Дна озерного водоема и прилегающей к озеру территории, даже незначительные колебания уровня озера могут привести к катастрофическим последствиям: отступанию береговой линии на сотни метров и возникновению обширных заболоченных пространств в случае понижения уровня или к затоплению прибрежных территорий с имеющейся инфраструктурой в случае повышения уровня . Понятно, что для разработки перспективных планов развития территории Прииссыккулья необходимы сведения о долговременных тенденциях колебания уровня озера. При этом необходимы знания не только об исторических колебаниях, зафиксированных на картах путешественников, но и о более длительном прошлом – на протяжении четвертичного времени, когда были сформированы основные черты современной физико-географической обстановки.