Hatice Yildirim YAROĞLU, Ayşegül GÖRÜR, Lokman AYAZ, Şenay BALCI FİDANCI, Serin AKBAYIR, Z.Nil DOĞRUER ÜNAL, Engin KAPLAN, Engin Kaplan Mehmet Sami SERİN, Resul BUĞDAYCI, Nurcan ARAS ATEŞ, Lülüfer TAMER GÜMÜŞ
Mersin İlinde Sağlıklı Bireylerde MikroRNA Ekspresyon Profili
Amaç: MikroRNA\'lar yaklaşık olarak 18-24 nükleotit uzunluğunda, tek iplikli, küçük, kodlanmayan RNA\'ların bir sınıfıdır. MikroRNA\'lar hedef mesajcı RNA\'nın yıkımını yada translasyonunun baskılanmasını gerçekleştirerek posttranskripsiyonal düzeyde gen ekspresyonunu düzenler. miRNA\'lar kardiyovasküler, nörodejeneratif ve inflamatuvar hastalıklar, infeksiyonlar, gelişimsel bozukluklar, musküler bozukluklar ve kanserde rol alırlar. Bu çalışmada sağlıklı bireylerde dolaşımda eksprese olan miRNA profilinin belirlenmesi amaçlandı. Yöntem: miRNA ekspresyonu yaşları 16 ile 80 arasında değişen, 98 kadın ve 194 erkekten oluşan 292 sağlıklı bireyde değerlendirildi. EDTA içeren tüplere alınan periferik kan örnekleri, 4000 rpm\'de 15 dakika santrifüj edilerek plazmaları ayrıldı. Plazmadan izole edilen miRNA\'lardan Reverse Transcription kitiyle cDNA\'lar elde edildi ve 96.96 Dynamic Array IFCs kullanılarak Yüksek Kapasiteli Real-Time PCR(qRT-PCR) cihazı (Fluidigm, Biomark, USA) ile 740 farklı miRNA analiz edildi. Bulgular: Çalışmamızda 740 miRNA\'dan 182\'si eksprese olurken, 558\'inde ekspresyon görülmedi. Sonuç: Sağlıklı bireylerde miRNA profilinin belirlenmesi ile başta kanser olmak üzere birçok hastalıkta immünoterapik veya farmokolojik tedavi amaçlı kullanımı gerçekleşebilir.
Anahtar Kelimeler:
miRNA, sağlıklı birey, profil
ARAŞTIRMA MAKALESİ Mersin İlinde Sağlıklı Bireylerde MikroRNA Ekspresyon Profili
Abstract MicroRNA Expression Profiling in Healthy Subjects in Mersin Aim: MicroRNAs are a class of about 18-24 nucleotid, non-coding single-stranded small RNA molecules that regulate gene expression at the posttranscriptional level by either degrading or blocking translation of messenger RNA targets. They have roles in cardiovascular, neurodegenerative and inflammatory diseases, infections, developmental disorders, muscular disorders and cancer. The levels and types of miRNA expression in normal tissues are significantly different from in tumor tissues. The aim of this study was to investigate the profiling of circulating miRNAs expression in volunteer healthy subjects. Method: The miRNAs expression was evaluated in 292 healthy volunteers (98 women and 194 men) whose ages\'re ranging from 16 to 80. EDTA-anticoagulated peripheral blood samples were centrifuged at 4000 rpm for 15 minutes to separate plasma. cDNA's were obtained from the isolated plasma miRNAs by employing Reverse Transcription Kits and subsequently, 740 different miRNAs were analyzed with High Throughput Real-Time PCR (qRT-PCR) device (Fluidigm, Biomark, USA) by using 96.96 Dynamic Array IFCs. Results: In our study, 182 of 740 miRNAs were expressed while an expression was not observed in 558 miRNAs. Conclusion: The determination of miRNA profiles in healthy volunteers may lead to their immunotherapeutic or pharmacotherapeutic use in treatment of many diseases such as cancer in particular.
Keywords:
miRNA; healthy subjects; profiling,
___
- Shenouda SK, Alahari SK. MicroRNA function in cancer: oncogene or a tumor suppressor? Cancer Metastasis Rev ;28(3-4):369—78. Witimann J, Jâck HM, Serum ınicroRNAs as powerful cancer biomarkers. Biochı'mı'ca et Biophysica Acta ;1806(2):200—20.
- Pillai RS, Bhattacharyya SN and Filipowicz W. Repression of protein synthesis by miRNAs: how many mechanisms? Trends in Cell Biology 2007;17(3):118 -26.
- Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell 1993;75(5): —54.
- Mersin İlinde Sağlıklı Bireylerde MikroRNA Ekspresyon ProŞli Bartels CL, Tsongalis GJ. MicroRNAs: novel biomarkers for human cancer. Clin Chem, 2009;55(4):623—31.
- Ha TY. MicroRNAs in Human Diseases: From Cancer to Cardiovascular Disease. Immune Netw 2011;11(3):135
- Garofalo M, Condorelli G, Croce CM: MicroRNAs in diseases and drug response. Curr Opin Pharmacol Selbach M, Schwan haus ser B, Thier fel der N, Fang Z, Khanin R, Rajewsky N. Wide spread changes in protein Baek D, Villen J, Shin C, Camar go FD, Gygi SP, Bartel DP. The impact of microRNAs on protein output. Nature Latronico MV, Catalucci D, Condorelli G. Emerging role of microRNAs in cardiovascular biology. Circ Res Soifer HS, Rossi JJ, Saetrom P. MicroRNAs in disease and potential therapeutic applications. Mol Iller 2007; 15(12):
- Lukiw WJ, Alexandrov PN, Zhao Y, Hill JM. Spreading of Alzheimer's disease inşammatory signaling through Wang LL, Huang Y, Wang G, Chen SD. The potential role of microRNA-146 in Alzheimer's disease: biomarker or Tsitsiou E, Lindsay MA. MicroRNAs and the immune response. Curr Opin Pharmacol 2009; 9(4):514-20.
- Tili E, Michaille JJ, Costinean S, Croce CM. MicroRNAs, the immune system and rheumatic disease. Nat Clin Pract Zhang C. MicroRNAs in Vascular Biology and Vascular Disease. J Cardiovasc Trans Res 2010;3(3):235—40.
- Wang GK, Zhu JQ, Zhang JT, Li, He J, Qin YM, Jing Q. Circulating microRNA: a novel potential biomarker for Khoshnaw S, Green A, Powe D, Ellis I. MicroRNA involvement in the pathogenesis and management of breast cancer. J Clin Pathol 2009;62(5):422—8.
- Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
- Başlangıç: 2008
- Yayıncı: Mersin Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Sayıdaki Diğer Makaleler
DERLEME Doğum Ağrısı Kontrolünde Nonfarmakolojik Yöntemler
Mersin İlinde Uyuşturucu Madde Kullananların Hepatit B ve Hepatit C Bilgi Düzeylerinin Belirlenmesi
Mersin İlinde Sağlıklı Bireylerde MikroRNA Ekspresyon Profili
Hatice Yildirim YAROĞLU, Ayşegül GÖRÜR, Lokman AYAZ, Şenay BALCI FİDANCI, Serin AKBAYIR, Z.Nil DOĞRUER ÜNAL, Engin KAPLAN, Engin Kaplan Mehmet Sami SERİN, Resul BUĞDAYCI, Nurcan ARAS ATEŞ, Lülüfer TAMER GÜMÜŞ
Kan Sayım Cihazında Çalışılan Parametrelerin Metod Performans Değerlendirmesi
Serin AKBAYIR, Fatma KARAZİNDİYANOĞLU, Hatice Gülçin ESKANDARİ
DERLEME Batı Nil Virusu ve İnfeksiyonu