCH1 ve SF3B1 gen mutasyonlarını Sanger sekanslama yöntemi ile araştırdık. Klinik heterojeniteye sahip KLL olgu grubumuzun, 1/42’sinde NOTCH1 geninde frameshift 7541_7542delCT mutasyonu saptanırken, SF3B1 geninde mutasyon tespit edemedik. Çalışmamız sonucunda, NOTCH1 ve SF3B1 gen mutasyonlarının literatür verileri ile uyumlu olarak izole del(13q) ile ilişkili olmadığı gözlenmiştir. Çalışmamız Türk populasyonunda izole del(13q) KLL hastalarında prognostik parametreler ile birlikte NOTCH1 ve SF3B1 gen mutasyonlarının değerlendirildiği ilk çalışma olma özelliğindedir. Sonuç olarak; izole del(13q) vakalarının klinik heterojenitesinden sorumlu başka nedenlerin de olabileceği ve bunların ortaya çıkarılmasını amaçlayan daha fazla çalışmaya ihtiyaç olduğu sonucuna varılmıştır.
Anahtar Kelimeler:

Del13q, KLL, NOTCH1, Sanger, SF3B1

Düzeltme: Analyzing The Mutations Of Notch1 And Sf3b1 Genes In Cases With CLL Detected Isolated 13q Deletion

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is known as type of leukemia originating from clonal mature B lymphocytes and has genetic heterogeneity. Many studies have been done to clarify the genome of CLL. In these studies, del(13q) is reported as the most common chromosomal aberration. Although this anomaly is associated with good prognosis when isolated, patients have clinical heterogeneity. In addition, in many gene mutations including TP53, NOTCH1 and SF3B1 gene mutations, poor prognosis has been identified. The prognostic significance of these genes has begun to be demonstrated. According to these data, we aimed to determine the mutation rate of NOTCH1 and SF3B1 genes and to investigate the prognostic effects (disease stages, TTFT and OS) in 43 cases with isolated del(13q) by using FISH method. We investigated the most common mutations of NOTCH1 and SF3B1 gene in CLL by using Sanger sequencing method. While frameshift 7541_7542delCT mutation was detected in the NOTCH1 gene in 1 out of 42 CLL cases with clinical heterogeneity, mutation in the SF3B1 gene couldn’t be detected. As a result of our study, it was observed that NOTCH1 and SF3B1 gene mutations weren’t associated with isolated del(13q) which is compatible with the literature data. Our study is the first study that evaluates NOTCH1 and SF3B1 gene mutations with prognostic parameters of isolated del(13q) with CLL patients in the Turkish population. As a result; It was concluded that there may be different reasons responsible for the clinical heterogeneity of isolated del(13q) cases and further studies are needed to reveal these reasons

___

  • 1. Kipps TJ, Stevenson FK, Wu CJ, Croce CM, Packham G, Wierda WG, et al. Chronic lymphocytic leukaemia. Nat Rev Dis Primers. 2017;3:16096.
  • 2. Jiang Y, Chen HC, Su X, Thompson PA, Liu X, Do KA, et al. ATM function and its relationship with ATM gene mutations in chronic lymphocytic leukemia with the recurrent deletion (11q22.3-23.2). Blood Cancer J. 2016;6(9):e465.
  • 3. Fabbri G, Dalla-Favera R. The molecular pathogenesis of chronic lymphocytic leukaemia. Nat Rev Cancer. 2016;16(3):145-62.
  • 4. Tausch E, Beck P, Schlenk RF, Jebaraj BJ, Dolnik A, Yosifov DY, et al. Prognostic and predictive role of gene mutations in chronic lymphocytic leukemia: results from the pivotal phase III study COMPLEMENT1. Haematologica. 2020;105(10):2440-7.
  • 5. Durak Aras B, Isik S, Uskudar Teke H, Aslan A, Yavasoglu F, Gulbas Z, et al. Which prognostic marker is responsible for the clinical heterogeneity in CLL with 13q deletion? Mol Cytogenet. 2021;14(1):2.
  • 6. Miao Y, Miao Y, Shi K, Sun Q, Zhao SS, Xia Y, et al. A higher percentage of cells with 13q deletion predicts worse outcome in Chinese patients with chronic lymphocytic leukemia carrying isolated 13q deletion. Ann Hematol. 2018;97(9):1663-9.
  • 7. Hu B, Patel KP, Chen HC, Wang X, Luthra R, Routbort MJ, et al. Association of gene mutations with time-to-first treatment in 384 treatment-naive chronic lymphocytic leukaemia patients. Br J Haematol. 2019;187(3):307-18.
  • 8. Oscier DG, Rose-Zerilli MJ, Winkelmann N, Gonzalez de Castro D, Gomez B, Forster J, et al. The clinical significance of NOTCH1 and SF3B1 mutations in the UK LRF CLL4 trial. Blood. 2013;121(3):468-75.
  • 9. Baliakas P, Hadzidimitriou A, Sutton LA, Rossi D, Minga E, Villamor N, et al. Recurrent mutations refine prognosis in chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. 2015;29(2):329-36.
  • 10. Schwaederlé M, Ghia E, Rassenti LZ, Obara M, Dell'Aquila ML, Fecteau JF, et al. Subclonal evolution involving SF3B1 mutations in chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. 2013;27(5):1214-7.
  • 11. Jeromin S, Weissmann S, Haferlach C, Dicker F, Bayer K, Grossmann V, et al. SF3B1 mutations correlated to cytogenetics and mutations in NOTCH1, FBXW7, MYD88, XPO1 and TP53 in 1160 untreated CLL patients. Leukemia. 2014;28(1):108-17.
  • 12. Villamor N, Conde L, Martínez-Trillos A, Cazorla M, Navarro A, Beà S, et al. NOTCH1 mutations identify a genetic subgroup of chronic lymphocytic leukemia patients with high risk of transformation and poor outcome. Leukemia. 2013;27(5):1100-6.
  • 13. Xu ZS, Zhang JS, Zhang JY, Wu SQ, Xiong DL, Chen HJ, et al. Constitutive activation of NF-κB signaling by NOTCH1 mutations in chronic lymphocytic leukemia. Oncol Rep. 2015;33(4):1609-14.
  • 14. Pérez C. C. R-VEA, Hernández-Sánchez M., Quijada-Álamo M., Benito R., Hernández-Sánchez J., Martín-Izquierdo M., … & Hernández Rivas J. Notch1, Tp53, Sf3b1, Atm And Bırc3 Gene Mutatıons Are Assocıated Wıth A Worse Outcome In Chronıc Lymphocytıc Leukemıa Patıents Wıth 13q Losses. European Hematology Association 2018.
Osmangazi Tıp Dergisi-Cover
  • ISSN: 1305-4953
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 2013
  • Yayıncı: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Rektörlüğü
Sayıdaki Diğer Makaleler

HPV Testi Pozitif, Servikal Sitolojisi Negatif Hastaların Kolposkopi Sonuçlarının Değerlendirilmesi

Fatma Nurgül TAŞGÖZ, Nergis KENDER ERTURK, Mehmet ÖZKANLI, Anıl ERTURK

Otolog Nakil İçin Periferik Kan Hematopoietik Kök Hücre Toplamanın Optimal Zamanı, Olgunlaşmamış Granülositler ve Çekirdekli Kırmızı Kan Hücreleri Tarafından Tahmin Edilebilir

Evin KOCATÜRK, Eren GUNDUZ, Hüseyin KAYADİBİ, Hava ÜSKÜDAR TEKE, İ. Özkan ALATAŞ

Tedavi Edilmemiş Pediatrik Çölyak Hastalarının Duodenal Biyopsi Materyallerinde Gastrik Metaplazi Sıklığının ve Öneminin Araştırılması

Funda CANAZ, Damla OFLAS, Evrim YILMAZ, Deniz ARIK, Yusuf AYDEMİR, Zeren BARIŞ, Hülya ÖZEN

Uzun Dönem COVID-19 Hastalarında ABO Kan Grubu Dağılımı ile Klinik Özellikler Arasındaki İlişkinin Değerlendirilmesi: Retrospektif Bir Çalışma

Yaşar BİLDİRİCİ, Anıl UÇAN, Şebnem EKER GÜVENÇ, Uğur BİLGE

Üreteropelvik Darlıkta Klinik, Radyolojik ve Sintigrafik Verilerin Laparoskopik Piyeloplasti Sonrası Erken ve Geç Dönem Seyrinin Değerlendirilmesi

Çiğdem ARSLAN ALICI, Mehmet Surhan ARDA, Umut ALICI, Huseyin ILHAN, TURKEY, Baran TOKAR

Omuz İmpingment Sendromlu Hastalarda Rehabilitasyon Protokolüne Eklenen Ayna Terapisi ile İlgili Sonuçlar: Prospektif Randomize Kontrollü Çalışma

Merve AKDENİZ LEBLEBİCİER, Fatıma YAMAN, Dilan BULUT ÖZKAYA

Triceps Aşırı Kullanımına Bağlı Gelişen Spiral Oluk Tuzak Nöropatisi: Bir Olgu Sunumu

Onur ARMAĞAN, Burcu ORTANCA

Antidepresanlar ile İlişkili Mitlerin Bağlanma Stilleri ve Kişilik Özellikleri ile İlişkisi

İmran Gökçen YILMAZ KARAMAN, Melike EZERBOLAT ÖZATEŞ

Diyet Öz Yeterlilik Ölçeği Türkçe Uyarlamasının Geçerlilik ve Güvenilirlik Çalışması

Pınar HAMURCU, İrem Nur ŞAHİN, Nazlı BATAR, Abdullah ÇELİK

Marjinal Zon Lenfomalı Hastaların Klinik ve Laboratuar Özellikleri: Tek Merkez Deneyimi

Fatih YAMAN, Nur OGUZ DAVUTOGLU, Filiz YAVAŞOĞLU, Neslihan ANDIC, Hava ÜSKÜDAR TEKE, Eren GUNDUZ