Yüksek oranda mineral içeren atık jeotermal sular ve rezervuarlardaki basınç düşümleri su baskın jeotermal sahaların en önemli sorunlarıdır. Ekonomik ve teknik açıdan uygulanabilir olması durumunda, atık suların derin akiferlere reenjekte edilmesi çok caziptir. Üretim sonucu Kızıldere Jeotermal Enerji Sahası'nda yıllık 0.5-0.6 bar basınç düşümü ve kuyular arasında güçlü hidrolik bağlantılar olduğu ortaya çıkartılmıştır. Sahanın güneyinde Büyük Menderes yakınlarındaki bölge, reenjeksiyon için jeolojik ve topoğrafik olarak en uygun alan olarak belirlenmiştir.

Highly mineralised water and pressure drawdown represent major problems for the water dominated geothermal fields. Reinjection of the waste water into deep formations was considered to be the most attractive method, if this could be technically and economically feasible. The studies tests have proven that the production wells were linked strongly together for that the reinjection site must be away from the production area and the faults which control the geothermal system. The point ofwiew geological and topographical conditions, the southern part of the field, near the Büyük Menderes River is the most suitable area for reinjection.