İdrar Kültürlerinden Üretilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Duyarlılıkları
GİRİŞ ve AMAÇ: Toplumda sıklıkla rastlanan üriner sistem enfeksiyonlarının oranlarındaki değişim ve baştaEscherichia coliolmak üzere tümÜSEetkenlerinde on yıllık süreçte izolasyon ve antibiyotik direnç oranlarındakiartışın retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. YÖNTEM ve GEREÇLER: Buçalışmada Ocak 2009 ileAralık 2018 tarihleriarasında yapılan idrar kültürlerivehastaların demografik özellikleri, idrar kültürünün gönderildiği yer (yoğun bakım ve yoğun bakım dışı), antibiyotikdirenç oranları incelendi. İstatistiksel analizler SPSS 20.0 programı kullanılarak yapıldı. BULGULAR:İdrarkültüründeüremeolan6916adetsonuçretrospektifolarakdeğerlendirildi.Hastaların 4903’ü(%70,9) (yaş ortalaması: 67,19±15,77) kadın, 2013’ü (%29,1) (yaş ortalaması: 51,70±22,55) erkek idi. Yoğun bakımdan gönderilen 3028 (%43,8) adet idrar kültüründe daha çok Staphylococcus (%28,9), Klebsiella (%12), Pseudomonas(%12,8), Acinetobacter (%11,7), Escherichia coli (%9,4) ve candida türleri (%8,5)izole edilirkenyoğun bakımdışıservisve polikliniklerden gönderilen 3888 (%56,2) adet idrar kültüründe sıklıklaE. coli(%57,2)izole edilmiştir. 18-30 yaş grubunda yaygın olarak E. coli(%53,8) izole edilirken 71-80 yaş grubunda Stafilokoktürleri(%21,6),E. coli(%17,7),Pseudomonas(%12,3),Klebsiella (%11,9), candida türleri(%9,8),Acinetobacter(%8,2) veEnterokok türleri(%4) gözlemlendi. 90 yaşüzerindekihasta grubunda ise ensık olarak Staphylococcus(%19,7) ve Acinetobacter türleri (%13) izole edildi. 10 yıllık süre boyunca giderek artan bir antibiyotik direnci vardı.TARTIŞMA ve SONUÇ: İdrar kültürlerinden sıkça izole edilen E. coli özellikle ampisiline, TMX/sulfometoksazoleve siprofloksasine karşı yüksek oranda dirençlidir. Buna karşın fosfomisin ve nitrofurantoine karşı ise daha duyarlıdır.Sonuçta bu iki antibiyotiğin tüm idrar yolu enfeksiyonlarında kullanılabileceği anlaşılabilir.
Microorganisms Isolated from Urine Cultures and Their Antibiotic Sensitivity
INTRODUCTION: Itwas aimed to evaluate the change in the ratesofurinary tract infections(ITU), which wereisolation and increased in ratesof antibiotic resistance allUTI agents atthe population especiallyEscherichia coli,for about ten years, retrospectively. METHODS: In this study were examined urine cultures that their antibiotic resistance rates and demographiccharacteristicsofthepatients,thattheysentfromdepartments(intensivecareandnon-intensivecare),fromJanuary2009 to December 2018. Statistical analyzes were made using the SPSS 20.0 program. RESULTS: Total of 6916 urine cultures were evaluated retrospectively, of which 4903 (70.9%) were takenin women (mean age: 67.19±15.77) and 2013(29.1%) in men (mean age: 51.70±22.55). Whereas mostlyStaphylococcus(28.9%), Klebsiella(12%), Pseudomonas(12.8%), Acinetobacter(11.7%), Escherichia coli(9.4%)and candida(8.5%) were isolated in 3028(43.8%) urine culturesthatsent fromintensive care, E. coli(57.2%) wasfrequently isolated in 3888(56.2%) urine culturesthatsentfromnon-intensive care units and polyclinics.WhileE.coli(53.8%) was isolated the most common in the 18-30 age group, Staphylococcus species(21.6%), E. coli(17.7%),Pseudomonas(12.3%), Klebsiella(11.9%), candida species(9.8%), Acinetobacter(8.2%) and Enterococci species(4%)were observed in the 71-80 age group. Most common Staphylococcus(19.7%) and Acinetobacter(13%) were isolatedin the group over the age of 90. There was increasingly antibiotic resistance during the ten years. DISCUSSION AND CONCLUSION: E. coli is highly resistant to ampicillin, TMX / sulfomethoxazole andciprofloxacin which is frequently isolated from urine cultures, However, it is more sensitive to fosfomycin andnitrofurantoin. As a result, it can be understood that these two antibiotics can be used in all UTIs.
___
- 1. Aral M, Kireçci E, Doğan SŞ. İdrar örneklerinden izole edilen gram negatif bakteriler ve antibiyotiklere direnç oranlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2011; 41:139-42
- 2. Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. ANKEM 2011; 25:232-6 https://doi.org/10.5222/ankem.2011.232
- 3. Sucu N, Aktoz Boz G, Bayraktar Ö. Üropatojen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının yıllar içerisindeki değişimi. Klimik Dergisi 2004; 17:128-131
- 4. Amábile Cuevas CF, Arredondo García JL, Cruz A, Rosas I. Fluoroquinolone resistance in clinical and environmental isolates of Escherichia coli in Mexico City. J Appl Microbiol 2010; 108:158-162 https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2009.04401.x
- 5. Güneysel Ö, Erdede M, Denizbaşı A. Trimethoprim/ sulfamethoxazole resistance in urinary tract infections: which is next? Eur J Emerg Med 2006; 13:48 https://doi.org/10.1097/00063110-200602000-00019
- 6. Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S. İdrar kültürlerinden izole edilen Gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç. Ankem Derg 2007; 21:19-22
- 7. Pullukçu H, Taşbakan M, Aydemir Ş, Sipahi OR, Turhan A, Özinel MA et al. İdrar kültürlerinden soyutlanan bakteriler ve çeşitli antibiyotiklere invitro duyarlılıklarının değerlendirilmesi, Ankem Derg 2006; 20:26-30
- 8. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin invitro etkinliği. Ankem Derg 2009; 23:172- 6
- 9. Bozkurt ÖF, Kara C, Akarsu S, Çağlar M, Ünsal A. Semptomatik idrar yolu infeksiyonu olan kadınların tedavisinde tek doz fosfomisin etkinliğinin siprofloksasin ile karşılaştırılması. Türk Ürol Derg 2008; 34:360-2
- 10. Taşbakan MI, Pullukçu H, Yamazhan T, Arda B, Ulusoy S. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan Escherichia coli suşlarına fosfomisinin invitro etkinliğinin diğer antibiyotiklerle karşılaştırılması. ANKEM 2004; 18:216-9
- 11. Köken G, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z, Aktepe OC, Yılmazer M. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol etkinliği. ANKEM 2008; 22:23-7
- 12. Maraki S, Samonis G, Rafailidis PI, Vouloumanou EK, Mavromanolakis E, Falagas ME. Susceptibility of urinary tract bacteriato fosfomycin. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53:4508-10 https://doi.org/10.1128/AAC.00721-09
- 13. Prakash V,Lewis JS 2nd, Herrera ML, Wickes BL,Jorgensen JH. Oral and parenteralt herapeutic options for outpatient urinary infections caused by enterobacteriaceae producing CTX-M extended spectrum beta lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2009 53:1278-80 https://doi.org/10.1128/AAC.01519-08
- 14. Deveci Ö, Yula E, Tekin A. İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşların da betalaktamaz sıklığı ve antibiyotik direnci. Klin Den Ar Derg 2010; 1:182-6
- 15. Küçükbasmacı Ö, Çelik N. Çocuk hastaların idrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009; 39:40-3
- 16. Akpaka PE, Christian N, Bodonaik NC, Smikle MF. Epidemiology of coagulase-negative Staphylococci isolated from clinical blood specimens at the universty hospital of the West Indes. West Indian Medical Journal 2006; 55(3):170-73 https://doi.org/10.1590/S0043-31442006000300008
- 17. Kireçci E, Aktaş AE. Stafilokok suşlarının gaz kromotografi metoduyla tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2004;34: 215-19
- 18. Otto M (Nisan 2010). “Staphylococcus colonization of the skin and antimicrobial peptides”. Expert Review of Dermatology 5 (2): 183-95 https://doi.org/10.1586/edm.10.6
- 19. Miller LG, Tang AW. Treatment of Uncomplicated Urinary Tract Infections in an Era of Increasing Antimicrobial Resistance. Mayo Clin Proc. 2004; 79:1048-1054 https://doi.org/10.4065/79.8.1048
- 20. Ay S, Abut İşeri L, Duman B İdrar Örneklerinden Izole Edilen Gram Olumsuz Mikroorganizmalarin Antibiyotiklere Duyarlılıkları. İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2003; 10(2) 59-62
- 21. Altoparlak Ü, Özbek A, Aktaş F. Üriner Sistem İnfeksiyonlarından İzole edilen Bakterilerin Çeşitli Antibiyotiklere Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002; 32:167-173
- 22. Sierra Díaz E, Hernández Ríos CJ, Bravo Cuellar A. Antibiotic resistance: microbiological profile of urinary tract infections in Mexico. CirCir, 2019;87(2):176-82 https://doi.org/10.24875/CIRU.18000494
- 23. Abbas HA, El Ganiny AM, Kamel HA. Phenotypic and genotypic detection of antibiotic resistance of Pseudomonas aeruginosa isolated from urinary tract infections. Afr Health Sci, 2018;18(1):11-21 https://doi.org/10.4314/ahs.v18i1.3
- 24. Antunes LC, Visca P, Towner KJ. Acinetobacter baumannii: evolution of a global pathogen. Pathog Dis 2014; 71:292-301 https://doi.org/10.1111/2049-632X.12125
- 25. Bassetti M, Vena A, Croxatto A, Righi E, Guery B. How to manage Pseudomonas aeruginosa infections. Drugs Context 2018; 7:212527 https://doi.org/10.7573/dic.212527
- 26. Central Asian and Eastern European Surveillance of Antimicrobial Resistance Annual report 2017. WHO. 2017
- 27. Yıldız İ, Bayır H, Küçükbayrak A, Yoldaş H, Balcı M, Erkuran MK, et al. Acinetobacter Infection and Resistance Profile of Intensive Care Units In a City of Northwestern Anatolia. Acta Medica Anatolia 2016; 4:98-100 https://doi.org/10.5505/actamedica.2016.52714
- 28. Barış A, Bulut ME, Öncül A, Bayraktar B. Yoğun Bakım Ünitelerinde Yatan Hastalara Ait Klinik İzolatların Tür Dağılımı ve Antibiyotik Duyarlılıkları. J Turk Soc Intens Care 2017; 15:21-7 https://doi.org/10.4274/tybdd.55707