Morphological and Molecular Phylogeny of Cortinarius rufo-olivaceus (Pers.) Fr. (subgenus Phlegmacium sect. Calochroi) Collected from Tokat Region

Cortinarius (Pers.) Gray samples were collected in the oak forestsfrom Tokat province. Macro and micromorphological features as wellas molecular phylogenetic analyses according to the DNA sequencescorresponding to internal transcribed spacer region (ITS) and thelarge subunit (LSU) of nuclear ribosomal RNA gene regionsindicated that the studied specimen is a Cortinarius rufo-olivaceus(Pers.) Fr. This study determined the first microscopic andmacroscopic morphological description and molecular phylogeneticanalysis of the Cortinarius rufo-olivaceus (Pers.) Fr. in Turkey.

Tokat Yöresinden Toplanan Cortinarius rufo-olivaceus (Pers.) Fr. (subgenus Phlegmacium sect. Calochroi) Türünün Morfolojik ve Moleküler Filogenisi

Cortinarius (Pers.) Gray örnekleri Tokat ilinden meşe ormanlarında toplanmıştır. Makro ve mikromorfolojik özellikler ile nükleer ribozomal iç aralayıcı bölge (ITS) ve ribozomal en büyük alt birim (LSU) gen bölgelerine karşılık gelen DNA dizileri ile moleküler filogenetik analizler, çalışılan numunenin Cortinarius rufo-olivaceus (Pers.) Fr. türü olduğunu göstermiştir. Bu çalışma, Türkiye’de C. rufo-olivaceus’un mikroskobik ve makroskobik morfolojik tanımı ve moleküler filogenetik analizini belirleyen ilk çalışmadır.

___

Akata I, Kabaktepe S, Akgül H 2015. Cortinarius caperatus (Pers.) Fr., a new record for Turkish mycobiota. Kastamonu University Journal of Forestry Faculty 15: 86-89.

Bon M 1987. The Mushrooms and Toadstools of Britain and North-Western Europe. HodderStoughton, London, 352 p. Breitenbach J, Kränzlin F 2000. Fungi of Switzerland. Vol.5, Verlag Mykologia, Lucerne, Switzerland.

Frøslev TG, Jeppesen TS, Læssøe T, Kjøller R 2007. Molecular phylogenetics and delimitation of species in Cortinarius section Calochroi (Basidiomycota, Agaricales) in Europe. Molecular phylogenetics and evolution 44(1): 217-227.

Garnica S, Weiß M, Oertel B, Ammirati J, Oberwinkler F 2009. Phylogenetic relationships in Cortinarius, section Calochroi, inferred from nuclear DNA sequences. BMC Evolutionary Biology 9(1): 1.

Garrido-Benavent I, Ballarà J, Mahiques R 2015. New insights into subg. Phlegmacium sect. Calochroi: adding morphological and molecular data from Mediterranean representatives, with special regard to Cortinarius prasinus, C. natalis and C. murellensis species complexes. Journal des J.E.C., 17:38-78.

Işıloğlu M, Öder N 1995. Contributions to the macrofungi of Mediterranean Turkey. Turkish Journal of Botany, 19: 603-609.

Itoo ZA, Reshi ZA, Basharat Q, Majeed ST, Andrabi KI 2015. Identification and characterization of Ectomycorrhizal Cortinarius species (Agaricales, Basidiomycetes) from temperate Kashmir Himalaya, India, by ITS barcoding. Advances in Molecular Biology 2015: 1-9.

Kalmer A, Acar İ, Dizkırıcı Tekpınar A 2019. Phylogenetic and taxonomic studies on Cortinarius caerulescens (Schaeff.) Fr. a new record for Turkish mycota. The Journal of Fungus 10(1):8-16.

Kirk P 2011. Index Fungorum. URL: http://www.indexfungorum.org (accessed 27.12.2019).

Kumar S, Stecher G, Tamura K 2016. MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular biology and evolution 33(7): 1870-1874.

Mazza G 2019. Monaco Nature Encyclopedia. Retrieved in December, 21, 2019 from https://www.monaconatureencyclopedia.com/cortin arius-rufoolivaceus/?lang=en

Moser M 1983. Keys to Agarics and Boleti. Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 535 p.

Ortega A, Suárez-Santiago VN, Reyes JD 2008. Morphological and ITS identification of Cortinarius species (section Calochroi) collected in Mediterranean Quercus woodlands. Fungal Diversity, 29: 73-88.

Orton PD 1955. The genus Cortinarius I. Myxacium and Phlegmacium. The Naturalist. 1-80, London.

Phillips R 1981. Mushrooms and Other Fungi of Great Britain & Europe. Pan Books Ltd., London. Sesli E, Denchev CM 2014. Checklists of the myxomycetes, larger ascomycetes, and larger basidiomycetes in Turkey. 6 th. Mycotaxon Checklists Online: 1-136.

Sesli E, Contu M, Jordi VI, Moreau PA, Battistin E 2015. Taxonomic studies on some agaricoid and boletoid fungi of Turkey. Turkish Journal of Botany 39(1): 134-146.

Sesli E, Türkekul İ, Akata I, Niskanen T 2016. New records of Basidiomycota from Trabzon, Tokat, and İstanbul provinces in Turkey. Turkish Journal of Botany 40(5): 531-545.

Sesli E 2018. Cortinarius ve Lyophyllum cinslerine ait yeni kayıtlar. Mantar dergisi 9(1): 18-23.

Sesli E, Liimatainen K 2018. Cortinarius conicoumbonatus (Cortinarius subgen. Telamonia sect. Hinnulei): a new species from spruce-beech forests of the East Black Sea Region of Turkey. Turkish Journal of Botany 42(3): 327-334.

Stensrud Ø, Orr RJS, Røberg KR, Schumacher T, Høiland K 2014. Phylogenetic relationships in Cortinarius with focus on North European species. Karstenia, 54: 57-71.

Tamura K, Nei M 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular biology and evolution 10(3): 512-526.

Vilgalys R, Hester M 1990. Rapid genetic identification and mapping of enzymatically amplified ribosomal DNA from several Cryptococcus species. Journal of Bacteriology 172(8): 4238-4246.

White TJ, Bruns T, Lee SJ, Taylor J 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ, editors. PCR protocols: a guide to methods and applications. New York, NY, USA: Academic Press, pp. 315-322.
KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi-Cover
  • ISSN: 2619-9149
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 2018
Sayıdaki Diğer Makaleler

Bazı Soya Fasulyesi [Glycine Max (L.) Merr.] Genotipleri Arasında Agronomik Özelliklerin ve ISSR Yönteminin Karşılaştırmalı Analizi

Emine ARSLAN, Elif GÜLBAHÇE MUTLU, Ömer DURSUN, Ahmet BAĞCI

Arazi Toplulaştırma Projelerinin Tarımsal Mekanizasyon İşletmeciliğine Etkisi

Hamza KUZU, Hasan DEĞİRMENCİ

A New Genus Record for the Flora of Turkey: Reynoutria (Polygonaceae)

Fergan KARAER, Salih TERZİOĞLU, Hamdi Güray KUTBAY

Bitki Yaşı ve Hasat Zamanının Kuşkonmaz Verimi ve Sürgün Kalitesi Üzerine Etkileri

Şebnem KÖKLÜ, Sevda DOLUNBAY, Gökçen YAKUPOĞLU, Aygül KARACA, Abdullah HAVAN, Ahmet KORKMAZ

Yağışa Dayalı Koşullarda Bazı Ekmeklik Buğday Çeşitlerinin (Triticum aestivum L.) Verim ve Bazı Kalite Özelliklerinin Değerlendirilmesi

Seydi AYDOĞAN, mehmet ŞAHİN, Aysun GÖÇMEN AKÇACIK, Berat DEMİR, Telat YILDIRIM, Sümeyra HAMZAOĞLU

Çataldağ (Balıkesir-Susurluk) Çevresinin Carabidae, Staphylinidae, Elateridae, Cleridae, Cerambycidae ve Chrysomelidae (Coleoptera) Faunası Üzerine Çalışmalar

Sakin Vural VARLI, Hakan SÜRGÜT, Aylin TÜVEN, Nicklas JANSSON

Trakya Bölgesi’nde Farklı Bitkiler Yetiştirilen Arazilerde Toprak ve Hava Mikrofungusları Üzerine Bir Araştırma

Meltem ÇAKMAK, Halide AYDOĞDU

Çukurova bölgesi pamuk alanlarında Bemisia tabaci (Gennadius)’de aşırı düzeyde sitokrom P450 CYP6CM1 gen ekspresyonu

Selçuk ULUSOY

Siyah Alaca ve Doğu Anadolu Kırmızısı Irkına Ait Sığırların Mycoplasma bovis ile Enfekte Sütlerinden Köken Alan Eksozomlardaki Yangı Ile Ilişkili miRNA’ların Ekpresyon Profili

Selçuk ÖZDEMİR

Yabani Yenilebilir Mantar Suillus granulatus'un Antioksidan Potansiyeli ve Element İçerikleri

Hayri BABA, Ilgaz AKATA, Waseem MUSHTAQ, Mustafa SEVİNDİK