Mitokondrial DNA Kullanılarak İran’daki Eski Dünya Develerinin (Camelus dromedaries ve Camelus Bactrianus) Genetik Farklılık ve Popülasyon Yapısının Araştırılması

Bu çalışma mitokondrial DNA kullanılarak İran develerinin genetik farklılığını araştırmak amacıyla yapılmıştır. Dört deve popülasyonundan toplam 120 devede 1052 bp cyt-b segmenti amplifiye edilmiş ve sekans analizi yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar, çift hörgüçlü develerde 30 mutasyonun tek hörgüçlü develerde ise 9 mutasyonun olduğunu ve sırasıyla dokuz ve altı mtDNA haplotipinin bulunduğunu göstermiştir. Nükleotid farklılığı, tek ve çift hörgüçlü develer için sırasıyla 0.0015 ve 0.0121 olarak hesaplandı. Çift hörgüçlü deve popülasyonunda yüksek haplotip çeşitliliği (0.886±0.145) gözlemlenirken tek hörgüçlü deve popülasyonunda düşük genetik farklılaşma tespit edildi. Filogenetik analiz develer için farklı topluluklar gösterdi.

Genetic Diversity and Population Structure of Old World Camelids (Camelus dromedaries and Camelus Bactrianus) in Iran Using Mitochondrial DNA

This study was conducted to investigate the genetic diversity of Iranian camels using mitochondrial DNA. A fragment of 1052 bp cyt-b wasamplified and sequenced in 120 individuals from four camel populations. The results revealed that there are 30 mutations for Bactrian camelsand 9 mutations for dromedaries that lead to nine and six mtDNA haplotypes, respectively. Nucleotide diversity was calculated as 0.0015and 0.0121 for dromedaries and Bactrian camel populations respectively. We found high haplotype diversity in Bactrian camel populations(0.886±0.145) and low genetic differentiation among dromedary populations. Phylogeny analysis showed different cluster for camelids.

___

  • Crandall KA, Templeton AR: Empirical tests of some predictions from coalescent theory with applications to intraspecific phylogeny reconstruction. Genetics, 134, 959-969, 1993.
  • Babar ME, Hussain T, Wajid A, Nawaz A, Nadeem A, Shah SA, Shahid MA, Ahmad N, Javed K, Abdullah M: Mitochondrial cytochrome-b and d-Loop sequence based genetic diversity in Mareecha and Bareela camel breeds of Pakistan. J Anim Plant Sci, 25, 591-594, 2015.
  • Ming L, Yi L, Sa R, Wang ZX, Wang Z, Ji R: Genetic diversity and phylogeographic structure of Bactrian camels shown by mitochondrial sequence variations. Anim Genet, 48, 217-220, 2016. DOI: 10.1111/ age.12511
  • Almathen F, Charruau P, Mohandesan E, Mwacharo JM, OrozcoterWengel P, Pitt D, Abdussamad AM, Uerpmann M, Uerpmann HP, De Cupere B, Magee P, Alnaqeeb MA, Salim B, Raziq A, Dessie T, Abdelhadi OM, Banabazi MH, Al-Eknah M, Walzer C, Faye B, Hofreiter M, Peters J, Hanotte O, Burger PA: Ancient and modern DNA reveal dynamics of domestication and cross-continental dispersal of the dromedary. Proc Natl Acad Sci, 113, 6707-6712, 2016. DOI: 10.1073/ pnas.1519508113
  • Bandelt HJ, Forster P, Röhl A: Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol, 16, 37-48, 1999. DOI: 10.1093/ oxfordjournals.molbev.a026036
  • Rozas J, Librado P, Sanchez-Delbarrio J, Messeguer X, Rozas R: DnaSP 5.10. 00. Universitat de Barcelona, Spain 2009.
  • Hall T: BioEdit v. 7.0. 1. Department of Microbiology, North Carolina State University. 2004.
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S: MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol, 30, 2725-2729, 2013. DOI: 10.1093/molbev/mst197
  • Barreta J, Iñiguez V, Sarno R, Gutiérrez-Gil B, Arranz J: Mitochondrial DNA (mtDNA) genetic diversity of Vicugna vicugna mensalis in Bolivia. In, Pérez-Cabal MÁ, Gutiérrez JP, Cervantes I, Alcalde MJ (Eds): Fibre Production in South American camelids and other fibre animals. 123- 130, Wageningen Academic Publishers, Wageningen, 2011.
  • Goldstein D, Pollock D: Launching microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic interference. J Hered, 88 (5): 335-342, 1997
  • Sharma R, Kishore A, Mukesh M, Ahlawat S, Maitra A, Pandey AK, Tantia MS: Genetic diversity and relationship of Indian cattle inferred from microsatellite and mitochondrial DNA markers. BMC Genet, 16, 73, 2015. DOI: 10.1186/s12863-015-0221-0
  • Lenstra J, Groeneveld L, Eding H, Kantanen J, Williams J, Taberlet P, Nicolazzi E, Sölkner J, Simianer H, Ciani E, Garcia JF, Bruford MW, Ajmone-Marsan P, Weigend S: Molecular tools and analytical approaches for the characterization of farm animal genetic diversity. Anim Genet, 43, 483-502, 2012. DOI: 10.1111/j.1365-2052.2011.02309.x
  • Woodward RB, Hoffmann R: The conservation of orbital symmetry. Elsevier, 2013.
  • Hamers-Casterman C, Atarhouch T, Muyldermans S, Robinson G, Hamers C, Songa EB, Bendahman N, Hamers R: Naturally occurring antibodies devoid of light chains. Nature, 363 (6428): 446-448, 1993. DOI: 10.1038/363446a0
  • Wu H, Guang X, Al-Fageeh MB, Cao J, Pan S, Zhou H, Zhang L, Abutarboush MH, Xing Y, Xie Z, Alshanqeeti AS, Zhang Y, Yao Q, AlShomrani BM, Zhang D, Li J, Manee MM, Yang Z, Yang L, Liu Y, Zhang J, Altammami MA, Wang S, Yu L, Zhang W, Liu S, Ba L, Liu C, Yang X, Meng F, Wang S, Li L, Li E, Li X, Wu K, Zhang S, Wang J, Yin Y, Yang H, Al-Swailem AM, Wang J: Camelid genomes reveal evolution and adaptation to desert environments. Nat Commun, 5, 5188, 2014. DOI: 10.1038/ncomms6188
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-6045
  • Yayın Aralığı: Yılda 6 Sayı
  • Başlangıç: 1995
  • Yayıncı: Kafkas Üniv. Veteriner Fak.
Sayıdaki Diğer Makaleler

Düzenli ve Yoğun Egzersiz Yaptırılan Ratlarda Takviye Olarak Tüketilen Dallı Zincirli Amino Asitlerin Miyokard ve Koroner Damarlar Üzerine Etkisi

Mahmut YESİN, İbrahim RENCÜZOĞULLARI, Metin ÇAĞDAŞ, Fatih MEDETALİBEYOĞLU, Uğur AYDIN, Doğan İLİŞ, Ekin Emre ERKILIÇ, Yasemen ADALI, Yavuz KARABAĞ, İnanç ARTAÇ, Süleyman KARAKOYUN

Radiosynthesis and Biodistribution of 99mTc-Trimethoprim: A Novel Radiolabeled Antibiotic for Bacterial Infection Imaging Using Experimental Animals

Hasan DEMİROĞLU, Gökçen TOPAL, Yasemin PARLAK, Fikriye Gül GÜMÜŞER, Elgin ULUER TÜRKÖZ, Volkan TEKİN, Buket ATEŞ, PERİHAN ÜNAK, UĞUR AVCIBAŞI

Çin’de Tavuk Cinsleri Arasında Avian Endojen Retrovirus ev/J Genomunda Yeni Delesyonların Tespiti

Xiongyan LIANG, Chun FANG, Yufang GU, Tuofan LI, Yuying YANG, Lan LIU

Mitokondrial DNA Kullanılarak İran’daki Eski Dünya Develerinin (Camelus dromedaries ve Camelus Bactrianus) Genetik Farklılık ve Popülasyon Yapısının Araştırılması

Reza KHALKHALI EVRIGH, Kobra POURASAD, Reza Seyed SHARIFI, Vahid VAHEDI, Nemat HEDAYAT EVRIGH

Lactobacillus plantarum ve Pediococcus acidilactici Kullanımının Fil Otu (Pennisetum purpureum) Silajının Fermantasyon Dinamikleri, Mikrobiyal İçerik ve Aerobik Stabilitesi Üzerine Etkisi

Junfeng LI, Tao SHAO, Azizza SİFEELDEİN, Xianjun YUAN, Zhihao DONG

Primer Koyun Serebral Mikrodamar Endotelyal ve Astrosit Hücrelerinin Birlikte Kültüre Edilmesiyle Oluşturulmuş In vitro Kan Beyin Bariyeri Modeli

Jingjing REN, Mingwei YANG, Genqiang YAN, Jianjun JIANG, Pengyan WANG

Presence and Antibiotic Resistance of Listeria monocytogenes in Raw Milk and Dairy Products

AKSEM AKSOY, ÇİĞDEM SEZER, LEYLA VATANSEVER, GÜVEN GÜLBAZ

Determination of Some Acute Phase Proteins, Biochemical Parameters and Oxidative Stress in Sheep with Naturally Infected Sheeppox Virus

KADİR BOZUKLUHAN, OĞUZ MERHAN, HALİL İBRAHİM GÖKCE, METİN ÖĞÜN, EMİNE ATAKİŞİ, Şemistan KIZILTEPE, Gürbüz GÖKÇE

Deneysel Rat Modeli: Anestezi İndüksiyonu Öncesi %100 O2 İle Preoksijenizasyon Uygun mu Değil mi?

Buket DEMİRCİ, Erdem ÖZKISACIK, Varlik K. EREL, Tugba OZBEK CELIK, Mustafa YILMAZ

Genetic Diversity and Population Structure of Old World Camelids (Camelus dromedaries and Camelus Bactrianus) in Iran Using Mitochondrial DNA

Nemat HEDAYAT EVRIGH, Reza KHALKHALI EVRIGH, Vahid VAHEDI, Kobra POURASAD, Reza Seyed SHARIFI