Kocaeli’de Yayılış Gösteren Bazı Böcek Türlerinin Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Alt Ünite 1 Geni ile Filogenetik Analizi
Böcek türleri bakımından zengin bir coğrafyada yaşamaktayız. Ancak coğrafyamızda tespit edilen böcek türleri sayısı tahmin edilen sayıdan çok daha azdır. Buradan yola çıkarak yapılan bu çalışmada, Kocaeli ilinden rastgele toplanılan çeşitli böcek türlerinin moleküler düzeyde tespit edilmesi amaçlandı. Bunun için böceklerden önce DNA izolasyonu ardından mitokondrial COI bölgelerine ait evrensel primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA sekans analizi yapıldı. Her bir DNA dizisi NCBI Nucleotide BLAST’a yüklenerek erişim numaraları elde edildi. Böcek türlerine ait COI gen dizileri MEGA 7.0 programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlendi. DNA barkod geni olarak yaygın bir şekilde kullanılan COI geni ile yapılan bu çalışmada, böcek türlerinin Exechia seriata, Phlebotomus neglectus, Chironomus riparius, Drosophila tsukubaensis, ve Rhamphomyia sp. oldukları tespit edildi.
Anahtar Kelimeler:
Böcek, COI geni, Filogenetik Analiz, Kocaeli
___
- Hancı H., 2003. Adli Entomoloji, TBB Dergisi, 2003(49).
- Aydın G., 2016. Böceklerin Sınıflandırılması (Takım) Düzeyinde,http://atabeymyo.isparta.edu.tr/assets/uploads/sites/76/files/boceklerin-siniflandirilmasi-1810201 6.pdf.
- Gullan P. J., Cranston P. S., 2005. The Insects: An Outline of Entomology, 4. ed., Blackwell Publishig, California, USA.
- Hancı İ., Tüzün A., Açıkgöz N., Balseven A., Candar, S., 2002. Adli Entomoloji, Asayiş Daire Başkanlığı, Yayın no: 9, Ankara.
- Eric J., Biyoloji Öz., 2015. 1. Baskı, Pearson, Nobel, Ankara.
- Yılmaz C., 2017. Terme’nin Biyoçeşitlilik ve Doğal Ortam Özellikleri, O.M.Ü. Eğitim Fak. Serander Yayınları, Samsun.
- Yıldırım E., 2012. The distribution and biogeography of Vespidae (Hymenoptera: Aculeata) in Turkey, Türk Entomol. Dergisi., 36(1), 23-42.
- Yıldırım E., Gusenleitner J., 2012. Contribution to the knowledge of the Vespidae (Hymenoptera, Aculeata) of Turkey, with a checklist of the Turkish species, Türk J. Zool., 36(3), 361-374.
- https://en.wikipedia.org/wiki/Rhamphomyia (Erişim tarihi: 29.08.2018).
- Ivović V., Chaniotis V., Vujanić M., B. Bobić B., Nikolić A., Klun A., Živković T, Djurković-Djaković O., 2010., Life Tables And Reproductive Parameters Of Phlebotomus Neglectus Tonnoır, 1921 (Diptera, Psychodidae) Under Laboratory Conditions. Arch. Biol. Sci., Belgrade, 62(1), 153-157.
- Chaniotis B., Spyridaki I., Scoulika E., Antoniou M., 2000. Colonization of Phlebotomus neglectus (Diptera: Psychodidae), the major vector of visceral leishmaniasis in Greece. J Med Entomol., 37(3): 346-348.
- https://en.wikipedia.org/wiki/Chironomus_riparius, Erişim tarihi 29.08.2018.
- Barták M., Danielson R., 2007. Revision of Rhamphomyia species (Diptera, Empididae) described by J. W. Zetterstedt. Acta Zoologica Universitatis Comenianae 47(2): 105–114.
- https://en.wikipedia.org/wiki/Drosophila, (Erişim Tarihi 29.08.2018).
- Hebert P. D. N., Cywinska A., Ball S. L., deWaard J. R., 2003a. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings Of The Royal Society B: Biological Sciences. 270, 313-321.
- Avise J. C., 2000. Phylogeography: the history and formation of species. Harvard university pres, Harvard.
- Hebert P. D. N., Ratnasingham S., deWaard J. R., 2003b. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings in Biological Sciences, 270(1): 96–99.
- Arnot D. E., Roper C., Bayoumi R. A., 1993. Digital codes from hypervariable tandemly repeated DNA sequences in the Plasmodium falciparum circumsporozoite gene can genetically barcode isolates. Molecular and Biochemical Parasitology, 61, 15-24.
- Ball S. L., Armstrong K. F., 2006. DNA barcodes for insect pest identification: a test case with tussock moths (Lepidoptera: Lymantriidae). Canadian Journal of Forest Research, 36(2), 337-350.
- Martijn J. T. N., Timmermans C. V., Geoff M., Kevin H. A., Vogler P., 2016. Rapid assembly of taxonomically validated mitochondrial genomes from historical insect collections. Biological Journal of the Linnean Society, 117, 83-95.
- Yayın Aralığı: Yılda 2 Sayı
- Başlangıç: 2018
- Yayıncı: Kocaeli Üniversitesi