Molecular Characterization of Sheep Isolates of Echinococcus granulosus in Kilis Province

Kistik ekinokokkozis Türkiye'de ve dünyada en önemli helmintozoonozlardan biridir. Kilis ilindeki 19 koyundan elde edilen 28 Echinococcus granulosus izolatının moleküler karakterizasyonu için mitokondrial 12S rRNA (mt-12S rRNA) ve küçük altünite ribosomal RNA (rrnS) genleri polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile çoğaltıldı. Ayrıca rastgele seçilen iki koyun izolatının mitokondrial sitokrom c oksidaz altünite 1 (mt-CO1) geni kısmi olarak çoğaltılıp dizi analizi yapıldı. Çalışma sonucunda tüm koyun izolatları E. granulosus sensu stricto (G1-G3 kompleks) olarak belirlendi

Kilis İlinde Echinococcus granulosus'un Koyun İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu

Cystic echinococcosis is one of the most important helminthozoonosis both in Turkey and all around world. Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification of mitochondrial 12S rRNA (mt-12S rRNA) and small subunit ribosomal RNA (rrnS) genes were used for molecular characterization of 28 isolates of Echinococcus granulosus obtained from 19 sheep in Kilis province. And also partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (mt-CO1) genes of randomly selected two sheep isolates were amplified and sequenced. At the end of the study, all sheep isolates were detected as E. granulosus sensu stricto (G1-G3 complex)

___

1. Thompson RCA, Lymbery AJ: The nature, extent and significance of variation within the genus Echinococcus. Adv Parasitol, 27, 209-258, 1988.

2. Thomson RCA: The taxonomy, phylogeny and transmission of Echinococcus.Exp Parasitol, 119, 439-446, 2008.

3. Akyol CV: Echinococ türlerinin epidemiyolojisi. In, Altıntaş N, Tınar R, Çoker A (Eds): Echinococcosis. Yayın No: 1. s. 259-283, Hidatidoloji Derneği, İzmir, 2004.

4. Beyhan YE, Umur S: Molecular characterization and prevalence of cystic echinococcosis in slaughtered water buffaloes in Turkey. Vet Parasitol, 181, 174-179, 2011.

5. Simsek S, Koroglu E, Dumanli N, Aktas M, Saki CE, Altay K, Utuk AE:Seroprevalance of cattle hydatidosis insome districts in the east Anatolian region of Turkey. Tr J Vet Anim Sci, 29, 1305-1310, 2005.

6. Altıntas N: Past to present: Echinococcosis in Turkey. Acta Tropica, 85, 105-112, 2003.

7. Nakao M, Yanagida T, Okamato M, Knapp J, Nkouawa A, Sako Y, Ito A: State-of-the-art Echinococcus and Taenia: Phylogenetic taxomomy of human-pathogenic tapeworms and its application to molecular diagnosis. Infect Gen Evol, 10, 444-452, 2010.

8. Utuk AE, Simsek S, Koroglu E, McManus DP:Molecular genetic characterization of different isolates of Echinococcus granulosus in East and Southeast Regions of Turkey. Acta Tropica, 107, 192-194, 2008.

9. Simsek S, Balkaya I, Ciftci AT, Utuk AE: Molecular discrimination of sheep and cattle isolates of Echinococcus granulosus by SSCP and conventional PCR in Turkey. Vet Parasitol, 178, 367-369, 2011.

10. Simsek S, Kaplan M, Ozercan IH: A comprehensive molecular survey of Echinococcus granulosus in formaline fixed paraffin embedded tissues in human isolates in Turkey. Parasitol Res, 109, 411-419, 2011.

11. Ergin S, Sarbas S, Yüksel P, Zengin K, Midilli K, Adas G, Arikan S, Aslan M, Uysal H, Caliskan R, Oner A, Kucukbasmacı O, Kaygusuz A, Torun MM, Kocazeybek B: Genotypic characterization of Echinococcus granulosusisolated from human in Turkey, African J Microbil Res, 4, 551-555, 2010.

12. ?nábel V, Altintas N, D'Amelio S, Nakao M, Romig T, Yolasigmaz A, Gunes K, Turk M, Busi M, Hüttner M, ?evcová D, Ito A, Altintas N, Dubinsk? P: Cystic echinococcosis in Turkey: Genetic variability and first record of the pig strain (G7) in the country. Parasitol Res, 105, 145-154, 2009.

13. Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T: Molecular cloning: A laboratory manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor, NY, 1989.

14. Trachsel D, Deplazes P, Mathis A: Identification of taeniid eggs in the faeces from carnivores based on multiplex PCR using targets in mitochondrial DNA. Parasitology, 134, 911-920, 2007.

15. Dinkel A, Njoroge EM, Zimmermann A, Walz M, Zeyhle E, Elmahdi IE, Mackenstedt U, Romig T: A PCR system for detection of species and genotypes of the Echinococcus granulosus complex, with reference to the epidemiological situation in eastern Africa. Int J Parasitol, 34, 645-653, 2004.

16. Bowles J, Blair D, McManus DP: Genetic variants within the genus Echinococcus identified by mitochondrial DNA sequencing. Mol Biochem Parasitol, 54, 165-174, 1992.

17. CLC Sequence Viewer: http://www.clcbio.com/index.php, Accesed: 24.10.2011.

18. Utuk AE, Simsek S, Koroglu E: Molecular genetic characterization of genus Echinococcus. Acta Parasitol Turc, 29, 171-176, 2005. 1

9. Utuk AE, Piskin FC: Molecular detection of cystic echinococcosis in a three month old lamb. FÜ Sağ Bil Vet Derg, 25, 95-97, 2011.

20. Yildiran FAB, Yildiz K, Cakir S, Gazyagci AN: The molecular characterization of Echinococcus granulosus isolates from sheep in Kırıkkale region. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 16, 245-250, 2010.

21.Ütük AE, Şimşek S, Köroğlu E: Echinococcus granulosus'un koyun suşunun (G1) RAPD-PCR ve DNA dizi analizi ile tanısı. 3. Ulusal Hidatidoloji Kongresi, Samsun, 06-09 Eylül 2006.

22. Utuk AE, Piskin FC: Cystic hydatidosis in a crossbreed mountain goat and its molecular characterization. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 16 (4): 671-673, 2010.

23. Simsek S, Balkaya I, Koroglu E: Epidemiological survey and molecular characterization of Echinococcus granulosus in cattle in an endemic area of eastern Turkey. Vet Parasitol, 172, 347-349, 2010.

24. Simsek S, Eroksuz Y: Occurrence and molecular characterization of Echinococcus granulosus in Turkish mouflon (Ovis gmelinii anatolica). Acta Tropica, 109, 167-169, 2009.
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6045
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 1995
  • Yayıncı: Kafkas Üniv. Veteriner Fak.
Sayıdaki Diğer Makaleler

Kutanöz Leishmaniasis Tanısında Serolojinin Yeri

Fadile YILDIZ ZEYREK, Derya ERDOĞAN DİRİM, Nermin ULUCA, Seray TÜMER, METİN KORKMAZ

Gastrointestinal Sistem Yakınması Olan Hastalarda Dışkının Parazitolojik ve Bakteriyolojik İncelemelerinin Karşılaştırılması

Arzu BAYRAM, Tuba OYUR, Aysegul UNVER, Şöhret AYDEMİR, Tijen ÖZACAR, Seray ÖZENSOY TÖZ, NEVİN TURGAY

Prevalence and Associated Factors of Cryptosporidium spp and Cyclospora cayetanensis in Izmir Province, Turkey

Derya ERDOĞAN DİRİM, Özgür KURT, Aliye MANDIRACIOĞLU, Ahmet ÜNER, Mücide AK, HANDE DAĞCI

Feconomics®: A Simple, Novel and Fast Technique for Stool Concentration in Parasitology Laboratory

Özgür KURT, Işın AKYAR, Serhan GÖRGÜN, Tanıl KOCAGÖZ, Ahmet ÖZBİLGİN

A Case of Contracaecum sp. (Ascaridida: Anisakidae) Infection in Dalmatian Pelican (Pelecanus crispus)

AHMET ONUR GİRİŞGİN, AYLİN ALASONYALILAR DEMİRER, OYA GİRİŞGİN

Kars Yöresinde Periparturient Dönemdeki İneklerde Eimeria ve Cryptosporidium Türlerinin Yaygınlığı Üzerine Araştırmalar

MÜKREMİN ÖZKAN ARSLAN, BARIŞ SARI, MURAT KARA, GENCAY TAŞKIN TAŞÇI, Aysel EKİNCİ İTİK, Neslihan GÜNDÜZ

Türkiye'nin Karadeniz Bölgesindeki Koyun ve Keçilerde Kene Enfestasyonları

MEHMET FATİH AYDIN, Münir AKTAŞ, Nazir DUMANL

The in vitro Effects of Azithromycin and Clarithromycin on Promastigotes and Amastigotes of Leishmania tropica

İ. Cüneyt BALCIOĞLU, Z. Ülgen OK, YUSUF ÖZBEL, Nogay GİRGİNKARDEŞLER, Ahmet ÖZBİLGİN

2002-2011 Yılları Arasında Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Parazitoloji Anabilim Dalına Başvuran Hastalarda Demodex spp. Görülme Sıklığı

Süleyman YAZAR, Salih KUK, Süheyla DOĞAN, İzzet ŞAHİN

Klinik Bakımdan Sağlıklı Görünümlü Koyunlarda Coenurosisin Yaygınlığı

SAMİ GÖKPINAR, KADER YILDIZ