Potansiyel Antioksidan İlaç Adayları Olarak Yeni 3H-Tiazolo[4,5-b]piridin-2-on Türevlerinin Yorumlanabilir QSAR Modellemesi ve QSAR Tabanlı Sanal Taraması

Potansiyel antioksidan ilaç adayları olarak 32 N3 ikameli 3H-tiazolo[4,5-b]piridin-2-on türevleri için kantitatif yapı-aktivite ilişkisi (QSAR) çalışması yapılmıştır. Tanımlayıcı seçimi ve korelasyon modelleri oluşturmak için uygun teknikler olarak genetik algoritma (GA) ve çoklu doğrusal regresyon analizi (MLRA) kullanıldı. DPPH radikalini temizleme yeteneğinin tahmini için en iyi dört regresyon, en yüksek istatistiksel özelliklere ve öngörü yeteneğine sahip üç parametreli QSAR modelleri olarak üretildi. Oluşturulan modellerin doğrulama parametrelerine dayanarak, bunların hepsinin, mevcut aşırı uyum olmadan uyumun iyiliği için istatistiksel gereklilikleri karşıladığı söylenebilir. Oluşturulan modellerin tahmin yeteneği, hem iç hem de dış doğrulama yaklaşımıyla değerlendirildi ve birini dışarıda bırak ve grubu dışarıda bırak çapraz doğrulama katsayıları (Q2LOO ve Q2LGO) ile tahmin edildi. Q2LOO (0.7060  0.7480) ve Q2LGO (0.6647  0.7711) değerleri makul olup, modellerin hem eğitim hem de doğrulama setlerinden bileşiklerin serbest radikal yakalama aktivitesini tahmin etmek için önemli ve sağlam olduğunu göstermektedir. Elde edilen modellere uygulanabilirlik alanı tanımlama tekniği uygulandı ve çoğu yapının modellerin kimyasal uzayı tarafından yeterince temsil edildiği belirtildi.

Interpretable QSAR Modelling and QSAR-Based Virtual Screening of Novel 3H-Thiazolo[4,5-b]pyridin-2-one Derivatives as Potential Antioxidant Drug Candidates

Quantitative structure-activity relationship (QSAR) study has been carried out for 32 N3 substituted 3H-thiazolo[4,5-b]pyridin-2-one derivatives as potential antioxidant drug candidates. The genetic algorithm (GA) and multiple linear regression analysis (MLRA) were used as appropriate techniques for descriptors selection and correlation models generation. The four best regressions for the prediction of the ability to scavenge the DPPH radical were generated as three-parameter QSAR models with the highest statistical characteristics and predictive ability. Based on the validation parameters of the generated models, it may be stated that they all satisfy the statistical requirements for their goodness-of-fitting with no current overfitting. The predictive ability of the constructed models was assessed with both internal and external validation approach and estimated with the leave-one-out and leave-group-out cross-validation coefficients (Q2LOO and Q2LGO). The values of Q2LOO (0.7060  0.7480) and Q2LGO (0.6647  0.7711) are reasonable, showing that the models are significant and robust to predict the free radical scavenging activity of the compounds from both training and validation sets. Applicability domain defining technique was employed to the obtained models and it was indicated that most structures were adequately represented by the chemical space of the models.

___

  • Chaban, T. I., Panchuk, R. R., Klenina, O. V., Skorokhyd, N. R., Ogurtsov, V. V., & Chaban, I. G. (2012). Synthesis and evaluation of antitumor activity of some thiazolo(4,5-b) pyridines. Вiopolymers and Cell.
  • Chaban, T. I., Ogurtsov, V. V., Chaban, I. G., Klenina, O. V., & Komarytsia, J. D. (2013). Synthesis and antioxidant activity evaluation of novel 5, 7-dimethyl- 3 H-thiazolo(4,5-b)pyridines. Phosphorus, Sulfur, and Silicon and the Related Elements, 188(11), 1611-1620.
Fabad Eczacılık Bilimler Dergisi-Cover
  • ISSN: 1300-4182
  • Yayın Aralığı: Yılda 3 Sayı
  • Başlangıç: 2005
  • Yayıncı: FABAD Ankara Eczacılık Bilimleri Derneği
Sayıdaki Diğer Makaleler

Potansiyel Antioksidan İlaç Adayları Olarak Yeni 3H-Tiazolo[4,5-b]piridin-2-on Türevlerinin Yorumlanabilir QSAR Modellemesi ve QSAR Tabanlı Sanal Taraması

Olena KLENİNA

Topotekan, karvakrol, epigallokateşin gallat ve kombinasyonlarının nöroblastom ve astrosit hücrelerinde apoptotik süreç üzerine etkisinin değerlendirilmesi

Çağatay OLTULU, Melek AKINCI, Elvan BAKAR

Synthesis of some novel Schiff base derivative 5-substituted-4-amino-1,2,4-triazole-3-one compounds with potential lipase inhibition activity

Yaren KAHVECİ, İnci Selin DOĞAN, Şeyda KANBOLAT, Bahittin KAHVECİ

Design and Assessment of a Microemulsion-Based Transdermal Drug Delivery System for Meloxicam; Examination of Formulation Ingredients

Anayatollah SALİMİ, Ramin NOORAFROOZ, Maryam FOULADİ, Saeed MOHAMMAD SOLEYMANİ

Metabolomic Studies in Girls With Central and Peripheral Precocious Puberty

Aylin BALCI ÖZYURT, Tuba REÇBER, Emirhan NEMUTLU, Derya BULUŞ, Sedef KIR, Belma KOÇER GÜMÜŞEL, Pınar ERKEKOĞLU

Mide Kanseri Hastalarında İnflamatuar Parametrelerin Subtotal ve Total Gastrektomi Sonrası Sağkalımla İlişkisi

Bercis İmge UÇAR, Muhammed Alperen TAŞ, Huseyin Emre ARSLAN, Mehmet Fatih EKİCİ, Sezgin ZEREN

Phase Transformation of Anhydrous to Dihydrate Carbamazepine: Preparation and Comparative Characterization

Kamlesh J WADHER, Vaishnavi RAUT, Keshav HİRAVE, Sagar TRİVEDİ, Milind UMEKAR

Hidrojen Sülfür hiperglisemik koşullar altında fibroblastlarda reaktif oksijen türevlerini azaltarak yara iyileşmesini destekler

Merve DENİZALTI

In Silico and In Vitro Anticancer Effects of Caffeic Acid Phenethyl Ester on Pancreatic Adenocarcinoma Cells

Zübeyde TANRIVERDİ, Burak KUZU, Ergül EYOL, Fuat KARAKUŞ

Üçlü negatif meme kanseri hücrelerine folik asit polietilenimin polipleksleri ile gen aktarımı

Devrim DEMİR DORA