HASTANE ENFEKSİYONU ARAŞTIRMA LABORATUVARINDA SAPTANAN RETROSPEKTİF SONUÇLARIN DEĞERLENDİRİLMESİ

Amaç: Hastaneler, sağlık hizmeti sunumu sırasında potansiyel enfeksiyon riski kaynağıdırlar. Vankomisine dirençli enterokoklar (VRE) ve karbapenemaz üreten Gram-negatif çomaklar, kalıcı kolonizasyona ve çok ilaca dirençli bakteriyel enfeksiyonlara neden olduğundan hastane enfeksiyonlarında önemlidirler. Bu çalışmada, 1 Ocak 2020 / 31 Aralık 2020 tarihleri arasında kliniklerde yatan hastaların rektal sürüntü örneklerinin hastane enfeksiyonu etkeni olan VRE ve karbapenem-dirençli (KD) Gram-negatif çomaklar açısından retrospektif olarak değerlendirmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Hastanede yatan hastaların Hastane enfeksiyon Araştırma Laboratuvarı’na gönderilen rektal sürüntü örneklerinden KD Gram-negatif çomaklar ve VRE’yi izole etmek ve tanımlamak için standart klinik laboratuvar yöntemleri kullanılmıştır. Bulgular: İncelenen 2688 örneğin 777’sinde (%28,9) üreme olmuştur. Üreyen bakterilerin 627’si (%80,7) VRE ve 150’si (%19,3) KD Gram-negatif çomaklar olarak tanımlanmıştır. Bunlardan 75’i KD K. pneumonia; 7’si KD K. oxytoca; 26’sı KD Enterobacter türleri; 2’si KD E. coli; ve 40 suş KD Acinetobacter türü olarak belirlenmiştir. Vankomisine dirençli enterokoklar en sıklıkla dahiliye servisinde (%56,3 - 353/627) ve pediatrik yoğun bakım-yenidoğan servisinde (%37,6 - 236/627) tespit edilmiştir. Pediatri servislerinde toplam 296 bakterinin 146’sı VRE olarak tanımlanmıştır. Sonuç: Hastane enfeksiyonlarının kontrolünde yapılan sürveyans çalışmaları ile her sağlık kuruluşu kendi hastane florasını oluşturan mikroorganizmaları, direnç durumlarını ve dağılımlarını belirlemektedir. Elde edilen verilerin hastanelerin enfeksiyon kontrol süreçlerinde katkı sağlayacağı düşünülmektedir.

AN EVALUATION OF RETROSPECTIVE RESULTS DETECTED IN THE HOSPITAL INFECTION RESEARCH LABORATORY

Objective: Hospitals are a potential source of infection risk during healthcare delivery. Since vancomycin-resistant enterococci (VRE) and carbapenemase producing Gram-negative rods cause persistent colonization and multi-drug resistant bacterial infections, they are important in nosocomial infections. In this study, we aimed to retrospectively evaluate rectal swab samples of patients hospitalized in the clinics in terms of VRE and carbapenem- resistant (CR) Gram-negative rods as nosocomial infection agents between 1st January 2020 and 31st December 2020. Materials and Methods: Standard clinical laboratory methods were used to isolate and identify CR Gram-negative rods and VRE from rectal swab samples of hospitalized patients sent to our Hospital Infection Research Laboratory. Results: There was growth in 777 (28.9%) of 2688 samples examined. Of the bacteria that grew, 627 (80.7%) were defined as VRE, and 150 (19.3%) as Gram-negative rods resistant to carbapenem. Seventy-five of these were defined as CR K. pneumoniae: 7 as CR K. oxytoca: 26 as CR Enterobacter species: 2 as CR E. coli: and 40 as CR Acinetobacter species. Vancomycin-resistant enterococci were detected most frequently in the internal medicine ward (56.3% - 353/627) and pediatric intensive care-neonatal ward (37.6% - 236/627). In pediatric services, 146 of total 296 bacteria isolated were identified as VRE. Conclusion: With the surveillance studies carried out in the control of hospital infections, each health institution determines the microorganisms that make up its own hospital flora, their resistance status and their distribution. It is thought that the data we obtain will contribute to the infection control processes of the hospitals.

___

  • 1. Karahocagil MK, Yaman G, Goktas U, Sunnetcioglu M, Cikman A, Bilici A, et al. Hastane enfeksiyon etkenlerinin ve direnç profillerinin belirlenmesi. Van Tıp Derg 2011;18(1):27-32. google scholar
  • 2. Sievert DM, Ricks P, Edward JR, Schneider A, Patel J, Srinivasan A, et al. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare associated infections: summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2009-2010. Infect Control Hosp Epidemiol 2013;34(1):1-14. [Crossref] google scholar
  • 3. Aydin F. Ülkemizde mevcut duruma eleştirel bir yaklaşım: Klinik mikrobiyoloji uzmanı gözüyle enfeksiyon kontrol yönetmeliği. 2. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi; 2013 November 10-13; Antalya, Türkiye, 2013, p.157-8. google scholar
  • 4. Sinatra I, Carubia L, Marchese V, Aprea L, Alessandro ND, Mammina C, et al. Prevalence survey of healthcare-associated infections and antimicrobial use at the University Hospital “Paolo Giaccone”, Palermo, Italy. J Prev Med Hyg 2013;54(4):200-4. google scholar
  • 5. Ducel G, Fabry J, Nicolle L. Prevention of hospital-acquired infections. A practical guide. 2nd edition. World Health Organization. https://apps.who.int/iris/ handle/10665/67350?show=full google scholar
  • 6. Ahmed MO, Baptiste KE. Vancomycin-resistant enterococci: A review of antimicrobial resistance mechanisms and perspectives of human and animal health. Microbial Drug Resistance 2018;24(5):590-606. [Crossref] google scholar
  • 7. Bilgehan A, Kayabas U. Yoğun bakım birimlerinde dirençli infeksiyon sorunu. Klimik Derg 2001;14(2):83-7. google scholar
  • 8. Doi Y. Treatment options for carbapenem-resistant gramnegative bacterial infections. Clin Infect Dis 2019;69(Supply 7):S565-75. [Crossref] google scholar
  • 9. Kahraman EP, Toptan H, Otlu B, Köroğlu M, Altindiş M. Karbapenemaz üreten Klebsiella pneumoniae suşlarında blaOXA-48-benzeri genlerin araştırılması [Investigation of blaOXA-48-like genes in carbapenemase producing Klebsiella spp. isolates]. Mikrobiyol Bul 2019;53(2):134-43. [Crossref] google scholar
  • 10. Şahin AR, Doğruer D, Nazik S, Aktemur A, Öksüz H, Aral M, et al. Hastane kökenli patojenlerde artan antimikrobiyal direnç sorunu: Acinetobacter baumannii [Increasing antimicrobial resistance problem of nosocomial pathogens: Acinetobacter baumannii]. OTJHS 2019;4(2):156-69. [Crossref] google scholar
  • 11. David S, Reuter S, Harris SR, Glasner C, Feltwell T, Argimon S, et al. Epidemic of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in Europe is driven by nosocomial spread. Nat Microbiol 2019;4(11):1919-29. [Crossref] google scholar
  • 12. Liu Q, Liu L, Li Y, Ch Xia , Yan Q, Liu W-E . Fecal carriage and epidemiology of carbapenem-resistant enterobacteriaceae among hospitalized patients in a university hospital. Infect Drug Resist 2019;12:3935-42. [Crossref] google scholar
  • 13. Procop GW, Church DL, Hall GS, Janda WM, Koneman EW, Schreckenberger PC, et al. Gram positive cocci. In Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. Lippincot Williams & Wilkins-China, Seventh Edition, Chapter 13, 2017, p:733-843. google scholar
  • 14. Bryskier A, Antimicrobial Agents. In: Carbapenems. ASM Press, Washington, USA, 2005, p:269-318. [Crossref] google scholar
  • 15. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing: 28th Edition, CLSI supplement M100, Wayne, PA, 2018. https://clsi. org/standards/products/microbiology/documents/m100/ google scholar
  • 16. Clinical and Laboratory Standards Institute. Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically: Approved Standards, 7th Edition, CLSI Standart M7-A7, Wayne, USA, 2006. https://clsi.org/ standards/products/microbiology/documents/m07/ google scholar
  • 17. Procop GW, Church DL, Hall GS, Janda WM, Koneman EW, Schreckenberger PC, et al. The Enterobacteriaceae. In: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 7th Edition, Lippincot Williams & Wilkins-China, 2017, p:213-315. google scholar
  • 18. Procop GW, Church DL, Hall GS, Janda WM, Koneman EW, Schreckenberger PC, et al. The Nonfermentative Gramnegative bacilli. In: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 7th Edition, Lippincot Williams & Wilkins-China, 2017, p:316-431. google scholar
  • 19. Procop GW, Church DL, Hall GS, Janda WM, Koneman EW, Schreckenberger PC, et al. Antimicrobial testing. In: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology,7th Edition, Lippincot Williams & Wilkins-China, 2017, p:1074-171. google scholar
  • 20. Rai V, Gan CHS, Rosenthal VD, Hasan MSH, Lum LCHS, Mansor M, et al. Device-associated infection and mortality rates, bacterial resistance, and length of stay in hospitals of Malaysia: International Nosocomial Infection Control Consortium (INICC)’s findings. Can J Infect Control 2016;31(2):107-12. google scholar
  • 21. World Health Organization (WHO) Guidelines on hand hygiene in health care: a summary. 2009. https://apps.who. int/iris/handle/10665/70126 google scholar
  • 22. Cetinkaya Y, Falk P, Mayhall CG. Vancomycin-resistant enterococci. Clin Mikrobiol Rev 2000;13(4):686-707. [Crossref] google scholar
  • 23. Reyes K, Bardossy AC, Zervos M. Vancomycin-resistant enterococci: epidemiology, infection prevention, and control. Infect Dis Clin North Am 2016;30(4):953-65. [Crossref] google scholar
  • 24. Chiang HY, Perencevich EN, Nair R, Nelson RE, Samore M, Khader K, et al. Incidence and outcomes associated with infections caused by vancomycin-resistant enterococci in the United States: Systematic literature review and meta-analysis. Infect Control Hosp Epidemiol 2017;38(2):203-15. [Crossref] google scholar
  • 25. Xanthopoulou K, Peter S, Tobys D, Behnke M, Dinkelacker AG, Eisenbeis S, et al. Vancomycin-resistant Enterococcus faecium colonizing patients on hospital admission in Germany: prevalence and molecular epidemiology. J Antimicrob Chemother 2020;75(10):2743-51. [Crossref] google scholar
  • 26. Durante-Mangoni E, Andini R, Zampino R. Management of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae infections. Clin Microbiol Infect 2019;25(8):943-59. [Crossref] google scholar
  • 27. Xu L, Sun X, Ma X. Systematic review and meta-analysis of mortality of patients infected with carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2017;16(1):18. [Crossref] google scholar
  • 28. Kuş H, Arslan U, Türk Dağı H, Fındık D. Hastane enfeksiyonu etkeni Klebsiella pneumonia izolatlarında çeşitli virülans faktörlerinin araştırılması. [Investigation of various virulence factors of Klebsiella pneumoniae strains isolated from nosocomial infections]. Mikrobiyol Bul 2017;51(4):329-39. [Crossref] google scholar
  • 29. Mills JP, Talati NJ, Alby K, Han JH. The epidemiology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae colonization and infection among long-term acute care hospital residents. Infect Control Hosp Epidemiol 2016;37(1):55-60. [Crossref] google scholar
  • 30. Yan L, Sun J, Xu X, Huang Sh. Epidemiology and risk factors of rectal colonization of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae among high-risk patients from ICU and HSCT wards in a university hospital. Antimicrob Resist Infect Control 2020;9(1):155. [Crossref] google scholar
  • 31. Aktaş F. Gram negative bakterilerin hastane infeksiyonlarındaki rolü ve epidemiyolojisi. Ulusoy S, Leblebicioğlu H, Arman D, 2. baskı, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara, Türkiye, 2012, p:183-206. google scholar
  • 32. Esen N. Acinetobacter ve non-fermentatif çomaklar. Topçu AW, Söyletir G, Doganay M, editörler. İnfeksiyon hastalıkları ve mikrobiyoloji. 4. baskı, İstanbul: Nobel Tıp Kitapevleri, İstanbul-Turkiye. 2017, p:1916-24. google scholar
  • 33. Ambretti S, Bassetti M, Clerici P, Petrosillo N, Tumietto F, Viale P, et al. Screening for carriage of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in settings of high endemicity: a position paper from an Italian working group on CRE infections. Antimicrob resist infect control 2019;13(8):136. [Crossref] google scholar
İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi-Cover
  • Başlangıç: 1916
  • Yayıncı: İstanbul Üniversitesi Yayınevi
Sayıdaki Diğer Makaleler

SEÇİCİ SEROTONİN GERİ ALIM İNHİBİTÖRLERİYLE TEDAVİ EDİLEN ÇOCUK VE ERGENLERDE YAN ETKİLERİN SIKLIĞI VE İLİŞKİLİ FAKTÖRLER: BİR DOSYA TARAMA ÇALIŞMASI

Hanım Hülya ALINAY, Ali KARAYAĞMURLU, Murat COŞKUN

HASTANE ENFEKSİYONU ARAŞTIRMA LABORATUVARINDA SAPTANAN RETROSPEKTİF SONUÇLARIN DEĞERLENDİRİLMESİ

Niyousha Matloobi AGHDAM, Gülseren AKTAŞ

GESTASYONEL DİABETES MELLİTUSTA GLİSEMİK DEĞİŞKENLİKLERİN ÖNEMİ VE FARKLI YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI

Nida ÖZTOP, Ayşe KUBAT ÜZÜM, Selda ÇELİK, Cemile İDİZ, Yıldız TUTUNCU, Elif BAĞDEMİR, Nevin DİNÇCAĞ

MiR-34a-5p’NİN AŞIRI İFADE EDİLEN AML İLİŞKİLİ GENLER ÜZERİNDEKİ ETKİSİ

Murat KAYA, Ilknur SUER

MEME KANSERİNDE MİTOMİR’LERİN TANIMLANMASI: İN VİTRO ÇALIŞMA İLE ROLLERİNİN GÖSTERİLMESİ

Pervin Elvan TOKGÜN, Ayşe Gaye TOMATIR

TÜRK DİYALİZ SAĞLIK ÇALIŞANLARINDA COVID-19’A BAĞLI GÖRÜLEN RUHSAL TEPKİLER

İrmak POLAT, Mehmet Sukru SEVER, Erol DEMİR, Halil YAZICI, Serkan Kubilay KOÇ, Rabia PAPİLA, Mine ÖZKAN

MİTOKONDRİYAL DNA MUTASYONLARININ TEKRAR DİZİLEME ARRAY YÖNTEMİ İLE ALTI AİLEDE DEĞERLENDİRİLMESİ

Guyem KOLBAŞI DEMİRCİOĞLU, Sezen GÜNTEKİN ERGÜN, Kıvılcım GÜCÜYENER, Ferda E. PERÇİN, Mehmet Ali ERGUN

İZOLE ABERAN SAĞ SUBKLAVYAN ARTER: NONİNVAZİV PRENATAL TESTLERİN VARLIĞINDA PRENATAL TANI İÇİN İNVAZİV GİRİŞİM ÖNERİLMELİ Mİ?

Tuğba SARAÇ, Selen GÜRSOY ERZİNCAN, Lutfiye UYGUR, Çiğdem KUNT İŞGÜDER, Savcı Bekir TELEK, Recep HAS, İbrahim KALELİOĞLU

VİSERAL LAYŞMANYAZ MODELİ OLUŞTURULAN FARELERDE TİGESİKLİN VE REİSHİ SHİİTAKE MAİTAKE MANTAR EKSTRESİNİN TEDAVİ ETKİNLİĞİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Özden BORAL, Deniz Gözde ÇELİK, Halim İŞSEVER

COVID-19 PNÖMONİSİ GEÇİRMİŞ HASTALARDA SOL VENTRİKÜL STRAİN DEĞERİNİN BÖLGESEL TUTULUMU

Ekrem Bilal KARAAYVAZ, Berat ENGİN, Pelin KARACA ÖZER, Zeynep Gizem DEMİRTAKAN, Elif AYDUK GÖVDELİ, Turker DEMIRTAKAN, Derya BAYKIZ, Alpay MEDETALİBEYOĞLU